Домен BTB/POZ
| Домен BTB/POZ | |||
|---|---|---|---|
 Структура домена BTB от PLZF. [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | БТБ | ||
| Пфам | PF00651 | ||
| ИнтерПро | ИПР013069 | ||
| PROSITE | PS50097 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1буо / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
Домен BTB/POZ (BTB для BR-C, ttk и bab [ 2 ] или POZ для вируса оспы и цинкового пальца [ 3 ] ) — структурный домен , обнаруженный в белках домена Eukarya . [ 4 ] Учитывая его распространенность у эукариот и отсутствие у архей и бактерий , он, вероятно, возник после возникновения эукариот. [ 5 ] Хотя в первую очередь это домен межбелкового взаимодействия, [ 5 ] некоторые домены BTB обладают дополнительной функциональностью в регуляции транскрипции , [ 6 ] подвижность цитоскелета , [ 7 ] белков , убиквитинирование и деградация [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] ионных каналов . формирование и функционирование [ 11 ] Домены BTB традиционно классифицируются по другим структурным особенностям, присутствующим в белке. [ 4 ]
Открытие
[ редактировать ]Домен BTB/POZ был впервые описан двумя независимыми исследовательскими группами в 1994 году. Исследователи из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе обнаружили консервативный мотив из 115 аминокислот в девяти белках дрозофилы, включая комплекс Broad, трамвай и безделушки, и назвали консервативный участок Домен BTB. [ 2 ] В то же время группа из лабораторий Имперского фонда исследования рака в Лондоне обнаружила один и тот же мотив из 120 аминокислот в наборе других неродственных белков цинковых пальцев и наборе белков вируса оспы и, таким образом, назвала эту область доменом POZ. [ 3 ]
Структура
[ редактировать ]Длина мотива альфа составляет около 120 аминокислот , а ядро состоит из 95 аминокислот, которые образуют пять -спиралей и три бета-листа . [ 4 ] Альфа-спирали образуют две шпильковые структуры, А1/А2 и А4/А5, из первой и второй, а также четвертой и пятой альфа-спиралей соответственно. Оставшаяся альфа-спираль, А3, соединяет их. Три бета-листа завершают шпильку A1/A2. [ 4 ] Дополнительные вторичные структуры могут окружать эту центральную складку. Например, домены BTB в белках Кельха , белках с цинковыми пальцами C2H2 и HTH -содержащих белках часто включают дополнительную альфа-спираль и бета-лист на N-конце домена. [ 12 ]
Функция
[ редактировать ]Домен BTB представляет собой прежде всего домен межбелкового взаимодействия. В белках с цинковыми пальцами он обычно образует гомодимеры с другими BTB-доменами, опосредует гетеромерную димеризацию и рекрутирует транскрипционные корепрессоры . [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ахмад К.Ф., Энгель К.К., Приве Г.Г. (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура домена BTB из PLZF» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (21): 12123–12128. Бибкод : 1998PNAS...9512123F . дои : 10.1073/pnas.95.21.12123 . ПМК 22795 . ПМИД 9770450 .
- ^ Jump up to: а б Золлман С., Годт Д., Приве Г.Г., Кудерк Дж.Л., Ласки Ф.А. (октябрь 1994 г.). «Домен BTB, обнаруженный в основном в белках цинковых пальцев, определяет эволюционно консервативное семейство, которое включает в себя несколько генов, регулируемых развитием у дрозофилы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (22): 10717–10721. Бибкод : 1994PNAS...9110717Z . дои : 10.1073/pnas.91.22.10717 . ПМК 45093 . ПМИД 7938017 .
- ^ Jump up to: а б Бардуэлл В.Дж., Трейсман Р. (июль 1994 г.). «Домен POZ: консервативный мотив межбелкового взаимодействия» . Гены и развитие . 8 (14): 1664–1677. дои : 10.1101/gad.8.14.1664 . ПМИД 7958847 . S2CID 27334252 .
- ^ Jump up to: а б с д Стогиос П.Дж., Даунс Г.С., Джаухал Дж.Дж., Нандра С.К., Приве Г.Г. (15 сентября 2005 г.). «Последовательность и структурный анализ белков домена BTB» . Геномная биология . 6 (10): Р82. дои : 10.1186/gb-2005-6-10-r82 . ПМЦ 1257465 . ПМИД 16207353 .
- ^ Jump up to: а б с Перес-Торрадо Р., Ямада Д., Дефосс П.А. (декабрь 2006 г.). «Рожденный для связывания: домен белок-белкового взаимодействия BTB». Биоэссе . 28 (12): 1194–1202. дои : 10.1002/bies.20500 . ПМИД 17120193 . S2CID 23248814 .
- ^ Мельник А., Ахмад К.Ф., Араи С., Полингер А., Болл Х., Борден К.Л. и др. (сентябрь 2000 г.). «Углубленный мутационный анализ домена BTB/POZ с цинковым пальцем промиелоцитарного лейкоза выявляет мотивы и остатки, необходимые для биологических и транскрипционных функций» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (17): 6550–6567. дои : 10.1128/MCB.20.17.6550-6567.2000 . ПМЦ 86130 . ПМИД 10938130 .
- ^ Бомонт П., Кавалер Л., Блондо Ф., Бен Хамида С., Белал С., Тазир М. и др. (ноябрь 2000 г.). «Ген, кодирующий гигаксонин, новый член семейства цитоскелетных повторов BTB/kelch, мутирует при гигантской аксональной нейропатии». Природная генетика . 26 (3): 370–374. дои : 10.1038/81701 . ПМИД 11062483 . S2CID 2917153 .
- ^ Фурукава М., Хэ Ю.Дж., Борчерс К., Сюн Ю. (ноябрь 2003 г.). «Нацеливание на убиквитинирование белка с помощью убиквитинлигазы BTB-Cullin 3-Roc1». Природная клеточная биология . 5 (11): 1001–1007. дои : 10.1038/ncb1056 . ПМИД 14528312 . S2CID 22937928 .
- ^ Пинтард Л., Уиллис Дж.Х., Виллемс А., Джонсон Дж.Л., Страйко М., Курц Т. и др. (сентябрь 2003 г.). «Белок BTB MEL-26 представляет собой субстрат-специфичный адаптер убиквитин-лигазы CUL-3». Природа . 425 (6955): 311–316. Бибкод : 2003Natur.425..311P . дои : 10.1038/nature01959 . ПМИД 13679921 . S2CID 4425748 .
- ^ Гейер Р., Ви С., Андерсон С., Йейтс Дж., Вольф Д.А. (сентябрь 2003 г.). «Белки домена BTB/POZ являются предполагаемыми адаптерами субстрата для кулин-3-убиквитинлигазы» . Молекулярная клетка . 12 (3): 783–790. дои : 10.1016/s1097-2765(03)00341-1 . ПМИД 14527422 .
- ^ Минор Д.Л., Лин Ю.Ф., Мобли BC, Авелар А., Ян Ю.Н., Ян Л.И., Бергер Дж.М. (сентябрь 2000 г.). «Полярный интерфейс Т1 связан с конформационными изменениями, которые открывают потенциалзависимый калиевый канал» . Клетка . 102 (5): 657–670. дои : 10.1016/s0092-8674(00)00088-x . ПМИД 11007484 . S2CID 776305 .
- ^ Бончук А., Балагуров К., Георгиев П. (февраль 2023 г.). «Домены BTB: структурный взгляд на эволюцию, мультимеризацию и белок-белковые взаимодействия». Биоэссе . 45 (2): e2200179. дои : 10.1002/bies.202200179 . ПМИД 36449605 . S2CID 254122488 .