НФИК

НФИК
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1N1J, 4AWL, 4CSR
Идентификаторы
Псевдонимы	NFYC , CBF-C, CBFC, H1TF2A, HAP5, HSM, NF-YC, субъединица гамма Y фактора ядерной транскрипции.
Внешние идентификаторы	Опустить : 605344 ; МГИ : 107901 ; Гомологен : 7440 ; GeneCards : NFYC ; OMA : NFYC — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	40,771,603 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	120,688,769 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; apex of heart; ; muscle of thigh; ; monocyte; ; tendon of biceps brachii; ; right lobe of thyroid gland; ; right auricle; ; gastrocnemius muscle; ; ganglionic eminence; ; skin of abdomen;
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; zygote; ; primary oocyte; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; thymus; ; heart; ; cerebellar cortex; ; bone marrow; ; olfactory bulb;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA binding; transcription coactivator activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; protein heterodimerization activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; transcription factor binding; sequence-specific DNA binding;
Cellular component	CCAAT-binding factor complex; protein-DNA complex; nucleus; nucleoplasm; RNA polymerase II transcription regulator complex;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; protein folding; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of cholesterol biosynthetic process; negative regulation of transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	4802
	18046
	ENSG00000066136
	ENSMUSG00000032897
	Q13952
	P70353
показывать НМ_001142587 ; НМ_001142588 ; НМ_001142589 ; НМ_001142590 ; НМ_001308114 ;
	NM_001308115; NM_014223
показывать НМ_001048168 ; НМ_001277095 ; НМ_008692 ; НМ_001357192 ; НМ_001357193 ;
	NM_001357194
показывать НП_001136059 ; НП_001136060 ; НП_001136061 ; НП_001136062 ; НП_001295043 ;
	NP_001295044; NP_055038
показывать НП_001041633 ; НП_001264024 ; НП_032718 ; НП_001344121 ; НП_001344122 ;
	NP_001344123
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица гамма-фактора ядерной транскрипции Y представляет собой белок , который у человека кодируется NFYC геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой одну субъединицу тримерного комплекса, образующего высококонсервативный фактор транскрипции , который с высокой специфичностью связывается с мотивами CCAAT в промоторных областях различных генов. Этот генный продукт, субъединица C, образует плотный димер с субъединицей B ( NFYB субъединицы A ( NFYA ), что является предпосылкой для ассоциации ). Полученный тример связывается с ДНК с высокой специфичностью и сродством. Каждая из субъединиц B и C содержит гистон- подобный мотив. Наблюдение за гистоновой природой этих субъединиц подтверждается двумя типами доказательств; выравнивание последовательностей белков и эксперименты с мутантами. Дополнительная регуляция, предварительно подтвержденная базой данных EST, может быть представлена альтернативным сплайсингом в этой субъединице. ^[7]

Две микроРНК ; миР-30c и миР-30е расположены внутри интронов гена nfyc . Эти микроРНК активно транскрибируются в бета-клетках , продуцирующих инсулин человека , в островках поджелудочной железы , которые также демонстрируют высокую экспрессию генов nfyc и CDH1 . Экспрессия этих интронных микроРНК необходима для поддержания дифференцированного фенотипа островковых бета-клеток человека. Ингибирование микроРНК семейства miR-30 индуцирует эпителиально-мезенхимальный переход островковых клеток поджелудочной железы человека. ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что NFYC взаимодействует с Myc . ^[9]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000066136 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032897 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Синха С., Майти С.Н., Селдин М.Ф., де Кромбрюг Б. (февраль 1997 г.). «Хромосомное распределение и тканевая экспрессия CBF-C/NFY-C, третьей субъединицы CCAAT-связывающего фактора млекопитающих». Геномика . 37 (2): 260–3. дои : 10.1006/geno.1996.0555 . ПМИД 8921405 .
^ Беллорини М., Земзуми К., Фарина А., Бертельсен Дж., Пьяджио Дж., Мантовани Р. (август 1997 г.). «Клонирование и экспрессия человеческого NF-YC». Джин . 193 (1): 119–25. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00109-1 . ПМИД 9249075 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: ядерный фактор транскрипции NFYC Y, гамма» .
^ Джоглекар М.В., Патил Д., Джоглекар В.М., Рао Г.В., Редди Д.Н., Митнала С., Шуш Й., Хардикар А.А. (сентябрь – октябрь 2009 г.). «МикроРНК семейства miR-30 придают эпителиальный фенотип клеткам поджелудочной железы человека» . Островки . 1 (2): 137–147. дои : 10.4161/isl.1.2.9578 . ПМИД 21099261 .
^ Тайра Т., Савай М., Икеда М., Тамаи К., Игучи-Арига С.М., Арига Х. (август 1999 г.). «Зависимое от клеточного цикла переключение повышающей и понижающей регуляции экспрессии гена hsp70 человека путем взаимодействия между c-Myc и CBF/NF-Y» . Ж. Биол. Хим . 274 (34): 24270–9. дои : 10.1074/jbc.274.34.24270 . ПМИД 10446203 .

Дальнейшее чтение

Мантовани Р. (1999). «Молекулярная биология CCAAT-связывающего фактора NF-Y». Джин . 239 (1): 15–27. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00368-6 . ПМИД 10571030 .
Мартинелли Р., Хайнц Н. (1994). «H1TF2A, большая субъединица гетеродимерного, богатого глутамином CCAAT-связывающего транскрипционного фактора, участвующего в регуляции клеточного цикла гистона H1» . Мол. Клетка. Биол . 14 (12): 8322–32. дои : 10.1128/mcb.14.12.8322 . ПМК 359371 . ПМИД 7969168 .
Накшатри Х, Бхат-Накшатри П, Карри Р.А. (1997). «Ассоциация субъединиц и ДНК-связывающая активность гетеротримерного транскрипционного фактора NF-Y регулируются клеточным окислительно-восстановительным процессом» . Ж. Биол. Хим . 271 (46): 28784–91. дои : 10.1074/jbc.271.46.28784 . hdl : 1805/18866 . ПМИД 8910521 .
Дмитренко В, Гарифулин О, Кавсан В (1997). «Выделение и анализ последовательности кДНК, кодирующей субъединицу C CCAAT-связывающего транскрипционного фактора человека». Джин . 197 (1–2): 161–3. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00255-2 . ПМИД 9332362 .
Карри Р.А. (1998). «Функциональное взаимодействие между доменом тримеризации ДНК-связывающей субъединицы NF-Y и белком группы высокой подвижности HMG-I (Y)» . Ж. Биол. Хим . 272 (49): 30880–8. дои : 10.1074/jbc.272.49.30880 . ПМИД 9388234 .
Тайра Т., Савай М., Икеда М., Тамаи К., Игучи-Арига С.М., Арига Х. (1999). «Зависимое от клеточного цикла переключение повышающей и понижающей регуляции экспрессии гена hsp70 человека путем взаимодействия между c-Myc и CBF/NF-Y» . Ж. Биол. Хим . 274 (34): 24270–9. дои : 10.1074/jbc.274.34.24270 . ПМИД 10446203 .
Ёсида Х, Окада Т, Хейз К, Янаги Х, Юра Т, Негиши М, Мори К (2001). «Стресс эндоплазматического ретикулума формирует комплекс транскрипционных факторов ERSF, включая NF-Y (CBF) и активирующие транскрипционные факторы 6альфа и 6бета, которые активируют реакцию развернутого белка млекопитающих» . Мол. Клетка. Биол . 21 (4): 1239–48. дои : 10.1128/MCB.21.4.1239-1248.2001 . ПМК 99577 . ПМИД 11158310 .
Изуми Х., Моландер С., Пенн Л.З., Исисаки А., Коно К., Фуна К. (2001). «Механизм репрессии транскрипции c-Myc на бета-рецепторе PDGF». Дж. Клеточная наука . 114 (Часть 8): 1533–44. дои : 10.1242/jcs.114.8.1533 . ПМИД 11282029 .
Чен Ф., Огава К., Лю Х, Стрингфилд Т.М., Чен Ю (2002). «Репрессия трансактивирующей активности Smad2 и Smad3 путем ассоциации с новым сплайсинговым вариантом субъединицы CCAAT-связывающего фактора C» . Биохим. Дж . 364 (Часть 2): 571–7. дои : 10.1042/BJ20011703 . ПМЦ 1222603 . ПМИД 12023901 .
Ромье С., Коккьярелла Ф., Мантовани Р., Морас Д. (2003). «Структура NF-YB/NF-YC дает представление о связывании ДНК и регуляции транскрипции с помощью фактора CCAAT NF-Y» . Ж. Биол. Хим . 278 (2): 1336–45. дои : 10.1074/jbc.M209635200 . ПМИД 12401788 .
Салси В., Каретти Г., Васнер М., Рейнхард В., Хаугвиц У., Энгеланд К., Мантовани Р. (2003). «Взаимодействие между p300 и несколькими тримерами NF-Y регулирует функцию промотора циклина B2» . Ж. Биол. Хим . 278 (9): 6642–50. дои : 10.1074/jbc.M210065200 . HDL : 11380/1202119 . ПМИД 12482752 .
Хиросе Т., Сова Ю., Такахаси С., Сайто С., Ясуда С., Шиндо Н., Фуруичи К., Сакаи Т. (2003). «p53-независимая индукция Gadd45 ингибитором гистондеацетилазы: координация регуляции с помощью факторов транскрипции Oct-1 и NF-Y». Онкоген . 22 (49): 7762–73. дои : 10.1038/sj.onc.1207091 . ПМИД 14586402 . S2CID 1826456 .
Чаттопадхьяй С., Хоук Д., Кобаяши Р., Майти С.Н. (2004). «Человеческий p32 взаимодействует с субъединицей B CCAAT-связывающего фактора, CBF/NF-Y, и ингибирует CBF-опосредованную активацию транскрипции in vitro» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (12): 3632–41. дои : 10.1093/nar/gkh692 . ПМЦ 484179 . ПМИД 15243141 .
Ван Б., Гао С., Пондер КП (2005). «C / EBPbeta способствует репликации гепатоцитов грызунов, индуцированной фактором роста гепатоцитов». Дж. Гепатол . 43 (2): 294–302. дои : 10.1016/j.jhep.2005.02.029 . ПМИД 15922473 .

Внешние ссылки

NFYC+белок,+человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000066136 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032897 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8921405-5] Синха С., Майти С.Н., Селдин М.Ф., де Кромбрюг Б. (февраль 1997 г.). «Хромосомное распределение и тканевая экспрессия CBF-C/NFY-C, третьей субъединицы CCAAT-связывающего фактора млекопитающих». Геномика . 37 (2): 260–3. дои : 10.1006/geno.1996.0555 . ПМИД 8921405 .

[pmid9249075-6] Беллорини М., Земзуми К., Фарина А., Бертельсен Дж., Пьяджио Дж., Мантовани Р. (август 1997 г.). «Клонирование и экспрессия человеческого NF-YC». Джин . 193 (1): 119–25. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00109-1 . ПМИД 9249075 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: ядерный фактор транскрипции NFYC Y, гамма» .

[Joglekar_2009-8] Джоглекар М.В., Патил Д., Джоглекар В.М., Рао Г.В., Редди Д.Н., Митнала С., Шуш Й., Хардикар А.А. (сентябрь – октябрь 2009 г.). «МикроРНК семейства miR-30 придают эпителиальный фенотип клеткам поджелудочной железы человека» . Островки . 1 (2): 137–147. дои : 10.4161/isl.1.2.9578 . ПМИД 21099261 .

[pmid10446203-9] Тайра Т., Савай М., Икеда М., Тамаи К., Игучи-Арига С.М., Арига Х. (август 1999 г.). «Зависимое от клеточного цикла переключение повышающей и понижающей регуляции экспрессии гена hsp70 человека путем взаимодействия между c-Myc и CBF/NF-Y» . Ж. Биол. Хим . 274 (34): 24270–9. дои : 10.1074/jbc.274.34.24270 . ПМИД 10446203 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]