HMG-коробка
| Коробка HMG (группа высокой мобильности) | |||
|---|---|---|---|
 ЯМР-структура HMG-бокс-домена белка LEF1 (радужный цвет, N-конец = синий, С-конец = красный) в комплексе с ДНК (коричневый) на основе координат PDB : 2LEF . | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | PF00505 | ||
| Пфам | PF00505 | ||
| ИнтерПро | ИПР009071 | ||
| СКОП2 | 1hsm / SCOPe / СУПФАМ | ||
| |||
В молекулярной биологии HMG -бокс ( высокой подвижности групповой блок связывании ) представляет собой белковый домен , который участвует в ДНК . [1] Домен состоит примерно из 75 аминокислотных остатков, которые в совокупности опосредуют связывание ДНК с белками группы высокой подвижности, ассоциированными с хроматином. HMG-боксы присутствуют во многих факторах транскрипции и комплексах ремоделирования хроматина, где они могут опосредовать не-последовательность или специфичное для последовательности связывание ДНК. [2]
Структура
[ редактировать ]Структура домена HMG-box содержит три альфа-спирали, разделенные петлями (см. рисунок справа). [3]
Функция
[ редактировать ]Белки, содержащие HMG-бокс, связывают только конформации ДНК не B-типа (перекрученные или размотанные) с высоким сродством. [1] Домены HMG-бокса обнаружены в некоторых группах белков с высокой подвижностью, которые участвуют в регуляции ДНК-зависимых процессов, таких как , репликация и репарация ДНК , все из которых требуют изменения конформации хроматина транскрипция . [3] Белки HMG с одинарным и двойным ящиком изменяют архитектуру ДНК, вызывая изгибы при связывании. [4] [5]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б Строс М., Лаунхолт Д., Грассер К.Д. (октябрь 2007 г.). «HMG-бокс: универсальный белковый домен, встречающийся в самых разных ДНК-связывающих белках» . Клетка. Мол. Наука о жизни . 64 (19–20): 2590–606. дои : 10.1007/s00018-007-7162-3 . ПМЦ 11136187 . ПМИД 17599239 . S2CID 28156847 .
- ^ Штрос, М.; Лаунхольт, Д.; Грассер, К.Д. (октябрь 2007 г.). «HMG-бокс: универсальный белковый домен, встречающийся в самых разных ДНК-связывающих белках» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 64 (19–20): 2590–2606. дои : 10.1007/s00018-007-7162-3 . ПМЦ 11136187 . ПМИД 17599239 . Проверено 18 февраля 2023 г.
- ^ Перейти обратно: а б Томас Дж.О. (август 2001 г.). «HMG1 и 2: архитектурные ДНК-связывающие белки». Биохим. Соц. Транс . 29 (Часть 4): 395–401. дои : 10.1042/BST0290395 . ПМИД 11497996 .
- ^ Д. Муругесапиллай и др ., Соединение мостиков и петель ДНК с помощью HMO1 обеспечивает механизм стабилизации безнуклеосомного хроматина , Nucleic Acids Res (2014) 42 (14): 8996-9004.
- ^ Д. Муругесапиллай и др. , Одномолекулярные исследования высокомобильных белков, изгибающих архитектурную ДНК группы B , Biophys Rev (2016) doi: 10.1007/s12551-016-0236-4
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Домены HMG-Box Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)
 | Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |