КЛФ6

КЛФ6
Идентификаторы
Псевдонимы	KLF6 , BCD1, CBA1, COPEB, CPBP, GBF, PAC1, ST12, ZF9, Круппелеподобный фактор 6, Круппелеподобный фактор 6
Внешние идентификаторы	Опустить : 602053 ; МГИ : 1346318 ; Гомологен : 996 ; Генные карты : KLF6 ; ОМА : KLF6 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	3,785,281 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	5,920,393 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	nipple; ; lower lobe of lung; ; skin of thigh; ; saphenous vein; ; vena cava; ; pericardium; ; gastric mucosa; ; skin of hip; ; monocyte; ; synovial joint;
	Top expressed in
	granulocyte; ; stroma of bone marrow; ; aortic valve; ; ascending aorta; ; sciatic nerve; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; left colon; ; tunica media of zone of aorta; ; right lung lobe; ; blood;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein binding; metal ion binding; nucleic acid binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; double-stranded DNA binding;
Cellular component	fibrillar center; nucleus; nucleolus; cytosol; intracellular membrane-bounded organelle;
Biological process	positive regulation of transcription, DNA-templated; B cell differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription by RNA polymerase II; cytokine-mediated signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1316
	23849
	ENSG00000067082
	ENSMUSG00000000078
	Q99612
	О08584 ; Q8BPQ2
	НМ_001008490 ; НМ_001160124 ; НМ_001160125 ; НМ_001300
	НМ_011803
	НП_001153596 ; НП_001153597 ; НП_001291
	НП_035933
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Круппелеподобный фактор 6 — это белок , который у человека кодируется KLF6 геном . ^[5]

Это ген-супрессор опухоли . ^[6]

Функция

Этот ген кодирует ядерный белок , который имеет три цинковых пальца на конце С-концевого домена, центральную область, богатую серином/треонином, и кислый домен, расположенный внутри N-концевой области. Цинковые пальцы этого белка отвечают за специфическое связывание ДНК с богатыми гуанином основными промоторными элементами. Центральная область может участвовать в путях активации или посттрансляционной регуляции, а кислый N-концевой домен может играть важную роль в процессе активации транскрипции. Он способен активировать транскрипцию примерно в 4 раза как на гомологичных, так и на гетерологичных промоторах. ДНК-связывание и транскрипционная активность этого белка в сочетании с характером его экспрессии позволяют предположить, что этот белок может участвовать в регуляции и/или поддержании базовой экспрессии генов гликопротеинов, специфичных для беременности, и, возможно, других генов, не имеющих TATA-бокса . Для этого гена обнаружено два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что KLF6 взаимодействует с транскрипционным фактором Sp1 . ^[8]

См. также

Факторы Круппеля

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000067082 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000078 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Оньянго П., Коричхонер Н.П., Патрито Л.К., Зенке М., Вейт А. (февраль 1998 г.). «Присвоение гена, кодирующего белок, связывающий основной промоторный элемент (COPEB), с хромосомой 10p15 человека с помощью соматического гибридного анализа и флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика . 48 (1): 143–4. дои : 10.1006/geno.1997.5124 . ПМИД 9503030 .
^ Ли Д., Йеа С., Долиос Г., Мартинетти Дж.А., Нарла Дж., Ван Р., Уолш М.Дж., Фридман С.Л. (октябрь 2005 г.). «Регуляция активности супрессора опухоли Круппель-подобного фактора 6 путем ацетилирования» . Исследования рака . 65 (20): 9216–25. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-1040 . ПМИД 16230382 .
^ «Ген Энтрез: KLF6 Круппель-подобный фактор 6» .
^ Ботелла Л.М., Санчес-Эльснер Т., Санс-Родригес Ф., Кодзима С., Шимада Дж., Герреро-Эстео М., Куреман М.П., Рациу В., Ланга К., Вари С.П., Рамирес Дж.Р., Фридман С., Бернабеу С. (декабрь 2002 г.). «Транкрипционная активация эндоглина и трансформирующие сигнальные компоненты фактора роста-бета путем кооперативного взаимодействия между Sp1 и KLF6: их потенциальная роль в ответе на сосудистое повреждение» . Кровь . 100 (12): 4001–10. дои : 10.1182/blood.V100.12.4001 . ПМИД 12433697 .

Дальнейшее чтение

Нарла Г., Фридман С.Л., Мартинетти Дж.А. (апрель 2003 г.). «Крюппель наносит вред раку простаты: прогресс и перспективы KLF6» . Американский журнал патологии . 162 (4): 1047–52. дои : 10.1016/S0002-9440(10)63901-6 . ПМЦ 1851219 . ПМИД 12651597 .
Эль Руби С., Ньюкомб EW (декабрь 1996 г.). «Идентификация Bcd, нового протоонкогена, экспрессируемого в B-клетках». Онкоген . 13 (12): 2623–30. ПМИД 9000136 .
Кориччонер Н.П., Бокко Дж.Л., Панцетта-Дутари ГМ, Думур С.И., Флюри А., Патрито Л.К. (апрель 1997 г.). «Новый человеческий белок цинковых пальцев, который взаимодействует с основным промоторным элементом бесбоксового гена ТАТА» . Журнал биологической химии . 272 (14): 9573–80. дои : 10.1074/jbc.272.14.9573 . ПМИД 9083102 .
Сузуки Т., Ямамото Т., Курабаяши М., Нагай Р., Язаки Ю., Хорикоши М. (август 1998 г.). «Выделение и первоначальная характеристика GBF, нового ДНК-связывающего белка цинковых пальцев, который связывается с богатыми GC сайтами связывания промотора ВИЧ-1». Журнал биохимии . 124 (2): 389–95. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022124 . ПМИД 9685731 .
Рациу В., Лалазар А., Вонг Л., Данг К., Коллинз С., Шаулиан Э., Дженсен С., Фридман С.Л. (август 1998 г.). «Zf9, Круппель-подобный фактор транскрипции, активируемый in vivo во время раннего фиброза печени» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (16): 9500–5. Бибкод : 1998PNAS...95.9500R . дои : 10.1073/pnas.95.16.9500 . ПМК 21367 . ПМИД 9689109 .
Окано Дж., Опиц О.Г., Накагава Х., Дженкинс Т.Д., Фридман С.Л., Рустги А.К. (май 2000 г.). «Крюппель-подобные транскрипционные факторы Zf9 и GKLF коактивируют промотор кератина 4 человека и физически взаимодействуют». Письма ФЭБС . 473 (1): 95–100. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01468-X . ПМИД 10802067 . S2CID 34923598 .
Нарла Дж., Хит К.Э., Ривз Х.Л., Ли Д., Джионо Л.Е., Киммельман А.С., Глюксман М.Дж., Нарла Дж., Энг Ф.Дж., Чан А.М., Феррари AC, Мартинетти Дж.А., Фридман С.Л. (декабрь 2001 г.). «KLF6, ген-кандидат-супрессор опухоли, мутировавший при раке простаты». Наука . 294 (5551): 2563–6. Бибкод : 2001Sci...294.2563N . дои : 10.1126/science.1066326 . ПМИД 11752579 . S2CID 31619019 .
Ботелла Л.М., Санчес-Эльснер Т., Санс-Родригес Ф., Кодзима С., Шимада Дж., Герреро-Эстео М., Куреман М.П., Рациу В., Ланга К., Вари С.П., Рамирес Дж.Р., Фридман С., Бернабеу С. (декабрь 2002 г.). «Транкрипционная активация эндоглина и трансформирующие сигнальные компоненты фактора роста-бета путем кооперативного взаимодействия между Sp1 и KLF6: их потенциальная роль в ответе на сосудистое повреждение» . Кровь . 100 (12): 4001–10. дои : 10.1182/blood.V100.12.4001 . ПМИД 12433697 .
Чен Х.К., Лю XQ, Линь Дж, Чен Тай, Фэн QS, Цзэн YX (октябрь 2002 г.). «[Анализ мутации гена KLF6 при раке носоглотки человека]». АИ Чжэн = Айчжэн = Китайский журнал рака . 21 (10): 1047–50. ПМИД 12508640 .
Варке В.Г., Намбиар М.П., Кришнан С., Тенброк К., Геллер Д.А., Кориччонер Н.П., Аткинс Дж.Л., Фарбер Д.Л., Цокос Г.К. (апрель 2003 г.). «Транскрипционная активация человеческого промотора синтазы оксида азота с помощью Круппелеподобного фактора 6» . Журнал биологической химии . 278 (17): 14812–9. дои : 10.1074/jbc.M300787200 . ПМИД 12590140 .
Чен С., Хютинен Э.Р., Сунь Х, Хелин Х.Дж., Койвисто П.А., Фриерсон Х.Ф., Весселла Р.Л., Донг Дж.Т. (апрель 2003 г.). «Делекция, мутация и потеря экспрессии KLF6 при раке простаты человека» . Американский журнал патологии . 162 (4): 1349–54. дои : 10.1016/S0002-9440(10)63930-2 . ПМЦ 1851229 . ПМИД 12651626 .
Дженг Ю.М., Сюй Х.К. (июль 2003 г.). «KLF6, предполагаемый ген-супрессор опухоли, мутирует в астроцитарных глиомах». Международный журнал рака . 105 (5): 625–9. дои : 10.1002/ijc.11123 . ПМИД 12740910 . S2CID 25600692 .
Баят А., Уотсон Дж.С., Стэнли Дж.К., Фергюсон М.В., Оллиер В.Е. (июнь 2003 г.). «Генетическая предрасположенность к болезни Дюпюитрена: ассоциация гена транскрипционного фактора Zf9». Пластическая и реконструктивная хирургия . 111 (7): 2133–9. дои : 10.1097/01.PRS.0000060531.98180.32 . ПМИД 12794452 . S2CID 22210744 .
Ривз Х.Л., Нарла Г., Огунбии О., Хак А.И., Кац А., Бензено С., Ход Е., Харпас Н., Голдберг С., Тал-Кремер С., Энг Ф.Дж., Артур М.Дж., Мартинетти Дж.А., Фридман С.Л. (апрель 2004 г.). «Крюпелеподобный фактор 6 (KLF6) представляет собой ген-супрессор опухолей, который часто инактивируется при колоректальном раке» . Гастроэнтерология . 126 (4): 1090–103. дои : 10.1053/j.gastro.2004.01.005 . ПМИД 15057748 .
Киммельман А.С., Цяо Р.Ф., Нарла Г., Банно А., Лау Н., Бос П.Д., Нуньес Родригес Н., Лян Б.С., Гуха А., Мартинетти Х.А., Фридман С.Л., Чан А.М. (июнь 2004 г.). «Подавление туморогенности глиобластомы круппелеподобным фактором транскрипции KLF6» . Онкоген . 23 (29): 5077–83. дои : 10.1038/sj.onc.1207662 . ПМИД 15064720 .
Глинский Г.В., Глинский А.Б., Стивенсон А.Дж., Хоффман Р.М., Джеральд В.Л. (март 2004 г.). «Профилирование экспрессии генов предсказывает клинический исход рака простаты» . Журнал клинических исследований . 113 (6): 913–23. дои : 10.1172/JCI20032 . ПМК 362118 . ПМИД 15067324 .
Рубинштейн М., Идельман Г., Плимат С.Р., Нарла Г., Фридман С.Л., Вернер Х. (август 2004 г.). «Транскрипционная активация гена рецептора инсулиноподобного фактора роста I с помощью белка-супрессора опухоли KLF6 (KLF6): потенциальные взаимодействия между KLF6 и p53» . Эндокринология . 145 (8): 3769–77. дои : 10.1210/en.2004-0173 . ПМИД 15131018 .

Внешние ссылки

KLF6 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 10 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000067082 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000078 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9503030-5] Оньянго П., Коричхонер Н.П., Патрито Л.К., Зенке М., Вейт А. (февраль 1998 г.). «Присвоение гена, кодирующего белок, связывающий основной промоторный элемент (COPEB), с хромосомой 10p15 человека с помощью соматического гибридного анализа и флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика . 48 (1): 143–4. дои : 10.1006/geno.1997.5124 . ПМИД 9503030 .

[pmid16230382-6] Ли Д., Йеа С., Долиос Г., Мартинетти Дж.А., Нарла Дж., Ван Р., Уолш М.Дж., Фридман С.Л. (октябрь 2005 г.). «Регуляция активности супрессора опухоли Круппель-подобного фактора 6 путем ацетилирования» . Исследования рака . 65 (20): 9216–25. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-1040 . ПМИД 16230382 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: KLF6 Круппель-подобный фактор 6» .

[pmid12433697-8] Ботелла Л.М., Санчес-Эльснер Т., Санс-Родригес Ф., Кодзима С., Шимада Дж., Герреро-Эстео М., Куреман М.П., Рациу В., Ланга К., Вари С.П., Рамирес Дж.Р., Фридман С., Бернабеу С. (декабрь 2002 г.). «Транкрипционная активация эндоглина и трансформирующие сигнальные компоненты фактора роста-бета путем кооперативного взаимодействия между Sp1 и KLF6: их потенциальная роль в ответе на сосудистое повреждение» . Кровь . 100 (12): 4001–10. дои : 10.1182/blood.V100.12.4001 . ПМИД 12433697 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]