Изоцитратдегидрогеназа
| Изоцитратдегидрогеназа | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 1.1.1.42 | ||
| Номер CAS. | 9028-48-2 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
| изоцитратдегидрогеназа (НАД + ) | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 1.1.1.41 | ||
| Номер CAS. | 9001-58-5 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
| Мономерная изоцитратдегидрогеназа | |||
|---|---|---|---|
 кристаллическая структура мономерной изоцитратдегидрогеназы в комплексе с изоцитратом и mn | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ИДГ | ||
| Пфам | PF03971 | ||
| Пфам Клан | CL0270 | ||
| ИнтерПро | ИПР004436 | ||
| СКОП2 | 1офг / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
Изоцитратдегидрогеназа ( IDH ) ( EC 1.1.1.42 ) и ( EC 1.1.1.41 ) представляет собой фермент , который катализирует окислительное декарбоксилирование изоцитрата с образованием альфа-кетоглутарата (α-кетоглутарата) и CO 2 . Это двухэтапный процесс, который включает окисление изоцитрата ( вторичного спирта ) до оксалосукцината ( кетона ) с последующим декарбоксилированием бета-карбоксильной группы до кетона с образованием альфа-кетоглутарата. У человека IDH существует в трех изоформах: IDH3 катализирует третий этап цикла трикарбоновых кислот , превращая НАД. + НАДН в митохондриях . Изоформы IDH1 и IDH2 катализируют одну и ту же реакцию вне цикла трикарбоновых кислот и используют НАДФ. + в качестве кофактора вместо НАД + . Они локализуются в цитозоле , а также в митохондриях и пероксисомах . [2]
Структура [ править ]
НАД-ИДГ состоит из 3 субъединиц, аллостерически регулируется и требует интегрированного Mg. 2+ или Мн 2+ ион. Ближайшим гомологом, имеющим известную структуру, является НАДФ-зависимая ИДГ E. coli , которая имеет только 2 субъединицы, 13% идентичности и 29% сходства на основе аминокислотных последовательностей, что делает ее непохожей на ИДГ человека и непригодной для близкого изучения. сравнение. Все известные НАДФ-ИДГ являются гомодимерами.
Большинство изоцитратдегидрогеназ представляют собой димеры, точнее, гомодимеры (две идентичные субъединицы мономера, образующие одну димерную единицу). Сравнивая C.glutamicum и E.coli , [4] мономер и димер соответственно, оба фермента «эффективно катализируют идентичные реакции». Однако было зарегистрировано, что C. Glutacumum обладает в десять раз большей активностью, чем E. coli , и в семь раз более аффинитивен/специфичен к НАДФ. C. Glutacumum предпочитает НАДФ. + над НАД + . Что касается стабильности и реакции на температуру, оба фермента имели одинаковую Tm или температуру плавления примерно от 55°C до 60°C. Однако мономер C. Glutacumum продемонстрировал более стабильную стабильность при более высоких температурах, что и ожидалось. Димер E. coli показал стабильность при более высокой температуре, чем обычно, благодаря взаимодействиям между двумя мономерными субъединицами.
структура Mycobacterium Tuberculosis Методом рентгеновской кристаллографии решена (Mtb) ICDH-1, связанная с НАДФН и Mn(2+). Это гомодимер, в котором каждая субъединица имеет складку Россмана и общий верхний домен из переплетенных β-листов. Mtb ICDH-1 структурно наиболее похож на мутантный человеческий ICDH R132H, обнаруженный в ЦНС 4 астроцитомах степени ВОЗ , ранее классифицированных как [5] как глиобластомы . Подобно человеческому R132H ICDH, Mtb ICDH-1 также катализирует образование α-гидроксиглутарата. [6]
Регламент [ править ]
Стадия IDH цикла лимонной кислоты часто (но не всегда) является необратимой реакцией из-за большого отрицательного изменения свободной энергии. Поэтому его необходимо тщательно регулировать, чтобы избежать истощения изоцитрата (и, следовательно, накопления альфа-кетоглутарата). Реакция стимулируется простыми механизмами доступности субстрата (изоцитрат, НАД + или НАДФ + , мг 2+ / Мин 2+ ), ингибирование продукции НАДН (или НАДФН вне цикла трикарбоновых кислот) и альфа-кетоглутаратом, а также конкурентное ингибирование по обратной связи с помощью АТФ . [7] Консервативная нкРНК выше гена icd , кодирующего НАДФ. + -зависимая изоцитратдегидрогеназа (IDH) была обнаружена в бактериальных геномах; по своим характеристикам эта нкРНК напоминает предыдущие регуляторные мотивы, называемые рибопереключателями , мотив нкРНК icd-II был предложен в качестве сильного кандидата на рибопереключатель. [8]
Каталитические механизмы [ править ]
Изоцитратдегидрогеназа катализирует химические реакции :
- Изоцитрат + НАД + 2-оксоглутарат + СО 2 + НАДН + Н +
- Изоцитрат + НАДФ + 2-оксоглутарат + СО 2 + НАДФН + Н + [9] [10] [11]
Общая свободная энергия этой реакции составляет -8,4 кДж/моль. [12]
Шаги [ править ]
В цикле лимонной кислоты , изоцитрат образующийся в результате изомеризации цитрата, подвергается как окислению , так и декарбоксилированию . Фермент изоцитратдегидрогеназа (IDH) удерживает изоцитрат в своем активном центре , используя окружающие аминокислоты , включая аргинин , тирозин , аспарагин , серин , треонин и аспарагиновую кислоту .
На представленном рисунке в первом блоке показана общая реакция изоцитратдегидрогеназы. Необходимыми реагентами для этого ферментативного механизма являются изоцитрат, НАД. + / НАДП + , и Мн 2+ или мг 2+ . Продуктами реакции являются альфа-кетоглутарат , углекислый газ и НАДН +Н. + / НАДФН + Н + . [10] Молекулы воды помогают депротонировать атомы кислорода изоцитрата.
Второй прямоугольник на рисунке иллюстрирует стадию 1 реакции, которая представляет собой окисление альфа-углерода (здесь C2, также называемого альфа-C). [9] [10] В этом процессе [9] спиртовая кетоновую группа альфа-углерода депротонируется, и образующаяся неподеленная пара электронов образует группу на этом углероде. НАД + /НАДП + , принимающий электроны действует как кофактор , и собирает образующийся гидрид из C2. Окисление альфа-углерода создает молекулярную структуру, при которой электроны (на следующем этапе) будут течь из близлежащей карбоксильной группы и толкать электроны кислорода с двойной связью вверх к самому атому кислорода, который собирает протон из близлежащего лизина .
Третий блок иллюстрирует этап 2, который представляет собой декарбоксилирование оксалосукцината . На этом этапе [9] [10] кислород карбоксильной группы депротонируется соседним тирозином , и эти электроны стекают к C2. Углекислый газ, уходящая группа, отделяется от бета-углерода изоцитрата (C3), и электроны перетекают к кетонному кислороду, присоединенному к альфа-углероду, придавая отрицательный заряд связанному атому кислорода и образуя альфа-бета-ненасыщенную двойную связь между атомы углерода 2 и 3.
Четвертый и последний блок иллюстрирует шаг 3, который представляет собой насыщение ненасыщенной двойной связи альфа-бета, образовавшейся на предыдущем этапе. Отрицательно заряженный кислород (присоединенный к альфа-углероду) отдает свои электроны, реформируя двойную связь кетона и выталкивая другую неподеленную пару (ту, которая образует двойную связь между альфа- и бета-углеродом) «от» молекулы. Эта одинокая пара, в свою очередь, забирает протон у соседнего тирозина. [14] В результате этой реакции образуется альфа-кетоглутарат НАДН + Н. + /НАДФН + Н + и СО 2 .
Подробный механизм [ править ]
Два аминокислотных остатка аспартата (внизу слева) взаимодействуют с двумя соседними молекулами воды (w6 и w8) в Mn. 2+ изоцитрат свиного комплекса IDH для депротонирования спирта у альфа-углеродного атома. На этой картине также происходит окисление альфа-С, где НАД + принимает гидрид, в результате чего образуется оксалосукцинат. Наряду с сп 3 sp 2 стереохимическое изменение вокруг альфа-С, из спиртовой группы образуется кетоновая группа. Образование этой двойной связи кетона позволяет возникнуть резонансу, когда электроны, спускающиеся с уходящей карбоксилатной группы, движутся к кетону.
Декарбоксилирование оксалосукцината (внизу в центре) является ключевым этапом образования альфа-кетоглутарата. В этой реакции неподеленная пара соседнего гидроксила тирозина отрывает протон от карбоксильной группы. [14] Эту карбоксильную группу также называют бета-субъединицей в молекуле изоцитрата. Депротонирование карбоксильной группы заставляет неподеленную пару электронов двигаться вниз, образуя углекислый газ и отделяясь от оксалосукцината. Электроны продолжают двигаться к альфа-углероду, подталкивая электроны двойной связи (образуя кетон) вверх, отрывая протон от соседнего остатка лизина. Между атомами углерода 2 и 3 образуется альфа-бета-ненасыщенная двойная связь. Как вы можете видеть на рисунке, зеленый ион представляет собой либо Mg 2+ или Мн 2+ , который является кофактором, необходимым для возникновения этой реакции. Ион металла образует небольшой комплекс за счет ионных взаимодействий с атомами кислорода на четвертом и пятом атомах углерода (также известный как гамма-субъединица изоцитрата).
После отделения диоксида углерода от оксалосукцината на стадии декарбоксилирования (внизу справа) енол таутомеризуется с образованием кето. Образование двойной связи кетона начинается с депротонирования этого кислорода от альфа-углерода (C#2) тем же лизином, который в первую очередь протонировал кислород. [14] Неподеленная пара электронов движется вниз, отбрасывая неподеленные пары, образующие двойную связь. Эта неподеленная пара электронов отрывает протон от тирозина, который депротонировал карбоксильную группу на стадии декарбоксилирования. Причина, по которой мы можем сказать, что остатки Lys и Tyr будут такими же, как на предыдущем этапе, заключается в том, что они помогают удерживать молекулу изоцитрата в активном центре фермента. Эти два остатка смогут образовывать водородные связи туда и обратно, пока они находятся достаточно близко к субстрату . [4]
 |  |  |
Фермент изоцитратдегидрогеназа, как указано выше, продуцирует альфа-кетоглутарат, углекислый газ и НАДН + Н. + /НАДФН + Н + . В ходе реакции произошли три изменения. Окисление углерода 2, декарбоксилирование (потеря углекислого газа) углерода 3 и образование кетоновой группы со стереохимическим изменением от sp 3 sp 2 . [14]
 |  |  |  |
Активный сайт [ править ]
Структура фермента изоцитратдегидрогеназы (IDH) в Escherichia coli была первой структурой-ортологом IDH, которую удалось выяснить и понять. [14] С тех пор структура IDH Escherichia coli использовалась большинством исследователей для сравнения с другими ферментами изоцитратдегидрогеназы. Об этом бактериальном ферменте известно много подробностей, и было обнаружено, что большинство изоцитратдегидрогеназ сходны по структуре и, следовательно, по функциям. Такое сходство структуры и функций дает основание полагать, что структуры консервативны так же, как и аминокислоты. [11] Следовательно, активные центры большинства прокариотических ферментов изоцитратдегидрогеназы также должны быть консервативными, что наблюдается во многих исследованиях, проведенных на прокариотических ферментах. С другой стороны, эукариотические ферменты изоцитратдегидрогеназы еще не полностью открыты.Каждый димер IDH имеет два активных центра. [14] Каждый активный сайт связывает НАД. + /НАДП + молекула и ион двухвалентного металла (Mg 2+ ,Мн 2+ ). В общем, каждый активный сайт имеет консервативную последовательность аминокислот для каждого конкретного сайта связывания. У Desulfotalea psychrophila ( Dp IDH) [14] и свинья ( Pc IDH) [3] с активным центром связаны три субстрата.
- Изоцитрат связывается в активном центре с консервативной последовательностью, состоящей примерно из восьми аминокислот посредством водородных связей. Эти кислоты включают (могут различаться по остатку, но со схожими свойствами) тирозин, серин, аспарагин, аргинин, аргинин, аргинин, тирозин и лизин. Их положения на основной цепи различаются, но все они находятся в близком диапазоне (т.е. Arg131 DpIDH и Arg133 PcIDH, Tyr138 DpIDH и Tyr140 PcIDH). [14]
- Ион металла (Mg 2+ , Мн 2+ ) связывается с тремя консервативными аминокислотами посредством водородных связей. Эти аминокислоты включают три остатка аспартата. [14]
- ОНИ + и НАДП + связываются внутри активного центра в четырех областях со схожими свойствами среди ферментов IDH. Эти области различаются, но составляют около [250–260], [280–290], [300–330] и [365–380]. Опять же, регионы различаются, но близость регионов сохраняется. [14]
Клиническое значение
Специфические мутации в гене изоцитратдегидрогеназы IDH1 были обнаружены в нескольких типах опухолей. [16] особенно опухоли головного мозга, включая астроцитому и олигодендроглиому . [5] Пациенты, чья опухоль имела мутацию IDH1, имели более длительную выживаемость по сравнению с пациентами, чья опухоль имела дикий тип IDH1 . [17] [18] Более того, мутации IDH2 и IDH1 были обнаружены почти в 20% цитогенетически нормальных случаев острого миелолейкоза (ОМЛ). [19] [20] Известно, что эти мутации приводят к образованию D-2-гидроксиглутарата из альфа-кетоглутарата. [21] D-2-гидроксиглутарат накапливается в очень высоких концентрациях, что ингибирует функцию ферментов, зависящих от альфа-кетоглутарата. [22] Это приводит к гиперметилированному состоянию ДНК и гистонов, что приводит к различной экспрессии генов, которые могут активировать онкогены и инактивировать гены-супрессоры опухолей. В конечном итоге это может привести к описанным выше типам рака. [23] Также были обнаружены соматические мозаичные мутации этого гена, связанные с болезнью Оллиера и синдромом Маффуччи . [24] Однако недавние исследования также показали, что D-2-гидроксиглутарат может превращаться обратно в альфа-кетоглутарат ферментативным или неферментативным путем. [25] [26] Необходимы дальнейшие исследования, чтобы полностью понять роль мутации IDH1 (и D-2-гидроксиглутарата) в развитии рака. Недавние исследования выявили вызывающие рак мутации в изоцитратдегидрогеназе, которые могут вызывать накопление метаболита D-2-гидроксиглутарата (D-2HG). Нотаранжело и др. показали, что такие высокие концентрации D-2HG могут действовать как прямой ингибитор лактатдегидрогеназы в Т-клетках мыши. Ингибирование этого метаболического фермента изменяло метаболизм глюкозы в Т-клетках и подавляло их пролиферацию, выработку цитокинов и способность убивать клетки-мишени. [27]
Изоферменты [ править ]
Ниже приводится список изоферментов изоцитратдегидрогеназы человека:
НАДП + зависимый [ править ]
Каждый НАДП + -зависимый изофермент функционирует как гомодимер:
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ОНИ + зависимый [ править ]
Изоцитратдегидрогеназа 3 представляет собой гетеротетрамер, состоящий из двух альфа-субъединиц, одной бета-субъединицы и одной гамма-субъединицы:
|
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
См. также [ править ]
- Оксидоредуктаза
- Миелодиспластический синдром#мутации IDH1 и IDH2
- Онкометаболизм
- Семейство изоцитрат/изопропилмалатдегидрогеназ
Ссылки [ править ]
- ^ PDB : 1CW7 ; Чербаваз Д.Б., Ли М.Э., Страуд Р.М., Кошланд Д.Э. (январь 2000 г.). «Молекулы воды с активным центром, выявленные в структуре разрешения 2,1 А сайт-направленного мутанта изоцитратдегидрогеназы». Журнал молекулярной биологии . 295 (3): 377–385. дои : 10.1006/jmbi.1999.3195 . ПМИД 10623532 .
- ^ Корпус Ф.Д., Баррозу Х.Б., Сандалио Л.М., Пальма Х.М., Лупианьес Х.А. (ноябрь 1999 г.). «Пероксисомальная НАДФ-зависимая изоцитратдегидрогеназа. Характеристика и регулирование активности во время естественного старения» . Физиология растений . 121 (3): 921–928. дои : 10.1104/стр.121.3.921 . ПМК 59455 . ПМИД 10557241 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д и ж ВВП : 1LWD ; Чеккарелли С., Гродский Н.Б., Арияратне Н., Колман Р.Ф., Бансон Б.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Кристаллическая структура митохондриальной НАДФ+-зависимой изоцитратдегидрогеназы свиньи в комплексе с Mn2+ и изоцитратом. Понимание механизма фермента» . Журнал биологической химии . 277 (45): 43454–43462. дои : 10.1074/jbc.M207306200 . ПМИД 12207025 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Чен Р., Ян Х (ноябрь 2000 г.). «Высокоспецифичная мономерная изоцитратдегидрогеназа из Corynebacteriumlutamicum». Архив биохимии и биофизики . 383 (2): 238–245. дои : 10.1006/abbi.2000.2082 . ПМИД 11185559 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Луи Д.Н., Перри А., Весселинг П., Брат Д.Д., Кри И.А., Фигарелла-Брэнгер Д. и др. (август 2021 г.). «Классификация опухолей центральной нервной системы ВОЗ 2021 года: краткое изложение» . Нейроонкология . 23 (8): 1231–1251. дои : 10.1093/neuonc/noab106 . ПМЦ 8328013 . ПМИД 34185076 .
- ^ Куартараро С.Э., Хазра С., Хади Т., Бланшар Дж.С. (март 2013 г.). «Структурный, кинетический и химический механизм изоцитратдегидрогеназы-1 микобактерии туберкулеза» . Биохимия . 52 (10): 1765–1775. дои : 10.1021/bi400037w . ПМК 3706558 . ПМИД 23409873 .
- ^ Маетинг И., Шмидт Г., Сам Х., Стаманн К.П. (2000). «Роль пероксисомальной НАДФ-специфической изоцитратдегидрогеназы в метаболизме сверхпродуцента рибофлавина Ashbya gossypii». Журнал молекулярного катализа B: Enzymatic . 10 (1–3): 335–343. дои : 10.1016/S1381-1177(00)00135-1 .
- ^ Брюэр К.И., Гринли Э.Б., Хиггс Г., Ю.Д., Мирихана Арахчилаге Г., Чен Х. и др. (декабрь 2021 г.). «Комплексное открытие новых структурированных некодирующих РНК в 26 бактериальных геномах» . Биология РНК . 18 (12): 2417–2432. дои : 10.1080/15476286.2021.1917891 . ПМЦ 8632094 . ПМИД 33970790 . S2CID 234361097 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д Бегли Т.П., Макмерри Дж. (2005). Органическая химия биологических путей . Издательство Робертс и Ко. стр. 189–190. ISBN 0-9747077-1-6 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д Кокс М., Нельсон Д.Р., Ленинджер А.Л. (2005). Ленингерские принципы биохимии . Сан-Франциско: WH Freeman. стр. 609–611 . ISBN 0-7167-4339-6 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Ясутаке Ю, Ватанабэ С, Яо М, Такада Ю, Фукунага Н, Танака I (сентябрь 2003 г.). «Кристаллическая структура мономерной изоцитратдегидрогеназы в присутствии НАДФ +: понимание кофактора распознавания, катализа и эволюции» . Журнал биологической химии . 278 (38): 36897–36904. дои : 10.1074/jbc.M304091200 . ПМИД 12855708 .
- ^ Гарретт Р., Гришэм К.М. (2012). Биохимия . Cengage Обучение. п. 621. ИСБН 978-1-133-10629-6 .
- ^ Аошима М., Игараси Ю (март 2008 г.). «Недекарбоксилирующие и декарбоксилирующие изоцитратдегидрогеназы: оксалосукцинатредуктаза как предковая форма изоцитратдегидрогеназы» . Журнал бактериологии . 190 (6): 2050–2055. дои : 10.1128/JB.01799-07 . ПМЦ 2258884 . ПМИД 18203822 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л м Федой А.Е., Ян Н., Мартинес А., Лейрос Х.К., Стин И.Х. (сентябрь 2007 г.). «Структурные и функциональные свойства изоцитратдегидрогеназы психрофильной бактерии Desulfotalea psychrophila обнаруживают холодоактивный фермент с необычно высокой термостабильностью». Журнал молекулярной биологии . 372 (1): 130–149. дои : 10.1016/j.jmb.2007.06.040 . ПМИД 17632124 .
- ^ Каппер Д., Зентграф Х., Бальсс Дж., Хартманн К., фон Даймлинг А. (ноябрь 2009 г.). «Моноклональное антитело, специфичное к мутации IDH1 R132H». Акта Нейропатологика . 118 (5): 599–601. дои : 10.1007/s00401-009-0595-z . ПМИД 19798509 . S2CID 36093146 .
- ^ Зарей М., Хью Дж.Дж., Хаджихассани О., Граор Х.Дж., Катаяма Э.С., Лофтус А.В. и др. (февраль 2022 г.). «Клиническая разработка ингибиторов IDH1 для терапии рака». Обзоры лечения рака . 103 : 102334. doi : 10.1016/j.ctrv.2021.102334 . ПМИД 34974243 . S2CID 245547597 .
- ^ Хартманн С., Хентшель Б., Вик В., Кэппер Д., Фельсберг Дж., Саймон М. и др. (декабрь 2010 г.). «Пациенты с анапластическими астроцитомами дикого типа IDH1 имеют худший прогноз, чем глиобластомы с мутацией IDH1, а статус мутации IDH1 объясняет неблагоприятный прогностический эффект старшего возраста: последствия для классификации глиом» (PDF) . Акта Нейропатологика . 120 (6): 707–718. дои : 10.1007/s00401-010-0781-z . ПМИД 21088844 . S2CID 7323032 .
- ^ Моленаар Р.Дж., Вербаан Д., Ламба С., Занон С., Джеукен Дж.В., Бутс-Спренгер Ш. и др. (сентябрь 2014 г.). «Сочетание мутаций IDH1 и статуса метилирования MGMT предсказывает выживаемость при глиобластоме лучше, чем только IDH1 или MGMT» . Нейроонкология . 16 (9): 1263–1273. дои : 10.1093/neuonc/nou005 . ПМК 4136888 . ПМИД 24510240 .
- ^ Уорд П.С., Патель Дж., Уайз Д.Р., Абдель-Вахаб О., Беннетт Б.Д., Коллер Х.А. и др. (март 2010 г.). «Общей чертой мутаций IDH1 и IDH2, связанных с лейкемией, является неоморфная активность фермента, превращающая альфа-кетоглутарат в 2-гидроксиглутарат» . Раковая клетка . 17 (3): 225–234. дои : 10.1016/j.ccr.2010.01.020 . ПМЦ 2849316 . ПМИД 20171147 .
- ^ Ван Ю, Сяо М, Чен Икс, Чен Л, Сюй Ю, Лв Л и др. (февраль 2015 г.). «WT1 привлекает TET2 для регулирования экспрессии целевого гена и подавления пролиферации лейкозных клеток» . Молекулярная клетка . 57 (4): 662–673. doi : 10.1016/j.molcel.2014.12.023 . ПМЦ 4336627 . ПМИД 25601757 .
- ^ Данг Л., Уайт Д.В., Гросс С., Беннетт Б.Д., Биттингер М.А., Дриггерс Э.М. и др. (июнь 2010 г.). «Связанные с раком мутации IDH1 производят 2-гидроксиглутарат» . Природа . 465 (7300): 966. Бибкод : 2010Natur.465..966D . дои : 10.1038/nature09132 . ПМК 3766976 . ПМИД 20559394 .
- ^ Чоудхури Р., Йео К.К., Тиан Ю.М., Хиллрингхаус Л., Бэгг Э.А., Роуз Н.Р. и др. (май 2011 г.). «Онкометаболит 2-гидроксиглутарат ингибирует лизиндеметилазы гистонов» . Отчеты ЭМБО . 12 (5): 463–469. дои : 10.1038/embor.2011.43 . ПМК 3090014 . ПМИД 21460794 .
- ^ Моленаар Р.Дж., Радивоевич Т., Мациевски Дж.П., ван Норден К.Дж., Бликер Ф.Е. (декабрь 2014 г.). «Драйвер и пассажирские эффекты мутаций изоцитратдегидрогеназы 1 и 2 в онкогенезе и продлении выживаемости». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Обзоры о раке . 1846 (2): 326–341. дои : 10.1016/j.bbcan.2014.05.004 . ПМИД 24880135 .
- ^ Амари М.Ф., Дамато С., Халаи Д., Эскандарпур М., Бериша Ф., Бонар Ф. и др. (ноябрь 2011 г.). «Болезнь Оллиера и синдром Маффуччи вызваны соматическими мозаичными мутациями IDH1 и IDH2». Природная генетика . 43 (12): 1262–1265. дои : 10.1038/ng.994 . ПМИД 22057236 . S2CID 5592593 .
- ^ Тархонская Х., Рыдзик А.М., Люнг И.К., Лоик Н.Д., Чан М.К., Кавамура А. и др. (март 2014 г.). «Неферментативная химия обеспечивает 2-гидроксиглутарат-опосредованную активацию 2-оксоглутаратоксигеназ» . Природные коммуникации . 5 : 3423. Бибкод : 2014NatCo...5.3423T . дои : 10.1038/ncomms4423 . ПМК 3959194 . ПМИД 24594748 .
- ^ Койвунен П., Ли С., Дункан К.Г., Лопес Г., Лу Г., Рамкиссун С. и др. (февраль 2012 г.). «Трансформация (R)-энантиомером 2-гидроксиглутарата, связанная с активацией EGLN» . Природа . 483 (7390): 484–488. Бибкод : 2012Natur.483..484K . дои : 10.1038/nature10898 . ПМЦ 3656605 . ПМИД 22343896 .
- ^ Нотаранжело Г., Спинелли Дж.Б., Перес Э.М., Бейкер Г.Дж., Курми К., Элия И. и др. (сентябрь 2022 г.). «Онкометаболит d-2HG изменяет метаболизм Т-клеток, ухудшая CD8. + Функция Т-клеток» . Science . 377 (6614): 1519–1529. Bibcode : ...377.1519N doi : 10.1126 /science.abj5104 . PMC 9629749. 2022Sci PMID 36173860. . S2CID 252623286 .
Внешние ссылки [ править ]
- Изоцитратдегидрогеназа: Молекула месяца RCSB PDB. Архивировано 24 декабря 2013 г. в Wayback Machine.
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O75874 (цитоплазматическая изоцитратдегидрогеназа [NADP]) в PDBe-KB .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P48735 (изоцитратдегидрогеназа [NADP], митохондриальная) в PDBe-KB .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P50213 (субъединица альфа изоцитратдегидрогеназы [NAD], митохондриальная) в PDBe-KB .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O43837 (бета-субъединица изоцитратдегидрогеназы [NAD], митохондриальная) в PDBe-KB .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P51553 (гамма-субъединица изоцитратдегидрогеназы [NAD], митохондриальная) в PDBe-KB .
