COQ7
| COQ7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | COQ7 , CAT5, CLK-1, CLK1, COQ10D8, коэнзим Q7, гидроксилаза | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | ОМИМ : 601683 ; МГИ : 107207 ; Гомологен : 6953 ; Генные карты : COQ7 ; OMA : COQ7 – ортологи | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Митохондриальная 5-деметоксиубихинонгидроксилаза ( DMQ-гидроксилаза ), также известная как кофермент Q7, гидроксилаза , представляет собой фермент , который у человека кодируется COQ7 геном . Ген clk-1 ( lock-1 ) кодирует этот белок , необходимый для биосинтеза убихинона у червя Caenorhabditis elegans и других эукариот . Мышиная , версия гена называется mclk-1 человека, плодовой мухи и дрожжей а гомолог COQ7 (белок биосинтеза кофермента Q 7). [5] [6]
CLK-1 не следует путать с несвязанным с ним человеческим белком CLK1, который играет роль в сплайсинге РНК .
Структура
[ редактировать ]Белок имеет два повтора примерно из 90 аминокислот , которые содержат два консервативных мотива, которые, как предполагается, важны для координации железа. Структура и функция гена высоко консервативны среди разных видов. [7]
Белок C. elegans содержит 187 аминокислотных остатков (20 килодальтон ), человеческий гомолог - 217 аминокислотных остатков (24 килодальтон, ген состоит из шести экзонов , охватывающих 11 т.п.н. и расположенных на хромосоме 16 ). [8]
Митохондриальная функция
[ редактировать ]Убихинон представляет собой небольшой окислительно-восстановительный липид , который содержится в большинстве клеточных мембран, где он действует как кофактор во многих клеточных окислительно-восстановительных процессах, включая митохондриальный транспорт электронов . В качестве кофактора убихинон часто участвует в процессах образования активных форм кислорода (АФК). Кроме того, убихинон является одним из основных эндогенных антиоксидантов клетки. Фермент CLK-1 отвечает за гидроксилирование 5-деметоксиубихинона в 5-гидроксиубихинон.
Было показано, что мутации в этом гене связаны с увеличением продолжительности жизни . [5] [7] Дефекты гена замедляют различные процессы развития и физиологические процессы, включая клеточный цикл, эмбриогенез, постэмбриональный рост, ритмическое поведение и старение. [9]
Ядерная функция
[ редактировать ]CLK-1 и COQ7 преимущественно локализуются в митохондриях и участвуют в пути биосинтеза убихинона, который там находится. Однако небольшой пул CLK-1 и COQ7 перемещается в ядро в ответ на выработку АФК нормально функционирующими митохондриями как в клетках червей, так и в клетках человека соответственно. [10] Транслокация CLK-1 и COQ7 представляет собой ретроградный сигнальный путь от митохондрий к ядерному, который подавляет реакции митохондрий на стресс. Считается, что митохондриальный и ядерный пулы CLK-1 независимо вносят вклад в регуляцию продолжительности жизни червей. Считается, что ядерная форма CLK-1 и COQ7 регулирует экспрессию генов посредством неустановленного механизма.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000167186 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030652 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Jump up to: а б Юбэнк Дж.Дж., Барнс Т.М., Лаковски Б., Люсье М., Бусси Х., Хекими С. (февраль 1997 г.). «Структурная и функциональная консервативность гена синхронизации Caenorhabditis elegans clk-1». Наука . 275 (5302): 980–3. дои : 10.1126/science.275.5302.980 . ПМИД 9020081 . S2CID 32191959 .
- ^ «Ген Энтреза: гомолог коэнзима Q7 COQ7, убихинон (дрожжи)» .
- ^ Jump up to: а б Лю Икс, Цзян Н., Хьюз Б., Биграс Э., Шубридж Э., Хэкими С. (октябрь 2005 г.). «Эволюционная консервация clk-1-зависимого механизма долголетия: потеря mclk1 увеличивает клеточную пригодность и продолжительность жизни у мышей» . Генс Дев . 19 (20): 2424–34. дои : 10.1101/gad.1352905 . ПМЦ 1257397 . ПМИД 16195414 .
- ^ Асауми С., Куроянаги Х., Секи Н., Ширасава Т. (июнь 1999 г.). «Ортологи гена долголетия clk-1 Caenorhabditis elegans у мышей и человека». Геномика . 58 (3): 293–301. дои : 10.1006/geno.1999.5838 . ПМИД 10373327 .
- ^ Фелкай С., Юбанк Дж.Дж., Лемье Дж., Лаббе Дж.К., Браун Г.Г., Хекими С. (апрель 1999 г.). «CLK-1 контролирует дыхание, поведение и старение нематоды Caenorhabditis elegans» . ЭМБО Дж . 18 (7): 1783–92. дои : 10.1093/emboj/18.7.1783 . ПМК 1171264 . ПМИД 10202142 .
- ^ Монаган Р.М., Барнс Р.Г., Фишер К., Андреу Т., Руни Н., Пулин ГБ, Уитмарш А.Дж. (июнь 2015 г.). «Ядерная роль дыхательного фермента CLK-1 в регуляции реакции митохондрий на стресс и долголетия» . Природная клеточная биология . 17 (6): 782–92. дои : 10.1038/ncb3170 . ПМЦ 4539581 . ПМИД 25961505 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
- Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
- Йонассен Т., Профт М., Рандес-Гил Ф. и др. (1998). «Дрожжевой гомолог Clk-1 (Coq7/Cat5) представляет собой митохондриальный белок, участвующий в синтезе кофермента Q» . Ж. Биол. Хим . 273 (6): 3351–7. дои : 10.1074/jbc.273.6.3351 . ПМИД 9452453 .
- Асауми С., Куроянаги Х., Секи Н., Ширасава Т. (1999). «Ортологи гена долголетия clk-1 Caenorhabditis elegans у мышей и человека». Геномика . 58 (3): 293–301. дои : 10.1006/geno.1999.5838 . ПМИД 10373327 .
- Вахо З., Кинг Л.М., Йонассен Т. и др. (2000). «Сохранение гена синхронизации clk-1 Caenorhabditis elegans от дрожжей к человеку: ген, необходимый для биосинтеза убихинона с потенциальными последствиями для старения». Мамм. Геном . 10 (10): 1000–4. дои : 10.1007/s003359901147 . ПМИД 10501970 . S2CID 13800512 .
- Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
- Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
- Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
- Стенмарк П., Грюнлер Дж., Маттссон Дж. и др. (2001). «Новый член семейства белков ди-железо-карбоксилата. Coq7 (clk-1), мембраносвязанная гидроксилаза, участвующая в биосинтезе убихинона» . Ж. Биол. Хим . 276 (36): 33297–300. дои : 10.1074/jbc.C100346200 . ПМИД 11435415 .
- Такахаши М., Асауми С., Хонда С. и др. (2001). «Мышиный ортолог coq7/clk-1 спас замедленное ритмическое поведение и увеличил продолжительность жизни мутанта долголетия clk-1 у Caenorhabditis elegans». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 286 (3): 534–40. дои : 10.1006/bbrc.2001.5439 . ПМИД 11511092 .
- Ри С (2002). «CLK-1/Coq7p представляет собой монооксигеназу DMQ и новый член семейства белков дикарбоксилата железа» . ФЭБС Летт . 509 (3): 389–94. дои : 10.1016/S0014-5793(01)03099-X . ПМИД 11749961 . S2CID 28650687 .
- Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
- Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
- Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
- COQ7 Расположение человеческого гена в браузере генома UCSC .
- Подробности о гене человека COQ7 в браузере генома UCSC .
 | Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 16 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |