РИПК3

РИПК3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4M66, 4M69
Идентификаторы
Псевдонимы	RIPK3 , RIP3, серин/треониновая киназа 3, взаимодействующая с рецептором
Внешние идентификаторы	Опустить : 605817 ; МГИ : 2154952 ; Гомологен : 31410 ; Генные карты : РИПК3 ; ОМА : РИПК3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	24,340,022 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	56,026,322 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; mucosa of transverse colon; ; blood; ; duodenum; ; spleen; ; rectum; ; appendix; ; monocyte; ; right lobe of thyroid gland; ; lymph node;
	Top expressed in
	endothelial cell of lymphatic vessel; ; yolk sac; ; thymus; ; Paneth cell; ; internal carotid artery; ; cartilage organ; ; dermis; ; epithelium of small intestine; ; external carotid artery; ; embryo;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; protein kinase activity; nucleotide binding; transcription coactivator activity; kinase activity; protein serine/threonine kinase activity; NF-kappaB-inducing kinase activity; protein binding; identical protein binding; ATP binding; protein-containing complex binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; membrane; plasma membrane; intracellular anatomical structure; mitochondrion;
Biological process	regulation of CD8-positive, alpha-beta cytotoxic T cell extravasation; amyloid fibril formation; T cell differentiation in thymus; protein heterooligomerization; phosphorylation; thymus development; regulation of interferon-gamma production; positive regulation of oxidoreductase activity; regulation of adaptive immune response; spleen development; regulation of reactive oxygen species metabolic process; regulation of activation-induced cell death of T cells; T cell homeostasis; positive regulation of phosphatase activity; positive regulation of necroptotic process; protein phosphorylation; regulation of activated T cell proliferation; positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; NIK/NF-kappaB signaling; positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; apoptotic signaling pathway; protein autophosphorylation; positive regulation of ligase activity; necroptosis; regulation of T cell mediated cytotoxicity; I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; lymph node development; protein homooligomerization; activation of protein kinase activity; positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; signal transduction; programmed cell death; positive regulation of necrotic cell death; positive regulation of nucleic acid-templated transcription; cellular response to hydrogen peroxide; programmed necrotic cell death;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11035
	56532
	ENSG00000129465 ; ENSG00000285379
	ENSMUSG00000022221
	Q9Y572
	Q9QZL0
	НМ_006871
	НМ_001164107 ; НМ_001164108 ; НМ_019955
	НП_006862
	НП_001157579 ; НП_001157580 ; НП_064339
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Взаимодействующая с рецептором серин/треонин-протеинкиназа 3 представляет собой фермент , который у человека кодируется RIPK3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Продукт этого гена является членом взаимодействующих с рецепторами (RIP) семейства серин/треониновых протеинкиназ, . Он содержит C-концевой домен, уникальный среди других членов семейства RIP. Кодируемый белок преимущественно локализован в цитоплазме и может подвергаться нуклеоцитоплазматическому перемещению в зависимости от новых сигналов ядерной локализации и экспорта. Он является компонентом сигнального комплекса рецептора-I фактора некроза опухоли (TNF) и может вызывать некроптоз путем взаимодействия с RIPK1 и MLKL в белковом комплексе, называемом некросомой. ^{[ 7 ]} Взаимодействия между RIPK1 и RIPK3 также образуют некросому, которая запускает апоптоз. ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RIPK3 взаимодействует с RIPK1, образуя амилоидный отросток. ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]} Мотивы гомотипического взаимодействия RIP (RHIM) RIPK3 позволяют ему образовывать некросому с RIPK1. ^{[ 9 ]} В результате этого взаимодействия образуются гетеротипические β-листы , которые соединяются вместе, образуя чередующуюся «лестницу» серина из RIPK1 и цистеина из RIPK3. ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000285379 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000129465, ENSG00000285379 — Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022221 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Ю П.В., Хуан Б.С., Шен М., Куаст Дж., Чан Э., Сюй Х и др. (май 1999 г.). «Идентификация RIP3, RIP-подобной киназы, которая активирует апоптоз и NFkappaB» . Современная биология . 9 (10): 539–542. Бибкод : 1999CBio....9..539Y . дои : 10.1016/S0960-9822(99)80239-5 . ПМИД 10339433 .
^ Сан X, Ли Дж., Навас Т., Болдуин Д.Т., Стюарт Т.А., Диксит В.М. (июнь 1999 г.). «RIP3, новая киназа, индуцирующая апоптоз» . Журнал биологической химии . 274 (24): 16871–16875. дои : 10.1074/jbc.274.24.16871 . ПМИД 10358032 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: серин-треониновая киназа 3, взаимодействующая с рецептором RIPK3» .
^ Jump up to: ^а ^б Ли Дж., Маккуэйд Т., Симер А.Б., Напетшниг Дж., Мориваки К., Сяо Ю.С. и др. (июль 2012 г.). «Некросома RIP1/RIP3 образует функциональный амилоидный сигнальный комплекс, необходимый для запрограммированного некроза» . Клетка . 150 (2): 339–350. дои : 10.1016/j.cell.2012.06.019 . ПМК 3664196 . ПМИД 22817896 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Момпеан М., Ли В., Ли Дж., Лааге С., Симер А.Б., Бозкурт Г. и др. (май 2018 г.). «Структура ядра некросомы RIPK1-RIPK3, гетероамилоидного сигнального комплекса человека» . Клетка . 173 (5): 1244–1253.e10. дои : 10.1016/j.cell.2018.03.032 . ПМК 6002806 . ПМИД 29681455 .
^ «RIPK3 - серин/треонин-протеинкиназа 3, взаимодействующая с рецептором - Homo sapiens (человек) - ген и белок RIPK3» . www.uniprot.org . Проверено 13 мая 2022 г.

Дальнейшее чтение

Касоф Г.М., Проссер Дж.К., Лю Д., Лоренци М.В., Гомес BC (май 2000 г.). «RIP-подобная киназа, RIP3, индуцирует апоптоз и ядерную транслокацию NF-kappaB и локализуется в митохондриях» . Письма ФЭБС . 473 (3): 285–291. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01473-3 . ПМИД 10818227 .
Сунь X, Инь Дж, Старовасник М.А., Фэйрбратер В.Дж., Диксит В.М. (март 2002 г.). «Идентификация нового мотива гомотипического взаимодействия, необходимого для фосфорилирования белка, взаимодействующего с рецептором (RIP), с помощью RIP3» . Журнал биологической химии . 277 (11): 9505–9511. дои : 10.1074/jbc.M109488200 . ПМИД 11734559 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С. и др. (декабрь 2002 г.). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Баумистер Т., Баух А., Раффнер Х., Ангранд П.О., Бергамини Г., Кротон К. и др. (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Природная клеточная биология . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .
Мейлан Э., Бернс К., Хофманн К., Бланшето В., Мартинон Ф., Келлихер М. и др. (май 2004 г.). «RIP1 является важным медиатором активации NF-каппа B, индуцированной Toll-подобным рецептором 3» (PDF) . Природная иммунология . 5 (5): 503–507. дои : 10.1038/ni1061 . ПМИД 15064760 . S2CID 12570157 .
Ян Ю, Ма Дж, Чен Ю, Ву М (сентябрь 2004 г.). «Нуклеоцитоплазматическое перемещение белка 3, взаимодействующего с рецептором (RIP3): идентификация новых сигналов ядерного экспорта и импорта в RIP3» . Журнал биологической химии . 279 (37): 38820–38829. дои : 10.1074/jbc.M401663200 . ПМИД 15208320 .
Ян Ю, Ху В, Фэн С, Ма Дж, Ву М (июнь 2005 г.). «RIP3 бета и RIP3 гамма, два новых варианта сплайсинга взаимодействующего с рецептором белка 3 (RIP3), подавляют апоптоз, индуцированный RIP3». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 332 (1): 181–187. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.04.114 . ПМИД 15896315 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Й., Ота Т., Нишикава Т., Ямашита Р. и др. (январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .
Чжао Л., Ван Г., Лу Д., Ву Дж., Сун Ф., Донг Дж. и др. (июнь 2006 г.). «Гомоцистеин, hRIP3 и врожденные сердечно-сосудистые пороки развития». Анатомия и эмбриология . 211 (3): 203–212. дои : 10.1007/s00429-005-0074-9 . ПМИД 16429275 . S2CID 7176317 .
Фэн С., Ма Л., Ян Ю, Ву М (сентябрь 2006 г.). «Усеченный RIP3 (tRIP3) действует выше FADD, индуцируя апоптоз в клеточной линии гепатоцеллюлярной карциномы человека QGY-7703». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 347 (3): 558–565. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.06.118 . ПМИД 16844082 .
Ан К.С., Сетхи Г., Кришнан К., Аггарвал Б.Б. (январь 2007 г.). «Гамма-токотриенол ингибирует сигнальный путь ядерного фактора-каппаВ посредством ингибирования белка, взаимодействующего с рецептором, и ТАК1, что приводит к подавлению продуктов антиапоптотических генов и усилению апоптоза» . Журнал биологической химии . 282 (1): 809–820. дои : 10.1074/jbc.M610028200 . ПМИД 17114179 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 14 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000285379 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000129465, ENSG00000285379 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022221 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10339433-5] Jump up to: ^а ^б Ю П.В., Хуан Б.С., Шен М., Куаст Дж., Чан Э., Сюй Х и др. (май 1999 г.). «Идентификация RIP3, RIP-подобной киназы, которая активирует апоптоз и NFkappaB» . Современная биология . 9 (10): 539–542. Бибкод : 1999CBio....9..539Y . дои : 10.1016/S0960-9822(99)80239-5 . ПМИД 10339433 .

[pmid10358032-6] Сан X, Ли Дж., Навас Т., Болдуин Д.Т., Стюарт Т.А., Диксит В.М. (июнь 1999 г.). «RIP3, новая киназа, индуцирующая апоптоз» . Журнал биологической химии . 274 (24): 16871–16875. дои : 10.1074/jbc.274.24.16871 . ПМИД 10358032 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: серин-треониновая киназа 3, взаимодействующая с рецептором RIPK3» .

[Li_2012-8] Jump up to: ^а ^б Ли Дж., Маккуэйд Т., Симер А.Б., Напетшниг Дж., Мориваки К., Сяо Ю.С. и др. (июль 2012 г.). «Некросома RIP1/RIP3 образует функциональный амилоидный сигнальный комплекс, необходимый для запрограммированного некроза» . Клетка . 150 (2): 339–350. дои : 10.1016/j.cell.2012.06.019 . ПМК 3664196 . ПМИД 22817896 .

[Mompeán_2018-9] Jump up to: ^а ^б ^с Момпеан М., Ли В., Ли Дж., Лааге С., Симер А.Б., Бозкурт Г. и др. (май 2018 г.). «Структура ядра некросомы RIPK1-RIPK3, гетероамилоидного сигнального комплекса человека» . Клетка . 173 (5): 1244–1253.e10. дои : 10.1016/j.cell.2018.03.032 . ПМК 6002806 . ПМИД 29681455 .

[10] «RIPK3 - серин/треонин-протеинкиназа 3, взаимодействующая с рецептором - Homo sapiens (человек) - ген и белок RIPK3» . www.uniprot.org . Проверено 13 мая 2022 г.

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]