Paxip1

Paxip1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3SQD
Идентификаторы
Псевдонимы	Paxip1 , Cagf29, Pacip1, Paxip1l, PTIP, TNRC2, CAGF28, PAX взаимодействующий белок 1
Внешние идентификаторы	Омим : 608254 ; MGI : 1890430 ; Гомологен : 133914 ; GeneCards : Paxip1 ; OMA : Paxip1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	155,003,124 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	27,996,689 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; cerebellar hemisphere; ; ventricular zone; ; right hemisphere of cerebellum; ; corpus epididymis; ; thymus; ; cerebellar vermis; ; cartilage tissue; ; embryo; ; ganglionic eminence;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; epiblast; ; ventricular zone; ; zygote; ; islet of Langerhans; ; thymus; ; otic placode; ; spermatid; ; primitive streak;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding;
Cellular component	nuclear matrix; nucleoplasm; MLL3/4 complex; nucleus; histone methyltransferase complex; chromosome;
Biological process	response to ionizing radiation; positive regulation of histone H3-K36 methylation; DNA recombination; regulation of transcription, DNA-templated; chorion development; DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; transcription, DNA-templated; positive regulation of histone acetylation; cellular response to DNA damage stimulus; vasculogenesis; positive regulation of isotype switching; histone H3-K4 methylation; positive regulation of histone H3-K4 methylation; adipose tissue development; double-strand break repair via nonhomologous end joining; positive regulation of protein ubiquitination; endothelial cell migration; DNA repair; positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; regulation of cell cycle G2/M phase transition; positive regulation of isotype switching to IgG isotypes; positive regulation of response to DNA damage stimulus; negative regulation of DNA-binding transcription factor activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	22976
	55982
	ENSG00000157212
	EMSMUSM00000002221
	Q6ZW49
	Q6NZQ4
	NM_007349
	NM_018878
	NP_031375
	NP_061366
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Пакс-взаимодействующий белок 1 является белком , который у людей кодируется Paxip1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген является членом семейства генов парной коробки (PAX) и кодирует ядерный белок с шестью доменами BRCT (карбокси-терминал рака молочной железы. Этот белок играет критическую роль в поддержании стабильности генома, конденсации хроматина и прогрессирования посредством митоза. ^{[ 6 ]} Варианты, влияющие на белок, также участвуют в болезни Альцгеймера. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что Paxip1 взаимодействует с Pax2 ^{[ 8 ]} и TP53BP1 . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000157212 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000002221 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Марголис Р.Л., Авраам М.Р., Гэтчелл С.Б., Ли Ш.Х., Кидвай А.С., Брешель Т.С., Стейн О.К., Каллахан С., Макиннис М.Г., Росс Калифорния (июль 1997 г.). «КДНК с длинными тринуклеотидными повторениями из мозга человеческого мозга». Гул Генет . 100 (1): 114–22. doi : 10.1007/s004390050476 . PMID 9225980 . S2CID 25999127 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Paxip1 Pax взаимодействующий (с доменом активации транскрипции) 1» .
^ Chen Ja, Wang Q, Davis-Turak J, et al. (Апрель 2015). «Мультианцестральное исследование по всему геномскому массивам по борьбе с болезнью Альцгеймера, лобно-височной деменции и прогрессивного наддерного паралича» . Джама неврология . 72 (4): 414–22. doi : 10.1001/jamaneurol.2014.4040 . PMC 4397175 . PMID 25706306 .
^ Лехнер М.С., Левитан I, Дресслер Гр (июль 2000 г.). «PTIP, новый белок, содержащий домен BRCT, взаимодействует с PAX2 и связан с активным хроматином» . Нуклеиновые кислоты Res . 28 (14): 2741–51. doi : 10.1093/nar/28.14.2741 . PMC 102659 . PMID 10908331 .
^ Jowsey PA, Doherty AJ, Rouse J (декабрь 2004 г.). «Человеческий PTIP облегчает ATM-опосредованную активацию p53 и способствует устойчивости клеток ионизирующему излучению» . Дж. Биол. Химический 279 (53): 55562–9. doi : 10.1074/jbc.m411021200 . PMID 15456759 .
^ Manke IA, Lowery DM, Nguyen A, Yaffe MB (октябрь 2003 г.). «BRCT повторяется как фосфопептид-связывающие модули, участвующие в нацеливании белка». Наука . 302 (5645): 636–9. Bibcode : 2003sci ... 302..636M . doi : 10.1126/science.1088877 . PMID 14576432 . S2CID 21866417 .

Дальнейшее чтение

Сангерский центр,; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета (1998). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геном Res . 8 (11): 1097–108. doi : 10.1101/gr.8.11.1097 . PMID 9847074 .
Лехнер М.С., Левитан I, Дресслер Г.Р. (2000). «PTIP, новый белок, содержащий домен BRCT, взаимодействует с PAX2 и связан с активным хроматином» . Нуклеиновые кислоты Res . 28 (14): 2741–51. doi : 10.1093/nar/28.14.2741 . PMC 102659 . PMID 10908331 .
Hoffmeister A, Ropolo A, Vasseur S, Mallo GV, Bodeker H, Ritz-Laser B, Dressler GR, Vaccaro MI, Dagorn JC, Moreno S, Iovanna JL (2002). «Связанный с HMG-I/Y белок p8 связывается с транс-активационным доменным белком P300 и PAX2 для регуляции транса-активационной активности транскрипционных факторов PAX2A и PAX2B на промоторе гена глюкагона» . Дж. Биол. Химический 277 (25): 22314–9. doi : 10.1074/jbc.m201657200 . PMID 11940591 .
Чо Е.А., Придл М.Дж., Дресслер Г.Р. (2003). «Домен BRCT-содержащий белок PTIP необходим для прогрессирования посредством митоза» . Мол Клетка. Биол . 23 (5): 1666–73. doi : 10.1128/mcb.23.5.1666-1673.2003 . PMC 151700 . PMID 12588986 .
Manke IA, Lowery DM, Nguyen A, Yaffe MB (2003). «BRCT повторяется как фосфопептид-связывающие модули, участвующие в нацеливании белка». Наука . 302 (5645): 636–9. Bibcode : 2003sci ... 302..636M . doi : 10.1126/science.1088877 . PMID 14576432 . S2CID 21866417 .
Джоуси П.А., Доэрти А.Дж., Рауз Дж. (2004). «Человеческий PTIP облегчает ATM-опосредованную активацию p53 и способствует устойчивости клеток ионизирующему излучению» . Дж. Биол. Химический 279 (53): 55562–9. doi : 10.1074/jbc.m411021200 . PMID 15456759 .
Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смоляр А., Босак С., Прочтенность Р, Поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid DE, FP Roth, Vidal M (2005). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
Чо Ю.В., Хонг Т., Хонг С., Го Х, Ю Х, Ким Д., Гушцинский Т., Дресслер Г.Р., Коупленд Т.Д., Калкум М., Г. К. (2007). «PTIP ассоциируется с MLL3- и MLL4-содержащим гистон-лизин-лизин-4-метилтрансфераза» . Дж. Биол. Химический 282 (28): 20395–406. doi : 10.1074/jbc.m701574200 . PMC 2729684 . PMID 17500065 .
Муньос И.М., Джоуси П.А., Тот Р., Рауз Дж. (2007). «Связывание фосфо-эпитопа с помощью BRCT-доменов HPTIP контролирует множественные аспекты клеточного ответа на повреждение ДНК» . Нуклеиновые кислоты Res . 35 (16): 5312–22. doi : 10.1093/nar/gkm493 . PMC 2018624 . PMID 17690115 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 7 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000157212 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000002221 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9225980-5] Марголис Р.Л., Авраам М.Р., Гэтчелл С.Б., Ли Ш.Х., Кидвай А.С., Брешель Т.С., Стейн О.К., Каллахан С., Макиннис М.Г., Росс Калифорния (июль 1997 г.). «КДНК с длинными тринуклеотидными повторениями из мозга человеческого мозга». Гул Генет . 100 (1): 114–22. doi : 10.1007/s004390050476 . PMID 9225980 . S2CID 25999127 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Paxip1 Pax взаимодействующий (с доменом активации транскрипции) 1» .

[7] Chen Ja, Wang Q, Davis-Turak J, et al. (Апрель 2015). «Мультианцестральное исследование по всему геномскому массивам по борьбе с болезнью Альцгеймера, лобно-височной деменции и прогрессивного наддерного паралича» . Джама неврология . 72 (4): 414–22. doi : 10.1001/jamaneurol.2014.4040 . PMC 4397175 . PMID 25706306 .

[pmid10908331-8] Лехнер М.С., Левитан I, Дресслер Гр (июль 2000 г.). «PTIP, новый белок, содержащий домен BRCT, взаимодействует с PAX2 и связан с активным хроматином» . Нуклеиновые кислоты Res . 28 (14): 2741–51. doi : 10.1093/nar/28.14.2741 . PMC 102659 . PMID 10908331 .

[pmid15456759-9] Jowsey PA, Doherty AJ, Rouse J (декабрь 2004 г.). «Человеческий PTIP облегчает ATM-опосредованную активацию p53 и способствует устойчивости клеток ионизирующему излучению» . Дж. Биол. Химический 279 (53): 55562–9. doi : 10.1074/jbc.m411021200 . PMID 15456759 .

[pmid14576432-10] Manke IA, Lowery DM, Nguyen A, Yaffe MB (октябрь 2003 г.). «BRCT повторяется как фосфопептид-связывающие модули, участвующие в нацеливании белка». Наука . 302 (5645): 636–9. Bibcode : 2003sci ... 302..636M . doi : 10.1126/science.1088877 . PMID 14576432 . S2CID 21866417 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]