АКАДВЛ

АКАДВЛ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2UXW, 3B96
Идентификаторы
Псевдонимы	ACADVL , ацил-КоА-дегидрогеназа, очень длинная цепь, ACAD6, LCACD, VLCAD, ацил-КоА-дегидрогеназа, очень длинная цепь
Внешние идентификаторы	Опустить : 609575 ; МГИ : 895149 ; Гомологен : 5 ; GeneCards : ACADVL ; ОМА : ACADVL — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	7,225,266 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	69,906,237 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right adrenal cortex; ; apex of heart; ; left adrenal cortex; ; anterior pituitary; ; right lobe of liver; ; right hemisphere of cerebellum; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; left ventricle; ; mucosa of transverse colon;
	Top expressed in
	myocardium of ventricle; ; right ventricle; ; cardiac muscles; ; extraocular muscle; ; digastric muscle; ; soleus muscle; ; intercostal muscle; ; sternocleidomastoid muscle; ; masseter muscle; ; thoracic diaphragm;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors; acyl-CoA dehydrogenase activity; oxidoreductase activity; flavin adenine dinucleotide binding; long-chain-acyl-CoA dehydrogenase activity; fatty-acyl-CoA binding; very-long-chain-acyl-CoA dehydrogenase activity;
Cellular component	membrane; mitochondrial matrix; nucleolus; mitochondrion; mitochondrial inner membrane; mitochondrial nucleoid; nucleus; cytosol; mitochondrial membranes;
Biological process	epithelial cell differentiation; negative regulation of fatty acid biosynthetic process; lipid metabolism; negative regulation of fatty acid oxidation; energy derivation by oxidation of organic compounds; fatty acid metabolic process; regulation of cholesterol metabolic process; IRE1-mediated unfolded protein response; fatty acid beta-oxidation; temperature homeostasis; fatty acid catabolic process; response to cold; fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA dehydrogenase;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	37
	11370
	ENSG00000072778
	ENSMUSG00000018574
	P49748
	P50544
	НМ_000018 ; НМ_001033859 ; НМ_001270447 ; НМ_001270448
	НМ_017366
	НП_000009 ; НП_001029031 ; НП_001257376 ; НП_001257377
	НП_059062
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Митохондриальная ацил-КоА-дегидрогеназа с очень длинной цепью (VLCAD) представляет собой фермент, который у человека кодируется ACADVL геном .

Мутации в ACADVL связаны с дефицитом очень длинноцепочечного ацил-коэнзима А-дегидрогеназы . Белок , кодируемый этим геном, направляется на внутреннюю мембрану митохондрий , где он катализирует первый этап пути бета-окисления митохондриальных жирных кислот . Эта ацил-коэнзим А-дегидрогеназа специфична для жирных кислот с длинной и очень длинной цепью . Дефицит этого генного продукта снижает бета-окисление жирных кислот миокарда и связан с кардиомиопатией . Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. ^[5]

Структура

Ген ACADVL содержит 20 экзонов . ^[6] и имеет длину около 5,4 КБ. ^[7] VLCAD имеет интересную генную структуру у человека: он расположен в структуре «голова к голове» с геном DLG4 на 17-й хромосоме , и транскрибируемые области этих генов перекрываются. Было показано, что обработка DEHP приводит к усилению регуляции минимального промотора. ^[8] Хотя DLG4 и VLCAD имеют общие регуляторные элементы, каждый из них имеет отдельные и отдельные тканеспецифичные элементы, которые определяют их функцию. У мышей эти два гена ориентированы «голова к голове», но не перекрываются. ^[7]

Функция

Фермент VLCAD катализирует большую часть бета-окисления жирных кислот путем образования транс - двойной связи C2-C3 в жирной кислоте. VLCAD специфичен для жирных кислот с очень длинной цепью, обычно C16- ацил-КоА и длиннее. ^[9] У мышей с дефицитом VLCAD гиперацетилирование белка в печени практически отсутствует; это означает, что белок VLCAD также необходим для ацетилирования белка в этой биологической системе. ^[10]

Клиническое значение

ACADVL связан с дефицитом очень длинноцепочечного ацил-коэнзима А-дегидрогеназы (VLCADD), который имеет множество симптомов и обычно проявляется в виде одного из трех фенотипов . Первый протекает тяжело, с началом в раннем детстве и высоким уровнем смертности; Наиболее частым симптомом этой формы является кардиомиопатия . Вторая — это детская форма с поздним началом, с более легкими симптомами, которые чаще всего проявляются в виде гипокетотической гипогликемии. Окончательная форма проявляется во взрослом возрасте и проявляется изолированным поражением скелетных мышц, рабдомиолизом и миоглобинурией , вызванной физической нагрузкой или голоданием. ^[11] Заболевание обычно диагностируется путем сначала выполнения тандемной масс-спектрометрии образца крови пациента в период стресса, а затем проведения молекулярно- генетического тестирования на наличие гена ACADVL. Дефицит лечат систематически, но избегают определенных состояний, таких как голодание , раздражение миокарда, обезвоживание и диета с высоким содержанием жиров, чтобы предотвратить вторичные осложнения. ^[12]

Взаимодействия

Было показано, что ACADVL имеет 75 бинарных белок-белковых взаимодействий, включая 73 кокомплексных взаимодействия. ACADVL, по-видимому, взаимодействует с RPSA и GPHN . ^[13]

См. также

Ацил-КоА-дегидрогеназа

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000072778 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018574 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь» .
^ Штраус А.В., Пауэлл К.К., Хейл Д.Е., Андерсон М.М., Ахуджа А., Брэкетт Дж.К., Симс Х.Ф. (ноябрь 1995 г.). «Молекулярные основы дефицита митохондриальной ацил-КоА-дегидрогеназы очень длинной цепи человека, вызывающего кардиомиопатию и внезапную смерть в детстве» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (23): 10496–500. Бибкод : 1995PNAS...9210496S . дои : 10.1073/pnas.92.23.10496 . ПМК 40638 . ПМИД 7479827 .
^ Jump up to: ^а ^б Чжоу С., Блумберг Б. (февраль 2003 г.). «Перекрывающаяся генная структура VLCAD и DLG4 человека». Джин . 305 (2): 161–6. дои : 10.1016/s0378-1119(02)01235-0 . ПМИД 12609736 .
^ Чжан Л.Ф., Дин Дж.Х., Ян Б.З., Хэ Г.К., Роу С. (декабрь 2003 г.). «Характеристика двунаправленной промоторной области между генами человека, кодирующими VLCAD и PSD-95». Геномика . 82 (6): 660–8. дои : 10.1016/s0888-7543(03)00211-8 . ПМИД 14611808 .
^ Аояма Т., Сури М., Усикубо С., Камидзё Т., Ямагути С., Келли Р.И., Рхед В.Дж., Уэтаке К., Танака К., Хашимото Т. (июнь 1995 г.). «Очистка человеческой ацил-коэнзима А-дегидрогеназы с очень длинной цепью и характеристика ее дефицита у семи пациентов» . Журнал клинических исследований . 95 (6): 2465–73. дои : 10.1172/JCI117947 . ПМК 295925 . ПМИД 7769092 .
^ Пуговкина О, Те Бринке Х, Офман Р, ван Крухтен А.Г., Кулик В., Вандерс Р.Дж., Хаутен С.М., де Бур В.К. (июль 2014 г.). «Ацетилирование митохондриального белка происходит под действием ацетил-КоА в результате окисления жирных кислот» . Молекулярная генетика человека . 23 (13): 3513–22. дои : 10.1093/hmg/ddu059 . ПМИД 24516071 .
^ Андресен Б.С., Олпин С., Поортуис Б.Дж., Шольте Х.Р., Виани-Сабан С., Вандерс Р., Ийлст Л., Моррис А., Пурфарзам М., Бартлетт К., Баумгартнер Э.Р., деКлерк Дж.Б., Шредер Л.Д., Коридон Т.Дж., Лунд Х., Винтер В., Бросс П., Болунд Л., Грегерсен Н. (февраль 1999 г.). «Четкая корреляция генотипа с фенотипом заболевания при дефиците ацил-КоА-дегидрогеназы с очень длинной цепью» . Американский журнал генетики человека . 64 (2): 479–94. дои : 10.1086/302261 . ПМЦ 1377757 . ПМИД 9973285 .
^ Лесли, Северная Дакота; Валенсия, Калифорния; Штраус, AW; Чжан, К.; Адам, член парламента; Ардингер, Х.Х.; Пагон, РА; Уоллес, ЮВ; Бин LJH; Стивенс, К.; Амемия, А. (1993). «Очень длинноцепочечный ацил-кофермент и дефицит дегидрогеназы». ПМИД 20301763 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
^ «По поисковому запросу ACADVL найдено 75 бинарных взаимодействий» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 24 августа 2018 г.

Дальнейшее чтение

Коста К.Г., Дорланд Л., де Алмейда И.Т., Якобс К., Дюран М., Poll-The BT (июнь 1998 г.). «Влияние голодания, нагрузки длинноцепочечными триглицеридами и карнитиновой нагрузки на уровни длинноцепочечного ацилкарнитина в плазме при дефиците митохондриальной очень длинноцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы». Журнал наследственных метаболических заболеваний . 21 (4): 391–9. дои : 10.1023/A:1005354624735 . ПМИД 9700596 . S2CID 2198523 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о дефиците ацил-коэнзима А с очень длинной цепью
человека ACADVL Расположение генома и страница сведений о гене ACADVL в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000072778 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018574 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь» .

[6] Штраус А.В., Пауэлл К.К., Хейл Д.Е., Андерсон М.М., Ахуджа А., Брэкетт Дж.К., Симс Х.Ф. (ноябрь 1995 г.). «Молекулярные основы дефицита митохондриальной ацил-КоА-дегидрогеназы очень длинной цепи человека, вызывающего кардиомиопатию и внезапную смерть в детстве» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (23): 10496–500. Бибкод : 1995PNAS...9210496S . дои : 10.1073/pnas.92.23.10496 . ПМК 40638 . ПМИД 7479827 .

[Zhou_2003-7] Jump up to: ^а ^б Чжоу С., Блумберг Б. (февраль 2003 г.). «Перекрывающаяся генная структура VLCAD и DLG4 человека». Джин . 305 (2): 161–6. дои : 10.1016/s0378-1119(02)01235-0 . ПМИД 12609736 .

[8] Чжан Л.Ф., Дин Дж.Х., Ян Б.З., Хэ Г.К., Роу С. (декабрь 2003 г.). «Характеристика двунаправленной промоторной области между генами человека, кодирующими VLCAD и PSD-95». Геномика . 82 (6): 660–8. дои : 10.1016/s0888-7543(03)00211-8 . ПМИД 14611808 .

[9] Аояма Т., Сури М., Усикубо С., Камидзё Т., Ямагути С., Келли Р.И., Рхед В.Дж., Уэтаке К., Танака К., Хашимото Т. (июнь 1995 г.). «Очистка человеческой ацил-коэнзима А-дегидрогеназы с очень длинной цепью и характеристика ее дефицита у семи пациентов» . Журнал клинических исследований . 95 (6): 2465–73. дои : 10.1172/JCI117947 . ПМК 295925 . ПМИД 7769092 .

[10] Пуговкина О, Те Бринке Х, Офман Р, ван Крухтен А.Г., Кулик В., Вандерс Р.Дж., Хаутен С.М., де Бур В.К. (июль 2014 г.). «Ацетилирование митохондриального белка происходит под действием ацетил-КоА в результате окисления жирных кислот» . Молекулярная генетика человека . 23 (13): 3513–22. дои : 10.1093/hmg/ddu059 . ПМИД 24516071 .

[11] Андресен Б.С., Олпин С., Поортуис Б.Дж., Шольте Х.Р., Виани-Сабан С., Вандерс Р., Ийлст Л., Моррис А., Пурфарзам М., Бартлетт К., Баумгартнер Э.Р., деКлерк Дж.Б., Шредер Л.Д., Коридон Т.Дж., Лунд Х., Винтер В., Бросс П., Болунд Л., Грегерсен Н. (февраль 1999 г.). «Четкая корреляция генотипа с фенотипом заболевания при дефиците ацил-КоА-дегидрогеназы с очень длинной цепью» . Американский журнал генетики человека . 64 (2): 479–94. дои : 10.1086/302261 . ПМЦ 1377757 . ПМИД 9973285 .

[12] Лесли, Северная Дакота; Валенсия, Калифорния; Штраус, AW; Чжан, К.; Адам, член парламента; Ардингер, Х.Х.; Пагон, РА; Уоллес, ЮВ; Бин LJH; Стивенс, К.; Амемия, А. (1993). «Очень длинноцепочечный ацил-кофермент и дефицит дегидрогеназы». ПМИД 20301763 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )

[13] «По поисковому запросу ACADVL найдено 75 бинарных взаимодействий» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 24 августа 2018 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]