АКАДСБ

АКАДСБ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2JIF
Идентификаторы
Псевдонимы	ACADSB , ацил-КоА-дегидрогеназа, короткая/разветвленная цепь, 2-MEBCAD, ACAD7, SBCAD, ацил-КоА-дегидрогеназа с короткой/разветвленной цепью
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 600301 ; МГИ : 1914135 ; Гомологен : 1216 ; GeneCards : ACADSB ; ОМА : ACADSB — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	123,058,290 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	131,050,673 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of liver; ; biceps brachii; ; renal medulla; ; right ventricle; ; duodenum; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; jejunal mucosa; ; human kidney; ; gastrocnemius muscle;
	Top expressed in
	muscle of thigh; ; epithelium of stomach; ; Epithelium of choroid plexus; ; right kidney; ; parotid gland; ; brown adipose tissue; ; seminal vesicula; ; masseter muscle; ; ciliary body; ; white adipose tissue;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors; oxidoreductase activity; acyl-CoA dehydrogenase activity; flavin adenine dinucleotide binding;
Cellular component	mitochondrial matrix; mitochondrion;
Biological process	branched-chain amino acid catabolic process; fatty acid metabolic process; lipid metabolism;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	36
	66885
	ENSG00000196177
	ENSMUSG00000030861
	P45954
	Q9DBL1
	НМ_001609 ; НМ_001330174
	НМ_025826
	НП_001317103 ; НП_001600
	НП_080102
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

ACADSB — это человеческий ген , который кодирует специфическую ацил-КоА-дегидрогеназу с короткой/разветвленной цепью (SBCAD), фермент из семейства ацил-КоА-дегидрогеназы .

Это может вызвать дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью . ^[5]

Структура

Ген ACADSB человека расположен на хромосоме 10 ; его точная локализация была определена как 10q25-q26. ^[6] Открытая рамка считывания (ORF) кодирует белок-предшественник, содержащий 431 аминокислоту ; посттрансляционный процессинг приводит к образованию зрелого белка с 399 аминокислотами. кДНК значительно похожа на кДНК других членов семейства ацил-КоА-дегидрогеназ; его структура наиболее близка к структуре короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы. ^[7] Также была изучена структура каталитического кармана; положение 104 в нижней части кармана для связывания субстрата было идентифицировано как важное для определения длины первичной углеродной цепи, которая может быть размещена. Было показано, что изменение остатков в положениях 105 и 177 влияет на скорость реакций дегидрирования . ^[8]

Функция

Ацил-КоА-дегидрогеназа с короткой/разветвленной цепью (ACADSB) является членом семейства ферментов ацил-КоА-дегидрогеназы, которые катализируют дегидрирование производных ацил-КоА при метаболизме жирных кислот или аминокислот с разветвленной цепью. Субстратная специфичность является основной характеристикой, используемой для определения членов этого семейства генов. Продукт гена ACADSB обладает наибольшей активностью по отношению к производному ацил-КоА с короткой разветвленной цепью, (S)-2-метилбутирил-КоА, но также в значительной степени реагирует с другими 2-метиловыми субстратами с разветвленной цепью и с короткоцепочечным ацил- КоА с прямой цепью . ^[9] Кодируемый белок также участвует в катаболизме L- лейцина . ^[10]

Клиническое значение

Мутации в гене ACADSB связаны с дефицитом 2-метилбутирил-КоА-дегидрогеназы (SBCADD, также известным как MBD), аутосомно -рецессивным метаболическим заболеванием, вызывающим нарушение деградации изолейцина . ^[11] Было выявлено множество мутаций в 10 экзонах гена, вызывающих пропуск экзонов и другие ошибки транскрипции и трансляции. Заболевание может быть обнаружено с помощью обычного скрининга новорожденных на основе MS/MS из-за повышенного присутствия 2-метилбутирилкарнитина в образцах тканей. ^[12]^[13] Заболевание также можно выявить с помощью анализа органических кислот мочи путем выявления присутствия 2- метилбутирилглицинурии . ^[10] Хотя у многих людей с мутацией в этом гене симптомы могут протекать бессимптомно, сообщалось, что у некоторых пациентов симптомы проявляются в раннем детстве. У младенцев могут наблюдаться апноэ эпизоды , генерализованная мышечная атрофия , гипотония , летаргия , судороги и задержка моторного развития. Пациенты также могут испытывать метаболические симптомы, такие как гипотермия и гипогликемия . ^[14] Наконец, генетические полиморфизмы гена ACADSB также могут быть вовлечены в развитие гипертонии у японской популяции. ^[15]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196177 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030861 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Андресен Б.С., Кристенсен Э., Коридон Т.Дж., Бросс П., Пилгаард Б., Вандерс Р.Дж., Руитер Дж.П., Симонсен Х., Винтер В., Кнудсен И., Шредер Л.Д., Грегерсен Н., Сковби Ф. (ноябрь 2000 г.). «Изолированная 2-метилбутирилглицинурия, вызванная дефицитом ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью: идентификация нового дефекта фермента, выяснение его молекулярной основы и доказательства существования различных ацил-КоА-дегидрогеназ в метаболизме изолейцина и валина» . Американский журнал генетики человека . 67 (5): 1095–103. дои : 10.1086/303105 . ПМЦ 1288551 . ПМИД 11013134 .
^ Арден К.С., Виарс К.С., Фу К., Розен Р. (февраль 1995 г.). «Локализация ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью (ACADSB) на хромосоме 10 человека». Геномика . 25 (3): 743–5. дои : 10.1016/0888-7543(95)80023-ф . ПМИД 7759115 .
^ Розен Р., Вокли Дж., Чжоу Л., Милош Р., Уиллард Дж., Фу К., Виканек С., Лоу-Нанг Л., Торбан Э., Фурнье Б. (ноябрь 1994 г.). «Выделение и экспрессия кДНК, кодирующей предшественник нового члена (ACADSB) семейства генов ацил-КоА-дегидрогеназы». Геномика . 24 (2): 280–7. дои : 10.1006/geno.1994.1617 . ПМИД 7698750 .
^ Хе М., Бургхардт Т.П., Вокли Дж. (сентябрь 2003 г.). «Новый подход к характеристике субстратной специфичности ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью» . Журнал биологической химии . 278 (39): 37974–86. дои : 10.1074/jbc.M306882200 . ПМИД 12855692 .
^ «Ген Энтрез: ацил-КоА-дегидрогеназа, короткая/разветвленная цепь» .
^ Jump up to: ^а ^б Андресен Б.С., Кристенсен Э., Коридон Т.Дж., Бросс П., Пилгаард Б., Вандерс Р.Дж., Руитер Дж.П., Симонсен Х., Винтер В., Кнудсен И., Шредер Л.Д., Грегерсен Н., Сковби Ф. (ноябрь 2000 г.). «Изолированная 2-метилбутирилглицинурия, вызванная дефицитом ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью: идентификация нового дефекта фермента, выяснение его молекулярной основы и доказательства существования различных ацил-КоА-дегидрогеназ в метаболизме изолейцина и валина» . Американский журнал генетики человека . 67 (5): 1095–103. дои : 10.1086/303105 . ПМЦ 1288551 . ПМИД 11013134 .
^ Сасс Д.О., Энсенауэр Р., Рёшингер В., Райх Х., Стойервальд У., Ширрмахер О., Энгель К., Хаберле Дж., Андресен Б.С., Мегарбане А., Ленерт В., Зшоке Дж. (январь 2008 г.). «Дефицит 2-метилбутирил-коэнзима А дегидрогеназы: функциональные и молекулярные исследования дефекта катаболизма изолейцина». Молекулярная генетика и обмен веществ . 93 (1): 30–5. дои : 10.1016/j.ymgme.2007.09.002 . ПМИД 17945527 .
^ Мэдсен П.П., Кибек М., Рока Х, Сачиданандам Р., Крайнер А.Р., Кристенсен Э., Штайнер Р.Д., Гибсон К.М., Коридон Т.Дж., Кнудсен И., Вандерс Р.Дж., Руитер Дж.П., Грегерсен Н., Андресен Б.С. (февраль 2006 г.). «Дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью из-за мутации IVS3 + 3A>G, которая вызывает пропуск экзона». Генетика человека . 118 (6): 680–90. дои : 10.1007/s00439-005-0070-4 . ПМИД 16317551 . S2CID 22861705 .
^ Альфардан Дж., Мохсен А.В., Коупленд С., Эллисон Дж., Кеппен-Дэвис Л., Рорбах М., Пауэлл Б.Р., Гиллис Дж., Матерн Д., Кант Дж., Вокли Дж. (август 2010 г.). «Характеристика новых мутаций последовательности гена ACADSB и их клиническое значение у пациентов с 2-метилбутирилглицинурией, выявленной при скрининге новорожденных» . Молекулярная генетика и обмен веществ . 100 (4): 333–8. дои : 10.1016/j.ymgme.2010.04.014 . ПМЦ 2906669 . ПМИД 20547083 .
^ Гибсон К.М., Бурлингейм Т.Г., Хогема Б., Якобс С., Шутгенс Р.Б., Миллингтон Д., Роу С.Р., Роу Д.С., Свитман Л., Штайнер Р.Д., Линк Л., Поховалла П., Сакс М., Кисс Д., Ринальдо П., Вокли Дж. (июнь 2000 г.) ). «Дефицит 2-метилбутирил-коэнзима А-дегидрогеназы: новая врожденная ошибка метаболизма L-изолейцина» . Педиатрические исследования . 47 (6): 830–3. дои : 10.1203/00006450-200006000-00025 . ПМИД 10832746 .
^ Камид К., Кокубо Ю., Ян Дж., Матайоши Т., Инамото Н., Такиути С., Хорио Т., Мива Ю., Ёси М., Томоике Х., Танака С., Банно М., Окуда Т., Кавано Ю., Мията Т. (январь 2007 г.). «Связь генетических полиморфизмов ACADSB и COMT с гипертонией человека». Журнал гипертонии . 25 (1): 103–10. дои : 10.1097/HJH.0b013e3280103a40 . ПМИД 17143180 . S2CID 40885244 .

Внешние ссылки

человека ACADSB Расположение генома ACADSB и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P45954 (специфическая ацил-КоА-дегидрогеназа с короткой/разветвленной цепью, митохондриальная) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта оксидоредуктазе статья об незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196177 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030861 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11013134-5] Андресен Б.С., Кристенсен Э., Коридон Т.Дж., Бросс П., Пилгаард Б., Вандерс Р.Дж., Руитер Дж.П., Симонсен Х., Винтер В., Кнудсен И., Шредер Л.Д., Грегерсен Н., Сковби Ф. (ноябрь 2000 г.). «Изолированная 2-метилбутирилглицинурия, вызванная дефицитом ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью: идентификация нового дефекта фермента, выяснение его молекулярной основы и доказательства существования различных ацил-КоА-дегидрогеназ в метаболизме изолейцина и валина» . Американский журнал генетики человека . 67 (5): 1095–103. дои : 10.1086/303105 . ПМЦ 1288551 . ПМИД 11013134 .

[6] Арден К.С., Виарс К.С., Фу К., Розен Р. (февраль 1995 г.). «Локализация ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью (ACADSB) на хромосоме 10 человека». Геномика . 25 (3): 743–5. дои : 10.1016/0888-7543(95)80023-ф . ПМИД 7759115 .

[7] Розен Р., Вокли Дж., Чжоу Л., Милош Р., Уиллард Дж., Фу К., Виканек С., Лоу-Нанг Л., Торбан Э., Фурнье Б. (ноябрь 1994 г.). «Выделение и экспрессия кДНК, кодирующей предшественник нового члена (ACADSB) семейства генов ацил-КоА-дегидрогеназы». Геномика . 24 (2): 280–7. дои : 10.1006/geno.1994.1617 . ПМИД 7698750 .

[8] Хе М., Бургхардт Т.П., Вокли Дж. (сентябрь 2003 г.). «Новый подход к характеристике субстратной специфичности ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью» . Журнал биологической химии . 278 (39): 37974–86. дои : 10.1074/jbc.M306882200 . ПМИД 12855692 .

[entrez-9] «Ген Энтрез: ацил-КоА-дегидрогеназа, короткая/разветвленная цепь» .

[pmid1101-10] Jump up to: ^а ^б Андресен Б.С., Кристенсен Э., Коридон Т.Дж., Бросс П., Пилгаард Б., Вандерс Р.Дж., Руитер Дж.П., Симонсен Х., Винтер В., Кнудсен И., Шредер Л.Д., Грегерсен Н., Сковби Ф. (ноябрь 2000 г.). «Изолированная 2-метилбутирилглицинурия, вызванная дефицитом ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью: идентификация нового дефекта фермента, выяснение его молекулярной основы и доказательства существования различных ацил-КоА-дегидрогеназ в метаболизме изолейцина и валина» . Американский журнал генетики человека . 67 (5): 1095–103. дои : 10.1086/303105 . ПМЦ 1288551 . ПМИД 11013134 .

[11] Сасс Д.О., Энсенауэр Р., Рёшингер В., Райх Х., Стойервальд У., Ширрмахер О., Энгель К., Хаберле Дж., Андресен Б.С., Мегарбане А., Ленерт В., Зшоке Дж. (январь 2008 г.). «Дефицит 2-метилбутирил-коэнзима А дегидрогеназы: функциональные и молекулярные исследования дефекта катаболизма изолейцина». Молекулярная генетика и обмен веществ . 93 (1): 30–5. дои : 10.1016/j.ymgme.2007.09.002 . ПМИД 17945527 .

[12] Мэдсен П.П., Кибек М., Рока Х, Сачиданандам Р., Крайнер А.Р., Кристенсен Э., Штайнер Р.Д., Гибсон К.М., Коридон Т.Дж., Кнудсен И., Вандерс Р.Дж., Руитер Дж.П., Грегерсен Н., Андресен Б.С. (февраль 2006 г.). «Дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой/разветвленной цепью из-за мутации IVS3 + 3A>G, которая вызывает пропуск экзона». Генетика человека . 118 (6): 680–90. дои : 10.1007/s00439-005-0070-4 . ПМИД 16317551 . S2CID 22861705 .

[13] Альфардан Дж., Мохсен А.В., Коупленд С., Эллисон Дж., Кеппен-Дэвис Л., Рорбах М., Пауэлл Б.Р., Гиллис Дж., Матерн Д., Кант Дж., Вокли Дж. (август 2010 г.). «Характеристика новых мутаций последовательности гена ACADSB и их клиническое значение у пациентов с 2-метилбутирилглицинурией, выявленной при скрининге новорожденных» . Молекулярная генетика и обмен веществ . 100 (4): 333–8. дои : 10.1016/j.ymgme.2010.04.014 . ПМЦ 2906669 . ПМИД 20547083 .

[14] Гибсон К.М., Бурлингейм Т.Г., Хогема Б., Якобс С., Шутгенс Р.Б., Миллингтон Д., Роу С.Р., Роу Д.С., Свитман Л., Штайнер Р.Д., Линк Л., Поховалла П., Сакс М., Кисс Д., Ринальдо П., Вокли Дж. (июнь 2000 г.) ). «Дефицит 2-метилбутирил-коэнзима А-дегидрогеназы: новая врожденная ошибка метаболизма L-изолейцина» . Педиатрические исследования . 47 (6): 830–3. дои : 10.1203/00006450-200006000-00025 . ПМИД 10832746 .

[15] Камид К., Кокубо Ю., Ян Дж., Матайоши Т., Инамото Н., Такиути С., Хорио Т., Мива Ю., Ёси М., Томоике Х., Танака С., Банно М., Окуда Т., Кавано Ю., Мията Т. (январь 2007 г.). «Связь генетических полиморфизмов ACADSB и COMT с гипертонией человека». Журнал гипертонии . 25 (1): 103–10. дои : 10.1097/HJH.0b013e3280103a40 . ПМИД 17143180 . S2CID 40885244 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

v т и Оксидоредуктазы : CH–CH оксидоредуктазы ( EC 1.3)
1.3.1 : НАД / НАДФ Акцептор	Эноил-ацил-протеин-редуктаза-носитель / Эноил-АПФ-редуктаза 7-дегидрохолестеринредуктаза Биливердинредуктаза 2,4-диеноил-КоА-редуктаза Дигидроксиметилоксотетрагидрохинолиндегидрогеназа
1.3.3 : кислорода Акцептор	Дигидрооротатдегидрогеназа Копропорфириноген III оксидаза Протопорфириногеноксидаза Билирубиноксидаза Ацил-КоА-оксидаза Дигидроурацилоксидаза Тетрагидробербериноксидаза Секологанинсинтаза Триптофан альфа, бета-оксидаза Пирролохинолин-хинонсинтаза L-галактонолактоноксидаза
1.3.5 : Хинон	Сукцинатдегидрогеназа СДХА СДХБ SDHC SDHD
1.3.99 : Другие акцепторы	Фумаратредуктаза Бутирил-КоА дегидрогеназа Ацил-КоА-дегидрогеназа АКАДСБ АКАДС 5α-редуктаза SRD5A1 СРД5А2 СРД5А3 Глутарил-КоА дегидрогеназа Изовалерилкоэнзим А дегидрогеназа 3-оксо-5бета-стероид 4-дегидрогеназа

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)