Субъединица C сукцинатдегидрогеназного комплекса
SDHC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | SDHC , CYB560, CYBL, PGL3, QPS1, SDH3, субъединица C сукцинатдегидрогеназного комплекса | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 602413 ; МГИ : 1913302 ; Гомологен : 2256 ; GeneCards : SDHC ; OMA : SDHC — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Субъединица C сукцинатдегидрогеназного комплекса , также известная как субъединица цитохрома b560 сукцинатдегидрогеназы, митохондриальная , представляет собой белок , который у человека кодируется SDHC геном . [ 5 ] Этот ген кодирует одну из четырех ядерно-кодируемых субъединиц, которые содержат сукцинатдегидрогеназу , также известную как митохондриальный комплекс II, ключевой ферментный комплекс цикла трикарбоновых кислот и аэробных дыхательных цепей митохондрий. Кодируемый белок является одним из двух интегральных мембранных белков , которые закрепляют другие субъединицы комплекса, образующие каталитическое ядро, на внутренней митохондриальной мембране . Для этого гена имеется несколько родственных псевдогенов на разных хромосомах. Мутации в этом гене связаны с феохромоцитомами и параганглиомами . Были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов. [ 6 ]
Структура
[ редактировать ]Ген, кодирующий белок SDHC, является ядерным, хотя белок расположен во внутренней мембране митохондрий . Расположение гена у человека находится на первой хромосоме в районе q21. Ген экзонов разделен на шесть . Ген SDHC продуцирует белок массой 18,6 кДа, состоящий из 169 аминокислот. [ 7 ] [ 8 ]
Белок SDHC представляет собой одну из двух трансмембранных субъединиц четырехсубъединичного белкового комплекса сукцинатдегидрогеназы (Комплекс II), который находится во внутренней митохондриальной мембране. Другая трансмембранная субъединица — SDHD . Димер SDHC/SDHD соединен с субъединицей транспорта электронов SDHB , которая, в свою очередь, связана с субъединицей SDHA . [ 9 ]
Функция
[ редактировать ]
Белок SDHC является одной из четырех ядерно-кодируемых субъединиц, которые содержат сукцинатдегидрогеназу , также известную как Комплекс II цепи переноса электронов , ключевой ферментный комплекс цикла лимонной кислоты и аэробных дыхательных цепей митохондрий. Кодируемый белок является одним из двух интегральных мембранных белков, которые закрепляют другие субъединицы комплекса, образующие каталитическое ядро, на внутренней митохондриальной мембране. [ 6 ]
SDHC является частью димера трансмембранного белка с SDHD , который закрепляет Комплекс II на внутренней митохондриальной мембране. Димер SDHC/SDHD обеспечивает места связывания убихинона и воды во время транспорта электронов в Комплексе II . Первоначально SDHA окисляет сукцинат путем депротонирования в сайте связывания FAD , образуя FADH 2 и оставляя фумарат , слабо связанный с активным сайтом, свободным для выхода из белка. Электроны, полученные из сукцината, туннелируют вдоль реле [Fe-S] в субъединице SDHB , пока не достигнут железо-серного кластера [3Fe-4S] . Затем электроны передаются ожидающей молекуле убихинона в активном центре пула Q в димере SDHC/SDHD. кислород O1 Карбонильный убихинона ориентируется в активном центре (изображение 4) за счет взаимодействия водородных связей с Tyr83 SDHD. Наличие электронов в железо-серном кластере [3Fe-4S] индуцирует движение убихинона во вторую ориентацию. Это облегчает взаимодействие второй водородной связи между карбонильной группой O4 убихинона и Ser27 SDHC. После первого этапа одноэлектронного восстановления семихиноновые образуются радикалы. Второй электрон приходит из кластера [3Fe-4S] и обеспечивает полное восстановление убихинона до убихинола . [ 10 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации в этом гене связаны с параганглиомами . [ 6 ] [ 11 ] Было обнаружено, что более 30 мутаций в гене SDHC повышают риск наследственной параганглиомы-феохромоцитомы 3-го типа. У людей с этим заболеванием наблюдаются параганглиомы, феохромоцитомы или и то, и другое. Наследственная мутация гена SDHC предрасполагает человека к этому состоянию, а соматическая мутация , которая удаляет нормальную копию гена SDHC, необходима для возникновения наследственной параганглиомы-феохромоцитомы типа 3. Большинство наследственных мутаций гена SDHC изменяют отдельные аминокислоты в SDHC. последовательность белка или привести к укорочению белка. В результате активность фермента SDH незначительна или отсутствует. Поскольку мутировавший фермент SDH не может превращать сукцинат в фумарат , сукцинат накапливается в клетке. Избыток сукцината аномально стабилизирует факторы, индуцируемые гипоксией (HIF), которые также накапливаются в клетках. Избыток HIF стимулирует деление клеток и запускает образование кровеносных сосудов, когда они не нужны. Быстрое и неконтролируемое деление клеток наряду с образованием новых кровеносных сосудов может привести к развитию опухолей у людей с наследственной параганглиомой-феохромоцитомой. [ 12 ]
Интерактивная карта маршрутов
[ редактировать ]Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. [ § 1 ]
- ^ Интерактивную карту маршрутов можно редактировать на WikiPathways: «TCACycle_WP78» .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000143252 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058076 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Хираваке Х., Таниваки М., Тамура А., Кодзима С., Кита К. (1997). «Цитохром b в человеческом комплексе II (сукцинат-убихинон оксидоредуктаза): клонирование кДНК компонентов в митохондриях печени и присвоение хромосом генов больших (SDHC) и малых (SDHD) субъединиц 1q21 и 11q23». Цитогенетика и клеточная генетика . 79 (1–2): 132–8. дои : 10.1159/000134700 . ПМИД 9533030 .
- ^ Jump up to: а б с «Энтрез Ген: комплекс сукцинатдегидрогеназы» .
- ^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
- ^ «SDHC - субъединица цитохрома b560 сукцинатдегидрогеназы, митохондриальная» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) . Архивировано из оригинала 19 июля 2018 года . Проверено 18 июля 2018 г.
- ^ Сунь Ф, Хо X, Чжай Ю, Ван А, Сюй Дж, Су Д, Бартлам М, Рао З (июль 2005 г.). «Кристаллическая структура белкового комплекса дыхательной мембраны митохондрий II» . Клетка . 121 (7): 1043–57. дои : 10.1016/j.cell.2005.05.025 . ПМИД 15989954 . S2CID 16697879 .
- ^ Хорсфилд Р., Янковская В., Секстон Г., Уиттингем В., Шиоми К., Омура С., Бирн Б., Чеккини Г., Ивата С. (март 2006 г.). «Структурный и вычислительный анализ хинон-связывающего сайта комплекса II (сукцинат-убихинон оксидоредуктаза): механизм переноса электрона и протонной проводимости при восстановлении убихинона» . Журнал биологической химии . 281 (11): 7309–16. дои : 10.1074/jbc.m508173200 . ПМИД 16407191 .
- ^ Ниманн С., Мюллер У., Энгельхардт Д., Лозе П. (июль 2003 г.). «Аутосомно-доминантная злокачественная параганглиома, продуцирующая катехоламины, вызванная мутацией донорного сайта сплайсинга в SDHC». Генетика человека . 113 (1): 92–4. дои : 10.1007/s00439-003-0938-0 . ПМИД 12658451 . S2CID 32412131 .
- ^ «СДХК» . Домашний справочник по генетике . Национальная медицинская библиотека США . Проверено 26 марта 2015 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Бэйли Дж.П., Вайс М.М., Гримберген А., ван Брюссель Б.Т., Хес Ф.Дж., Янсен Дж.К., Верхуф С., Девили П., Корссмит Э.П., Вриендс А.Х. (сентябрь 2009 г.). «Молекулярная характеристика новых делеций зародышевой линии, влияющих на SDHD и SDHC у пациентов с феохромоцитомой и параганглиомой» . Эндокринный рак . 16 (3): 929–37. дои : 10.1677/ERC-09-0084 . ПМИД 19546167 .
- Пасини Б, МакУинни С.Р., Бей Т., Матяхина Л., Стергиопулос С., Мухов М., Бойкос С.А., Феррандо Б., Пакак К., Асси Дж., Боден Э., Чомпрет А., Эллисон Дж.В., Бриер Дж.Дж., Растин П., Хименес-Рокепло А.П., Энг С., Карни Дж.А., Стратакис К.А. (январь 2008 г.). «Клиническая и молекулярная генетика пациентов с синдромом Карни-Стратакиса и зародышевыми мутациями генов, кодирующих субъединицы сукцинатдегидрогеназы SDHB, SDHC и SDHD» . Европейский журнал генетики человека . 16 (1): 79–8 дои : 10.1038/sj.ejhg.5201904 . ПМИД 17667967 .
- Гаал Дж., Бурнишон Н., Корпершук Э., Ронселин И., Бертерат Дж., Плуэн П.Ф., де Кригер Р.Р., Хименес-Рокепло А.П., Диньенс В.Н. (март 2010 г.). «Мутации изоцитратдегидрогеназы редко встречаются в феохромоцитомах и параганглиомах» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 95 (3): 1274–8. дои : 10.1210/jc.2009-2170 . ПМИД 19915015 .
- Милошевич Д., Лундквист П., Крадич К., Видаль-Фолч Н., Хюнь Т., Пачак К., Гребе С.К. (май 2010 г.). «Разработка и проверка комплексного анализа обнаружения мутаций и делеций SDHB, SDHC и SDHD» . Клиническая биохимия . 43 (7–8): 700–4. doi : 10.1016/j.clinbiochem.2010.01.016 . ПМК 3419008 . ПМИД 20153743 .
- Боначе С., Мартинес Х., Фернандес М., Бассас Л., Ларриба С. (июнь 2007 г.). «Однонуклеотидные полиморфизмы в субъединицах сукцинатдегидрогеназы и генах цитратсинтазы: результаты ассоциации с нарушением сперматогенеза» . Международный журнал андрологии . 30 (3): 144–52. дои : 10.1111/j.1365-2605.2006.00730.x . ПМИД 17298551 .
- Каскон А, Лопес-Хименес Е, Ланда И, Лескела С, Леандро-Гарсия Л.Дж., Малишевска А, Летон Р., де ла Вега Л., Гарсиа-Барсина М.Х., Санабриа К., Альварес-Эскола С., Родригес-Антона С., Робледо М. (сентябрь 2009 г.). «Рационализация генетического тестирования у пациентов с явно спорадической феохромоцитомой / параганглиомой». Гормональные и метаболические исследования . 41 (9): 672–5. дои : 10.1055/s-0029-1202814 . ПМИД 19343621 . S2CID 24979281 .
- Гото Ю, Андо Т, Наито М, Гото Х, Хамадзима Н (2006). «Нет связи полиморфизма гена SDHC с раком желудка». Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака . 7 (4): 525–8. ПМИД 17250422 .
- Каскон А, Пита Г, Бурничон Н, Ланда И, Лопес-Хименес Е, Монтеро-Конде С, Лескела С, Леандро-Гарсия Л.Х., Летон Р., Родригес-Антона С, Диас ХА, Лопес-Видриеро Е, Гонсалес-Нейра А , Веласко А, Матиас-Гю Х, Хименес-Рокепло AP, Робледо М (май 2009 г.). «Генетика феохромоцитомы и параганглиомы у испанских пациентов» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 94 (5): 1701–5. дои : 10.1210/jc.2008-2756 . ПМИД 19258401 .
- Бодекер CC, Нойманн Х.П., Майер В., Бауш Б., Шиппер Дж., Риддер Г.Дж. (июль 2007 г.). «Злокачественные параганглиомы головы и шеи у носителей мутации SDHB». Отоларингология – хирургия головы и шеи . 137 (1): 126–9. дои : 10.1016/j.otohns.2007.01.015 . ПМИД 17599579 . S2CID 13650583 .
- Гилл А.Дж., Бенн Д.Е., Чоу А., Кларксон А., Мулджоно А., Мейер-Рочоу Г.И., Ричардсон А.Л., Сидху С.Б., Робинсон Б.Г., Клифтон-Блай Р.Дж. (июнь 2010 г.). «Иммуногистохимия для сортировки SDHB, генетическое тестирование SDHB, SDHC и SDHD при синдромах параганглиомы-феохромоцитомы». Патология человека . 41 (6): 805–14. дои : 10.1016/j.humpath.2009.12.005 . ПМИД 20236688 .
- Рикеттс С., Вудворд Э.Р., Киллик П., Моррис М.Р., Астути Д., Латиф Ф., Махер Э.Р. (сентябрь 2008 г.). «Зародышевые мутации SDHB и семейный почечно-клеточный рак» . Журнал Национального института рака . 100 (17): 1260–2. дои : 10.1093/jnci/djn254 . ПМИД 18728283 .
- Маквинни С.Р., Пасини Б., Стратакис К.А. (сентябрь 2007 г.). «Семейные желудочно-кишечные стромальные опухоли и мутации зародышевой линии» . Медицинский журнал Новой Англии . 357 (10): 1054–6. дои : 10.1056/NEJMc071191 . ПМИД 17804857 . S2CID 35007543 .
- Энг С., Киуру М., Фернандес М.Дж., Аалтонен Л.А. (март 2003 г.). «Роль митохондриальных ферментов в наследственной неоплазии и за ее пределами». Обзоры природы. Рак . 3 (3): 193–202. дои : 10.1038/nrc1013 . ПМИД 12612654 . S2CID 20549458 .
- Хермсен М.А., Севилья М.А., Льоренте Х.Л., Вайс М.М., Гримберген А., Аллонка Е., Гарсия-Инклан С., Бальбин М., Суарес К. (январь 2010 г.). «Значение скрининга зародышевых мутаций как при семейных, так и при спорадических параганглиомах головы и шеи для ранней диагностики и клинического лечения» . Клеточная онкология . 32 (4): 275–83. дои : 10.3233/CLO-2009-0498 . ПМЦ 4619289 . ПМИД 20208144 .
- Бриер Ж.Дж., Фавье Ж., Эль Гузи В., Джуади Ф., Бенит П., Хименес А.П., Растин П. (октябрь 2005 г.). «Дефицит сукцинатдегидрогеназы у человека» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 62 (19–20): 2317–24. дои : 10.1007/s00018-005-5237-6 . ПМЦ 11139140 . ПМИД 16143825 . S2CID 23793565 .
- Маннелли М, Кастеллано М, Скьяви Ф, Филетти С, Джакке М, Мори Л, Пиньятаро В, Бернини Г, Джаче В, Бакка А, Бионди Б, Корона Г, Ди Трапани Г, Гроссрубачер Е, Реймондо Дж, Арнальди Дж, Джаккетти Дж., Вельо Ф, Лоли П., Колао А., Амбросио М.Р., Терзоло М., Летиция С., Эрколино Т., Опочер Дж. (май 2009 г.). «Клинически управляемый генетический скрининг у большой группы итальянских пациентов с феохромоцитомами и/или функциональными или нефункциональными параганглиомами» (PDF) . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 94 (5): 1541–7. дои : 10.1210/jc.2008-2419 . ПМИД 19223516 .
- Ришале Ж.П., Хименес-Рокепло А.П., Пейрар С., Венисс А., Марель Л., Бурнишон Н., Бузамондо А., Женемайтр Икс, Азизи М., Эльгози Х.Л. (декабрь 2009 г.). «Роль генов сукцинатдегидрогеназы в низкой химиочувствительности к гипоксии?». Клинические вегетативные исследования . 19 (6): 335–42. дои : 10.1007/s10286-009-0028-z . ПМИД 19768395 . S2CID 2265162 .
- Пиньи П., Кардо-Баутерс С., До Као С., Вантигем М.С., Карнай Б., Патту Ф., Карон П., Вемо Дж.Л., Порше Н. (февраль 2009 г.). «Следует ли проводить генетическое тестирование каждому пациенту со спорадической феохромоцитомой при поступлении?». Европейский журнал эндокринологии . 160 (2): 227–31. doi : 10.1530/EJE-08-0574 . ПМИД 19029228 . S2CID 31746044 .
- Корпершук Э., Ван Недервен Ф.Х., Данненберг Х., Петри Б.Дж., Комминот П., Перрен А., Лендерс Дж.В., Верхофстад А.А., Де Хердер В.В., Де Крийгер Р.Р., Диньенс В.Н. (август 2006 г.). «Генетический анализ явно спорадических феохромоцитом: опыт Роттердама». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1073 (1): 138–48. Бибкод : 2006NYASA1073..138K . дои : 10.1196/анналы.1353.014 . ПМИД 17102080 . S2CID 8418586 .
- Ван Л., Макдоннелл С.К., Хеббринг С.Дж., Каннингем Дж.М., Сент-Совер Дж., Серхан Дж.Р., Исайя Дж., Шайд Дж., Тибодо С.Н. (декабрь 2008 г.). «Полиморфизмы митохондриальных генов и риск рака простаты» . Эпидемиология рака, биомаркеры и профилактика . 17 (12): 3558–66. doi : 10.1158/1055-9965.EPI-08-0434 . ПМЦ 2750891 . ПМИД 19064571 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .