Jump to content

SDHD

SDHD
Идентификаторы
Псевдонимы SDHD , CBT1, CII-4, CWS3, PGL, PGL1, QPs3, SDH4, cybS, субъединица D комплекса сукцинатдегидрогеназы, MC2DN3
Внешние идентификаторы Опустить : 602690 ; МГИ : 1914175 ; Гомологен : 37718 ; GeneCards : SDHD ; OMA : SDHD — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001276503
НМ_001276504
НМ_001276506
НМ_003002

НМ_025848

RefSeq (белок)

НП_001263432
НП_001263433
НП_001263435
НП_002993

НП_080124

Местоположение (UCSC) Чр 11: 112.09 – 112.12 Мб Чр 9: 50,51 – 50,52 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Малая субъединица цитохрома b сукцинатдегидрогеназы [убихинона], митохондриальная (CybS), также известная как субъединица D комплекса сукцинатдегидрогеназы (SDHD), представляет собой белок , который у человека кодируется SDHD геном . Ранее для SDHD использовались имена PGL и PGL1 . Сукцинатдегидрогеназа является важным ферментом как в цикле лимонной кислоты, так и в цепи переноса электронов . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Наследственный синдром PGL-PCC вызван родительским импринтом гена SDHD. Скрининг можно начинать с 6 лет.

Структура

[ редактировать ]

SDHD Ген расположен на хромосоме 11 в локусе 11q23 и охватывает 8978 пар оснований . имеются Псевдогены этого гена на хромосомах 1 , 2 , 3 , 7 и 18 . [ 5 ] Ген SDHD производит белок массой 17 кДа, состоящий из 159 аминокислот . [ 8 ] [ 9 ]

Белок SDHD является одной из двух интегральных трансмембранных субъединиц, закрепляющих четырехсубъединичный сукцинатдегидрогеназы (Комплекс II) белковый комплекс на матриксной стороне внутренней мембраны митохондрий . Другая трансмембранная субъединица — SDHC . Димер SDHC /SDHD , которая, в свою очередь соединен с субъединицей транспорта электронов SDHB , связана с субъединицей SDHA . [ 10 ]

SDHD образует часть димера трансмембранного белка с SDHC , который закрепляет Комплекс II на внутренней митохондриальной мембране. Димер SDHC/SDHD обеспечивает места связывания убихинона и воды во время транспорта электронов в Комплексе II. Первоначально SDHA окисляет сукцинат путем депротонирования в сайте связывания FAD , оставляя фумарат , слабо связанный с активным сайтом, свободный для выхода из белка. Электроны, выведенные из сукцината, туннелируют по реле [Fe-S] в субъединице SDHB , пока не достигнут железо-серного кластера [3Fe-4S] . Затем электроны передаются ожидающей молекуле убихинона в активном центре димера SDHC/SDHD. кислород O1 Карбонильный убихинона ориентируется в активном центре (изображение 4) за счет взаимодействия водородных связей с Tyr83 SDHD. Наличие электронов в железо-серном кластере [3Fe-4S] индуцирует движение убихинона во вторую ориентацию. Это облегчает взаимодействие второй водородной связи между карбонильной группой O4 убихинона и Ser27 субъединицы C. После первой стадии одноэлектронного восстановления происходит семихиноновые образуются радикалы. Второй электрон приходит из кластера [3Fe-4S] и обеспечивает полное восстановление убихинона до убихинола . [ 11 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Мутации в SDHD гене могут вызывать семейную параганглиому . [ 5 ] Зародышевые мутации при SDHD впервые были связаны с наследственной параганглиомой в 2000 году. [ 12 ] С тех пор было показано, что мутации в SDHB и, в меньшей степени, в SDHC могут вызывать параглиому, а также семейную феохромоцитому . Примечательно, что спектр опухолей различен для разных мутаций. Мутации SDHB часто приводят к метастатическому заболеванию, которое выходит за пределы надпочечников, в то время как опухоли, связанные с мутациями SDHD , чаще являются доброкачественными и возникают в голове и шее. [ 13 ]

Точный механизм онкогенеза не определен, но предполагается, что нарушение работы комплекса SDH может вызвать гипоксическую реакцию в клетке, которая приводит к образованию опухоли. Мутации в генах SDHB , SDHC , SDHD и SDHAF2 приводят к потере или снижению активности фермента SDH. Поскольку мутировавший фермент SDH не может превращать сукцинат в фумарат, сукцинат накапливается в клетке. В результате в нормальных условиях кислорода запускаются пути гипоксии, что приводит к аномальному росту клеток и образованию опухолей. [ 13 ] Известно, что у людей, живущих на больших высотах (например, в Андах), наблюдается повышенный уровень заболеваемости доброкачественной параганглиомой, причем уровень заболевания увеличивается с увеличением высоты над уровнем моря.

По крайней мере пять вариантов гена SDHD были идентифицированы у людей с синдромом Каудена или аналогичным расстройством, называемым синдромом Каудена. Эти состояния характеризуются множественными опухолевидными разрастаниями, называемыми гамартомами , и повышенным риском развития некоторых видов рака. Когда синдром Каудена и синдром Каудена вызваны мутациями гена SDHD, эти состояния связаны с особенно высоким риском развития рака молочной железы и щитовидной железы . Варианты гена SDHD, связанные с синдромом Каудена и синдромом Каудена, изменяют отдельные аминокислоты в белке SDHD, что, вероятно, изменяет функцию фермента SDH. Исследования показывают, что дефектный фермент может позволить клеткам беспрепятственно расти и делиться, что приводит к образованию гамартом и раковых опухолей. Однако исследователи не уверены, связаны ли выявленные варианты гена SDHD напрямую с синдромом Каудена и синдромом Каудена. Некоторые из описанных выше вариантов редко встречаются у людей без особенностей этих состояний. [ 14 ]

Мутации в гене SDHD были обнаружены у небольшого числа людей с синдромом Карни-Стратакиса , наследственной формой рака желудочно-кишечного тракта, называемой желудочно-кишечной стромальной опухолью (ГИСО). У пациентов с синдромом Карни-Стратакиса имеется нераковая опухоль, связанная с нервной системой, называемая параганглиомой или феохромоцитомой (тип параганглиомы). Наследственная мутация гена SDHD предрасполагает человека к образованию рака. Дополнительная мутация, удаляющая нормальную копию гена, необходима для возникновения синдрома Карни-Стратакиса. Эта вторая мутация, называемая соматической мутацией , приобретается человеком в течение жизни и присутствует только в опухолевых клетках. [ 14 ]

Дефицит митохондриального комплекса II (MT-C2D) — заболевание дыхательной цепи митохондрий с гетерогенными клиническими проявлениями — также связан с мутациями гена SDHD . Клинические особенности включают психомоторный регресс у детей раннего возраста, отставание в росте с отсутствием речевого развития, выраженную спастическую квадриплегию, дистонию, прогрессирующую лейкоэнцефалопатию, мышечную слабость, непереносимость физической нагрузки, кардиомиопатию. У некоторых пациентов проявляется синдром Лея или синдром Кернса-Сейра . [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ]

Интерактивная карта маршрутов

[ редактировать ]

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. [ § 1 ]

[[Файл:
TCACycle_WP78Перейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти в ХМДБПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти в ХМДБПерейти в ХМДБПерейти к статьеПерейти на WikiPathwaysПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти на WikiPathwaysПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти на WikiPathwaysПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти в ХМДБПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти на WikiPathwaysПерейти к статьеПерейти на WikiPathwaysПерейти в ХМДБПерейти к статьеПерейти на WikiPathwaysПерейти к статьеПерейти в ХМДБПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статьеПерейти к статье
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
TCACycle_WP78Go to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to HMDBGo to articleGo to articleGo to articleGo to HMDBGo to HMDBGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to articleGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to articleGo to articleGo to HMDBGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to WikiPathwaysGo to HMDBGo to articleGo to WikiPathwaysGo to articleGo to HMDBGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to articleGo to article
|alt=TCACycle_WP78 редактировать ]]
  1. ^ Интерактивную карту маршрутов можно редактировать на WikiPathways: «TCACycle_WP78» .
  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000204370 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000000171 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Jump up to: а б с «Энтрез Ген: комплекс сукцинатдегидрогеназы» .
  6. ^ Хойтинк П., ван дер Мей А.Г., Сандкуйл Л.А., ван Гилс А.П., Бардоэль А., Бридвелд Г.Дж., ван Влит М., ван Оммен Г.Дж., Корнелисс К.Дж., Остра Б.А. (апрель 1992 г.). «Ген, подвергающийся геномному импринтингу и ответственный за наследственные параганглиомы, картируется на хромосоме 11q23-qter». Молекулярная генетика человека . 1 (1): 7–10. дои : 10.1093/хмг/1.1.7 . ПМИД   1301144 .
  7. ^ Хираваке Х., Таниваки М., Тамура А., Кодзима С., Кита К. (1997). «Цитохром b в человеческом комплексе II (сукцинат-убихинон оксидоредуктаза): клонирование кДНК компонентов в митохондриях печени и присвоение хромосом генов больших (SDHC) и малых (SDHD) субъединиц 1q21 и 11q23». Цитогенетика и клеточная генетика . 79 (1–2): 132–8. дои : 10.1159/000134700 . ПМИД   9533030 .
  8. ^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК   4076475 . ПМИД   23965338 .
  9. ^ «SDHD - малая субъединица цитохрома b сукцинатдегидрогеназы [убихинон], митохондриальная» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .
  10. ^ Сунь Ф, Хо X, Чжай Ю, Ван А, Сюй Дж, Су Д, Бартлам М, Рао З (июль 2005 г.). «Кристаллическая структура белкового комплекса дыхательной мембраны митохондрий II» . Клетка . 121 (7): 1043–57. дои : 10.1016/j.cell.2005.05.025 . ПМИД   15989954 . S2CID   16697879 .
  11. ^ Хорсфилд Р., Янковская В., Секстон Г., Уиттингем В., Шиоми К., Омура С., Бирн Б., Чеккини Г., Ивата С. (март 2006 г.). «Структурный и вычислительный анализ хинонсвязывающего сайта комплекса II (сукцинат-убихинон оксидоредуктаза): механизм переноса электрона и протонной проводимости при восстановлении убихинона» . Журнал биологической химии . 281 (11): 7309–16. дои : 10.1074/jbc.m508173200 . ПМИД   16407191 .
  12. ^ Байсал Б.Е., Феррелл Р.Э., Уиллетт-Брозик Дж.Э., Лоуренс Э.К., Миссиорек Д., Бош А., ван дер Мей А., Ташнер П.Е., Рубинштейн В.С., Майерс Э.Н., Ричард К.В., Корнелисс С.Дж., Девили П., Девлин Б. (февраль 2000 г.). «Мутации в SDHD, гене митохондриального комплекса II, при наследственной параганглиоме». Наука . 287 (5454): 848–51. Бибкод : 2000Sci...287..848B . дои : 10.1126/science.287.5454.848 . ПМИД   10657297 .
  13. ^ Jump up to: а б «Наследственная параганглиома-феохромоцитома» . Домашний справочник по генетике . Национальная медицинская библиотека США . Проверено 26 марта 2015 г.
  14. ^ Jump up to: а б «СДХД» . Домашний справочник по генетике . Национальная медицинская библиотека США . Проверено 26 марта 2015 г.
  15. ^ «Ген SDHD» . www.genecards.org . База данных генов человека GeneCards . Проверено 30 июля 2018 г.
  16. ^ Джексон CB, Нуоффер Дж. М., Хан Д., Прокиш Х., Хабербергер Б., Гаучи М., Хеберли А., Галлати С., Шаллер А. (март 2014 г.). «Мутации в SDHD приводят к аутосомно-рецессивной энцефаломиопатии и изолированному дефициту митохондриального комплекса II». Журнал медицинской генетики . 51 (3): 170–5. doi : 10.1136/jmedgenet-2013-101932 . ПМИД   24367056 . S2CID   25057245 .
  17. ^ Олстон К.Л., Чеккателли Берти С., Блейкли Э.Л., Олахова М., Хе Л., МакМахон С.Дж., Олпин С.Е., Харгривс И.П., Нолли С., МакФарланд Р., Гоффрини П., О'Салливан М.Дж., Тейлор Р.В. (август 2015 г.). «Рецессивная гомозиготная мутация p.Asp92Gly SDHD вызывает пренатальную кардиомиопатию и тяжелый дефицит митохондриального комплекса II» . Генетика человека . 134 (8): 869–79. дои : 10.1007/s00439-015-1568-z . ПМЦ   4495259 . ПМИД   26008905 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .


Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: eda264392dbb9e48fa6adbf36206c76e__1717384920
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/ed/6e/eda264392dbb9e48fa6adbf36206c76e.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
SDHD - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)