ВИЧEP3

ВИЧEP3
Идентификаторы
Псевдонимы	ВИЧEP3 , Hivep3, 2900056N03Rik, A130075N07, AI848000, E030045D18Rik, KBP-1, KBP1, Rc, Schnurri-3, Shn3, Zas3, ZNF40C, белок 3, связывающий энхансер вируса иммунодефицита человека I типа, компонент распознавания каппа (Krc), KRC, ВИЧEP цинковый палец 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 606649 ; МГИ : 106589 ; Гомологен : 7803 ; Генные карты : ВИЧEP3 ; ОМА : ВИЧEP3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	42,035,925 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	119,995,242 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; endothelial cell; ; Brodmann area 23; ; cartilage tissue; ; parietal pleura; ; primary visual cortex; ; granulocyte; ; middle temporal gyrus; ; entorhinal cortex; ; germinal epithelium;
	Top expressed in
	gastrula; ; medial geniculate nucleus; ; Rostral migratory stream; ; subiculum; ; medial dorsal nucleus; ; lateral geniculate nucleus; ; substantia nigra; ; trigeminal ganglion; ; anterior amygdaloid area; ; submandibular gland;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; sequence-specific DNA binding; DNA binding; metal ion binding; nucleic acid binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; nucleus;
Biological process	multicellular organism development; skeletal muscle cell differentiation; positive regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; signal transduction; transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	59269
	16656
	ENSG00000127124
	ENSMUSG00000028634
	Q5T1R4
	А2А884
	НМ_001127714 ; НМ_024503
	НМ_010657
	НП_001121186 ; НП_078779
	НП_034787
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный фактор ВИЧEP3 представляет собой белок , который у человека кодируется ВИЧEP3 геном . ^[5]^[6]

Функция

Члены семейства ZAS, такие как ZAS3 (HIVEP3), представляют собой крупные белки, содержащие домен ZAS, модульную белковую структуру, состоящую из пары цинковых пальцев C2H2 с богатой кислотой областью и последовательностью, богатой серином/треонином. Эти белки связывают специфические последовательности ДНК, включая мотив каппа-B (GGGACTTTCC), в промоторах и энхансерных областях нескольких генов и вирусов, включая вирус иммунодефицита человека (ВИЧ). Гены ZAS занимают более 150 т.п.н. и содержат не менее 10 экзонов, один из которых длиннее 5,5 т.п.н. (Allen and Wu, 2004). [предоставлено OMIM] ^[6]

Он регулирует остеобласты . ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что ВИЧEP3 взаимодействует с TRAF1. ^[8] и ТРАФ2 . ^[8]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000127124 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028634 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Hicar MD, Лю Ю, Аллен CE, Ву LC (январь 2001 г.). «Структура белка человеческого цинкового пальца ВИЧEP3: молекулярное клонирование, экспрессия, экзон-интронная структура и сравнение с паралогичными генами ВИЧEP1 и ВИЧEP2». Геномика . 71 (1): 89–100. дои : 10.1006/geno.2000.6425 . ПМИД 11161801 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 3, связывающий энхансер вируса иммунодефицита человека типа I ВИЧEP3» .
^ Глимчер, Л.Х.; Джонс, округ Колумбия; Вейн, Миннесота (ноябрь 2007 г.). «Контроль послеродовой костной массы с помощью белка-адаптера цинковых пальцев Шнурри-3». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1116 (1): 174–81. Бибкод : 2007NYASA1116..174G . дои : 10.1196/анналы.1402.044 . ПМИД 18083927 . S2CID 25260678 .
^ Jump up to: ^а ^б Оукка М., Ким С.Т., Луго Дж., Сан Дж., Ву Л.К., Глимчер Л.Х. (январь 2002 г.). «Гомолог Drosophila schnurri у млекопитающих, KRC, регулирует реакции, управляемые рецептором TNF, и взаимодействует с TRAF2» . Молекулярная клетка . 9 (1): 121–31. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00434-8 . ПМИД 11804591 .

Дальнейшее чтение

Рустги А.К., Ван 'т Вир Ж.Дж., Бернардс Р. (ноябрь 1990 г.). «Два гена кодируют факторы с ДНК-связывающими свойствами, подобными NF-каппа B и H2TF1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (22): 8707–10. Бибкод : 1990PNAS...87.8707R . дои : 10.1073/pnas.87.22.8707 . ПМК 55028 . ПМИД 2247438 .
Нагасе Т., Кикуно Р., Накаяма М., Хиросава М., Охара О. (август 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 7 (4): 273–81. дои : 10.1093/dnares/7.4.271 . ПМИД 10997877 .
Оукка М., Ким С.Т., Луго Дж., Сан Дж., Ву Л.К., Глимчер Л.Х. (январь 2002 г.). «Гомолог Drosophila schnurri у млекопитающих, KRC, регулирует реакции, управляемые рецептором TNF, и взаимодействует с TRAF2» . Молекулярная клетка . 9 (1): 121–31. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00434-8 . ПМИД 11804591 .
Оукка М., Вейн М.Н., Глимчер Л.Х. (январь 2004 г.). «Шнурри-3 (KRC) взаимодействует с c-Jun, регулируя ген IL-2 в Т-клетках» . Журнал экспериментальной медицины . 199 (1): 15–24. дои : 10.1084/jem.20030421 . ПМЦ 1887724 . ПМИД 14707112 .
Цинь Х, Ван Дж, Лян Ю, Танигучи Ю, Танигаки К, Хан Х (2004). «RING1 ингибирует трансактивацию RBP-J с помощью Notch посредством взаимодействия с белком LIM KyoT2» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (4): 1492–501. дои : 10.1093/nar/gkh295 . ПМК 390284 . ПМИД 14999091 .
Хун JW, Ву LC (январь 2005 г.). «Структурная характеристика гена, кодирующего белок большого цинкового пальца ZAS3: значение происхождения множественных промоторов в эукариотических генах». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1681 (2–3): 74–87. дои : 10.1016/j.bbaexp.2004.10.004 . ПМИД 15627499 .
Беттелли Э., Дастрейндж М., Оукка М. (апрель 2005 г.). «Foxp3 взаимодействует с ядерным фактором активированных Т-клеток и NF-каппа B, подавляя экспрессию генов цитокинов и эффекторные функции Т-хелперных клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (14): 5138–43. Бибкод : 2005PNAS..102.5138B . дои : 10.1073/pnas.0501675102 . ПМК 555574 . ПМИД 15790681 .
Ли Ю.Дж., Дэн Дж., Мэйхью ГМ, Гримсли Дж.В., Хо Икс, Вэнс Дж.М. (сентябрь 2007 г.). «Исследование гена PARK10 при болезни Паркинсона» . Анналы генетики человека . 71 (Часть 5): 639–47. дои : 10.1111/j.1469-1809.2007.00353.x . ПМИД 17388942 . S2CID 22122597 .

Внешние ссылки

ВИЧEP3+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000127124 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028634 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11161801-5] Hicar MD, Лю Ю, Аллен CE, Ву LC (январь 2001 г.). «Структура белка человеческого цинкового пальца ВИЧEP3: молекулярное клонирование, экспрессия, экзон-интронная структура и сравнение с паралогичными генами ВИЧEP1 и ВИЧEP2». Геномика . 71 (1): 89–100. дои : 10.1006/geno.2000.6425 . ПМИД 11161801 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 3, связывающий энхансер вируса иммунодефицита человека типа I ВИЧEP3» .

[7] Глимчер, Л.Х.; Джонс, округ Колумбия; Вейн, Миннесота (ноябрь 2007 г.). «Контроль послеродовой костной массы с помощью белка-адаптера цинковых пальцев Шнурри-3». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1116 (1): 174–81. Бибкод : 2007NYASA1116..174G . дои : 10.1196/анналы.1402.044 . ПМИД 18083927 . S2CID 25260678 .

[pmid11804591-8] Jump up to: ^а ^б Оукка М., Ким С.Т., Луго Дж., Сан Дж., Ву Л.К., Глимчер Л.Х. (январь 2002 г.). «Гомолог Drosophila schnurri у млекопитающих, KRC, регулирует реакции, управляемые рецептором TNF, и взаимодействует с TRAF2» . Молекулярная клетка . 9 (1): 121–31. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00434-8 . ПМИД 11804591 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]