Jump to content

МТ-НД3

НД3
Идентификаторы
Псевдонимы ND3 , MTMT-НАДН-дегидрогеназа, субъединица 3 (комплекс I), субъединица 3 НАДН-дегидрогеназа
Внешние идентификаторы ОМИМ : 516002 ; МГИ : 102499 ; Гомологен : 5018 ; Генные карты : ND3 ; ОМА : ND3 – ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

н/д

н/д

RefSeq (белок)

н/д

НП_904335

Местоположение (UCSC) Хр М: 0,01 – 0,01 Мб Хр М: 0,01 – 0,01 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши
Расположение гена MT-ND3 в митохондриальном геноме человека. MT-ND3 является одним из семи митохондриальных генов НАДН-дегидрогеназы (желтые прямоугольники).

MT-ND3 представляет собой ген митохондриального генома, кодирующий белок НАДН-дегидрогеназа 3 (ND3). [5] Белок ND3 представляет собой субъединицу НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , которая расположена во внутренней мембране митохондрий и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . [6] Варианты MT-ND3 связаны с митохондриальной энцефаломиопатией, лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами (MELAS), синдромом Ли (LS) и наследственной оптической невропатией Лебера (LHON). [7] [8]

Структура

[ редактировать ]

Общие характеристики

[ редактировать ]

MT-ND3 расположен в митохондриальной ДНК человека от пары оснований от 10 059 до 10 404. [5] Ген MT-ND3 производит белок массой 13 кДа, состоящий из 115 аминокислот. [9] [10] MT-ND3 — один из семи митохондриальных генов, кодирующих субъединицы фермента НАДН-дегидрогеназы (убихинон) , вместе с MT-ND1 , MT-ND2 , MT-ND4 , MT-ND4L , MT-ND5 и MT-ND6 . Этот фермент, также известный как Комплекс I , является крупнейшим из дыхательных комплексов. Структура имеет L-образную форму с длинным гидрофобным трансмембранным доменом и гидрофильным доменом периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания НАДН. Продукт MT-ND3 и остальные субъединицы, кодируемые митохондриями, являются наиболее гидрофобными из субъединиц Комплекса I и образуют ядро ​​трансмембранной области. [6]

Нетранслируемый дополнительный нуклеотид

[ редактировать ]

В гене MT-ND3 многих видов птиц и черепах. [11] есть лишний нуклеотид, который не транслируется в белок. [12] Трансляционный сдвиг рамки считывания или редактирование РНК являются альтернативными объяснениями поддержания функциональности рамки считывания ND3 у птиц, обладающих однонуклеотидной вставкой.Эта дополнительная нуклеотидная особенность предполагает, что черепахи могут быть связаны с Archosauria , о чем свидетельствуют исследования молекулярной филогении . [13] [14] Отсутствие дополнительного нуклеотида у крокодилов, некоторых птиц и черепах также может указывать на то, что соответствующие таксоны утратили эту особенность.

Продукт MT-ND3 представляет собой субъединицу Комплекса I дыхательной цепи , которая, как полагают, принадлежит к минимальной сборке основных белков, необходимых для катализа дегидрирования НАДН и переноса электронов на убихинон (коэнзим Q10). [15] Первоначально НАДН связывается с Комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо протезного плеча флавинмононуклеотида (FMN ) с образованием FMNH 2 . Электроны передаются через серию железо-серных кластеров (Fe-S) в протезной руке и, наконец, к коферменту Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинола (CoQH 2 ). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и сдвигу p K ионизируемой боковой цепи, которая выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса. [6]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Известно, что патогенные варианты митохондриального гена MT-ND3 вызывают синдром Лея , связанный с мтДНК , как и варианты MT-ATP6 , MT-TL1 , MT-TK , MT-TW , MT-TV , MT-ND1 , MT-ND2. , MT-ND4 , MT-ND5 , MT-ND6 и MT-CO3 . Нарушения выработки митохондриальной энергии приводят к нейродегенеративным расстройствам, таким как синдром Ли, который характеризуется появлением симптомов в возрасте от 12 месяцев до трех лет. Симптомы часто проявляются после вирусной инфекции и включают двигательные расстройства и периферическую нейропатию , а также гипотонию , спастичность и мозжечковую атаксию . Примерно половина заболевших пациентов умирают от дыхательной или сердечной недостаточности к трем годам. Синдром Ли является заболеванием, наследуемым по материнской линии, и его диагноз устанавливается посредством генетического тестирования вышеупомянутых митохондриальных генов, включая MT-ND3. [7] Эти комплексные гены I связаны с различными нейродегенеративными заболеваниями, включая наследственную оптическую невропатию Лебера (LHON), митохондриальную энцефаломиопатию с инсультоподобными эпизодами ( MELAS ) и ранее упомянутый синдром Ли . [8]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что MT-ND3 имеет 5 бинарных белок-белковых взаимодействий, включая 2 кокомплексных взаимодействия. MT-ND3, по-видимому, взаимодействует с APP и NDUFA9 . [16]

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000198840 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000064360 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: субъединица 3 НАДН-дегидрогеназы MT-ND3» .
  6. ^ Jump up to: а б с Дональд Воэт; Джудит Г. Воэт; Шарлотта В. Пратт (2013). «18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 581–620. ISBN  9780470547847 .
  7. ^ Jump up to: а б Торберн Д.Р., Рахман С. (1993–2015). «Синдром Ли, связанный с митохондриальной ДНК, и НАРП» . В Пагон Р.А., Адам М.П., ​​Ардингер Х.Х., Уоллес С.Е., Амемия А., Бин Л.Дж., Берд Т.Д., Долан Ч.Р., Фонг К.Т., Смит Р.Дж., Стивенс К. (ред.). GeneReviews [Интернет] . Сиэтл (Вашингтон): Вашингтонский университет, Сиэтл. ПМИД   20301352 .
  8. ^ Jump up to: а б Ла Морджиа С, Капорали Л, Гандини Ф, Оливьери А, Тони Ф, Нассетти С, Брунетто Д, Стипа С, Скадуто С, Пармеджани А, Тонон С, Лоди Р, Торрони А, Карелли В (май 2014 г.). «Связь мутации мтДНК m.4171C>A/MT-ND1 как с оптической нейропатией, так и с двусторонними поражениями ствола мозга» . БМК Неврология . 14 :116 дои : 10.1186/1471-2377-14-116 . ПМК   4047257 . ПМИД   24884847 .
  9. ^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК   4076475 . ПМИД   23965338 .
  10. ^ «Цепь 3 НАДН-убихиноноксидоредуктазы» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .
  11. ^ «Полные последовательности митохондриального генома» . megasun.bch.umontreal.ca . Проверено 20 февраля 2017 г.
  12. ^ Минделл Д.П., Соренсон, доктор медицинских наук, Димчефф Д.Е. (ноябрь 1998 г.). «Лишний нуклеотид не транслируется в митохондриях ND3 некоторых птиц и черепах» . Молекулярная биология и эволюция . 15 (11): 1568–71. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025884 . ПМИД   12572620 .
  13. ^ Кьяри И., Каэ В., Галтье Н., Дельсук Ф. (июль 2012 г.). «Филогеномный анализ подтверждает положение черепах как сестринской группы птиц и крокодилов (Archosauria)» . БМК Биология . 10:65 . дои : 10.1186/1741-7007-10-65 . ПМЦ   3473239 . ПМИД   22839781 .
  14. ^ Кроуфорд Н.Г., Фэрклот BC, МакКормак Дж.Э., Брумфилд Р.Т., Винкер К., Гленн Т.С. (октябрь 2012 г.). «Более 1000 ультраконсервативных элементов доказывают, что черепахи являются сестринской группой архозавров» . Письма по биологии . 8 (5): 783–6. дои : 10.1098/rsbl.2012.0331 . ПМК   3440978 . ПМИД   22593086 .
  15. ^ «MT-ND3 - НАДН-убихинон оксидоредуктаза цепь 3 - Homo sapiens (Человек)» . UniProt.org: центр информации о белках . Консорциум UniProt.
  16. ^ «По поисковому запросу MT-ND3 обнаружено 5 бинарных взаимодействий» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 77e9e491b366f6e869f4357bc4066d23__1701627960
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/77/23/77e9e491b366f6e869f4357bc4066d23.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
MT-ND3 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)