Коэнзим Q5, метилтрансфераза

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

2-Метокси-6-полипренил-1,4-бензохинолметилаза
2-Метокси-6-полипренил-1,4-бензохинолметилаза
Идентификаторы
Номер ЕС.	2.1.1.201
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
Экспаси	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	АмиГО / QuickGO
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

COQ5
Идентификаторы
Псевдонимы	COQ5 , коэнзим Q5, метилтрансфераза, COQ10D9
Внешние идентификаторы	Опустить : 616359 ; МГИ : 1098643 ; Гомологен : 6559 ; GeneCards : COQ5 ; OMA : COQ5 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	120,534,434 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	115,435,031 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	muscle of thigh; ; gastrocnemius muscle; ; skeletal muscle tissue; ; apex of heart; ; right lobe of liver; ; mucosa of transverse colon; ; left ventricle; ; right adrenal cortex; ; islet of Langerhans; ; gonad;
	Top expressed in
	muscle of thigh; ; Paneth cell; ; digastric muscle; ; sternocleidomastoid muscle; ; interventricular septum; ; motor neuron; ; genital tubercle; ; quadriceps femoris muscle; ; vastus lateralis muscle; ; temporal muscle;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	methyltransferase activity; transferase activity; protein binding; 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase activity; 2-decaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methyltransferase activity;
Cellular component	membrane; mitochondrion; mitochondrial inner membrane; mitochondrial matrix; protein-containing complex; extrinsic component of mitochondrial inner membrane;
Biological process	ubiquinone biosynthetic process; methylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	84274
	52064
	ENSG00000110871
	ENSMUSG00000041733
	Q5HYK3
	Q9CXI0
	НМ_032314
	НМ_026504
	НП_115690
	НП_080780
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Коэнзим Q5, метилтрансфераза , более известный как COQ5 , представляет собой фермент, участвующий в цепи переноса электронов . ^[5]^[6]^[7]^[8] COQ5 расположен в матриксе и участвует в биосинтезе убихинона митохондриальном . ^[9]

Функция

COQ5 играет роль катализатора C-метилирования в кофермента Q. биосинтезе ^[9] на бензойном кольце CoQ6 , промежуточного продукта биосинтеза, ^[10] как у человека, так и у дрожжей Saccharomyces cerevisiae . ^[9] COQ5 — один из одиннадцати полипептидов дрожжей, которые необходимы для производства Q. Более того, он собирается с CoQ-синтомом , многосубъединичным комплексом. У людей первичный дефицит Q возникает из-за мутации многих генов COQ. А такие заболевания, как митохондриальные, сердечно-сосудистые, почечные и нейродегенеративные заболевания, являются результатом снижения биосинтеза Q. ^[9] Разработка растворимых белков COQ5 может быть применена к другим митохондриальным белкам. Дефицит коэнзима Q10 связан с COQ5. Следовательно, для поддержания уровня CoQ10 в клетках человека необходим COQ5. ^[10]^[11]

Каталитическая активность

Катализирует C-метилирование и процесс биосинтеза убихинона . ^[12]

Механизм

COQ5 представляет собой S-аденозилметионин (SAM)-зависимую метилтрансферазу (SAM-MTase), катализирующую стадию C-метилирования, превращающую 2-метокси-6-полипренил-1,4-бензохинон (DDMQH ₂ ) в 2-метокси-5- метил-6-полипренил-1,4-бензохинон (DMQH ₂ ) в пути биосинтеза CoQ6. ^[13]

В каталитическом механизме COQ5, основанном на структурном анализе, на первом этапе перед переносом метила Arg201 отрывает водород от молекулы воды, образуя отрицательно заряженный атом кислорода, который депротонирует атом C5 DDMQH2. Если посмотреть на субстрат DDMQH2 и Asn202, то можно увидеть, что гидроксильная группа на атоме C4 и боковой цепи образует водородную связь, которая приводит к образованию аниона O4'. Стабильность аниона C5 является результатом делокализации отрицательного заряда в системе сопряжения π-связи. Tyr78 действует как каталитическое основание, а Tyr78, Arg201 и Asn202 инвариантны в гомологах COQ5. ^[13]^[14]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000110871 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041733 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ли П.Т., Сюй А.Ю., Ха Х.Т., Кларк К.Ф. (март 1997 г.). «C-метилтрансфераза, участвующая в биосинтезе убихинона и менахинона: выделение и идентификация гена ubiE Escherichia coli» . Журнал бактериологии . 179 (5): 1748–1754. дои : 10.1128/jb.179.5.1748-1754.1997 . ПМК 178890 . ПМИД 9045837 .
^ Янг И.Г., Макканн Л.М., Строобант П., Гибсон Ф. (март 1971 г.). «Характеристика и генетический анализ мутантных штаммов Escherichia coli К-12, аккумулирующих предшественники бихинонов 2-октапренил-6-метокси-1,4-бензохинон и 2-октапренил-3-метил-6-метокси-1,4-бензохинон» . Журнал бактериологии . 105 (3): 769–778. дои : 10.1128/jb.105.3.769-778.1971 . ПМЦ 248499 . ПМИД 4323297 .
^ Дибров Э., Робинсон К.М., Лемир Б.Д. (апрель 1997 г.). «Ген COQ5 кодирует митохондриальный белок дрожжей, необходимый для биосинтеза убихинона и сборки дыхательной цепи» . Журнал биологической химии . 272 (14): 9175–9181. дои : 10.1074/jbc.272.14.9175 . ПМИД 9083048 .
^ Баркович Р.Дж., Штанько А., Шеперд Дж.А., Ли П.Т., Майлз Д.С., Цаголов А., Кларк К.Ф. (апрель 1997 г.). «Характеристика гена COQ5 из Saccharomyces cerevisiae. Доказательства участия C-метилтрансферазы в биосинтезе убихинона» . Журнал биологической химии . 272 (14): 9182–9188. дои : 10.1074/jbc.272.14.9182 . ПМИД 9083049 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Нгуен Т.П., Казарин А., Десбатс М.А., Доймо М., Тревиссон Э., Сантос-Оканья С. и др. (ноябрь 2014 г.). «Молекулярная характеристика C-метилтрансферазы COQ5 человека в биосинтезе кофермента Q10» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1841 (11): 1628–1638. дои : 10.1016/j.bbalip.2014.08.007 . ПМЦ 4331671 . ПМИД 25152161 .
^ Jump up to: ^а ^б Чен СВ, Лю CC, Йен ХК (март 2013 г.). «Обнаружение подавления созревания человеческого белка COQ5 в митохондриях после митохондриального разобщения антителом, распознающим как предшественник, так и зрелые формы COQ5». Митохондрия . 13 (2): 143–152. дои : 10.1016/j.mito.2013.01.007 . ПМИД 23354120 .
^ Йен Х.К., Лю Ю.К., Кан К.С., Вэй Х.Дж., Ли Ш., Вэй Ю.Х. и др. (сентябрь 2016 г.). «Нарушение человеческого COQ5-содержащего белкового комплекса связано со снижением уровня коэнзима Q10 при двух разных состояниях дефицита митохондриальной энергии». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Общие предметы . 1860 (9): 1864–1876. дои : 10.1016/j.bbagen.2016.05.005 . ПМИД 27155576 .
^ «Ген COQ5 – коэнзим Q5, метилтрансфераза» . База данных генов человека GeneCards . Институт науки Вейцмана.
^ Jump up to: ^а ^б Дай Ю.Н., Чжоу К., Цао Д.Д., Цзян Ю.Л., Мэн Ф., Чи CB и др. (август 2014 г.). «Кристаллические структуры и каталитический механизм C-метилтрансферазы Coq5 дают представление о ключевом этапе пути синтеза дрожжевого кофермента Q». Акта Кристаллографика. Раздел D. Биологическая кристаллография . 70 (Часть 8): 2085–2092. дои : 10.1107/s1399004714011559 . ПМИД 25084328 .
^ Хуанг К.С., Смит К.В., Гликман М.С., Джейкобс В.Р., Саккеттини Дж.К. (март 2002 г.). «Кристаллические структуры циклопропансинтаз миколевой кислоты микобактерий туберкулеза» . Журнал биологической химии . 277 (13): 11559–11569. дои : 10.1074/jbc.m111698200 . ПМИД 11756461 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000110871 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041733 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Ли П.Т., Сюй А.Ю., Ха Х.Т., Кларк К.Ф. (март 1997 г.). «C-метилтрансфераза, участвующая в биосинтезе убихинона и менахинона: выделение и идентификация гена ubiE Escherichia coli» . Журнал бактериологии . 179 (5): 1748–1754. дои : 10.1128/jb.179.5.1748-1754.1997 . ПМК 178890 . ПМИД 9045837 .

[6] Янг И.Г., Макканн Л.М., Строобант П., Гибсон Ф. (март 1971 г.). «Характеристика и генетический анализ мутантных штаммов Escherichia coli К-12, аккумулирующих предшественники бихинонов 2-октапренил-6-метокси-1,4-бензохинон и 2-октапренил-3-метил-6-метокси-1,4-бензохинон» . Журнал бактериологии . 105 (3): 769–778. дои : 10.1128/jb.105.3.769-778.1971 . ПМЦ 248499 . ПМИД 4323297 .

[7] Дибров Э., Робинсон К.М., Лемир Б.Д. (апрель 1997 г.). «Ген COQ5 кодирует митохондриальный белок дрожжей, необходимый для биосинтеза убихинона и сборки дыхательной цепи» . Журнал биологической химии . 272 (14): 9175–9181. дои : 10.1074/jbc.272.14.9175 . ПМИД 9083048 .

[8] Баркович Р.Дж., Штанько А., Шеперд Дж.А., Ли П.Т., Майлз Д.С., Цаголов А., Кларк К.Ф. (апрель 1997 г.). «Характеристика гена COQ5 из Saccharomyces cerevisiae. Доказательства участия C-метилтрансферазы в биосинтезе убихинона» . Журнал биологической химии . 272 (14): 9182–9188. дои : 10.1074/jbc.272.14.9182 . ПМИД 9083049 .

[Nguyen_2014-9] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Нгуен Т.П., Казарин А., Десбатс М.А., Доймо М., Тревиссон Э., Сантос-Оканья С. и др. (ноябрь 2014 г.). «Молекулярная характеристика C-метилтрансферазы COQ5 человека в биосинтезе кофермента Q10» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1841 (11): 1628–1638. дои : 10.1016/j.bbalip.2014.08.007 . ПМЦ 4331671 . ПМИД 25152161 .

[auto2-10] Jump up to: ^а ^б Чен СВ, Лю CC, Йен ХК (март 2013 г.). «Обнаружение подавления созревания человеческого белка COQ5 в митохондриях после митохондриального разобщения антителом, распознающим как предшественник, так и зрелые формы COQ5». Митохондрия . 13 (2): 143–152. дои : 10.1016/j.mito.2013.01.007 . ПМИД 23354120 .

[11] Йен Х.К., Лю Ю.К., Кан К.С., Вэй Х.Дж., Ли Ш., Вэй Ю.Х. и др. (сентябрь 2016 г.). «Нарушение человеческого COQ5-содержащего белкового комплекса связано со снижением уровня коэнзима Q10 при двух разных состояниях дефицита митохондриальной энергии». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Общие предметы . 1860 (9): 1864–1876. дои : 10.1016/j.bbagen.2016.05.005 . ПМИД 27155576 .

[12] «Ген COQ5 – коэнзим Q5, метилтрансфераза» . База данных генов человека GeneCards . Институт науки Вейцмана.

[auto-13] Jump up to: ^а ^б Дай Ю.Н., Чжоу К., Цао Д.Д., Цзян Ю.Л., Мэн Ф., Чи CB и др. (август 2014 г.). «Кристаллические структуры и каталитический механизм C-метилтрансферазы Coq5 дают представление о ключевом этапе пути синтеза дрожжевого кофермента Q». Акта Кристаллографика. Раздел D. Биологическая кристаллография . 70 (Часть 8): 2085–2092. дои : 10.1107/s1399004714011559 . ПМИД 25084328 .

[14] Хуанг К.С., Смит К.В., Гликман М.С., Джейкобс В.Р., Саккеттини Дж.К. (март 2002 г.). «Кристаллические структуры циклопропансинтаз миколевой кислоты микобактерий туберкулеза» . Журнал биологической химии . 277 (13): 11559–11569. дои : 10.1074/jbc.m111698200 . ПМИД 11756461 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]