6-фосфоглюконатдегидрогеназа
| 6ПГД | |||
|---|---|---|---|
 Кристаллографическая структура овечьей 6-фосфоглюконатдегидрогеназы в комплексе с аденозин-2'-монофосфатом [1] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | 6ПГД | ||
| Пфам | PF00393 | ||
| Пфам Клан | CL0106 | ||
| ИнтерПро | ИПР006114 | ||
| PROSITE | PDOC00390 | ||
| СКОП2 | 2пгд / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
| Фосфоглюконатдегидрогеназа | |||
|---|---|---|---|
 Димер 6-фосфоглюконатдегидрогеназы, Ovis aries | |||
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 1.1.1.44 | ||
| Номер CAS. | 9001-82-5 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
| фосфоглюконатдегидрогеназа | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | ПГД | ||
| ген NCBI | 5226 | ||
| HGNC | 8891 | ||
| МОЙ БОГ | 172200 | ||
| RefSeq | НМ_002631 | ||
| ЮниПрот | P52209 | ||
| Другие данные | |||
| Номер ЕС | 1.1.1.44 | ||
| Локус | Хр. 1 п36.3-36.13 | ||
| |||
6-фосфоглюконатдегидрогеназа ( 6PGD ) представляет собой фермент пентозофосфатного пути . Он образует рибулозо-5-фосфат из 6-фосфоглюконата :
- 6-фосфо-D-глюконат + НАД(Ф) + D-рибулозо-5-фосфат + CO2 + НАД(Ф)H + H +
Это окислительная карбоксилаза, которая катализирует окислительное декарбоксилирование в 6-фосфоглюконата рибулозо -5-фосфат в присутствии НАДФ . Эта реакция является компонентом гексозомонофосфатного шунтирующего и пентозофосфатного путей (PPP). [2] [3] Прокариотические и эукариотические 6PGD представляют собой белки , состоящие примерно из 470 аминокислот которых , последовательности консервативны высоко . [4] Белок представляет собой гомодимер , в котором мономеры действуют независимо: [3] каждый содержит большой, в основном альфа-спиральный домен , и меньший бета-альфа-бета-домен, содержащий смешанный параллельный и антипараллельный 6-нитевой бета-лист . [3] НАДФ связывается в щели небольшого домена, а субстрат связывается в соседнем кармане. [3]
Биотехнологическое значение
[ редактировать ]Недавно было показано, что 6PGD катализирует также обратную реакцию (т.е. восстановительное карбоксилирование ) in vivo . [5] Эксперименты с использованием селекционных штаммов Escherichia coli показали, что эта реакция была достаточно эффективной, чтобы поддерживать образование биомассы, основанной исключительно на CO 2 и пентозных сахарах . В будущем это свойство можно будет использовать для синтетической фиксации углерода путей .
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации в гене, кодирующем этот фермент, приводят к дефициту 6-фосфоглюконатдегидрогеназы — аутосомно- наследственному заболеванию, поражающему эритроциты.
Как возможная мишень для наркотиков
[ редактировать ]6PGD участвует в метаболизме раковых клеток, поэтому ведется поиск ингибиторов 6PGD. [6]
См. также
[ редактировать ]- Париетин , ингибитор 6PGD
Ссылки
[ редактировать ]- ^ PDB : 1PGQ ; Адамс М.Дж., Эллис Г.Х., Говер С., Нейлор С.Э., Филлипс С. (июль 1994 г.). «Кристаллографическое исследование кофермента, аналога кофермента и связывания субстрата в 6-фосфоглюконатдегидрогеназе: значение для специфичности НАДФ и механизма фермента». Структура . 2 (7): 651–68. дои : 10.1016/s0969-2126(00)00066-6 . ПМИД 7922042 .
- ^ Бродель С.Е., Вольф Р.Э. (июль 1990 г.). «Генетическая маркировка, клонирование и последовательность ДНК гена PCC 7942 штамма Synechococcus sp. (gnd), кодирующего 6-фосфоглюконатдегидрогеназу» . Дж. Бактериол . 172 (7): 4023–31. дои : 10.1128/jb.172.7.4023-4031.1990 . ПМК 213388 . ПМИД 2113917 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Адамс М.Дж., Арчибальд И.Г., Багг С.Э., Карн А., Говер С., Хелливелл Дж.Р. , Пикерсгилл Р.В., Уайт С.В. (1983). «Трехмерная структура 6-фосфоглюконатдегидрогеназы печени овцы при разрешении 2,6 А» . ЭМБО Дж . 2 (6): 1009–14. дои : 10.1002/j.1460-2075.1983.tb01535.x . ПМК 555222 . ПМИД 6641716 .
- ^ Рейзер А., Дойчер Дж., Сайер М.Х., Рейзер Дж. (май 1991 г.). «Анализ глюконатного (gnt) оперона Bacillus subtilis». Мол. Микробиол . 5 (5): 1081–9. дои : 10.1111/j.1365-2958.1991.tb01880.x . ПМИД 1659648 . S2CID 2006623 .
- ^ Сатановский А., Дронселла Б., Нур Е., Фёгели Б., Хе Х., Вихманн П. и др. (ноябрь 2020 г.). «Пробуждение скрытого цикла фиксации углерода в Escherichia coli» . Природные коммуникации . 11 (1): 5812. Бибкод : 2020NatCo..11.5812S . дои : 10.1038/s41467-020-19564-5 . ПМЦ 7669889 . ПМИД 33199707 .
- ^ 6-фосфоглюконатдегидрогеназа связывает окислительный PPP, липогенез и рост опухоли, ингибируя передачу сигналов LKB1-AMPK. 2015 год
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Фрэмптон EW, Вуд WA (октябрь 1961 г.). «Окисление углеводов Pseudomonas fluorescens VI. Превращение 2-кето-6-фосфоглюконата в пируват» . Журнал биологической химии . 236 : 2571–7. дои : 10.1016/S0021-9258(19)61700-X . ПМИД 13894458 .
