RFX2

RFX2
Идентификаторы
Псевдонимы	RFX2 , регуляторный фактор X2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 142765 ; МГИ : 106583 ; Гомологен : 30980 ; Генные карты : RFX2 ; OMA : RFX2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	6,199,572 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	57,138,013 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right uterine tube; ; left testis; ; right testis; ; bronchial epithelial cell; ; left uterine tube; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; muscle layer of sigmoid colon; ; body of uterus; ; sural nerve; ; left ovary;
	Top expressed in
	seminiferous tubule; ; spermatid; ; spermatocyte; ; zygote; ; secondary oocyte; ; ascending aorta; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; primary oocyte; ; blood; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; protein binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; cytoplasm;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; cell differentiation; spermatogenesis; acrosome assembly; spermatid development; regulation of transcription by RNA polymerase II; cell projection organization; cilium assembly; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; cellular response to leukemia inhibitory factor;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5990
	19725
	ENSG00000087903
	ENSMUSG00000024206
	P48378
	P48379
	НМ_000635 ; НМ_134433
	НМ_009056 ; НМ_027787
	НП_000626 ; НП_602309
	НП_033082 ; НП_082063
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

ДНК-связывающий белок RFX2 — это белок , который у человека кодируется RFX2 геном . ^[5]^[6]

Этот ген является членом семейства генов регуляторного фактора X, которое кодирует факторы транскрипции , содержащие высококонсервативный домен, связывающий ДНК с крылатой спиралью. Белок, кодируемый этим геном, структурно связан с регуляторными факторами X1, X3, X4 и X5. Это активатор транскрипции , который может связывать ДНК в виде мономера или гетеродимера с другими членами семейства RFX. Этот белок может связываться с цис-элементами в промоторе гена альфа-рецептора IL-5 . два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы , и оба варианта используют альтернативные сайты полиаденилирования. Для этого гена описаны ^[6]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000087903 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024206 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пульятти Л., Дерре Дж., Бергер Р., Укла С., Рейт В., Мах Б. (сентябрь 1992 г.). «Гены регуляторных факторов MHC класса II RFX1 и RFX2 расположены на коротком плече хромосомы 19». Геномика . 13 (4): 1307–10. дои : 10.1016/0888-7543(92)90052-T . ПМИД 1505960 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: регуляторный фактор RFX2 X, 2 (влияет на экспрессию HLA класса II)» .

Дальнейшее чтение

Рейт В., Укла С., Баррас Э. и др. (1994). «RFX1, трансактиватор энхансера I вируса гепатита В, принадлежит к новому семейству гомодимерных и гетеродимерных ДНК-связывающих белков» . Мол. Клетка. Биол . 14 (2): 1230–44. дои : 10.1128/MCB.14.2.1230 . ПМЦ 358479 . ПМИД 8289803 .
Дойл Дж., Хоффман С., Укла С. и др. (1996). «Местоположение генов человека и мыши, кодирующих белки транскрипционных факторов RFX1 и RFX2» . Геномика . 35 (1): 227–30. дои : 10.1006/geno.1996.0343 . ПМИД 8661125 .
Хиллиер Л.Д., Леннон Г., Беккер М. и др. (1997). «Создание и анализ 280 000 меток экспрессируемых последовательностей человека» . Геном Рез . 6 (9): 807–28. дои : 10.1101/гр.6.9.807 . ПМИД 8889549 .
Ивама А., Пан Дж., Чжан П. и др. (1999). «Димерные белки RFX способствуют активности и специфичности клона альфа-промотора рецептора интерлейкина-5 посредством доменов активации и репрессии» . Мол. Клетка. Биол . 19 (6): 3940–50. дои : 10.1128/MCB.19.6.3940 . ПМК 104353 . ПМИД 10330134 .
Моротоми-Яно К., Яно К., Сайто Х. и др. (2002). «Человеческий регуляторный фактор X 4 (RFX4) представляет собой димерный ДНК-связывающий белок, специфичный для семенников, который взаимодействует с другими членами RFX человека» . Ж. Биол. Хим . 277 (1): 836–42. дои : 10.1074/jbc.M108638200 . ПМИД 11682486 .
Сенгупта П.К., Фарго Дж., Смит Б.Д. (2002). «Семейство RFX взаимодействует в стартовом сайте коллагена (COL1A2) и подавляет транскрипцию» . Ж. Биол. Хим . 277 (28): 24926–37. дои : 10.1074/jbc.M111712200 . ПМИД 11986307 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Майгрен С., Сур И., Нильссон М., Тофтгард Р. (2004). «Участие белков RFX в активации транскрипции с помощью Ras-чувствительного энхансерного элемента». Арх. Дерматол. Рез . 295 (11): 482–9. дои : 10.1007/s00403-004-0456-5 . ПМИД 15024578 . S2CID 2408607 .
Хорват Г.К., Кистлер В.С., Кистлер МК (2005). «RFX2 является потенциальным фактором регуляции транскрипции гистона H1t и других генов, экспрессируемых во время мейотической фазы сперматогенеза» . Биол. Репродукция . 71 (5): 1551–9. дои : 10.1095/biolreprod.104.032268 . ПМИД 15229132 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

Внешние ссылки

RFX2 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000087903 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024206 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1505960-5] Пульятти Л., Дерре Дж., Бергер Р., Укла С., Рейт В., Мах Б. (сентябрь 1992 г.). «Гены регуляторных факторов MHC класса II RFX1 и RFX2 расположены на коротком плече хромосомы 19». Геномика . 13 (4): 1307–10. дои : 10.1016/0888-7543(92)90052-T . ПМИД 1505960 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: регуляторный фактор RFX2 X, 2 (влияет на экспрессию HLA класса II)» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]