Руководство по фармакологии

Руководство IUPHAR/BPS по ФАРМАКОЛОГИИ
Содержание
Описание	Интернет-портал с открытым доступом, содержащий фармакологическую информацию обо всех человеческих мишенях отпускаемых по рецепту лекарств.
Типы данных ; захвачен	Целевая номенклатура, фармакологические данные, структуры лигандов.
Организмы	Человек, Мышь, Крыса
Контакт
Исследовательский центр	Эдинбургский университет, Великобритания
Первичное цитирование	Руководство IUPHAR/BPS по ФАРМАКОЛОГИИ в 2020 году: расширение содержания иммунофармакологии и представление Руководства IUPHAR/MMV по ФАРМАКОЛОГИИ МАЛЯРИИ
Доступ
Веб-сайт	www .руководство по фармакологии .org
веб-службы URL-адрес	www .руководство по фармакологии .org /вебсервисы .jsp
Sparql Конечная точка	РДФ .руководство по фармакологии .org /sparql
Разнообразный
Управление версиями	Содержимое обновляется примерно раз в квартал (т. е. 2020.2 обозначает [год].[номер выпуска]).
Политика курирования	Ручной, собственный

Руководство IUPHAR /BPS по ФАРМАКОЛОГИИ — это веб-сайт с открытым доступом , действующий как портал для информации о биологических мишенях лицензированных лекарств и других малых молекул. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ (стандартное сокращение GtoPdb) разработано совместным предприятием Международного союза фундаментальной и клинической фармакологии (IUPHAR) и Британского фармакологического общества (BPS). Она заменяет и расширяет исходную базу данных IUPHAR 2009 года (стандартное сокращение IUPHAR-DB). Целью «Руководства по ФАРМАКОЛОГИИ» является предоставление краткого обзора всех фармакологических целей, доступного всем членам научного и клинического сообщества и заинтересованной общественности, со ссылками на подробную информацию о выбранном наборе целей. Представленная информация включает фармакологические данные, мишень и номенклатуру генов, а также тщательно подобранную химическую информацию о лигандах. Включены обзоры и комментарии по каждому целевому семейству со ссылками на ключевые источники.

Предыстория и развитие

Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ первоначально было доступно онлайн в декабре 2011 г., а дополнительные материалы были опубликованы в июле 2012 г. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ поддерживается командой кураторов из Эдинбургского университета и разрабатывается международной сетью авторов, включая редакторов журнала Краткое руководство по ФАРМАКОЛОГИИ . Как и в случае с исходной базой данных IUPHAR, научно-консультативным и редакционным советом базы данных выступает Комитет Международного союза фундаментальной и клинической фармакологии (IUPHAR) по номенклатуре рецепторов и классификации лекарств (NC-IUPHAR). Его сеть из более чем 500 специалистов-консультантов (организованных в около 90 подкомитетов) делится своим опытом и данными. Текущим PI и обладателем гранта проекта GtoPdb является профессор Джейми А. Дэвис . Разработка и выпуск первой версии GtoPdb в 2012 году были описаны в редакционной статье, опубликованной в Британском журнале фармакологии под названием «Руководство по Pharmacology.org – обновление». ^[2] База данных IUPHAR больше не разрабатывается, и вся информация, содержащаяся на этом сайте, теперь доступна через Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ (ссылки на базу данных IUPHAR теперь должны быть перенаправлены).

Содержание и возможности

Целевыми группами, включенными в настоящее время в Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ, являются:

Каталитические рецепторы
Ферменты
Рецепторы, связанные с G-белком
Ионные каналы
Киназы
Ядерные рецепторы
Транспортеры
Другие белки-мишени, включая белки, связывающие жирные кислоты , сигма-рецепторы и рецепторы адипонектина.

Информация для каждой целевой группы подразделяется на семейства на основе классификации, с отдельной страницей данных для каждого семейства. На каждой странице мишени сгруппированы в списки таблиц, каждая из которых включает номенклатуру белков и генов мишени со ссылками на базы данных номенклатуры генов, а также список выбранных лигандов, обладающих активностью в отношении мишени, включая агонисты, антагонисты, ингибиторы и радиолиганды. Приводятся фармакологические данные и ссылки, а каждый лиганд имеет гиперссылку на страницу лигандов, отображающую номенклатуру и химическую структуру или последовательность пептидов, а также синонимы и соответствующие ссылки на базы данных. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ также включает список всех молекул-лигандов, представленных на сайте, разделенных на категории, включая малые органические молекулы (включая метаболиты млекопитающих , гормоны и нейротрансмиттеры ), синтетические органические молекулы, натуральные продукты , пептиды , неорганические молекулы и антитела . Полный список всех одобренных препаратов, представленных на сайте, также доступен через список лигандов. Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ расширяется и включает в себя клиническую информацию о мишенях и лигандах, а также образовательные ресурсы. Функции поиска на веб-сайте включают параметры быстрого и расширенного поиска, а также поиск рецепторов и лигандов, включая поддержку структур лигандов с использованием химических структур. Другие функции включают в себя новости «Горячие темы» и недавний список пар рецепторов и лигандов.

Руководство IUPHAR по ИММУНОФАРМАКОЛОГИИ

В период с ноября 2015 г. по октябрь 2018 г. Wellcome Trust поддержал проект по разработке Руководства IUPHAR по ИММУНОФАРМАКОЛОГИИ (GtoImmuPdb) на основе схемы GtoPdb. GtoImmuPdb — это ресурс с открытым доступом, который привносит иммунологический взгляд на высококачественные, тщательно отобранные экспертами фармакологические данные, содержащиеся в существующем Руководстве IUPHAR/BPS по ФАРМАКОЛОГИИ. Белковые мишени и лиганды, имеющие отношение к иммунофармакологии, были помечены и добавлены в GtoImmuPdb. Они также были связаны с новыми типами иммунологических данных, такими как иммунологические процессы, типы клеток и заболевания. GtoImmuPdb предоставляет базу знаний, которая связывает иммунологию с фармакологией, принося дополнительную пользу и поддерживая исследования и разработку лекарств, направленных на модуляцию иммунных, воспалительных или инфекционных компонентов заболевания. ^[3]

Краткое руководство по ФАРМАКОЛОГИИ

«Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ» включает онлайн-версию базы данных с открытым доступом « Краткого руководства по ФАРМАКОЛОГИИ» , ранее называвшегося «Руководство по рецепторам и каналам». ^[4] доступны в HTML, PDF и печатных форматах. Резюме онлайн-базы данных на бумажном носителе опубликовано как «Краткое руководство по фармакологии 2017/2018». ^[5] в виде серии статей, выходящих два раза в год приложения к Британскому журналу фармакологии .

Ссылки на базу данных

Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ включает ссылки на другие соответствующие ресурсы через страницы с мишенями и лигандами как на страницах с кратким, так и на подробных страницах. Многие из этих ресурсов поддерживают взаимные ссылки на соответствующие страницы «Руководства по ФАРМАКОЛОГИИ».

Будущие направления

После финансирования со стороны Wellcome Trust с 2012 по 2015 год Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ было расширено и теперь включает биологические мишени всех рецептурных лекарств и другие вероятные мишени будущих низкомолекулярных лекарств. Обзоры ключевых особенностей широкого спектра целей представлены на страницах сводного представления, а страницы подробного просмотра предоставляют более подробную информацию о свойствах выбранного подмножества целей. С января 2018 года предприятие «Лекарства от малярии» поддерживает новое расширение для разработки « Руководства по фармакологии малярии» . Ядро GtoPdb продолжает поддерживаться Британским фармакологическим обществом .

См. также

Ссылки

^ Армстронг, Дж. Ф.; Факсенда, Э; Хардинг, SD; Поусон, Эй Джей; Саутэн, К; Шарман, Дж.Л.; Кампо, Б; Кавана, ДР; Александр, SPH; Давенпорт, AP; Спеддинг, М; Дэвис, Дж.А. (8 января 2020 г.). «Руководство IUPHAR/BPS по ФАРМАКОЛОГИИ в 2020 году: расширение содержания иммунофармакологии и представление Руководства IUPHAR/MMV по ФАРМАКОЛОГИИ МАЛЯРИИ» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (Д1): Д1006–Д1021. дои : 10.1093/nar/gkz951 . ПМЦ 7145572 . ПМИД 31691834 .
^ Александр, ИП; Бенсон, HE; Давенпорт, А.; Мэти, А.; МакГрат, Ай-Джей; Поусон, Эй Джей; Питерс, Дж. А.; Шарман, Дж.Л.; Спеддинг, М.; Хармар, Эй Джей (2012). «GuideToPharmacology.org — обновление» . Британский журнал фармакологии . 167 (4): 697–698. дои : 10.1111/j.1476-5381.2012.02141.x . ПМЦ 3575771 . ПМИД 23003568 .
^ Хардинг, SD; Факсенда, Э; Саутэн, К; Мафия, П; Дэвис, Дж. А. (декабрь 2018 г.). «Новое руководство по иммунофармакологии» . Обзоры природы. Иммунология . 18 (12): 729. дои : 10.1038/s41577-018-0079-2 . ПМИД 30327546 .
^ Александр, ИП; Мэти, А; Питерс, Дж. А. (ноябрь 2011 г.). «Руководство по рецепторам и каналам (GRAC), 5-е издание» . Британский журнал фармакологии . 164 (Приложение 1): С1–324. дои : 10.1111/j.1476-5381.2011.01649_1.x . ПМЦ 3315626 . ПМИД 22040146 .
^ Александр, ИП; Келли, Э; Маррион, Невада; Питерс, Дж. А.; Факсенда, Э; Хардинг, SD; Поусон, Эй Джей; Шарман, Дж.Л.; Саутэн, К; Бунеман, ОП; Цидловски, Дж. А.; Христопулос, А; Давенпорт, AP; Фаббро, Д; Спеддинг, М; Стрессниг, Дж; Дэвис, Дж.А.; CGTP, сотрудники. (декабрь 2017 г.). «КРАТКОЕ РУКОВОДСТВО ПО ФАРМАКОЛОГИИ 2017/18: Обзор» . Британский журнал фармакологии . 174 Приложение 1 (Приложение 1): S1–S16. дои : 10.1111/bph.13882 . ПМК 5650665 . ПМИД 29055037 . {{cite journal}}: |first18= имеет общее имя ( справка )

Внешние ссылки

Руководство IUPHAR/BPS по ФАРМАКОЛОГИИ
- издание 2021 г. (опубликовано в BJP) Руководство IUPHAR/BPS по ФАРМАКОЛОГИИ,
- издание 2024 г. (опубликовано в BJP) Краткое руководство по ФАРМАКОЛОГИИ IUPHAR/BPS,
Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии (IUPHAR)
Британское фармакологическое общество (BPS)
Британский журнал фармакологии
Краткое руководство по ФАРМАКОЛОГИИ
Велком Траст
Лекарства от малярии Венчур

[1] Армстронг, Дж. Ф.; Факсенда, Э; Хардинг, SD; Поусон, Эй Джей; Саутэн, К; Шарман, Дж.Л.; Кампо, Б; Кавана, ДР; Александр, SPH; Давенпорт, AP; Спеддинг, М; Дэвис, Дж.А. (8 января 2020 г.). «Руководство IUPHAR/BPS по ФАРМАКОЛОГИИ в 2020 году: расширение содержания иммунофармакологии и представление Руководства IUPHAR/MMV по ФАРМАКОЛОГИИ МАЛЯРИИ» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (Д1): Д1006–Д1021. дои : 10.1093/nar/gkz951 . ПМЦ 7145572 . ПМИД 31691834 .

[pmid-2] Александр, ИП; Бенсон, HE; Давенпорт, А.; Мэти, А.; МакГрат, Ай-Джей; Поусон, Эй Джей; Питерс, Дж. А.; Шарман, Дж.Л.; Спеддинг, М.; Хармар, Эй Джей (2012). «GuideToPharmacology.org — обновление» . Британский журнал фармакологии . 167 (4): 697–698. дои : 10.1111/j.1476-5381.2012.02141.x . ПМЦ 3575771 . ПМИД 23003568 .

[3] Хардинг, SD; Факсенда, Э; Саутэн, К; Мафия, П; Дэвис, Дж. А. (декабрь 2018 г.). «Новое руководство по иммунофармакологии» . Обзоры природы. Иммунология . 18 (12): 729. дои : 10.1038/s41577-018-0079-2 . ПМИД 30327546 .

[4] Александр, ИП; Мэти, А; Питерс, Дж. А. (ноябрь 2011 г.). «Руководство по рецепторам и каналам (GRAC), 5-е издание» . Британский журнал фармакологии . 164 (Приложение 1): С1–324. дои : 10.1111/j.1476-5381.2011.01649_1.x . ПМЦ 3315626 . ПМИД 22040146 .

[5] Александр, ИП; Келли, Э; Маррион, Невада; Питерс, Дж. А.; Факсенда, Э; Хардинг, SD; Поусон, Эй Джей; Шарман, Дж.Л.; Саутэн, К; Бунеман, ОП; Цидловски, Дж. А.; Христопулос, А; Давенпорт, AP; Фаббро, Д; Спеддинг, М; Стрессниг, Дж; Дэвис, Дж.А.; CGTP, сотрудники. (декабрь 2017 г.). «КРАТКОЕ РУКОВОДСТВО ПО ФАРМАКОЛОГИИ 2017/18: Обзор» . Британский журнал фармакологии . 174 Приложение 1 (Приложение 1): S1–S16. дои : 10.1111/bph.13882 . ПМК 5650665 . ПМИД 29055037 . {{cite journal}}: |first18= имеет общее имя ( справка )

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]