ПАКС2
| ПАКС2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | PAX2 , PAPRS, FSGS7, спаренная коробка 2, PAX-2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 167409 ; МГИ : 97486 ; Гомологен : 2968 ; Генные карты : PAX2 ; ОМА : PAX2 — ортологи | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ген парного бокса 2 , также известный как Pax-2 , представляет собой белок , который у человека кодируется PAX2 геном . [5] [6]
Функция
[ редактировать ]Гены Pax, или гены, содержащие парные блоки, играют важную роль в развитии и пролиферации множества клеточных линий, развитии органов, а также развитии и организации центральной нервной системы. [7] Ген транскрипционного фактора PAX2 важен для регионального эмбриологического развития центральной нервной системы. У млекопитающих мозг развит в трех областях: переднем мозге, среднем мозге и заднем мозге. [8] Градиенты концентрации фактора роста фибробластов 8 (FGF8) и семейства сайтов интеграции MMTV бескрылого типа, член 1 (Wnt1) контролируют экспрессию Pax-2 во время развития среднего мозга или среднего мозга. [9] Подобный паттерн во время эмбриологического развития можно наблюдать у «базальных хордовых или асцидий», у которых организация центральной нервной системы у личинок асцидий также контролируется генами фактора роста фибробластов. [8] PAX2 кодирует фактор транскрипции, который, по-видимому, играет важную роль в организации областей среднего и заднего мозга и может быть обнаружен как можно раньше по обе стороны от ограничительной борозды, которая разделяет ядра двигательных и сенсорных нервов. [7] [10]
PAX2 кодирует парный бокс -ген 2, один из многих человеческих гомологов гена prd Drosophila melanogaster. Центральной особенностью этого семейства генов транскрипционных факторов является консервативный ДНК-связывающий парный бок-домен. Считается, что PAX2 является мишенью подавления транскрипции геном-супрессором опухоли WT1 . Pax 2 представляет собой фактор транскрипции, контролируемый сигнальными молекулами Wnt1 и Fgf8. Pax2 вместе с другими факторами транскрипции Pax5, Pax8, En1 и En 2 экспрессируются через границу Otx2-Gbx2 в области средней части заднего мозга. Эти факторы транскрипции работают с сигнальными молекулами Wnt1 и Fgf8, поддерживая организатор MHB . MHB контролирует развитие среднего мозга и мозжечка. Pax2 — самый ранний известный ген, экспрессирующийся через границу Otx2-Gbx2. Впервые он экспрессируется на стадии поздней примитивной полоски и экспрессируется в узком кольце с центром в MHB во время сомитогенеза. Трансгенная экспрессия среднего заднего мозга и развивающихся почек управляется Pax2. В расположенной выше области Pax2 имеются три различных MHB-специфичных энхансера. Экспрессия MHB, начиная с четырехсомитной стадии, управляется двумя поздними энхансерами в проксимальной и дистальной областях Pax2. Ранний энхансер, расположенный в промежуточной области, активирует область средней части заднего мозга эмбрионов поздней гаструлы. Активация Pax2, Pax5 и Pax8 является консервативной особенностью всех позвоночных.
Клиническое значение
[ редактировать ]Патологически было показано, что Pax2 активирует промотор гена фактора роста гепатоцитов (HGF), и оба они показаны как играющие роль в развитии рака простаты у человека. [11]
Было показано, что мутации в PAX2 приводят к колобомам зрительного нерва и гипоплазии почек . Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к образованию множества вариантов транскрипта. [12] Pax2 и Pax8 также необходимы для формирования пронефроса и последующих структур почек. Pax2 и Pax8 регулируют экспрессию Gata3. Без этих генов возникают мутации в мочеполовой системе.
Неправильная экспрессия Pax2 часто наблюдается при пролиферативных заболеваниях почек. Например, Pax2 высоко экспрессируется при поликистозной болезни почек (PKD), опухоли Вильмса (WT) и почечно-клеточном раке (RCC). [13] Экспрессия Pax2 при этих заболеваниях приводит к циклическому циклу топливных клеток, ингибированию гибели клеток и приданию устойчивости к химиотерапии. [13] Благодаря своей роли в этих заболеваниях Pax2 является привлекательной терапевтической мишенью, и был исследован ряд методов ингибирования его активности. Фактически, недавно была идентифицирована малая молекула, способная нарушать транскрипцию, опосредованную Pax2, блокируя связывание Pax2 с ДНК. [14] [15]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что PAX2 взаимодействует с PAXIP1 . [16]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000075891 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004231 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Пилц А.Дж., Пови С., Грусс П., Эбботт С.М. (1993). «Картирование человеческих гомологов мышиных генов, содержащих парный ящик». Геном млекопитающих . 4 (2): 78–82. дои : 10.1007/BF00290430 . ПМИД 8431641 . S2CID 30845070 .
- ^ Стэплтон П., Вейт А., Урбанек П., Козьмик З., Бусслингер М. (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семейства PAX-9». Природная генетика . 3 (4): 292–8. дои : 10.1038/ng0493-292 . ПМИД 7981748 . S2CID 21338655 .
- ^ Перейти обратно: а б Мансури А., Грусс П. (2013). «Пакс Джин». В Хьюз К., Малой К. (ред.). Энциклопедия генетики Бреннера (2-е изд.). Сан-Диего: Elsevier Science. стр. 246–248. дои : 10.1016/B978-0-12-374984-0.01128-1 . ISBN 978-0-08-096156-9 .
- ^ Перейти обратно: а б Имаи К.С., Сато Н., Сато Ю (2002). «Регионально-специфическая экспрессия генов в центральной нервной системе эмбриона асцидии» . Механизмы развития . 119 (Приложение 1): С275–7. дои : 10.1016/S0925-4773(03)00128-X . ПМИД 14516697 . S2CID 16714343 .
- ^ GeneCard для WNT1
- ^ Нолте Дж (2009). Человеческий мозг: введение в его функциональную анатомию (6-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Мосби/Элзевир. п. 685. ИСБН 978-0-323-04131-7 .
- ^ Уэда Т, Ито С, Сираиси Т, Танигучи Х, Каюкава Н, Наканиси Х, Накамура Т, Ная Ю, Хонго Ф, Камои К, Окихара К, Каваучи А, Мики Т (2015). «PAX2 способствует инвазии клеток рака простаты посредством регуляции транскрипции HGF в модели in vitro». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1852 (11): 2467–73. дои : 10.1016/j.bbadis.2015.08.008 . ПМИД 26296757 .
- ^ «Ген Энтреза: ген 2 парного бокса PAX2» .
- ^ Перейти обратно: а б Шарма Р., Санчес-Феррас О, Бушар М (2015). «Гены Pax в развитии, заболевании и регенерации почек». Семинары по клеточной биологии и биологии развития . 44 : 97–106. дои : 10.1016/j.semcdb.2015.09.016 . ПМИД 26410163 .
- ^ Гримли Э., Ляо С., Рангини Э., Николовска-Колеска З., Дресслер Г. (2017). «Ингибирование активации транскрипции Pax2 с помощью небольшой молекулы, нацеленной на ДНК-связывающий домен» . АКС Химическая биология . 12 (3): 724–734. doi : 10.1021/acschembio.6b00782 . ПМК 5761330 . ПМИД 28094913 .
- ^ Гримли Э., Дресслер Г.Р. (2018). «Являются ли белки Pax потенциальными терапевтическими мишенями при заболеваниях почек и раке?» . Почки Интернешнл . 94 (2): 259–267. дои : 10.1016/j.kint.2018.01.025 . ПМК 6054895 . ПМИД 29685496 .
- ^ Лехнер М.С., Левитан I, Дресслер Г.Р. (июль 2000 г.). «PTIP, новый белок, содержащий домен BRCT, взаимодействует с Pax2 и связан с активным хроматином» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (14): 2741–51. дои : 10.1093/нар/28.14.2741 . ПМЦ 102659 . ПМИД 10908331 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Нолл М. (август 1993 г.). «Эволюция и роль генов Pax». Текущее мнение в области генетики и развития . 3 (4): 595–605. дои : 10.1016/0959-437X(93)90095-7 . ПМИД 8241771 .
- Даль Э., Косеки Х., Баллинг Р. (сентябрь 1997 г.). «Гены Pax и органогенез». Биоэссе . 19 (9): 755–65. дои : 10.1002/bies.950190905 . ПМИД 9297966 . S2CID 23755557 .
- Эклс М.Р., Хе С., Легг М., Кумар Р., Фокс Дж., Чжоу С., Френч М., Цай Р.В. (2003). «Гены PAX в развитии и заболеваниях: роль PAX2 в развитии мочеполового тракта». Международный журнал биологии развития . 46 (4): 535–44. ПМИД 12141441 .
- Экклс М.Р., Уоллис Л.Дж., Фидлер А.Э., Сперр Н.К., Гудфеллоу П.Дж., Рив А.Е. (май 1992 г.). «Экспрессия гена PAX2 в почках плода человека и опухоли Вильмса». Рост и дифференцировка клеток . 3 (5): 279–89. ПМИД 1378753 .
- Саньянусин П., Шимменти Л.А., Макно Л.А., Уорд Т.А., Пирпонт М.Е., Салливан М.Дж., Добинс В.Б., Экклс М.Р. (апрель 1995 г.). «Мутация гена PAX2 в семье с колобомой зрительного нерва, почечными аномалиями и пузырно-мочеточниковым рефлюксом». Природная генетика . 9 (4): 358–64. дои : 10.1038/ng0495-358 . ПМИД 7795640 . S2CID 29180124 .
- Уорд Т.А., Небель А., Рив А.Е., Экклс М.Р. (сентябрь 1994 г.). «Альтернативные формы информационной РНК и открытые рамки считывания в дополнительной консервативной области человеческого гена PAX-2». Рост и дифференцировка клеток . 5 (9): 1015–21. ПМИД 7819127 .
- Стэплтон П., Вейт А., Урбанек П., Козьмик З., Бусслингер М. (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семейства PAX-9». Природная генетика . 3 (4): 292–8. дои : 10.1038/ng0493-292 . ПМИД 7981748 . S2CID 21338655 .
- Пилц А.Дж., Пови С., Грусс П., Эбботт С.М. (1993). «Картирование человеческих гомологов мышиных генов, содержащих парный ящик». Геном млекопитающих . 4 (2): 78–82. дои : 10.1007/BF00290430 . ПМИД 8431641 . S2CID 30845070 .
- Саньянусин П., Макно Л.А., Салливан М.Дж., Уивер Р.Г., Экклс М.Р. (ноябрь 1995 г.). «Мутация PAX2 у двух братьев и сестер с синдромом почечной колобомы». Молекулярная генетика человека . 4 (11): 2183–4. дои : 10.1093/hmg/4.11.2183 . ПМИД 8589702 .
- Саньянусин П., Норриш Дж. Х., Уорд Т. А., Небель А., Макно Л. А., Экклс М. Р. (июль 1996 г.). «Геномная структура гена PAX2 человека». Геномика . 35 (1): 258–61. дои : 10.1006/geno.1996.0350 . ПМИД 8661132 .
- Дехби М., Гаремани М., Лехнер М., Дресслер Г., Пеллетье Дж. (август 1996 г.). «Фактор транскрипции парного бокса, PAX2, положительно модулирует экспрессию гена-супрессора опухоли Вильмса (WT1)». Онкоген . 13 (3): 447–53. ПМИД 8760285 .
- Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
- Шимменти Л.А., Канлифф Х.Э., Макно Л.А., Уорд Т.А., Френч МС, Шим Х.Х., Чжан Ю.Х., Проесманс В., Лейс А., Байерли К.А., Брэддок С.Р., Масуно М., Имаидзуми К., Девриендт К., Экклс М.Р. (апрель 1997 г.). «Дальнейшее определение синдрома почечной колобомы у пациентов с крайней вариабельностью фенотипа и идентичными мутациями PAX2» . Американский журнал генетики человека . 60 (4): 869–78. ПМК 1712484 . ПМИД 9106533 .
- Нарахара К., Бейкер Э., Ито С., Ёкояма Ю., Ю.С., Хьюитт Д., Сазерленд Г.Р. , Экклс М.Р., Ричардс Р.И. (март 1997 г.). «Локализация точки разрыва 10q в гене PAX2 у пациента с транслокацией t(10;13) de novo и колобомой зрительного нерва и заболеванием почек» . Журнал медицинской генетики . 34 (3): 213–6. дои : 10.1136/jmg.34.3.213 . ПМЦ 1050895 . ПМИД 9132492 .
- Тавассоли К., Рюгер В., Хорст Дж. (декабрь 1997 г.). «Альтернативный сплайсинг в PAX2 создает новую рамку считывания и расширенную консервативную кодирующую область на карбокси-конце». Генетика человека . 101 (3): 371–5. дои : 10.1007/s004390050644 . ПМИД 9439670 . S2CID 43590139 .
- Стейнер К.К., Канлифф Х.Э., Уорд Т.А., Экклс М.Р. (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика промотора PAX2 человека» . Журнал биологической химии . 273 (39): 25472–9. дои : 10.1074/jbc.273.39.25472 . ПМИД 9738017 .
- Девриендт К., Маттейс Г., Ван Дамм Б., Ван Цесбрук Д., Экклс М., Ванрентергем Ю., Фринс Дж. П., Лейс А. (август 1998 г.). «Миссенс-мутация и дупликация гексануклеотидов в гене PAX2 в двух неродственных семьях с синдромом почечной колобомы (MIM 120330)». Генетика человека . 103 (2): 149–53. дои : 10.1007/s004390050798 . ПМИД 9760197 . S2CID 8930257 .
- Шимменти Л.А., Шим Х.Х., Виртшафтер Дж.Д., Панзарино В.А., Каштан С.Э., Киркпатрик С.Дж., Варговски Д.С., Франция Т.Д., Мишель Э., Добинс В.Б. (2000). «Гомонуклеотидные мутации расширения и сокращения PAX2 и включение порока развития Киари 1 как часть синдрома почечной колобомы» . Человеческая мутация . 14 (5): 369–76. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(199911)14:5<369::AID-HUMU2>3.0.CO;2-E . ПМИД 10533062 . S2CID 25564812 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о синдроме почечной колобомы
- PAX2 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
галерея PDB |
|---|
