HDAC4 Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB show 2H8N , 2O94 , 2VQJ , 2VQM , 2VQO , 2VQQ , 2VQV , 2VQW , 3UXG , 3UZD , 3V31 , 4CBT , 4CBY , 5A2S
Идентификаторы Псевдонимы HDAC4 Внешние идентификаторы ОМИМ : 605314 ; МГИ : 3036234 ; Гомологен : 55946 ; Генные карты : HDAC4 ; OMA : ортологи HDAC4 show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog)Top expressed in sural nerve glutes gastrocnemius muscle tibialis anterior muscle muscle of thigh muscle layer of sigmoid colon endothelial cell deltoid muscle Skeletal muscle tissue of biceps brachii blood
Top expressed in otic vesicle granulocyte gastrula Rostral migratory stream dentate gyrus of hippocampal formation granule cell muscle of thigh lip interventricular septum muscle tissue skeletal muscle tissue
More reference expression data
BioGPS
Викиданные
Гистондеацетилаза 4 , также известная как HDAC4 , представляет собой белок , который у человека кодируется HDAC4 геном . [5] [6]
Гистоны играют решающую роль в регуляции транскрипции , развитии клеточного цикла и событиях развития. гистонов Ацетилирование /деацетилирование изменяет структуру хромосом и влияет на доступ транскрипционных факторов к ДНК. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к классу II семейства деацетилаз гистонов /acuc/apha. Он обладает активностью гистондеацетилазы и подавляет транскрипцию при связывании с промотором. Этот белок связывается с ДНК не напрямую, а через факторы транскрипции MEF2C и MEF2D . По-видимому, он взаимодействует в мультибелковом комплексе с RbAp48 и HDAC3. [7] [8]
Исследования показали, что HDAC4 регулирует развитие костей и мышц. Исследователи Гарвардского университета также пришли к выводу, что он способствует здоровому зрению: снижение уровня белка привело к гибели палочек фоторецепторов и биполярных клеток в сетчатке мышей. [9] [10]
Было показано, что HDAC4 взаимодействует с:
БКЛ6 , [11] БТГ2 , [12] [13] CBX5 , [14] ГАТА1 , [15] HDAC3 , [5] [16] [17] [18] МАПК1 , [19] МАПК3 , [19] МЕФ2С , [20] [21] Миоцитспецифический энхансерный фактор 2А , [22] [23] Ко-репрессор ядерного рецептора 1 , [16] [24] Ко-репрессор ядерных рецепторов 2 , [16] [24] Тестикулярный рецептор 2 , [25] [26] ЯХВЕ , [17] ДА , [17] [27] Белок, содержащий цинковый палец и домен BTB 16 . [11] [28]
^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000068024 – Ensembl , май 2017 г. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026313 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Jump up to: а б Грозингер К.М., Хассиг К.А., Шрайбер С.Л. (апрель 1999 г.). «Три белка определяют класс деацетилаз гистонов человека, родственных дрожжевому Hda1p» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (9): 4868–73. Бибкод : 1999PNAS...96.4868G . дои : 10.1073/pnas.96.9.4868 ПМК 21783 ПМИД 10220385 . ^ Фишле В., Эмилиани С., Хендзель М.Дж., Нагасе Т., Номура Н., Фельтер В., Вердин Э. (апрель 1999 г.). «Новое семейство деацетилаз гистонов человека, родственное Saccharomyces cerevisiae HDA1p» . Журнал биологической химии . 274 (17): 11713–20. дои : 10.1074/jbc.274.17.11713 ПМИД 10206986 . ^ «Ген Энтрез: деацетилаза гистонов HDAC4 4» . ^ Глениссон В., Кастроново В., Валтреньи Д. (октябрь 2007 г.). «Гистондеацетилаза 4 необходима для миофибробластной дифференцировки, индуцированной TGFbeta1» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1773 (10): 1572–82. дои : 10.1016/j.bbamcr.2007.05.016 ПМИД 17610967 . ^ Белок для зрения , Scientific American , 300 , 3 (март 2009 г.), стр. 23 ^ Чен Б., Чепко С.Л. (январь 2009 г.). «HDAC4 регулирует выживаемость нейронов в нормальной и больной сетчатке» . Наука . 323 (5911): 256–9. дои : 10.1126/science.1166226 . ПМЦ 3339762 ПМИД 19131628 . ^ Jump up to: а б Лемерсье С., Брокар М.П., Пувион-Дютиль Ф., Као Х.И., Альбагли О., Хохбин С. (июнь 2002 г.). «Деацетилазы гистонов класса II напрямую рекрутируются репрессором транскрипции BCL6» . Журнал биологической химии . 277 (24): 22045–52. дои : 10.1074/jbc.M201736200 ПМИД 11929873 . ^ Фариоли-Веккьоли С., Танори М., Микели Л., Манкузо М., Леонарди Л., Саран А., Чиотти М.Т., Ферретти Е., Гулино А., Паццалья С., Тироне Ф (июль 2007 г.). «Ингибирование онкогенеза медуллобластомы антипролиферативным и продифференциативным геном PC3» . Журнал ФАСЭБ . 21 (9): 2215–25. дои : 10.1096/fj.06-7548com ПМИД 17371797 . S2CID 4974360 . ^ Микели Л., Д'Андреа Г., Леонарди Л., Тироне Ф. (июль 2017 г.). «HDAC1, HDAC4 и HDAC9 связываются с PC3/Tis21/Btg2 и необходимы для ингибирования прогрессирования клеточного цикла и экспрессии циклина D1» (PDF) . Журнал клеточной физиологии . 232 (7): 1696–1707. дои : 10.1002/jcp.25467 . ПМИД 27333946 . S2CID 4070837 . ^ Чжан С.Л., McKinsey Т.А., Олсон Э.Н. (октябрь 2002 г.). «Ассоциация деацетилаз гистонов класса II с белком гетерохроматина 1: потенциальная роль метилирования гистонов в контроле дифференцировки мышц» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (20): 7302–12. дои : 10.1128/mcb.22.20.7302-7312.2002 . ПМК 139799 ПМИД 12242305 . ^ Ватамото К., Товатари М., Одзава Ю., Мията Ю., Окамото М., Абэ А., Наоэ Т., Сайто Х. (декабрь 2003 г.). «Измененное взаимодействие HDAC5 с GATA-1 во время дифференцировки клеток MEL» . Онкоген . 22 (57): 9176–84. дои : 10.1038/sj.onc.1206902 PMID 14668799 . ^ Jump up to: а б с Фишле В., Декиедт Ф., Хендзель М.Дж., Гюнтер М.Г., Лазар М.А., Фельтер В., Вердин Э. (январь 2002 г.). «Ферментативная активность, связанная с HDAC класса II, зависит от мультибелкового комплекса, содержащего HDAC3 и SMRT/N-CoR». Молекулярная клетка . 9 (1): 45–57. дои : 10.1016/s1097-2765(01)00429-4 . hdl : 11858/00-001M-0000-002C-9FF9-9 ПМИД 11804585 . ^ Jump up to: а б с Грозингер CM, Шрайбер С.Л. (июль 2000 г.). «Регуляция деацетилазы гистонов 4 и 5 и транскрипционной активности посредством 14-3-3-зависимой клеточной локализации» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (14): 7835–40. Бибкод : 2000PNAS...97.7835G . дои : 10.1073/pnas.140199597 ПМК 16631 ПМИД 10869435 . ^ Фишле В., Декиедт Ф., Филлион М., Хендзель М.Дж., Фельтер В., Вердин Э. (сентябрь 2001 г.). «Активность деацетилазы гистонов HDAC7 человека связана с HDAC3 in vivo» . Журнал биологической химии . 276 (38): 35826–35. дои : 10.1074/jbc.M104935200 ПМИД 11466315 . ^ Jump up to: а б Чжоу X, Ричон В.М., Ван А.Х., Ян XJ, Рифкинд Р.А., Маркс П.А. (декабрь 2000 г.). «Гистондеацетилаза 4 связывается с киназами 1 и 2, регулируемыми внеклеточными сигналами, а ее клеточная локализация регулируется онкогенным Ras» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (26): 14329–33. Бибкод : 2000PNAS...9714329Z . дои : 10.1073/pnas.250494697 ЧВК 18918 ПМИД 11114188 . ^ Ван А.Х., Бертос Н.Р., Везмар М., Пеллетье Н., Крозато М., Хенг Х.Х., Тинг Дж., Хан Дж., Ян XJ (ноябрь 1999 г.). «HDAC4, деацетилаза гистонов человека, родственная дрожжевому HDA1, является корепрессором транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (11): 7816–27. дои : 10.1128/mcb.19.11.7816 . ПМЦ 84849 ПМИД 10523670 . ^ Ван А.Х., Ян XJ (сентябрь 2001 г.). «Гистондеацетилаза 4 обладает собственными сигналами ядерного импорта и экспорта» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (17): 5992–6005. дои : 10.1128/mcb.21.17.5992-6005.2001 . ПМЦ 87317 ПМИД 11486037 . ^ Миска Э.А., Карлссон С., Лэнгли Э., Нильсен С.Дж., Пайнс Дж., Кузаридес Т. (сентябрь 1999 г.). «Деацетилаза HDAC4 связывается с фактором транскрипции MEF2 и подавляет его» . Журнал ЭМБО . 18 (18): 5099–107. дои : 10.1093/emboj/18.18.5099 . ПМК 1171580 ПМИД 10487761 . ^ Лемерсье С., Вердель А., Галлу Б., Курте С., Брокар М.П., Хохбин С. (май 2000 г.). «Деацетилаза гистонов mHDA1/HDAC5 взаимодействует с транскрипционной активностью MEF2A и подавляет ее» (PDF) . Журнал биологической химии . 275 (20): 15594–9. дои : 10.1074/jbc.M908437199 ПМИД 10748098 . S2CID 39220205 . ^ Jump up to: а б Хуан Э.Ю., Чжан Дж., Миска Э.А., Гюнтер М.Г., Кузаридес Т., Лазар М.А. (январь 2000 г.). «Корепрессоры ядерных рецепторов сотрудничают с деацетилазами гистонов класса II в Sin3-независимом пути репрессии» . Гены и развитие . 14 (1): 45–54. дои : 10.1101/gad.14.1.45 . ПМК 316335 ПМИД 10640275 . ^ Франко П.Дж., Ли Г., Вэй Л.Н. (август 2003 г.). «Взаимодействие ДНК-связывающих доменов ядерного рецептора цинкового пальца с деацетилазой гистонов». Молекулярная и клеточная эндокринология . 206 (1–2): 1–12. дои : 10.1016/s0303-7207(03)00254-5 . ПМИД 12943985 . S2CID 19487189 . ^ Франко П.Дж., Фаруки М., Сето Э., Вэй Л.Н. (август 2001 г.). «Осиротный ядерный рецептор TR2 напрямую взаимодействует с деацетилазами гистонов как класса I, так и класса II» . Молекулярная эндокринология . 15 (8): 1318–28. дои : 10.1210/mend.15.8.0682 ПМИД 11463856 . ^ Миска Э.А., Лэнгли Э., Вольф Д., Карлссон С., Пайнс Дж., Кузаридес Т. (август 2001 г.). «Дифференциальная локализация HDAC4 управляет мышечной дифференцировкой» . Исследования нуклеиновых кислот . 29 (16): 3439–47. дои : 10.1093/нар/29.16.3439 . ПМК 55849 ПМИД 11504882 . ^ Шошеро А., Матье М., де Сениньон Ж., Феррейра Р., Причард Л.Л., Мишаль З., Дежан А., Арель-Беллан А. (ноябрь 2004 г.). «HDAC4 опосредует репрессию транскрипции с помощью белка PLZF, связанного с острым промиелоцитарным лейкозом» . Онкоген . 23 (54): 8777–84. дои : 10.1038/sj.onc.1208128 ПМИД 15467736 . Пазин М.Ю., Кадонага Дж.Т. (май 1997 г.). «Что происходит с деацетилированием и транскрипцией гистонов?» . Клетка . 89 (3): 325–8. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80211-1 ПМИД 9150131 . S2CID 11488594 . Вердин Э., Декьедт Ф., Каслер Х.Г. (май 2003 г.). «Деацетилазы гистонов класса II: универсальные регуляторы». Тенденции в генетике . 19 (5): 286–93. дои : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . hdl : 2268/80861 ПМИД 12711221 . Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 . Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В., Рикафренте Дж.Ю., Вентланд М.А., Леннон Дж., Гиббс Р.А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 ПМИД 9110174 . Вольф А.П. (май 1997 г.). «Транскрипционный контроль. Греховная репрессия» . Природа . 387 (6628): 16–7. дои : 10.1038/387016a0 ПМИД 9139815 . S2CID 29803420 . Охара О, Нагасе Т, Исикава К, Накадзима Д, Охира М, Секи Н, Номура Н (февраль 1997 г.). «Создание и характеристика библиотек кДНК головного мозга человека, подходящих для анализа клонов кДНК, кодирующих относительно большие белки» . Исследование ДНК . 4 (1): 53–9. дои : 10.1093/dnares/4.1.53 ПМИД 9179496 . Фишле В., Эмилиани С., Хендзель М.Дж., Нагасе Т., Номура Н., Фельтер В., Вердин Э. (апрель 1999 г.). «Новое семейство деацетилаз гистонов человека, родственное Saccharomyces cerevisiae HDA1p» . Журнал биологической химии . 274 (17): 11713–20. дои : 10.1074/jbc.274.17.11713 ПМИД 10206986 . Грозингер К.М., Хассиг К.А., Шрайбер С.Л. (апрель 1999 г.). «Три белка определяют класс деацетилаз гистонов человека, родственных дрожжевому Hda1p» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (9): 4868–73. Бибкод : 1999PNAS...96.4868G . дои : 10.1073/pnas.96.9.4868 ПМК 21783 ПМИД 10220385 . Миска Э.А., Карлссон С., Лэнгли Э., Нильсен С.Дж., Пайнс Дж., Кузаридес Т. (сентябрь 1999 г.). «Деацетилаза HDAC4 связывается с фактором транскрипции MEF2 и подавляет его» . Журнал ЭМБО . 18 (18): 5099–107. дои : 10.1093/emboj/18.18.5099 . ПМК 1171580 ПМИД 10487761 . Ван А.Х., Бертос Н.Р., Везмар М., Пеллетье Н., Крозато М., Хенг Х.Х., Тинг Дж., Хан Дж., Ян XJ (ноябрь 1999 г.). «HDAC4, деацетилаза гистонов человека, родственная дрожжевому HDA1, является корепрессором транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (11): 7816–27. дои : 10.1128/mcb.19.11.7816 . ПМЦ 84849 ПМИД 10523670 . Юн Х.Д., Грозингер С.М., Лю ДЖО (июль 2000 г.). «Кальций регулирует репрессию транскрипции фактора-энхансера 2 миоцитов с помощью деацетилазы гистонов 4» . Журнал биологической химии . 275 (29): 22563–7. дои : 10.1074/jbc.C000304200 ПМИД 10825153 . Грозингер CM, Шрайбер С.Л. (июль 2000 г.). «Регуляция деацетилазы гистонов 4 и 5 и транскрипционной активности посредством 14-3-3-зависимой клеточной локализации» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (14): 7835–40. Бибкод : 2000PNAS...97.7835G . дои : 10.1073/pnas.140199597 ПМК 16631 ПМИД 10869435 . Хюинь К.Д., Фишле В., Вердин Э., Бардуэлл В.Дж. (июль 2000 г.). «BCoR, новый корепрессор, участвующий в репрессии BCL-6» . Гены и развитие . 14 (14): 1810–23. дои : 10.1101/gad.14.14.1810 . ПМК 316791 ПМИД 10898795 . Ли Дж., Ван Дж., Ван Дж., Наваз З., Лю Дж. М., Цинь Дж., Вонг Дж. (август 2000 г.). «Оба корепрессорных белка SMRT и N-CoR существуют в больших белковых комплексах, содержащих HDAC3» . Журнал ЭМБО . 19 (16): 4342–50. дои : 10.1093/emboj/19.16.4342 . ПМК 302030 ПМИД 10944117 . Ван А.Х., Круглак М.Дж., Ву Дж., Бертос Н.Р., Везмар М., Познер Б.И., Базетт-Джонс Д.П., Ян XJ (сентябрь 2000 г.). «Регуляция деацетилазы гистонов 4 путем связывания белков 14-3-3» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (18): 6904–12. дои : 10.1128/MCB.20.18.6904-6912.2000 . ПМЦ 88766 ПМИД 10958686 . Чжан С.Л., McKinsey Т.А., Лу Дж.Р., Олсон Э.Н. (январь 2001 г.). «Ассоциация COOH-концевого связывающего белка (CtBP) и репрессора транскрипции, взаимодействующего с MEF2 (MITR), способствует репрессии транскрипции фактора транскрипции MEF2» . Журнал биологической химии . 276 (1): 35–9. дои : 10.1074/jbc.M007364200 ПМИД 11022042 . McKinsey Т.А., Чжан С.Л., Лу Дж., Олсон Э.Н. (ноябрь 2000 г.). «Сигналзависимый ядерный экспорт деацетилазы гистонов регулирует дифференцировку мышц» . Природа . 408 (6808): 106–11. Бибкод : 2000Natur.408..106M . дои : 10.1038/35040593 . ПМЦ 4459600 ПМИД 11081517 . Чжоу X, Ричон В.М., Ван А.Х., Ян XJ, Рифкинд Р.А., Маркс П.А. (декабрь 2000 г.). «Гистондеацетилаза 4 связывается с киназами 1 и 2, регулируемыми внеклеточными сигналами, а ее клеточная локализация регулируется онкогенным Ras» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (26): 14329–33. Бибкод : 2000PNAS...9714329Z . дои : 10.1073/pnas.250494697 ЧВК 18918 ПМИД 11114188 . McKinsey Т.А., Чжан С.Л., Олсон Э.Н. (декабрь 2000 г.). «Активация транскрипционного фактора фактора-2 усилителя миоцитов путем стимулирования кальций/кальмодулин-зависимой протеинкиназой связывания 14-3-3 с деацетилазой гистонов 5» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (26): 14400–5. Бибкод : 2000PNAS...9714400M . дои : 10.1073/pnas.260501497 ЧВК 18930 ПМИД 11114197 . Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
показывать Активность Регулирование Классификация Кинетика Типы
