Пиридоксальфосфат

Пиридоксальфосфат
	; Идеализированная скелетная формула
	; Шаровидная модель на основе кристаллической структуры . Обратите внимание, что фосфатная и пиридиновая группы прореагировали с образованием цвиттер-иона , а альдегидная группа гидратировалась .
Имена
	Предпочтительное название ИЮПАК (4-Формил-5-гидрокси-6-метилпиридин-3-ил)метилдигидрофосфат
	Другие имена Пиридоксаль-5-фосфат, PAL-P, PLP, фосфат витамина B6.
Идентификаторы
Номер CAS	54-47-7 ;
3D model ( JSmol )	Интерактивное изображение ;
КЭБ	ЧЕБИ:18405 ;
ХЭМБЛ	ХЕМБЛ82202 ;
Информационная карта ECHA	100.000.190
ИЮФАР/БПС	5249 ;
МеШ	Пиридоксаль+фосфат
ПабХим CID	1051 ;
НЕКОТОРЫЙ	F06SGE49M6 ;
Панель управления CompTox ( EPA )	DTXSID4048351 ;
	показывать УЛЫБКИ
Характеристики
Химическая формула	С 8 Ч 10 НЕТ 6 П
Молярная масса	247.142 g/mol
Плотность	1,638±0,06 г/см3
Температура плавления	От 139 до 142 ° C (от 282 до 288 ° F; от 412 до 415 К)
Кислотность ( pKa )	1.56
Фармакология
код АТС	A11HA06 ( ВОЗ )
Опасности
точка возгорания	296,0±32,9 °С
	Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа). проверить ( что такое ?) Ссылки на инфобоксы

Пиридоксальфосфат ( PLP , пиридоксаль -5'- фосфат , P5P ), активная форма витамина B6 _, является коферментом в различных ферментативных реакциях. Международный союз биохимии и молекулярной биологии каталогизировал более 140 PLP-зависимых активностей, что соответствует примерно 4% всех классифицированных активностей. ^{[ 5 ]} Универсальность PLP обусловлена его способностью ковалентно связывать субстрат, а затем действовать как электрофильный катализатор, тем самым стабилизируя различные типы карбанионных промежуточных продуктов реакции.

Роль кофермента

ПЛП действует как кофермент во всех реакциях переаминирования , а также в некоторых декарбоксилирования , дезаминирования и рацемизации реакциях аминокислот . ^{[ 6 ]} Альдегидная группа ПЛП образует связь Шиффового основания (внутренний альдимин ) с ε-аминогруппой специфической лизиновой группы фермента аминотрансферазы . α-аминогруппа аминокислотного субстрата замещает ε-аминогруппу остатка лизина в активном центре в процессе, известном как трансальдиминирование. Образующийся внешний альдимин может потерять протон, диоксид углерода или боковую цепь аминокислоты и стать промежуточным хиноидом, который, в свою очередь, может действовать как нуклеофил в нескольких путях реакции.

При трансаминировании после депротонирования хиноноидный промежуточный продукт принимает протон в другом положении и становится кетимином . Образующийся кетимин гидролизуется так, что аминогруппа остается в комплексе. ^{[ 7 ]} Кроме того, PLP используется аминотрансферазами (или трансаминазами), которые действуют на необычные сахара, такие как перозамин и дезозамин . ^{[ 8 ]} В этих реакциях ПЛП реагирует с глутаматом , который передает свою альфа-аминогруппу ПЛП с образованием фосфата пиридоксамина (ПМП). Затем PMP передает свой азот сахару, образуя аминосахара .

PLP также участвует в различных реакциях бета-элиминирования, таких как реакции, осуществляемые сериндегидратазой и GDP-4-кето-6-дезоксиманнозо-3-дегидратазой (ColD) . ^{[ 8 ]}

Он также активен в реакции конденсации при синтезе гема .

ПЛП играет роль в превращении леводопы в дофамин , облегчает преобразование возбуждающего нейромедиатора глутамата в тормозной нейромедиатор ГАМК и позволяет SAM декарбоксилироваться с образованием пропиламина , который является предшественником полиаминов.

Роль в организме человека

Пиридоксальфосфат выполняет множество функций в организме человека. Несколько примеров ниже:

Метаболизм и биосинтез серотонина  . Пиридоксальфосфат является кофактором декарбоксилазы ароматических L-аминокислот . Это позволяет превращать 5-гидрокситриптофан (5-HTP) в серотонин (5-HT). Эта реакция происходит в серотонинергических нейронах.
Метаболизм и биосинтез гистамина . Пиридоксальфосфат является кофактором L-гистидиндекарбоксилазы . Это позволяет преобразовать гистидин в гистамин. Эта реакция протекает в аппарате Гольджи , в тучных клетках и базофилах . Далее гистамин сохраняется в гранулярном виде в тучных клетках в виде комплекса с кислотными остатками протеогликана гепарина , а в базофилах - в виде комплекса с хондроитинсульфатом.
Метаболизм и биосинтез ГАМК (γ-аминомасляной кислоты) . Пиридоксальфосфат является кофактором декарбоксилазы глутаминовой кислоты (GAD). Это позволяет преобразовать глутамат в ГАМК. Реакция происходит в цитоплазме терминации ГАМК-ергических нейронов, поэтому дефицит витамина В6 _может вызывать эпилептические припадки у детей . Пиридоксальфосфат также участвует в окислительном дезаминировании ГАМК, где он является кофактором ГАМК-аминотрансферазы.
Метаболизм орнитина . Пиридоксальфосфат является кофактором орнитинкарбоксилазы.
Трансаминирование . Пиридоксальфосфат принимает участие в разложении и синтезе аминокислот , жиров и углеводов, а также в биосинтезе гормонов, нейромедиаторов и гема. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Неклассические примеры PLP

ПЛП также обнаруживается в гликогенфосфорилазе в печени, где он используется для расщепления гликогена при гликогенолизе , когда глюкагон или адреналин сигнализируют ему об этом. Однако этот фермент не использует реакционноспособную альдегидную группу, а вместо этого использует фосфатную группу PLP для осуществления своей реакции.

Хотя подавляющее большинство PLP-зависимых ферментов образуют внутренний альдимин с PLP через остаток лизина в активном центре, некоторые PLP-зависимые ферменты не имеют этого остатка лизина, а вместо этого имеют гистидин в активном центре. В таком случае гистидин не может образовывать внутренний альдимин, и, следовательно, кофактор не становится ковалентно связанным с ферментом. GDP-4-кето-6-дезоксиманнозо-3-дегидратаза (ColD) является примером такого фермента. ^{[ 11 ]} 2 человека Сериновая гидроксиметилтрансфераза регулирует реакции переноса одного углерода, необходимые для метаболизма аминокислот и нуклеотидов, и существует в димерной и тетрамерной формах. Димерный вариант SHMT2 является мощным ингибитором ферментного комплекса деубиквитилазы BRISC, который регулирует передачу сигналов в клетках на основе иммунной системы. Недавние исследования показывают, что тетрамеризация SJMT2 индуцируется PLP. Это предотвращает взаимодействие с комплексом деубикутилазы BRISC, потенциально связывая уровень витамина B6 и его метаболизм с воспалением. ^{[ 12 ]}

Каталитический механизм

Пиридоксаль-5'-фосфат-зависимые ферменты (ферменты PLP) катализируют множество реакций. Хотя объем реакций, катализируемых PLP, кажется огромным, объединяющим принципом является образование внутреннего альдимина, производного лизина. Как только аминосубстрат взаимодействует с активным центром, образуется новое основание Шиффа, обычно называемое внешним альдимином. После этого этапа пути каждой реакции, катализируемой PLP, расходятся. ^{[ 13 ]}

Специфика

Специфичность обеспечивается тем, что из четырех связей альфа-углерода аминокислоты в альдиминовом состоянии разрывается связь, перпендикулярная пиридиновому кольцу ( стереоэлектронная гипотеза Дунатана ). ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]} Следовательно, специфичность определяется тем, как ферменты связывают свои субстраты. Дополнительную роль в специфичности играет легкость протонирования азота пиридинового кольца. ^{[ 16 ]}

PLP-ферменты

ПЛП удерживается в активном центре не только благодаря лизину, но и благодаря взаимодействию фосфатной группы и фосфатсвязывающего кармана и в меньшей степени благодаря стопке оснований пиридинового кольца с нависающим ароматическим остатком, обычно тирозином. (которые также могут участвовать в кислотно-основном катализе). Несмотря на ограниченные требования к карману связывания PLP, ферменты PLP принадлежат только к пяти различным семействам. Эти семейства плохо коррелируют с конкретным типом реакции. Пять семейств классифицируются как типы складок, за которыми следует римская цифра. ^{[ 14 ]}

Тип складки I — семейство аспартатаминотрансфераз
Тип складки II — семейство триптофансинтазы
Тип складки III — семейство аланиновых рацемаз (ТИМ-бочонок)
Тип складки IV — семейство аминотрансфераз D-аминокислот
Тип складки V — семейство гликогенфосфорилаз

Биосинтез

Из витамеров

Животные являются ауксотрофами по отношению к этому кофактору фермента и нуждаются в добавлении его или промежуточного продукта, отсюда его классификация как витамин B ₆ , в отличие от MoCo или CoQ10 , например, . ПЛП синтезируется из пиридоксаля ферментом пиридоксалькиназой , для чего требуется одна молекула АТФ. ПЛП метаболизируется в печени.

Прототрофия

В настоящее время известны два естественных пути PLP: один требует дезоксиксилулозо-5-фосфата (DXP), а другой нет, поэтому они известны как DXP-зависимые и DXP-независимые. Эти пути были тщательно изучены на Escherichia coli и Bacillus subtilis соответственно. Несмотря на различия в исходных соединениях и различное количество необходимых стадий, эти два пути имеют много общего. ^{[ 17 ]}

DXP-зависимый биосинтез

Зависимый от DXP путь биосинтеза требует нескольких стадий и сближения двух ветвей: одна производит 3-гидрокси-1-аминоацетонфосфат из эритрозо-4-фосфата , а другая (один фермент) производит дезоксиксилулозо-5-фосфат (DXP) из глицеральдегида-3. -фосфат (GAP) и пируват . Продуктом конденсации 3-гидрокси-1-аминоацетонфосфата и дезоксилулозо-5-фосфата является пиридоксин-5'-фосфат . Конденсация катализируется PNP-синтазой , кодируемой pdxJ , которая создает PNP (пиридоксин-5'-фосфат). ^{[ 18 ]} Последним ферментом является PNP-оксидаза ( pdxH ), которая катализирует окисление 4'-гидроксильной группы до альдегида с использованием диоксигена, что приводит к образованию перекиси водорода.

Первая ветвь катализируется в E. coli ферментами, кодируемыми epd , pdxB , serC и pdxA . Они имеют механистическое сходство и гомологию с тремя ферментами биосинтеза серина ( serA (гомолог pdxB ), serC , serB — однако epd является гомологом разрыва ), что указывает на общее эволюционное происхождение двух путей. ^{[ 19 ]} У некоторых видов есть два гомолога гена E. coli serC , обычно один в опероне ser ( serC ), а другой в опероне pdx, и в этом случае он называется pdxF .

В библиотеке сверхэкспрессии был обнаружен «случайный путь», который мог подавлять ауксотрофию, вызванную делецией pdxB (кодирующей эритронат-4-фосфатдегидрогеназу) в E. coli . Случайный путь был очень неэффективен, но возможен из-за беспорядочной активности различных ферментов. Он начинался с 3-фосфогидроксипирувата (продукта фермента, кодируемого serA в биосинтезе серина) и не требовал эритронат-4-фосфата. 3PHP был дефосфорилирован, в результате чего образовался нестабильный промежуточный продукт, который спонтанно декарбоксилируется (отсюда и присутствие фосфата в пути биосинтеза серина) до гликальдегида. Гликальдегид конденсировали с глицином, и фосфорилированным продуктом был 4-фосфогидрокситреонин (4PHT), канонический субстрат для 4-PHT дегидрогеназы ( pdxA ). ^{[ 20 ]}

DXP-независимый биосинтез

DXP-независимый путь биосинтеза PLP состоит из этапа, катализируемого PLP-синтазой, ферментом, состоящим из двух субъединиц. PdxS катализирует конденсацию рибулозо-5-фосфата, глицеральдегид-3-фосфата и аммиака ; последние молекулы производятся PdxT, который катализирует производство аммиака из глютамина . PdxS представляет собой ствол (β/α)8 (также известный как TIM-цилиндр), образующий додекамер. ^{[ 21 ]}

Абиотический синтез

Широкое использование ПЛП в центральном метаболизме, особенно в биосинтезе аминокислот, и его активность в отсутствие ферментов позволяют предположить, что ПЛП может быть «пребиотическим» соединением, то есть соединением, которое предшествовало зарождению органической жизни (не путать с с пребиотическими соединениями — веществами, которые служат источником питания для полезных бактерий). ^{[ 22 ]} Фактически, при нагревании NH3 и гликольдегида самопроизвольно образуются различные пиридины, включая пиридоксаль. ^{[ 22 ]} При определенных условиях ПЛП образуется из цианоацетилена, диацетилена, оксида углерода, водорода, воды и фосфорной кислоты. ^{[ 23 ]}

Ингибиторы

Известно несколько ингибиторов ферментов PLP.

Один тип ингибитора образует электрофил с PLP, заставляя его необратимо реагировать с лизином активного центра. Такими ингибиторами являются ацетиленовые соединения (например, пропаргилглицин) и виниловые соединения (например, винилглицин). Другой тип ингибитора инактивирует PLP, например, аналоги α-метил- и амино-оксисубстрата (например, α-метилглутамат). Другие ингибиторы имеют хорошие уходящие группы, которые нуклеофильно атакуют PLP. Таков хлораланин , который ингибирует большое количество ферментов. ^{[ 14 ]}

Примеры ингибиторов:

Левотироксин. У крыс, получавших только 10 мкг D, L-тироксина ежедневно в течение 15 дней, активность цистеиндесульфгидразы печени исчезает, а активность серин- и треониндегидразы и аланинглутаматтрансаминазы снижается примерно на 40%. Либо введение пиридоксаль-5-фосфата in vivo, либо добавление кофермента in vitro к препаратам печени восстанавливает полную активность всех этих ферментов, а небольшое ингибирование in vitro в присутствии 10 ⁻⁵ М-тироксин также реверсируется пиридоксаль-5-фосфатом. ^{[ 24 ]}^{[ 25 ]}
Неактивная форма пиридоксина конкурентно ингибирует активный пиридоксаль-5'-фосфат. Следовательно, симптомы приема добавок витамина B6 в форме пиридоксина могут имитировать симптомы дефицита витамина B6; эффекта, которого, возможно, можно было бы избежать, добавляя вместо этого P5P. ^{[ 26 ]}
AlaP (аланинфосфонат) ингибирует аланинрацемазы , но его недостаточная специфичность побудила к разработке дальнейших ингибиторов ALR. ^{[ 27 ]}
Габакулин и Вигабатрин ингибируют ГАМК-аминотрансферазу.
Каналин и 5-фторметилорнитин ингибируют орнитинаминотрансферазу.
Амино-окси SAM ингибирует АСС-синтазу

Эволюция

Пиридоксаль-5-фосфат (витамин B6) -зависимые ферменты имеют множественное эволюционное происхождение. В целом ферменты B6 разделились на четыре независимые эволюционные линии: семейство α (т.е. аспартатаминотрансфераза ), семейство β ( сериндегидратаза ), D- аланинаминотрансфераз семейство и семейство аланинрацемазы . Пример эволюционного сходства семейства Бета можно увидеть в механизме. Все β-ферменты являются лиазами и катализируют реакции, в которых участвуют Cα и Cβ. В целом, в PLP -зависимых ферментах PLP в каждом случае ковалентно присоединен через иминную связь к аминогруппе в активном центре. ^{[ 28 ]}

См. также

Ссылки

^ «Запись CSD: PLPHYD10» . Кембриджская структурная база данных : Структуры доступа . Кембриджский центр кристаллографических данных . 1974. Архивировано из оригинала 4 ноября 2023 г. Проверено 4 ноября 2023 г.
^ Фудзивара Т. (1973). «Кристаллическая и молекулярная структура производных витамина B _6. I. Гидрат пиридоксальфосфата и метилгемиацеталь пиридоксальфосфата» . Бык. хим. Соц. Япония. 46 (3): 863–871. дои : 10.1246/bcsj.46.863 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Рассчитано с использованием программного обеспечения Advanced Chemistry Development (ACD/Labs) V11.02 (© 1994-2011 ACD/Labs)
^ Козлов Э.И., Львова М.С. (1978). «Стабильность водорастворимых витаминов и коферментов. Гидролиз пиридоксаль-5-фосфата в кислых, нейтральных и слабощелочных растворах». Фармацевтически-химический журнал . 11 (11): 1543–9. дои : 10.1007/BF00778244 . S2CID 1094223 .
^ Перкудани Р., Перакки А. (сентябрь 2003 г.). «Геномный обзор пиридоксальфосфат-зависимых ферментов» . Отчеты ЭМБО . 4 (9): 850–4. дои : 10.1038/sj.embor.embor914 . ПМК 1326353 . ПМИД 12949584 .
^ Дельфин Д., Поулсон Р., Аврамович О. (1986). «Витамин B6: пиридоксальфосфат» (PDF) . Коэнзимы и кофакторы . Том. 1, Часть B. Нью-Йорк: Wiley Interscience. ISBN 978-0471097853 . Архивировано (PDF) из оригинала 4 марта 2016 г. Проверено 4 января 2015 г.
^ Тони, доктор медицины (январь 2005 г.). «Специфичность реакции ферментов пиридоксальфосфата». Архив биохимии и биофизики . 433 (1): 279–87. дои : 10.1016/j.abb.2004.09.037 . ПМИД 15581583 .
^ Jump up to: ^а ^б Сэмюэл Дж., Ривз П. (ноябрь 2003 г.). «Биосинтез О-антигенов: гены и пути, участвующие в синтезе предшественников нуклеотидных сахаров и сборке О-антигенов». Исследование углеводов . 338 (23): 2503–19. дои : 10.1016/j.carres.2003.07.009 . ПМИД 14670712 .
^ Лутц М.Б., Романи Н., Штайнкассерер А., ред. (6 февраля 2006 г.). Справочник дендритных клеток: биология, болезни и методы лечения (1-е изд.). Уайли. дои : 10.1002/9783527619696 . ISBN 978-3-527-31109-5 . S2CID 183733461 . Архивировано из оригинала 21 ноября 2023 г. Проверено 21 ноября 2023 г.
^ Ракер Р.Б., изд. (2001). Справочник витаминов . Клиническое питание в здоровье и болезни (3-е изд., перераб. и расширенное изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Деккер. ISBN 978-0-8247-0428-5 .
^ Кук П.Д., Тоден Дж.Б., Холден Х.М. (сентябрь 2006 г.). «Строение ВВП-4-кето-6-дезокси-D-маннозо-3-дегидратазы: уникального кофермента В6-зависимого фермента» . Белковая наука . 15 (9): 2093–106. дои : 10.1110/ps.062328306 . ПМК 2242600 . ПМИД 16943443 .
^ Эйерс, Пенсильвания, Мерфи Дж. М. (ноябрь 2016 г.). «Эволюционирующий мир псевдоферментов: белки, предрассудки и зомби» . БМК Биология . 14 (1): 98. дои : 10.1186/s12915-016-0322-x . ПМК 5106787 . ПМИД 27835992 .
^ Элиот AC, Кирш Дж. Ф. (2004). «Пиридоксальфосфатные ферменты: механистические, структурные и эволюционные соображения». Ежегодный обзор биохимии . 73 : 383–415. doi : 10.1146/annurev.biochem.73.011303.074021 . ПМИД 15189147 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Элиот AC, Кирш Дж. Ф. (2004). «Ферменты пиридоксальфосфата: механистические, структурные и эволюционные соображения». Ежегодный обзор биохимии . 73 : 383–415. doi : 10.1146/annurev.biochem.73.011303.074021 . ПМИД 15189147 . S2CID 36010634 .
^ Гаятри СК, Манодж Н. (декабрь 2020 г.). «Кристаллографические снимки дунатана и хиноноидных промежуточных продуктов дают представление о механизме реакции декарбоксилаз группы II» . Журнал молекулярной биологии . 432 (24): 166692. doi : 10.1016/j.jmb.2020.10.026 . ПМИД 33122004 . S2CID 226205717 . Архивировано из оригинала 15 июля 2022 г. Проверено 25 октября 2022 г.
^ Грисволд В.Р., Тони, доктор медицины (сентябрь 2011 г.). «Роль пиридинового азота в катализе пиридоксаль-5'-фосфата: активность трех классов ферментов PLP, восстановленных деазапиридоксаль-5'-фосфатом». Журнал Американского химического общества . 133 (37): 14823–30. дои : 10.1021/ja2061006 . ПМИД 21827189 . S2CID 10780336 .
^ Фитцпатрик Т.Б., Амрайн Н., Каппес Б., Машеру П., Тьюс И., Рашле Т. (октябрь 2007 г.). «Два независимых пути биосинтеза витамина B6 de novo: в конце концов, они не так уж и отличаются» . Биохимический журнал . 407 (1): 1–13. дои : 10.1042/BJ20070765 . ПМК 2267407 . ПМИД 17822383 . S2CID 28231094 .
^ Сакаи А., Кита М., Тани Ю. (апрель 2004 г.). «Недавний прогресс биосинтеза витамина B6» . Журнал диетологии и витаминологии . 50 (2): 69–77. дои : 10.3177/jnsv.50.69 . ПМИД 15242009 .
^ Лам Х.М., Винклер М.Е. (ноябрь 1990 г.). «Метаболические взаимоотношения между пиридоксином (витамином B6) и биосинтезом серина в Escherichia coli K-12» . Журнал бактериологии . 172 (11): 6518–28. дои : 10.1128/jb.172.11.6518-6528.1990 . ПМК 526841 . ПМИД 2121717 .
^ Ким Дж., Кершнер Дж.П., Новиков Ю., Шумейкер Р.К., Копли С.Д. (ноябрь 2010 г.). «Три случайных пути в E. coli могут обойти блокировку синтеза пиридоксаль-5'-фосфата» . Молекулярная системная биология . 6 : 436. дои : 10.1038/msb.2010.88 . ПМК 3010111 . ПМИД 21119630 .
^ Чжу Дж., Бургнер Дж.В., Хармс Э., Белицкий Б.Р., Смит Дж.Л. (июль 2005 г.). «Новое расположение (бета/альфа)8-цилиндров в синтазной субъединице PLP-синтазы» . Журнал биологической химии . 280 (30): 27914–23. дои : 10.1074/jbc.M503642200 . ПМИД 15911615 .
^ Jump up to: ^а ^б Остин С.М., Уодделл Т.Г. (май 1999 г.). «Пребиотический синтез соединений типа витамина В6». Происхождение жизни и эволюция биосферы . 29 (3): 287–96. Бибкод : 1999OLEB...29..287A . дои : 10.1023/A:1006532518221 . ПМИД 10389266 . S2CID 22284565 .
^ Эйлуорд Н., Бофингер Н. (сентябрь 2006 г.). «Вероятный пребиотический синтез пиридоксальфосфата: витамин B6 - компьютерное исследование». Биофизическая химия . 123 (2–3): 113–21. дои : 10.1016/j.bpc.2006.04.014 . ПМИД 16730878 .
^ Хорват А (1957). «Ингибирование тироксином ферментов, требующих пиридоксаль-5-фосфата» . Природа . 179 (4567): 968. Бибкод : 1957Natur.179..968H . дои : 10.1038/179968a0 . ПМИД 13430754 . S2CID 4262396 .
^ Хох, Флорида (1962). «Биохимическое действие гормонов щитовидной железы». Физиологические обзоры . 42 (4): 605–673. дои : 10.1152/physrev.1962.42.4.605 . ПМИД 13954890 .
^ Вролийк М.Ф., Опперхейзен А., Янсен Э.Х., Хагеман Г.Дж., Баст А., Хаенен Г.Р. (2017). «Парадокс витамина B6: прием высоких концентраций пиридоксина приводит к снижению функции витамина B6». Токсикология in vitro . 44 : 206–212. Бибкод : 2017ToxVi..44..206V . дои : 10.1016/j.tiv.2017.07.009 . ПМИД 28716455 .
^ Энтони К.Г., Стрих У., Юнг К.Р., Шоен К.С., Перес О., Краузе К.Л. и др. (2011). Ахмед Н. (ред.). «Новые классы ингибиторов аланинрацемазы, идентифицированные с помощью высокопроизводительного скрининга, демонстрируют антимикробную активность против микобактерий туберкулеза» . ПЛОС ОДИН . 6 (5): e20374. Бибкод : 2011PLoSO...620374A . дои : 10.1371/journal.pone.0020374 . ПМК 3102704 . ПМИД 21637807 .
^ Кристен П., Мехта ПК (2001). «От кофактора к ферментам. Молекулярная эволюция пиридоксаль-5'-фосфат-зависимых ферментов». Химическая запись . 1 (6): 436–47. дои : 10.1002/tcr.10005 . ПМИД 11933250 .

Внешние ссылки

A11HA06 ( ВОЗ )

[PLPHYD10-1] «Запись CSD: PLPHYD10» . Кембриджская структурная база данных : Структуры доступа . Кембриджский центр кристаллографических данных . 1974. Архивировано из оригинала 4 ноября 2023 г. Проверено 4 ноября 2023 г.

[2] Фудзивара Т. (1973). «Кристаллическая и молекулярная структура производных витамина B _6. I. Гидрат пиридоксальфосфата и метилгемиацеталь пиридоксальфосфата» . Бык. хим. Соц. Япония. 46 (3): 863–871. дои : 10.1246/bcsj.46.863 .

[ReferenceA-3] Jump up to: ^а ^б ^с Рассчитано с использованием программного обеспечения Advanced Chemistry Development (ACD/Labs) V11.02 (© 1994-2011 ACD/Labs)

[4] Козлов Э.И., Львова М.С. (1978). «Стабильность водорастворимых витаминов и коферментов. Гидролиз пиридоксаль-5-фосфата в кислых, нейтральных и слабощелочных растворах». Фармацевтически-химический журнал . 11 (11): 1543–9. дои : 10.1007/BF00778244 . S2CID 1094223 .

[5] Перкудани Р., Перакки А. (сентябрь 2003 г.). «Геномный обзор пиридоксальфосфат-зависимых ферментов» . Отчеты ЭМБО . 4 (9): 850–4. дои : 10.1038/sj.embor.embor914 . ПМК 1326353 . ПМИД 12949584 .

[Dolphin-6] Дельфин Д., Поулсон Р., Аврамович О. (1986). «Витамин B6: пиридоксальфосфат» (PDF) . Коэнзимы и кофакторы . Том. 1, Часть B. Нью-Йорк: Wiley Interscience. ISBN 978-0471097853 . Архивировано (PDF) из оригинала 4 марта 2016 г. Проверено 4 января 2015 г.

[pmid15581583-7] Тони, доктор медицины (январь 2005 г.). «Специфичность реакции ферментов пиридоксальфосфата». Архив биохимии и биофизики . 433 (1): 279–87. дои : 10.1016/j.abb.2004.09.037 . ПМИД 15581583 .

[samuel-8] Jump up to: ^а ^б Сэмюэл Дж., Ривз П. (ноябрь 2003 г.). «Биосинтез О-антигенов: гены и пути, участвующие в синтезе предшественников нуклеотидных сахаров и сборке О-антигенов». Исследование углеводов . 338 (23): 2503–19. дои : 10.1016/j.carres.2003.07.009 . ПМИД 14670712 .

[9] Лутц М.Б., Романи Н., Штайнкассерер А., ред. (6 февраля 2006 г.). Справочник дендритных клеток: биология, болезни и методы лечения (1-е изд.). Уайли. дои : 10.1002/9783527619696 . ISBN 978-3-527-31109-5 . S2CID 183733461 . Архивировано из оригинала 21 ноября 2023 г. Проверено 21 ноября 2023 г.

[10] Ракер Р.Б., изд. (2001). Справочник витаминов . Клиническое питание в здоровье и болезни (3-е изд., перераб. и расширенное изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Деккер. ISBN 978-0-8247-0428-5 .

[pmid16943443-11] Кук П.Д., Тоден Дж.Б., Холден Х.М. (сентябрь 2006 г.). «Строение ВВП-4-кето-6-дезокси-D-маннозо-3-дегидратазы: уникального кофермента В6-зависимого фермента» . Белковая наука . 15 (9): 2093–106. дои : 10.1110/ps.062328306 . ПМК 2242600 . ПМИД 16943443 .

[12] Эйерс, Пенсильвания, Мерфи Дж. М. (ноябрь 2016 г.). «Эволюционирующий мир псевдоферментов: белки, предрассудки и зомби» . БМК Биология . 14 (1): 98. дои : 10.1186/s12915-016-0322-x . ПМК 5106787 . ПМИД 27835992 .

[13] Элиот AC, Кирш Дж. Ф. (2004). «Пиридоксальфосфатные ферменты: механистические, структурные и эволюционные соображения». Ежегодный обзор биохимии . 73 : 383–415. doi : 10.1146/annurev.biochem.73.011303.074021 . ПМИД 15189147 .

[rev-14] Jump up to: ^а ^б ^с Элиот AC, Кирш Дж. Ф. (2004). «Ферменты пиридоксальфосфата: механистические, структурные и эволюционные соображения». Ежегодный обзор биохимии . 73 : 383–415. doi : 10.1146/annurev.biochem.73.011303.074021 . ПМИД 15189147 . S2CID 36010634 .

[15] Гаятри СК, Манодж Н. (декабрь 2020 г.). «Кристаллографические снимки дунатана и хиноноидных промежуточных продуктов дают представление о механизме реакции декарбоксилаз группы II» . Журнал молекулярной биологии . 432 (24): 166692. doi : 10.1016/j.jmb.2020.10.026 . ПМИД 33122004 . S2CID 226205717 . Архивировано из оригинала 15 июля 2022 г. Проверено 25 октября 2022 г.

[16] Грисволд В.Р., Тони, доктор медицины (сентябрь 2011 г.). «Роль пиридинового азота в катализе пиридоксаль-5'-фосфата: активность трех классов ферментов PLP, восстановленных деазапиридоксаль-5'-фосфатом». Журнал Американского химического общества . 133 (37): 14823–30. дои : 10.1021/ja2061006 . ПМИД 21827189 . S2CID 10780336 .

[17] Фитцпатрик Т.Б., Амрайн Н., Каппес Б., Машеру П., Тьюс И., Рашле Т. (октябрь 2007 г.). «Два независимых пути биосинтеза витамина B6 de novo: в конце концов, они не так уж и отличаются» . Биохимический журнал . 407 (1): 1–13. дои : 10.1042/BJ20070765 . ПМК 2267407 . ПМИД 17822383 . S2CID 28231094 .

[18] Сакаи А., Кита М., Тани Ю. (апрель 2004 г.). «Недавний прогресс биосинтеза витамина B6» . Журнал диетологии и витаминологии . 50 (2): 69–77. дои : 10.3177/jnsv.50.69 . ПМИД 15242009 .

[19] Лам Х.М., Винклер М.Е. (ноябрь 1990 г.). «Метаболические взаимоотношения между пиридоксином (витамином B6) и биосинтезом серина в Escherichia coli K-12» . Журнал бактериологии . 172 (11): 6518–28. дои : 10.1128/jb.172.11.6518-6528.1990 . ПМК 526841 . ПМИД 2121717 .

[20] Ким Дж., Кершнер Дж.П., Новиков Ю., Шумейкер Р.К., Копли С.Д. (ноябрь 2010 г.). «Три случайных пути в E. coli могут обойти блокировку синтеза пиридоксаль-5'-фосфата» . Молекулярная системная биология . 6 : 436. дои : 10.1038/msb.2010.88 . ПМК 3010111 . ПМИД 21119630 .

[21] Чжу Дж., Бургнер Дж.В., Хармс Э., Белицкий Б.Р., Смит Дж.Л. (июль 2005 г.). «Новое расположение (бета/альфа)8-цилиндров в синтазной субъединице PLP-синтазы» . Журнал биологической химии . 280 (30): 27914–23. дои : 10.1074/jbc.M503642200 . ПМИД 15911615 .

[prebio99-22] Jump up to: ^а ^б Остин С.М., Уодделл Т.Г. (май 1999 г.). «Пребиотический синтез соединений типа витамина В6». Происхождение жизни и эволюция биосферы . 29 (3): 287–96. Бибкод : 1999OLEB...29..287A . дои : 10.1023/A:1006532518221 . ПМИД 10389266 . S2CID 22284565 .

[23] Эйлуорд Н., Бофингер Н. (сентябрь 2006 г.). «Вероятный пребиотический синтез пиридоксальфосфата: витамин B6 - компьютерное исследование». Биофизическая химия . 123 (2–3): 113–21. дои : 10.1016/j.bpc.2006.04.014 . ПМИД 16730878 .

[24] Хорват А (1957). «Ингибирование тироксином ферментов, требующих пиридоксаль-5-фосфата» . Природа . 179 (4567): 968. Бибкод : 1957Natur.179..968H . дои : 10.1038/179968a0 . ПМИД 13430754 . S2CID 4262396 .

[25] Хох, Флорида (1962). «Биохимическое действие гормонов щитовидной железы». Физиологические обзоры . 42 (4): 605–673. дои : 10.1152/physrev.1962.42.4.605 . ПМИД 13954890 .

[26] Вролийк М.Ф., Опперхейзен А., Янсен Э.Х., Хагеман Г.Дж., Баст А., Хаенен Г.Р. (2017). «Парадокс витамина B6: прием высоких концентраций пиридоксина приводит к снижению функции витамина B6». Токсикология in vitro . 44 : 206–212. Бибкод : 2017ToxVi..44..206V . дои : 10.1016/j.tiv.2017.07.009 . ПМИД 28716455 .

[27] Энтони К.Г., Стрих У., Юнг К.Р., Шоен К.С., Перес О., Краузе К.Л. и др. (2011). Ахмед Н. (ред.). «Новые классы ингибиторов аланинрацемазы, идентифицированные с помощью высокопроизводительного скрининга, демонстрируют антимикробную активность против микобактерий туберкулеза» . ПЛОС ОДИН . 6 (5): e20374. Бибкод : 2011PLoSO...620374A . дои : 10.1371/journal.pone.0020374 . ПМК 3102704 . ПМИД 21637807 .

[28] Кристен П., Мехта ПК (2001). «От кофактора к ферментам. Молекулярная эволюция пиридоксаль-5'-фосфат-зависимых ферментов». Химическая запись . 1 (6): 436–47. дои : 10.1002/tcr.10005 . ПМИД 11933250 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]