ХАХАХА

ХАХАХА
Идентификаторы
Псевдонимы	HADHA , гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа/3-кетоацил-КоА-тиолаза/еноил-КоА-гидратаза (трифункциональный белок), альфа-субъединица, ECHA, GBP, HADH, LCEH, LCHAD, MTPA, TP-АЛЬФА, субъединица трехфункционального мультиферментного комплекса гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы альфа
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 600890 ; МГИ : 2135593 ; Гомологен : 152 ; GeneCards : МАТЬ ; ОМА : МАТЬ - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	26,244,672 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	30,360,160 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	jejunal mucosa; ; gastrocnemius muscle; ; left ventricle; ; apex of heart; ; duodenum; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; right auricle; ; mucosa of transverse colon; ; muscle of thigh; ; rectum;
	Top expressed in
	myocardium of ventricle; ; right ventricle; ; cardiac muscles; ; brown adipose tissue; ; muscle of thigh; ; genital tubercle; ; extraocular muscle; ; soleus muscle; ; epithelium of small intestine; ; digastric muscle;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	fatty-acyl-CoA binding; acetyl-CoA C-acyltransferase activity; protein-containing complex binding; NAD binding; enoyl-CoA hydratase activity; acetyl-CoA C-acetyltransferase activity; long-chain-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase activity; protein binding; catalytic activity; lyase activity; oxidoreductase activity; long-chain-enoyl-CoA hydratase activity; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase activity;
Cellular component	mitochondrion; mitochondrial inner membrane; mitochondrial nucleoid; mitochondrial fatty acid beta-oxidation multienzyme complex; extracellular matrix;
Biological process	lipid metabolism; fatty acid metabolic process; response to insulin; fatty acid beta-oxidation; metabolism; cardiolipin acyl-chain remodeling;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3030
	97212
	ENSG00000084754
	ENSMUSG00000025745
	P40939
	Q8BMS1
	НМ_000182
	НМ_178878
	НП_000173
	НП_849209
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Трехфункциональная ферментная субъединица альфа, митохондриальная, также известная как гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа/3-кетоацил-КоА-тиолаза/еноил-КоА-гидратаза (трифункциональный белок), альфа-субъединица представляет собой белок , который у человека кодируется HADHA геном . Мутации в HADHA были связаны с дефицитом трехфункционального белка или дефицитом длинноцепочечного 3-гидроксиацил-коэнзима А-дегидрогеназы . ^[5]

Структура

HADHA представляет собой белок массой 82,9 кДа, состоящий из 763 аминокислот. ^[6]^[7]

Митохондриальный гидратазы мембраносвязанный гетерокомплекс состоит из четырех альфа- и четырех бета-субъединиц, причем альфа-субъединица катализирует активность 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы и еноил-КоА- . Гены альфа- и бета-субъединиц митохондриального трифункционального белка расположены в геноме человека рядом друг с другом в ориентации «голова к голове». ^[5]

Функция

Этот ген кодирует альфа-субъединицу митохондриального трифункционального белка, который катализирует последние три стадии митохондриального бета-окисления длинноцепочечных жирных кислот. ^[5] Фермент превращает соединения 2-еноил-КоА со средней и длинной цепью в следующие 3-кетоацил-КоА, когда присутствует только НАД, и ацетил-КоА, НАД и КоАСГ . когда присутствуют ^[8] Альфа-субъединица катализирует эту реакцию и присоединяется к HADHB , который катализирует последнюю стадию реакции. ^[9]

Клиническое значение

Мутации в этом гене приводят к дефициту трехфункционального белка или дефициту длинноцепочечного 3-гидроксиацил-кофермента А-дегидрогеназы . ^[5]

Наиболее распространенной формой мутации является G1528C, при которой гуанин в 1528-м положении заменяется на цитозин . Мутация гена создает дефицит белка, который связан с нарушением окисления длинноцепочечных жирных кислот , что может привести к внезапной детской смерти. ^[10] Клинические проявления этого дефицита могут включать миопатию , кардиомиопатию , эпизоды комы и гипогликемию . ^[11] Дефицит длинноцепочечного L-3-гидроксиацил-коэнзима А-дегидрогеназы связан с некоторыми расстройствами, специфичными для беременности, включая преэклампсию , синдром HELLP (гемолиз, повышение активности печеночных ферментов, низкий уровень тромбоцитов), гиперемезис беременных , ^[12]^[13] острая жировая дистрофия печени у беременных , ^[14] и инфаркт плаценты у матери. ^[12]^[13]

С клинической точки зрения HADHA также может быть полезным маркером для прогнозирования устойчивости к определенным типам химиотерапии у пациентов с раком легких . ^[15]

Взаимодействия

Было показано, что HADHA имеет 142 бинарных белок-белковых взаимодействия, включая 117 кокомплексных взаимодействий. HADHA, по-видимому, взаимодействует с GABARAP , MAP1LC3B , TRAF6 , GABARAPL2 , GABARAPL1, GAST, BCAR3 , EPB41 , TNFRSF1A , HLA-B , NFKB2 , MAP3K1 , IKBKE , PRKAB1 , RIPK3 , CD74 , NR4A1 , cdsA, ATXN2L , ABCF2 и МАПК3 . ^[16]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000084754 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025745 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д «Ген Энтреза: гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа/3-кетоацил-КоА-тиолаза/еноил-КоА-гидратаза (трифункциональный белок), альфа-субъединица» .
^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
^ «гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа/3-кетоацил-КоА-тиолаза/еноил-КоА-гидратаза (трифункциональный белок), альфа-субъединица» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) . Архивировано из оригинала 05 марта 2016 г. Проверено 18 марта 2015 г.
^ Карпентер К., Поллитт Р.Дж., Миддлтон Б. (март 1992 г.). «Длинноцепочечный 3-гидроксиацил-кофермент А дегидрогеназа печени человека представляет собой многофункциональный мембраносвязанный фермент бета-окисления митохондрий». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 183 (2): 443–8. дои : 10.1016/0006-291x(92)90501-b . ПМИД 1550553 .
^ Voet DJ, Voet JG, Пратт CW (2010). «Глава 18, Синтез митохондриального АТФ». Принципы биохимии (4-е изд.). Уайли. п. 669. ИСБН 978-0-470-23396-2 .
^ IJlst L, Ruiter JP, Hoovers JM, Jakobs ME, Wanders RJ (август 1996 г.). «Общая миссенс-мутация G1528C при дефиците длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы. Характеристика и экспрессия мутантного белка, анализ мутаций в геномной ДНК и хромосомная локализация гена альфа-субъединицы трифункционального белка митохондрий» . Журнал клинических исследований . 98 (4): 1028–33. дои : 10.1172/jci118863 . ПМК 507519 . ПМИД 8770876 .
^ Роккиччоли Ф., Вандерс Р.Дж., Обур П., Виани-Лио С., Ийлст Л., Фабр М., Картье Н., Бугнер П.Ф. (декабрь 1990 г.). «Дефицит длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы: причина летальных миопатий и кардиомиопатий в раннем детстве» . Педиатрические исследования . 28 (6): 657–62. дои : 10.1203/00006450-199012000-00023 . ПМИД 2284166 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ракхеджа Д., Беннетт М.Дж., Роджерс Б.Б. (июль 2002 г.). «Длинноцепочечный L-3-гидроксиацил-коэнзим и дефицит дегидрогеназы: молекулярный и биохимический обзор» . Лабораторные исследования; Журнал технических методов и патологии . 82 (7): 815–24. дои : 10.1097/01.lab.0000021175.50201.46 . ПМИД 12118083 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Гриффин А.С., Штраус А.В., Беннетт М.Дж., Эрнст Л.М. (сентябрь – октябрь 2012 г.). «Мутации длинноцепочечного 3-гидроксиацил-кофермента дегидрогеназы связаны с плацентарным инфарктом дна матери / массивным перивиллозным отложением фибрина». Педиатрическая патология и патология развития . 15 (5): 368–74. дои : 10.2350/12-05-1198-оа.1 . ПМИД 22746996 . S2CID 38407420 .
^ Ибда Дж.А., Ян З., Беннетт М.Дж. (сентябрь – октябрь 2000 г.). «Заболевания печени при беременности и дефекты окисления жирных кислот плода». Молекулярная генетика и обмен веществ . 71 (1–2): 182–9. дои : 10.1006/mgme.2000.3065 . ПМИД 11001809 .
^ Кагеяма Т., Нагасио Р., Рюге С., Мацумото Т., Иёда А., Сато Ю., Масуда Н., Цзян С.С., Саэгуса М., Сато Ю. (2011). «HADHA является потенциальным предиктором ответа на химиотерапию на основе платины при раке легких». Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака . 12 (12): 3457–63. ПМИД 22471497 .
^ «По запросу HADHA найдено 142 бинарных взаимодействия» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.

Дальнейшее чтение

Ракхеджа Д., Беннетт М.Дж., Роджерс Б.Б. (июль 2002 г.). «Длинноцепочечный L-3-гидроксиацил-коэнзим и дефицит дегидрогеназы: молекулярный и биохимический обзор» . Лабораторное исследование . 82 (7): 815–24. дои : 10.1097/01.lab.0000021175.50201.46 . ПМИД 12118083 .
Исаакс Дж.Д., Симс Х.Ф., Пауэлл К.К., Беннетт М.Дж., Хейл Д.Е., Трим В.Р., Штраус А.В. (сентябрь 1996 г.). «Острая жировая дистрофия печени у матери во время беременности, связанная с дефицитом трифункционального белка плода: молекулярная характеристика нового мутантного аллеля матери» . Педиатрические исследования . 40 (3): 393–8. дои : 10.1203/00006450-199609000-00005 . PMID 8865274 .
Джиллингем М.Б., Матерн Д., Хардинг СО (октябрь 2009 г.). «Влияние кормления, физических упражнений и генотипа на 3-гидроксиацилкарнитины в плазме у детей с дефицитом Лчада» . Темы клинического питания . 24 (4): 359–365. дои : 10.1097/TIN.0b013e3181c62182 . ПМЦ 2892921 . ПМИД 20589231 .
Милевска М., Макредмонд Дж., Бирн ПК (ноябрь 2009 г.). «Идентификация новых взаимодействующих со спартином показывает, что спартин является многофункциональным белком». Журнал нейрохимии . 111 (4): 1022–30. дои : 10.1111/j.1471-4159.2009.06382.x . ПМИД 19765186 . S2CID 205621232 .
Уикс Дж., Моррисон К., Маллен А., Уэйт Р., Бартон П., Данн М.Дж. (февраль 2003 г.). «Гиперубиквитинирование белков при дилатационной кардиомиопатии». Протеомика . 3 (2): 208–16. дои : 10.1002/pmic.200390029 . ПМИД 12601813 . S2CID 19874662 .
Богенхаген Д.Ф., Руссо Д., Берк С. (февраль 2008 г.). «Слоистая структура нуклеоидов митохондриальной ДНК человека» . Журнал биологической химии . 283 (6): 3665–75. дои : 10.1074/jbc.M708444200 . ПМИД 18063578 .
Чжан QX, Болдуин Г.С. (октябрь 1994 г.). «Структуры кДНК человека и гена, кодирующего гастрин-связывающий белок массой 78 кДа, и родственного псевдогена». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1219 (2): 567–75. дои : 10.1016/0167-4781(94)90091-4 . ПМИД 7918661 .
IJlst L, Oostheim W, Ruiter JP, Wanders RJ (июль 1997 г.). «Молекулярные основы дефицита длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы: идентификация двух новых мутаций» . Журнал наследственных метаболических заболеваний . 20 (3): 420–2. дои : 10.1023/А:1005310903004 . ПМИД 9266371 . S2CID 23046057 .
Яги М, Ли Т, Авано Х, Цудзи М, Тадзима Г, Кобаяши Х, Хасегава Ю, Ямагути С, Такэсима Ю, Мацуо М (декабрь 2011 г.). «У пациента с дефицитом митохондриального трифункционального белка из-за мутации в гене HADHB с раннего детства наблюдались рецидивирующие миалгии, диагноз был поставлен в подростковом возрасте». Молекулярная генетика и обмен веществ . 104 (4): 556–9. дои : 10.1016/j.ymgme.2011.09.025 . ПМИД 22000755 .

Внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для альфа-субъединицы трехфункционального фермента человека, митохондриальной (HADHA).

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000084754 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025745 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д «Ген Энтреза: гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа/3-кетоацил-КоА-тиолаза/еноил-КоА-гидратаза (трифункциональный белок), альфа-субъединица» .

[COPaKB-6] Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .

[url_COPaKB-7] «гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа/3-кетоацил-КоА-тиолаза/еноил-КоА-гидратаза (трифункциональный белок), альфа-субъединица» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) . Архивировано из оригинала 05 марта 2016 г. Проверено 18 марта 2015 г.

[8] Карпентер К., Поллитт Р.Дж., Миддлтон Б. (март 1992 г.). «Длинноцепочечный 3-гидроксиацил-кофермент А дегидрогеназа печени человека представляет собой многофункциональный мембраносвязанный фермент бета-окисления митохондрий». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 183 (2): 443–8. дои : 10.1016/0006-291x(92)90501-b . ПМИД 1550553 .

[BioChem-9] Voet DJ, Voet JG, Пратт CW (2010). «Глава 18, Синтез митохондриального АТФ». Принципы биохимии (4-е изд.). Уайли. п. 669. ИСБН 978-0-470-23396-2 .

[10] IJlst L, Ruiter JP, Hoovers JM, Jakobs ME, Wanders RJ (август 1996 г.). «Общая миссенс-мутация G1528C при дефиците длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы. Характеристика и экспрессия мутантного белка, анализ мутаций в геномной ДНК и хромосомная локализация гена альфа-субъединицы трифункционального белка митохондрий» . Журнал клинических исследований . 98 (4): 1028–33. дои : 10.1172/jci118863 . ПМК 507519 . ПМИД 8770876 .

[11] Роккиччоли Ф., Вандерс Р.Дж., Обур П., Виани-Лио С., Ийлст Л., Фабр М., Картье Н., Бугнер П.Ф. (декабрь 1990 г.). «Дефицит длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы: причина летальных миопатий и кардиомиопатий в раннем детстве» . Педиатрические исследования . 28 (6): 657–62. дои : 10.1203/00006450-199012000-00023 . ПМИД 2284166 .

[rakheja2002-12] Перейти обратно: ^а ^б Ракхеджа Д., Беннетт М.Дж., Роджерс Б.Б. (июль 2002 г.). «Длинноцепочечный L-3-гидроксиацил-коэнзим и дефицит дегидрогеназы: молекулярный и биохимический обзор» . Лабораторные исследования; Журнал технических методов и патологии . 82 (7): 815–24. дои : 10.1097/01.lab.0000021175.50201.46 . ПМИД 12118083 .

[griffin2012-13] Перейти обратно: ^а ^б Гриффин А.С., Штраус А.В., Беннетт М.Дж., Эрнст Л.М. (сентябрь – октябрь 2012 г.). «Мутации длинноцепочечного 3-гидроксиацил-кофермента дегидрогеназы связаны с плацентарным инфарктом дна матери / массивным перивиллозным отложением фибрина». Педиатрическая патология и патология развития . 15 (5): 368–74. дои : 10.2350/12-05-1198-оа.1 . ПМИД 22746996 . S2CID 38407420 .

[14] Ибда Дж.А., Ян З., Беннетт М.Дж. (сентябрь – октябрь 2000 г.). «Заболевания печени при беременности и дефекты окисления жирных кислот плода». Молекулярная генетика и обмен веществ . 71 (1–2): 182–9. дои : 10.1006/mgme.2000.3065 . ПМИД 11001809 .

[15] Кагеяма Т., Нагасио Р., Рюге С., Мацумото Т., Иёда А., Сато Ю., Масуда Н., Цзян С.С., Саэгуса М., Сато Ю. (2011). «HADHA является потенциальным предиктором ответа на химиотерапию на основе платины при раке легких». Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака . 12 (12): 3457–63. ПМИД 22471497 .

[16] «По запросу HADHA найдено 142 бинарных взаимодействия» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

v т и Ферменты : мультиферментные комплексы
Фотосинтез	Сложные белки фотосинтетического реакционного центра Фотосистема я II
Дегидрогеназа	Комплекс пируватдегидрогеназы Е1 Е2 Е3 Оксоглутаратдегидрогеназа ОГДХ Экотуризм междугородная связь Комплекс дегидрогеназы альфа-кетокислот с разветвленной цепью БКДГА БКДХБ ДБТ междугородная связь
Другой	САПР Карбамоилфосфатсинтаза II Аспартаткарбамоилтрансфераза Дигидрооротаза P450-содержащие системы Цитохромный комплекс b6f Электронно-транспортная цепь Синтетазный комплекс жирных кислот Глициндекарбоксилазный комплекс Митохондриальный трехфункциональный белок ХАХАХА ХАДХБ Фосфоенолпируватсахарная фосфотрансферазная система Поликетидсинтаза Сахаразно-изомальтазный комплекс Триптофансинтаза

v т и Оксидоредуктазы : алкогольоксидоредуктазы ( EC 1.1)
1.1.1: NAD/NADP acceptor	3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase 3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase Alcohol dehydrogenase Aldo-keto reductase 1A1 1B1 1B10 1C1 1C3 1C4 7A2 Aldose reductase Beta-Ketoacyl ACP reductase Carbohydrate dehydrogenases Carnitine dehydrogenase D-malate dehydrogenase (decarboxylating) DXP reductoisomerase Glucose-6-phosphate dehydrogenase Glycerol-3-phosphate dehydrogenase HMG-CoA reductase IMP dehydrogenase Isocitrate dehydrogenase Lactate dehydrogenase L-threonine dehydrogenase L-xylulose reductase Malate dehydrogenase Malate dehydrogenase (decarboxylating) Malate dehydrogenase (NADP+) Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP+) Phosphogluconate dehydrogenase Sorbitol dehydrogenase Hydroxysteroid dehydrogenase: 3β 3β-HSD NSDHL 11β 11β-HSD1 11β-HSD2 17β
1.1.2: cytochrome acceptor	D-lactate dehydrogenase (cytochrome) D-lactate dehydrogenase (cytochrome c-553) Mannitol dehydrogenase (cytochrome)
1.1.3: oxygen acceptor	Glucose oxidase L-gulonolactone oxidase Xanthine oxidase Alcohol oxidase
1.1.4: disulfide as acceptor	Vitamin K epoxide reductase Vitamin-K-epoxide reductase (warfarin-insensitive)
1.1.5: quinone/similar acceptor	Malate dehydrogenase (quinone) Quinoprotein glucose dehydrogenase
1.1.99: other acceptors	Choline dehydrogenase L2HGDH

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)