Орнитинаминотрансфераза
| орнитинаминотрансфераза | |||
|---|---|---|---|
 ОАТ + PLP, Человек | |||
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 2.6.1.13 | ||
| Номер CAS. | 9030-42-6 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
| орнитинаминотрансфераза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | ОАТ | ||
| ген NCBI | 4942 | ||
| HGNC | 8091 | ||
| МОЙ БОГ | 258870 | ||
| RefSeq | НМ_000274 | ||
| ЮниПрот | P04181 | ||
| Другие данные | |||
| Номер ЕС | 2.6.1.13 | ||
| Локус | Хр. 10 q26 | ||
| |||
Орнитинаминотрансфераза (ОАТ) представляет собой фермент , который у человека кодируется геном ОАТ, расположенным на хромосоме 10 .
ОАТ участвует в окончательном образовании заменимой аминокислоты пролина из аминокислоты орнитина . Орнитинаминотрансфераза . образует начальный промежуточный продукт в этом процессе Он также катализирует обратную реакцию и поэтому необходим для создания орнитина из исходного субстрата пролина.
Структура
[ редактировать ]Ген ОАТ кодирует белок размером примерно 46 кДа. Белок ОАТ экспрессируется преимущественно в печени и почках, а также в головном мозге и сетчатке. [1] Белок ОАТ локализован в митохондриях клеток, где он экспрессируется. [2]
Структура белка ОАТ была определена с помощью рентгеновской кристаллографии и демонстрирует сходство с другими аминотрансферазами подгруппы 2, такими как диалкилглюциндекарбоксилаза . [3] Белок ОАТ функционирует как димер , и каждый мономер состоит из большого домена, который вносит наибольший вклад в интерфейс субъединиц, а также С-концевого малого домена и N-концевой области, содержащей спираль, петлю и трехцепочечный бета-меандр. . В центральном большом домене находится семицепочечный бета-лист, покрытый восемью спиралями. Кофактор белка ОАТ ( пиридоксаль-5'-фосфат ) связывается с ОАТ через основание Шиффа в положении лизина 292, расположенном между двумя семицепочечными бета-листами. Считается, что три аминокислоты (R 180, E 235 и R413) участвуют в связывании субстрата в активном центре . [3]
Функция
[ редактировать ]Орнитинаминотрансфераза катализирует перенос дельта-аминогруппы от L- орнитина.
- L-орнитин + 2-оксокислота = L-глутамат-5-полуальдегид + L-аминокислота
Реакция требует пиридоксаль-5'-фосфата в качестве кофактора и является частью подпути, которая синтезирует L- глутамат-5-полуальдегид из L- орнитина .
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации в гене ОАТ могут привести к сбоям в работе белков, включая как точечные мутации, которые отменяют каталитическую активность, так и большие мутации со сдвигом рамки, а также мутированные белки, которые не доставляются должным образом в митохондрии, где происходит их нормальная функциональность. [2] В последнем случае нарушение импорта митохондрий вызывает эктопическое накопление белка ОАТ в цитозоле с последующей быстрой деградацией путем протеолиза . Дефицит активности ОАТ вызывает дефицит орнитинаминотрансферазы , также известный как круговая атрофия сосудистой оболочки и сетчатки. [4] [5] [6] [7]
Считается, что механизм спиральной атрофии сосудистой оболочки и сетчатки связан с токсичностью глиоксилата . [1]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Рао Г.Н., Котлиер Э (1984). «Активность орнитин-дельта-аминотрансферазы в сетчатке и других тканях». Нейрохим. Рез . 9 (4): 555–62. дои : 10.1007/bf00964382 . ПМИД 6462326 . S2CID 19775002 .
- ^ Jump up to: а б Кобаяши Т., Огава Х., Касахара М., Сиодзава З., Мацудзава Т. (1995). «Одна аминокислотная замена в зрелой последовательности орнитинаминотрансферазы препятствует проникновению предшественника в митохондрии» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 57 (2): 284–91. ПМК 1801533 . ПМИД 7668253 .
- ^ Jump up to: а б Шен Б.В., Хенниг М., Хоэнестер Э., Янсониус Дж.Н., Ширмер Т. (1998). «Кристаллическая структура рекомбинантной орнитинаминотрансферазы человека». Дж. Мол. Биол . 277 (1): 81–102. дои : 10.1006/jmbi.1997.1583 . ПМИД 9514741 .
- ^ «Вращающаяся атрофия сосудистой оболочки и сетчатки» . Национальные институты здравоохранения . Проверено 23 августа 2012 г.
- ^ Ким С.Дж., Лим Д.Х., Ким Дж.Х., Кан С.В. (2013). «Вращающаяся атрофия сосудистой оболочки и сетчатки, диагностированная с помощью анализа гена орнитин-δ-аминотрансферазы: отчет о случае» . Корейский J Офтальмол . 27 (5): 388–91. дои : 10.3341/kjo.2013.27.5.388 . ПМЦ 3782588 . ПМИД 24082780 .
- ^ Катагири С., Гекка Т., Хаяши Т., Ида Х., Охаши Т., Это Ю., Цунеока Х. (2014). «Мутации ОАТ и клинические особенности у двух японских братьев с круговой атрофией сосудистой оболочки и сетчатки». Доктор Офтальмол . 128 (2): 137–48. дои : 10.1007/s10633-014-9426-1 . ПМИД 24429551 . S2CID 713618 .
- ^ Доймо М., Десбатс М.А., Балдоин М.К., Ленцини Э., Бассо Дж., Мерфи Э., Грациано С., Сери М., Бурлина А., Сартори Г., Тревиссон Э., Сальвиати Л. (2013). «Функциональный анализ миссенс-мутаций ОАТ, вызывающих спиральную атрофию сосудистой оболочки и сетчатки». Хм. Мутат . 34 (1): 229–36. дои : 10.1002/humu.22233 . ПМИД 23076989 . S2CID 205921336 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Орнитин + аминотрансфераза Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)
- Зайлер Н. (сентябрь 2000 г.). «Орнитинаминотрансфераза — потенциальная мишень для лечения гипераммониемии» . Цели Curr по борьбе с наркотиками . 1 (2): 119–53. дои : 10.2174/1389450003349254 . ПМИД 11465067 .
