АКАДМ

АКАДМ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1EGC, 1EGD, 1EGE, 1T9G, 2A1T, 4P13
Идентификаторы
Псевдонимы	ACADM , ацил-КоА-дегидрогеназа, прямая цепь от C-4 до C-12, ACAD1, MCAD, MCADH, средняя цепь ацил-КоА-дегидрогеназы
Внешние идентификаторы	Опустить : 607008 ; МГИ : 87867 ; Гомологен : 3 ; GeneCards : ACADM ; ОМА : ACADM - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	75,787,575 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	153,650,269 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	jejunal mucosa; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; biceps brachii; ; right ventricle; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; body of tongue; ; vastus lateralis muscle; ; renal medulla; ; kidney tubule; ; skin of thigh;
	Top expressed in
	right ventricle; ; myocardium of ventricle; ; right kidney; ; brown adipose tissue; ; human kidney; ; soleus muscle; ; extraocular muscle; ; digastric muscle; ; cardiac muscles; ; tunica adventitia of aorta;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors; acyl-CoA dehydrogenase activity; identical protein binding; oxidoreductase activity; medium-chain-acyl-CoA dehydrogenase activity; flavin adenine dinucleotide binding;
Cellular component	axon; mitochondrion; extracellular exosome; nucleus; nuclear speck; mitochondrial matrix; mitochondrial membranes;
Biological process	medium-chain fatty acid metabolic process; lipid metabolism; fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA dehydrogenase; fatty acid metabolic process; metabolism; carnitine biosynthetic process; medium-chain fatty acid catabolic process; carnitine metabolic process, CoA-linked; fatty acid beta-oxidation; regulation of lipid metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	34
	11364
	ENSG00000117054
	ENSMUSG00000062908
	P11310
	P45952
	НМ_000016 ; НМ_001127328 ; НМ_001286042 ; НМ_001286043 ; НМ_001286044
	НМ_007382
	НП_000007 ; НП_001120800 ; НП_001272971 ; НП_001272972 ; НП_001272973
	НП_031408
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

ACADM ( ацил-коэнзим А-дегидрогеназа, прямая цепь от C-4 до C-12 ) — это ген , который дает инструкции для создания фермента, называемого ацил-коэнзим А-дегидрогеназой , который важен для расщепления (разложения) определенной группы жиров, называемой средней -цепочечные жирные кислоты .

Эти жирные кислоты содержатся в таких продуктах, как молоко и некоторые масла , а также хранятся в жировой ткани организма. Жирные кислоты со средней длиной цепи также образуются при разложении более крупных жирных кислот.

Фермент ацил-коэнзим А-дегидрогеназа жирных кислот со средней длиной цепи (ACADM) необходим для преобразования этих конкретных жирных кислот в энергию, особенно в периоды без еды (голодание). Фермент ACADM функционирует в митохондриях, центрах производства энергии внутри клеток. Он обнаружен в митохондриях нескольких типов тканей, в частности печени .

Ген ACADM расположен на коротком (p) плече хромосомы 1 в положении 31, от пары оснований 75 902 302 до пары оснований 75 941 203.

Структура

Белок, кодируемый геном ACADM , имеет размер ~ 47 кДа и состоит из 421 аминокислоты. ^[5]

Функция

Фермент LCAD катализирует большую часть бета-окисления жирных кислот путем образования транс-двойной связи C2-C3 в жирной кислоте. MCAD работает с длинноцепочечными жирными кислотами, обычно между C4 и C12-ацилКоА. ^[6] Доказано, что окисление жирных кислот экономит глюкозу в условиях голодания, а также необходимо для метаболизма аминокислот, что важно для поддержания адекватного производства глюкозы. ^[7] Кроме того, MCAD участвует в метаболизме жирных кислот и сигнальном пути PPAR. ^[8]

Клиническое значение

Дефицит ацил-коэнзима А со средней длиной цепи может быть вызван мутациями в гене ACADM. Было идентифицировано более 54 мутаций гена ACADM, которые вызывают дефицит ацил-коэнзима А со средней длиной цепи. ^[9] Многие из этих мутаций меняют аминокислотный строительный блок в ферменте ACADM. Наиболее распространенная аминокислотная замена заменяет лизин в глутаминовой кислотой положении 329 аминокислотной цепи фермента (также обозначаемой как Lys329Glu или K329E). ^[10] Эта мутация и другие аминокислотные замены изменяют структуру фермента, снижая или устраняя его активность. Другие мутации удаляют или дублируют часть гена ACADM, что приводит к нестабильности фермента, который не может функционировать.

При нехватке (дефиците) функционального фермента ACADM среднецепочечные жирные кислоты не могут подвергаться расщеплению и переработке. В результате эти жиры не преобразуются в энергию, что может привести к характерным симптомам этого расстройства, таким как недостаток энергии (вялость) и низкий уровень сахара в крови. Уровни жирных кислот со средней длиной цепи или частично расщепленных жирных кислот могут накапливаться в тканях и могут повредить печень и мозг, вызывая более серьезные осложнения. ^[11]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000117054 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062908 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «ACADM - специфическая ацил-КоА-дегидрогеназа со средней длиной цепи, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (человек) - ген и белок ACADM» . www.uniprot.org .
^ Мацубара И., Краус Дж.П., Ян-Фенг Т.Л., Франке У., Розенберг Л.Е., Танака К. (сентябрь 1986 г.). «Молекулярное клонирование кДНК, кодирующих ацил-КоА-дегидрогеназу средней цепи крысы и человека, и присвоение гена человеческой хромосоме 1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (17): 6543–7. Бибкод : 1986PNAS...83.6543M . дои : 10.1073/pnas.83.17.6543 . ПМЦ 386540 . ПМИД 3462713 .
^ Гетцман Э.С., Алкорн Дж.Ф., Бхарати С.С., Уппала Р., МакХью К.Дж., Космидер Б., Чен Р., Цзо Ю.Ю., Бек М.Е., МакКинни Р.В., Скиллинг Х., Сухри КР, Карунаниди А., Дрожжевой Р., Оцубо С., Эллис Б., Тюрина Ю.Ю. , Каган В.Е., Маллампалли Р.К., Вокли Дж. (апрель 2014 г.). «Длинноцепочечная недостаточность ацил-КоА-дегидрогеназы как причина дисфункции легочного сурфактанта» . Журнал биологической химии . 289 (15): 10668–79. дои : 10.1074/jbc.M113.540260 . ПМК 4036448 . ПМИД 24591516 .
^ Эззеддини Р., Тагихани М., Салек Фаррохи А., Соми М.Х., Самади Н., Исфахани А., Расаи, MJ (май 2021 г.). «Подавление окисления жирных кислот за счет участия HIF-1α и PPARγ в аденокарциноме желудка человека и связанное с этим клиническое значение» . Журнал физиологии и биохимии . 77 (2): 249–260. дои : 10.1007/s13105-021-00791-3 . ПМИД 33730333 . S2CID 232300877 .
^ Пагон Р.А., Берд Т.Д., Долан Ч.Р. и др. (1993). «Дефицит ацил-коэнзима А-дегидрогеназы со средней длиной цепи». ПМИД 20301597 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
^ Грегерсен Н., Андресен Б.С., Бросс П., Винтер В., Рюдигер Н., Энгст С., Кристенсен Э., Келли Д., Штраус А.В., Кёлвраа С. (апрель 1991 г.). «Молекулярная характеристика дефицита ацил-КоА-дегидрогеназы средней цепи (MCAD): идентификация мутации от lys329 до gl в гене MCAD и экспрессия неактивного мутантного ферментного белка в E. coli» (PDF) . Генетика человека . 86 (6): 545–51. дои : 10.1007/bf00201539 . ПМИД 1902818 . S2CID 9687627 .
^ Штурм М., Херебиан Д., Мюллер М., Лария М.Д., Шпикеркоттер Ю. (2012). «Функциональные эффекты различных генотипов ацил-КоА-дегидрогеназы средней цепи и идентификация бессимптомных вариантов» . ПЛОС ОДИН . 7 (9): е45110. Бибкод : 2012PLoSO...745110S . дои : 10.1371/journal.pone.0045110 . ПМЦ 3444485 . ПМИД 23028790 .

Дальнейшее чтение

Грегерсен Н., Андресен Б.С., Коридон М.Дж., Коридон Т.Дж., Олсен Р.К., Болунд Л., Бросс П. (сентябрь 2001 г.). «Мутационный анализ дефектов окисления митохондриальных жирных кислот: на примере дефицита ацил-КоА-дегидрогеназы с особым акцентом на взаимосвязь генотип-фенотип» . Человеческая мутация . 18 (3): 169–89. дои : 10.1002/humu.1174 . ПМИД 11524729 . S2CID 22616789 .
Ван С.С., Фернхофф П.М., Хэннон В.Х., Хури М.Дж. (1999). «Обзор эпидемиологии генома человека дефицита ацил-КоА-дегидрогеназы средней цепи» . Генетика в медицине . 1 (7): 332–9. дои : 10.1097/00125817-199911000-00004 . ПМИД 11263545 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NIH/NCBI/UW о дефиците ацил-коэнзима А со средней длиной цепи
GeneCard
ACADM в базе данных генома человека GDB
человека Расположение генома ACADM и ACADM страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000117054 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062908 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] «ACADM - специфическая ацил-КоА-дегидрогеназа со средней длиной цепи, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (человек) - ген и белок ACADM» . www.uniprot.org .

[6] Мацубара И., Краус Дж.П., Ян-Фенг Т.Л., Франке У., Розенберг Л.Е., Танака К. (сентябрь 1986 г.). «Молекулярное клонирование кДНК, кодирующих ацил-КоА-дегидрогеназу средней цепи крысы и человека, и присвоение гена человеческой хромосоме 1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (17): 6543–7. Бибкод : 1986PNAS...83.6543M . дои : 10.1073/pnas.83.17.6543 . ПМЦ 386540 . ПМИД 3462713 .

[7] Гетцман Э.С., Алкорн Дж.Ф., Бхарати С.С., Уппала Р., МакХью К.Дж., Космидер Б., Чен Р., Цзо Ю.Ю., Бек М.Е., МакКинни Р.В., Скиллинг Х., Сухри КР, Карунаниди А., Дрожжевой Р., Оцубо С., Эллис Б., Тюрина Ю.Ю. , Каган В.Е., Маллампалли Р.К., Вокли Дж. (апрель 2014 г.). «Длинноцепочечная недостаточность ацил-КоА-дегидрогеназы как причина дисфункции легочного сурфактанта» . Журнал биологической химии . 289 (15): 10668–79. дои : 10.1074/jbc.M113.540260 . ПМК 4036448 . ПМИД 24591516 .

[8] Эззеддини Р., Тагихани М., Салек Фаррохи А., Соми М.Х., Самади Н., Исфахани А., Расаи, MJ (май 2021 г.). «Подавление окисления жирных кислот за счет участия HIF-1α и PPARγ в аденокарциноме желудка человека и связанное с этим клиническое значение» . Журнал физиологии и биохимии . 77 (2): 249–260. дои : 10.1007/s13105-021-00791-3 . ПМИД 33730333 . S2CID 232300877 .

[9] Пагон Р.А., Берд Т.Д., Долан Ч.Р. и др. (1993). «Дефицит ацил-коэнзима А-дегидрогеназы со средней длиной цепи». ПМИД 20301597 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )

[10] Грегерсен Н., Андресен Б.С., Бросс П., Винтер В., Рюдигер Н., Энгст С., Кристенсен Э., Келли Д., Штраус А.В., Кёлвраа С. (апрель 1991 г.). «Молекулярная характеристика дефицита ацил-КоА-дегидрогеназы средней цепи (MCAD): идентификация мутации от lys329 до gl в гене MCAD и экспрессия неактивного мутантного ферментного белка в E. coli» (PDF) . Генетика человека . 86 (6): 545–51. дои : 10.1007/bf00201539 . ПМИД 1902818 . S2CID 9687627 .

[11] Штурм М., Херебиан Д., Мюллер М., Лария М.Д., Шпикеркоттер Ю. (2012). «Функциональные эффекты различных генотипов ацил-КоА-дегидрогеназы средней цепи и идентификация бессимптомных вариантов» . ПЛОС ОДИН . 7 (9): е45110. Бибкод : 2012PLoSO...745110S . дои : 10.1371/journal.pone.0045110 . ПМЦ 3444485 . ПМИД 23028790 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]