Гидроксиацил-Кофермент А дегидрогеназа

ТЕНЬ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1F0Y, 1F12, 1F14, 1F17, 1IL0, 1LSJ, 1LSO, 1M75, 1M76, 2HDH, 3HAD, 3RQS
Идентификаторы
Псевдонимы	HADH , HAD, HADH1, HADHSC, HCDH, HHF4, MSCHAD, SCHAD, гидроксиацил-Кофермент А дегидрогеназа, гидроксиацил-КоА дегидрогеназа
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601609 ; МГИ : 96009 ; Гомологен : 55888 ; GeneCards : МАТЬ ; ОМА : ХАДХ – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	108,035,241 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	131,065,750 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	islet of Langerhans; ; right ventricle; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; mucosa of transverse colon; ; beta cell; ; thoracic diaphragm; ; kidney tubule; ; vastus lateralis muscle; ; body of tongue; ; myocardium of left ventricle;
	Top expressed in
	Paneth cell; ; condyle; ; medullary collecting duct; ; tunica adventitia of aorta; ; brown adipose tissue; ; cumulus cell; ; atrioventricular junction; ; fossa; ; migratory enteric neural crest cell; ; renal corpuscle;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	oxidoreductase activity; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase activity; NAD+ binding;
Cellular component	cytoplasm; mitochondrial matrix; mitochondrion; nucleoplasm;
Biological process	response to insulin; response to hormone; fatty acid beta-oxidation; negative regulation of insulin secretion; response to activity; fatty acid metabolic process; lipid metabolism; positive regulation of cold-induced thermogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	3033
	15107
	ENSG00000138796
	ENSMUSG00000027984
	Q16836
	Q61425
	НМ_001184705 ; НМ_005327 ; НМ_001331027
	НМ_008212
	НП_001171634 ; НП_001317956 ; НП_005318
	НП_032238
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гидроксиацил-коэнзим А-дегидрогеназа ( HADH ) представляет собой фермент , который у человека кодируется HADH геном . ^[5]^[6]

Структура

Ген HADH расположен на 4-й хромосоме , его конкретное местоположение идентифицировано как 4q22-q26. Ген имеет 10 экзонов . ^[7] Ген HADH кодирует белок массой 34,3 кДа, который содержит 314 аминокислот и 124 наблюдаемых пептида . ^[8]^[9]

Функция

Этот ген является членом семейства генов 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы . Кодируемый белок функционирует в митохондриальном матриксе, катализируя окисление 3-гидроксиацил-КоА с прямой цепью как часть пути бета-окисления . Его ферментативная активность наиболее высока у жирных кислот со средней длиной цепи. ^[7]

Клиническое значение

Мутации в этом гене вызывают одну из форм семейной гиперинсулинемической гипогликемии . ^[10] Дефицит связан с дефицитом 3-гидроксиацил-кофермента А-дегидрогеназы . Мутации также вызывают дефицит 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы. Выявлено множество мутаций, вызывающих это заболевание. Среди них миссенс-мутации (A40T, P258L, D57G, Y226H) и нонсенс-мутации (R236X) в белке, а также мутации сплайсинга (261+1G>A, 710-2A>G) и некоторые небольшие делеции (587delC) в кДНК. . ^[11] вне рамки считывания Было показано, что одна мутация, 636+471G>T в гене HADH, создает загадочный донорный сайт сплайсинга и псевдоэкзон . ^[12] Большинство описанных случаев имеют гомозиготные мутации. Это заболевание имеет довольно однородную клиническую картину во всех случаях. Симптомы впервые появляются в раннем возрасте, между 1,5 часами после рождения и до 3 лет, и наиболее распространенными симптомами являются гипогликемия и судороги/конвульсии, непосредственно связанные с гипогликемией. Были выявлены и другие клинические проявления, а именно: миоглобинурия , дикарбоновая ацидурия , трудности с кормлением в младенчестве, мышечная гипотония , стеатоз печени , задержка роста, гипертрофическая кардиомиопатия , дилатационная кардиомиопатия, некроз печени и молниеносная печеночная недостаточность. Заболевание может быть диагностировано либо путем анализа молекулярной генетики человека, либо путем обнаружения аномальных уровней метаболитов в крови и/или плазме. У людей с этим дефицитом повышенное количество 3-гидроксиглутарата выводится с мочой; Для этого заболевания ФАО также характерен повышенный уровень С4-ОН-ацилкарнитина в плазме крови. Большинство зарегистрированных к настоящему времени случаев показали, что люди реагируют на лечение диазоксидом и подчеркнуть необходимость диагностики и назначения лечения как можно раньше, чтобы скорректировать гипогликемию и избежать необратимого повреждения головного мозга . ^[11]

Взаимодействия

Было показано, что HADH взаимодействует с Vpr , так что Vpr ВИЧ-1 регулирует митохондриальное дыхание и повышает активность гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы (HADH) через PPARbeta/delta. ^[13]

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000138796 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027984 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Крейг И., Толли Э., Бобров М. (1976). «Предварительный анализ сегрегации гидроксиацилкоэнзима А дегидрогеназы человека в гибридах соматических клеток человека и мыши». Цитогенетика и клеточная генетика . 16 (1–5): 114–7. дои : 10.1159/000130568 . ПМИД 975867 .
^ Ян С.Ю., Хэ XY, Шульц Х. (октябрь 2005 г.). «3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа и короткоцепочечная 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа в здоровье и заболеваниях человека» . Журнал ФЭБС . 272 (19): 4874–83. дои : 10.1111/j.1742-4658.2005.04911.x . ПМИД 16176262 . S2CID 45683141 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Энтрез Джин: ХАДХ» .
^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
^ «Гидроксиацил-кофермент А дегидрогеназа митохондриальная» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) . Архивировано из оригинала 24 сентября 2015 г. Проверено 23 марта 2015 г.
^ Молвен А., Матре Г.Е., Дюран М., Вандерс Р.Дж., Ришауг У., Ньёлстад П.Р., Джеллум Э., Совик О. (январь 2004 г.). «Семейная гиперинсулинемическая гипогликемия, вызванная дефектом фермента SCHAD окисления митохондриальных жирных кислот» . Диабет . 53 (1): 221–7. дои : 10.2337/диабет.53.1.221 . ПМИД 14693719 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Мартинс Э., Кардосо М.Л., Родригес Э., Барбот С., Рамос А., Беннетт М.Дж., Телес Э.Л., Вилариньо Л. (июнь 2011 г.). «Дефицит короткоцепочечной 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы: клиническая значимость ранней диагностики и сообщение о четырех новых случаях». Журнал наследственных метаболических заболеваний . 34 (3): 835–42. дои : 10.1007/s10545-011-9287-7 . ПМИД 21347589 . S2CID 36618116 .
^ Фланаган С.Э., Се В., Касвелл Р., Дамхейс А., Виани-Сабан С., Акчай Т., Даренделилер Ф., Бас Ф., Гювен А., Сиклар З., Окал Г., Бербероглу М., Мерфи Н., О'Салливан М., Грин А., Клейтон. П.Е., Банерджи И., Клейтон П.Т., Хуссейн К., Уидон М.Н., Эллард С. (январь 2013 г.). «Секвенирование следующего поколения выявляет глубокие интронные загадочные мутации-основатели сплайсинга ABCC8 и HADH, вызывающие гиперинсулинизм за счет активации псевдоэкзонов» . Американский журнал генетики человека . 92 (1): 131–6. дои : 10.1016/j.ajhg.2012.11.017 . ПМЦ 3542457 . ПМИД 23273570 .
^ Шривастав С., Чжан Л., Окамото К., Ли Х., Лагранья С., Абэ Ю., Баласубраманьям А., Лопащук Г.Д., Кино Т., Копп Дж.Б. (сентябрь 2013 г.). «Vpr ВИЧ-1 усиливает PPARβ/δ-опосредованную транскрипцию, увеличивает экспрессию PDK4 и снижает активность PDC» . Молекулярная эндокринология . 27 (9): 1564–76. дои : 10.1210/me.2012-1370 . ПМЦ 3753422 . ПМИД 23842279 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о семейном гиперинсулинизме
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q16836 (Гидроксиацил-коэнзим А-дегидрогеназа, митохондриальная) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000138796 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027984 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid975867-5] Крейг И., Толли Э., Бобров М. (1976). «Предварительный анализ сегрегации гидроксиацилкоэнзима А дегидрогеназы человека в гибридах соматических клеток человека и мыши». Цитогенетика и клеточная генетика . 16 (1–5): 114–7. дои : 10.1159/000130568 . ПМИД 975867 .

[pmid16176262-6] Ян С.Ю., Хэ XY, Шульц Х. (октябрь 2005 г.). «3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа и короткоцепочечная 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа в здоровье и заболеваниях человека» . Журнал ФЭБС . 272 (19): 4874–83. дои : 10.1111/j.1742-4658.2005.04911.x . ПМИД 16176262 . S2CID 45683141 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Энтрез Джин: ХАДХ» .

[COPaKB-8] Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .

[url_COPaKB-9] «Гидроксиацил-кофермент А дегидрогеназа митохондриальная» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) . Архивировано из оригинала 24 сентября 2015 г. Проверено 23 марта 2015 г.

[pmid14693719-10] Молвен А., Матре Г.Е., Дюран М., Вандерс Р.Дж., Ришауг У., Ньёлстад П.Р., Джеллум Э., Совик О. (январь 2004 г.). «Семейная гиперинсулинемическая гипогликемия, вызванная дефектом фермента SCHAD окисления митохондриальных жирных кислот» . Диабет . 53 (1): 221–7. дои : 10.2337/диабет.53.1.221 . ПМИД 14693719 .

[Gene_Review-11] Перейти обратно: ^а ^б Мартинс Э., Кардосо М.Л., Родригес Э., Барбот С., Рамос А., Беннетт М.Дж., Телес Э.Л., Вилариньо Л. (июнь 2011 г.). «Дефицит короткоцепочечной 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы: клиническая значимость ранней диагностики и сообщение о четырех новых случаях». Журнал наследственных метаболических заболеваний . 34 (3): 835–42. дои : 10.1007/s10545-011-9287-7 . ПМИД 21347589 . S2CID 36618116 .

[12] Фланаган С.Э., Се В., Касвелл Р., Дамхейс А., Виани-Сабан С., Акчай Т., Даренделилер Ф., Бас Ф., Гювен А., Сиклар З., Окал Г., Бербероглу М., Мерфи Н., О'Салливан М., Грин А., Клейтон. П.Е., Банерджи И., Клейтон П.Т., Хуссейн К., Уидон М.Н., Эллард С. (январь 2013 г.). «Секвенирование следующего поколения выявляет глубокие интронные загадочные мутации-основатели сплайсинга ABCC8 и HADH, вызывающие гиперинсулинизм за счет активации псевдоэкзонов» . Американский журнал генетики человека . 92 (1): 131–6. дои : 10.1016/j.ajhg.2012.11.017 . ПМЦ 3542457 . ПМИД 23273570 .

[13] Шривастав С., Чжан Л., Окамото К., Ли Х., Лагранья С., Абэ Ю., Баласубраманьям А., Лопащук Г.Д., Кино Т., Копп Дж.Б. (сентябрь 2013 г.). «Vpr ВИЧ-1 усиливает PPARβ/δ-опосредованную транскрипцию, увеличивает экспрессию PDK4 и снижает активность PDC» . Молекулярная эндокринология . 27 (9): 1564–76. дои : 10.1210/me.2012-1370 . ПМЦ 3753422 . ПМИД 23842279 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

v т и Оксидоредуктазы : алкогольоксидоредуктазы ( EC 1.1)
1.1.1: NAD/NADP acceptor	3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase 3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase Alcohol dehydrogenase Aldo-keto reductase 1A1 1B1 1B10 1C1 1C3 1C4 7A2 Aldose reductase Beta-Ketoacyl ACP reductase Carbohydrate dehydrogenases Carnitine dehydrogenase D-malate dehydrogenase (decarboxylating) DXP reductoisomerase Glucose-6-phosphate dehydrogenase Glycerol-3-phosphate dehydrogenase HMG-CoA reductase IMP dehydrogenase Isocitrate dehydrogenase Lactate dehydrogenase L-threonine dehydrogenase L-xylulose reductase Malate dehydrogenase Malate dehydrogenase (decarboxylating) Malate dehydrogenase (NADP+) Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP+) Phosphogluconate dehydrogenase Sorbitol dehydrogenase Hydroxysteroid dehydrogenase: 3β 3β-HSD NSDHL 11β 11β-HSD1 11β-HSD2 17β
1.1.2: cytochrome acceptor	D-lactate dehydrogenase (cytochrome) D-lactate dehydrogenase (cytochrome c-553) Mannitol dehydrogenase (cytochrome)
1.1.3: oxygen acceptor	Glucose oxidase L-gulonolactone oxidase Xanthine oxidase Alcohol oxidase
1.1.4: disulfide as acceptor	Vitamin K epoxide reductase Vitamin-K-epoxide reductase (warfarin-insensitive)
1.1.5: quinone/similar acceptor	Malate dehydrogenase (quinone) Quinoprotein glucose dehydrogenase
1.1.99: other acceptors	Choline dehydrogenase L2HGDH