GCM1

GCM1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1ODH
Идентификаторы
Псевдонимы	GCM1 , GCMA, hGCMa, в глиальных клетках отсутствует гомолог 1, в глиальных клетках отсутствует фактор транскрипции 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 603715 ; МГИ : 108045 ; Гомологен : 2702 ; Генные карты : GCM1 ; ОМА : GCM1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p12.1 Start 53,126,961 bp End 53,148,841 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 9 (mouse) Band 9 E1|9 43.49 cM Start 77,959,206 bp End 77,972,906 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in placenta decidua testicle sperm blood kidney tubule human kidney islet of Langerhans white blood cell metanephros Top expressed in syncytiotrophoblast embryo proximal tubule right kidney yolk sac trophoblast giant cell lumbar spinal ganglion human kidney metanephros More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function DNA binding DNA-binding transcription factor activity zinc ion binding DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific transcription factor binding histone deacetylase binding metal ion binding RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding protein binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Cellular component transcription regulator complex nucleus Biological process regulation of transcription, DNA-templated anatomical structure morphogenesis positive regulation of syncytium formation by plasma membrane fusion transcription by RNA polymerase II transcription, DNA-templated multicellular organism development branching involved in labyrinthine layer morphogenesis astrocyte fate commitment positive regulation of transcription by RNA polymerase II gliogenesis regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development cell differentiation involved in embryonic placenta development Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 8521 14531 Вместе ENSG00000137270 ENSMUSG00000023333 ЮниПрот Q9NP62 P70348 RefSeq (мРНК) НМ_003643 НМ_008103 RefSeq (белок) НП_003634 НП_032129 Местоположение (UCSC) Чр 6: 53,13 – 53,15 Мб Chr 9: 77,96 – 77,97 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Хорионспецифический транскрипционный фактор GCMa представляет собой белок , который у человека кодируется GCM1 геном .

Этот ген кодирует ДНК-связывающий белок с мотивом gcm ( мотив отсутствия глиальных клеток ). Кодируемый белок является гомологом отсутствующего гена глиальных клеток дрозофилы (gcm). Этот белок связывается с GCM-мотивом (A/G)CCCGCAT, новой последовательностью среди известных мишеней ДНК-связывающих белков. N-концевой ДНК-связывающий домен придает этому белку уникальную ДНК-связывающую активность.

Дальнейшее чтение

• Ямада К., Огава Х., Хонда С. и др. (1999). «Белок мотива GCM участвует в плацентарно-специфической экспрессии гена ароматазы человека» . Ж. Биол. Хим . 274 (45): 32279–86. дои : 10.1074/jbc.274.45.32279 . ПМИД   10542267 .
• Найт-Умесмар Б., Копперман А.Б., Лаццарини Р.А. (2000). «Плацентарная экспрессия и хромосомная локализация гена Gcm 1 человека» . Дж. Гистохим. Цитохим . 48 (7): 915–22. дои : 10.1177/002215540004800704 . ПМИД   10858268 .
• Ямада К., Огава Х., Тамия Г. и др. (2001). «Геномная организация, хромосомная локализация и полная последовательность ДНК длиной 22 т.п.н. человеческого GCMa/GCM1, гена плацентарно-специфического транскрипционного фактора». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 278 (1): 134–9. дои : 10.1006/bbrc.2000.3775 . ПМИД   11071865 .
• Ю С., Шен К., Лин М. и др. (2003). «GCMa регулирует синцитин-опосредованное слияние трофобластов» . Ж. Биол. Хим . 277 (51): 50062–8. дои : 10.1074/jbc.M209316200 . ПМИД   12397062 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека» . Природа . 425 (6960): 805–11. Бибкод : 2003Natur.425..805M . дои : 10.1038/nature02055 . ПМИД   14574404 .
• Чен С.П., Чен С.И., Ян Ю.К. и др. (2005). «Снижение экспрессии гена плацентарного GCM1 (отсутствие глиальных клеток) при преэклампсии». Плацента . 25 (5): 413–21. дои : 10.1016/j.placenta.2003.10.014 . ПМИД   15081636 .
• Бачик Д., Саткунаратнам А., Найт-Умесмар Б. и др. (2004). «Сложные структуры мРНК и белка GCM1 в ворсинчатых и вневорсинчатых клетках трофобласта плаценты человека». Плацента . 25 (6): 553–9. дои : 10.1016/j.placenta.2003.12.004 . ПМИД   15135239 .
• Шуберт С.В., Кардаш Э., Хан М.А. и др. (2005). «Взаимодействие, совместная модуляция промотора и почечная колокализация GCMa и Pitx2» . Ж. Биол. Хим . 279 (48): 50358–65. дои : 10.1074/jbc.M404587200 . ПМИД   15385555 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Ян К.С., Ю С., Чуанг Х.К. и др. (2005). «FBW2 нацеливает GCMa на систему деградации убиквитин-протеасома» . Ж. Биол. Хим . 280 (11): 10083–90. дои : 10.1074/jbc.M413986200 . ПМИД   15640526 .
• Кнерр И., Шуберт С.В., Вич С. и др. (2005). «Стимуляция GCMa и синцитина посредством цАМФ-опосредованной передачи сигналов PKA в трофобластических клетках человека в нормоксичных и гипоксических условиях». ФЭБС Летт . 579 (18): 3991–8. дои : 10.1016/j.febslet.2005.06.029 . ПМИД   16004993 . S2CID   46648257 .
• Чанг К.В., Чуанг Х.К., Ю С. и др. (2005). «Стимуляция транскрипционной активности GCMa с помощью передачи сигналов циклического АМФ/протеинкиназы А объясняется CBP-опосредованным ацетилированием GCMa» . Мол. Клетка. Биол . 25 (19): 8401–14. дои : 10.1128/MCB.25.19.8401-8414.2005 . ПМЦ   1265739 . ПМИД   16166624 .
• Чуанг Х.К., Чанг К.В., Чанг Г.Д. и др. (2006). «Гистондеацетилаза 3 связывается с фактором транскрипции GCMa и регулирует его» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (5): 1459–69. дои : 10.1093/нар/gkl048 . ПМК   1401512 . ПМИД   16528103 .
• Фудзито Н., Самура О., Михару Н. и др. (2007). «Повышение уровня мРНК в плазме плацентарно-специфического 1 (PLAC1) и 1, отсутствующего в глиальных клетках (GCM1) у матерей с преэклампсией». Хиросима Дж. Мед. Наука . 55 (1): 9–15. ПМИД   16594548 .
• Чжоу С.С., Чанг С., Лю Дж.Х. и др. (2007). «Небольшая модификация убиквитиноподобного модификатора регулирует ДНК-связывающую активность глиальных клеток, в которых отсутствует гомолог а дрозофилы». Ж. Биол. Хим . 282 (37): 27239–49. дои : 10.1074/jbc.M700351200 . ПМИД   17646165 .