Кинурениназа

КЫНУ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2HZP, 3E9K
Идентификаторы
Псевдонимы	KYNU , KYNUU, кинурениназа, VCRL2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 605197 ; МГИ : 1918039 ; ГомогенныйГен : 2925 ; GeneCards : KYNU ; ОМА : Ортолог КИНУ.
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	143,055,833 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	43,572,727 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	palpebral conjunctiva; ; sperm; ; epithelium of nasopharynx; ; monocyte; ; liver; ; nasal epithelium; ; right lobe of liver; ; kidney tubule; ; mucosa of urinary bladder; ; granulocyte;
	Top expressed in
	left lobe of liver; ; yolk sac; ; embryo; ; epithelium of lens; ; spleen; ; embryo; ; zygote; ; right kidney; ; blood; ; mesenteric lymph nodes;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; kynureninase activity; catalytic activity; pyridoxal phosphate binding; hydrolase activity; 3-hydroxykynureninase activity;
Cellular component	cytosol; mitochondrion; cytoplasm; nucleoplasm;
Biological process	pyridine nucleotide biosynthetic process; response to vitamin B6; response to interferon-gamma; tryptophan catabolic process to acetyl-CoA; L-kynurenine catabolic process; tryptophan catabolic process; tryptophan catabolic process to kynurenine; quinolinate biosynthetic process; anthranilate metabolic process; NAD biosynthetic process; 'de novo' NAD biosynthetic process from tryptophan; human ageing;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	8942
	70789
	ENSG00000115919
	ENSMUSG00000026866
	Q16719
	Q9CXF0
	НМ_001032998 ; НМ_001199241 ; НМ_003937
	НМ_027552 ; НМ_001289593 ; НМ_001289594 ; НМ_001398676
	НП_001028170 ; НП_001186170 ; НП_003928
	НП_001276522 ; НП_001276523 ; НП_081828 ; НП_001385605
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

кинурениназа
кинурениназа
	Кристаллическая структура кинурениназы Homo sapiens .
Идентификаторы
Номер ЕС.	3.7.1.3
Номер CAS.	9024-78-6
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
Экспаси	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	АмиГО / QuickGO
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Кинурениназа или L -кинуренингидролаза (KYNU) ( EC 3.7.1.3 ) представляет собой PLP- зависимый фермент , который катализирует расщепление кинуренина (Kyn) на антраниловую кислоту (Ant). Он также может действовать на 3-гидроксикинуренин (с образованием 3-гидроксиантранилата ) и некоторых других (3-арилкарбонил) аланинов . У людей экспрессируется один фермент кинурениназа, который кодируется KYNU, геном расположенным на хромосоме 2. ^[6]^[7]

KYNU является частью пути катаболизма Trp и ( Trp биосинтеза НАД кофакторов из триптофана ).

Кинурениназа катализирует следующую реакцию:

L – кинуренин + H ₂ O ↔ антранилат + L – аланин

Структура

Кинурениназа принадлежит к V класса группе суперсемейства аспартатаминотрансфераз структурно гомологичных пиридоксаль-5'-фосфат- зависимых ферментов. На сегодняшний день с помощью рентгеновской дифракции с разрешением 2,0 и 1,7 Å определены две структуры кинурениназы человека. ^[1]^[8] Сорок процентов аминокислот расположены в альфа-спирали, а двенадцать процентов — в бета-листах. Стыковка субстрата кинуренина с активным центром позволяет предположить, что Asn-333 и His-102 участвуют в связывании субстрата. ^[1]

Функция

В реакции KYNU PLP облегчает _{разрыв связи Cβ} - _Cγ . Реакция повторяет те же стадии, что и реакция трансаминирования , но не гидролизует таутомеризованное основание Шиффа . фермента Предполагаемый механизм реакции включает атаку нуклеофила на карбонильный углерод (Cγ ₎ таутомеризованного основания Шиффа 3hKyn-PLP. За этим следует разрыв связи C _β -C _γ с образованием промежуточного продукта ацил-фермента вместе с таутомеризованным аддуктом Ala-PLP. Затем гидролиз ацил-фермента дает 3hAnt.

**Механизм реакции КИНУ** .
Цветовая схема следующая: KYNU , PLP , названия субстратов , неорганические молекулы , фрагмент 3hAn , фрагмент Ala.

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ПДБ : 2ХЗП ; Лима С., Христофоров Р., Момани С., Филлипс Р.С. (март 2007 г.). «Кристаллическая структура кинурениназы Homo sapiens» . Биохимия . 46 (10): 2735–44. дои : 10.1021/bi0616697 . ПМК 2531291 . ПМИД 17300176 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000115919 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026866 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Альберати-Джани Д., Бухли Р., Малерб П., Брогер С., Ланг Г., Кёлер С., Лам Х.В., Чесура А.М. (июль 1996 г.). «Выделение и экспрессия клона кДНК, кодирующего кинурениназу человека» . Евро. Дж. Биохим . 239 (2): 460–8. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0460u.x . ПМИД 8706755 .
^ Тома С., Накамура М., Тоне С., Окуно Э., Кидо Р., Бретон Дж., Аванзи Н., Коззи Л., Спешиале С., Мостардини М., Гатти С., Бенатти Л. (май 1997 г.). «Клонирование и рекомбинантная экспрессия кинурениназы крысы и человека» . ФЭБС Летт . 408 (1): 5–10. дои : 10.1016/S0014-5793(97)00374-8 . ПМИД 9180257 . S2CID 36265922 .
^ PDB : 3E9K ; Лима С., Кумар С., Гаванди В., Момани С., Филлипс Р.С. (январь 2009 г.). «Кристаллическая структура комплекса ингибитора кинурениназы-3-гидроксигиппуровой кислоты Homo sapiens: понимание молекулярной основы специфичности субстрата кинурениназы». Дж. Мед. Хим . 52 (2): 389–96. дои : 10.1021/jm8010806 . ПМИД 19143568 .

Дальнейшее чтение

Лима С., Христофоров Р., Момани С., Филлипс Р.С. (2007). «Кристаллическая структура кинурениназы Homo sapiens» . Биохимия . 46 (10): 2735–2744. дои : 10.1021/bi0616697 . ПМК 2531291 . ПМИД 17300176 .
Привет, член парламента, Чен С.И., Майор Э.О., Сайто К. (1997). «Различные ферменты кинуренинового пути ограничивают образование хинолиновой кислоты различными типами клеток человека» . Биохим. Дж . 326 (2): 351–6. дои : 10.1042/bj3260351 . ПМЦ 1218677 . ПМИД 9291104 .
Роуз Дж.Э., Бем Ф.М., Дргон Т. и др. (2010). «Персонализированное прекращение курения: взаимодействие между дозой никотина, зависимостью и оценкой генотипа успеха в отказе от курения» . Мол. Мед . 16 (7–8): 247–53. дои : 10.2119/molmed.2009.00159 . ПМЦ 2896464 . ПМИД 20379614 .
Чжан Ю, Чжан КХ, Хе Х и др. (2005). «[Полиморфизм гена кинурениназы в хромосомном регионе-кандидате на гипертензию связан с эссенциальной гипертензией]». Чжунхуа Синь Сюэ Гуань Бин Цза Чжи . 33 (7): 588–91. ПМИД 16080802 .
Инада Дж., Окуно Э., Кимура М., Кидо Р. (1984). «Внутриклеточная локализация и характеристика 3-гидроксикинурениназы в печени человека». Межд. Дж. Биохим . 16 (6): 623–8. дои : 10.1016/0020-711x(84)90031-4 . ПМИД 6468727 .
Уббинк Дж.Б., Вермаак В.Дж., Биссборт С.Х. (1991). «Высокоэффективный жидкостный хроматографический анализ уровней активности кинурениназы лимфоцитов человека». Дж. Хроматогр . 566 (2): 369–75. дои : 10.1016/0378-4347(91)80253-9 . ПМИД 1939450 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Магни Дж., Амичи А., Эмануэлли М. и др. (2004). «Энзимология гомеостаза НАД+ у человека» . Клетка. Мол. Наука о жизни . 61 (1): 19–34. дои : 10.1007/s00018-003-3161-1 . ПМЦ 11138864 . ПМИД 14704851 . S2CID 22041610 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2002). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Кристенсен М., Дуно М., Лунд А.М. и др. (2007). «Ксантуреновая ацидурия из-за мутации KYNU, кодирующего кинурениназу». Дж. Наследовать. Метаб. Дис . 30 (2): 248–55. дои : 10.1007/s10545-007-0396-2 . ПМИД 17334708 . S2CID 13295336 .
Уолш Х.А., Боттинг НП (2002). «Очистка и биохимическая характеристика некоторых свойств рекомбинантной кинурениназы человека». Евро. Дж. Биохим . 269 (8): 2069–74. дои : 10.1046/j.1432-1033.2002.02854.x . ПМИД 11985583 .
Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .

Внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для кинурениназы человека.

[pmid17300176-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ПДБ : 2ХЗП ; Лима С., Христофоров Р., Момани С., Филлипс Р.С. (март 2007 г.). «Кристаллическая структура кинурениназы Homo sapiens» . Биохимия . 46 (10): 2735–44. дои : 10.1021/bi0616697 . ПМК 2531291 . ПМИД 17300176 .

[refGRCh38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000115919 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026866 – Ensembl , май 2017 г.

[4] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8706755-6] Альберати-Джани Д., Бухли Р., Малерб П., Брогер С., Ланг Г., Кёлер С., Лам Х.В., Чесура А.М. (июль 1996 г.). «Выделение и экспрессия клона кДНК, кодирующего кинурениназу человека» . Евро. Дж. Биохим . 239 (2): 460–8. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0460u.x . ПМИД 8706755 .

[pmid9180257-7] Тома С., Накамура М., Тоне С., Окуно Э., Кидо Р., Бретон Дж., Аванзи Н., Коззи Л., Спешиале С., Мостардини М., Гатти С., Бенатти Л. (май 1997 г.). «Клонирование и рекомбинантная экспрессия кинурениназы крысы и человека» . ФЭБС Летт . 408 (1): 5–10. дои : 10.1016/S0014-5793(97)00374-8 . ПМИД 9180257 . S2CID 36265922 .

[pmid19143568-8] PDB : 3E9K ; Лима С., Кумар С., Гаванди В., Момани С., Филлипс Р.С. (январь 2009 г.). «Кристаллическая структура комплекса ингибитора кинурениназы-3-гидроксигиппуровой кислоты Homo sapiens: понимание молекулярной основы специфичности субстрата кинурениназы». Дж. Мед. Хим . 52 (2): 389–96. дои : 10.1021/jm8010806 . ПМИД 19143568 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)