Jump to content

ФОКСА2

ФОКСА2
Идентификаторы
Псевдонимы FOXA2 , HNF3B, TCF3B, коробка с вилкой A2, HNF-3-бета
Внешние идентификаторы Опустить : 600288 ; МГИ : 1347476 ; Гомологен : 7762 ; Генные карты : FOXA2 ; ОМА : FOXA2 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_021784
НМ_153675

НМ_001291065
НМ_001291067
НМ_010446

RefSeq (белок)

НП_068556
НП_710141

НП_001277994
НП_001277996
НП_034576

Местоположение (UCSC) Чр 20: 22,58 – 22,59 Мб Chr 2: 147,88 – 147,89 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок A2 «вилкоголовки» (FOXA2) , также известный как ядерный фактор гепатоцитов 3-бета (HNF-3B) , является фактором транскрипции, который играет важную роль во время развития, в зрелых тканях, а в случае нарушения регуляции или мутации – также при раке. [5]

Структура

[ редактировать ]

FOXA2 принадлежит к подсемейству транскрипционных факторов Forkhead Box (FOX), другими членами которого являются FOXA1 и FOXA3. Это подсемейство белков FOX млекопитающих было впервые идентифицировано из-за их способности связывать ДНК в ядерных экстрактах печени крыс. Поэтому белки первоначально были названы ядерным фактором гепатоцитов 3 альфа, бета и гамма. [6] Эти факторы транскрипции содержат домен вилкообразной головки (также известный как домен крылатой спирали), фланкированный последовательностями, необходимыми для ядерной локализации. [7] Их N- и C-концы также консервативны и служат доменами трансактивации. [8] [9]

Факторы транскрипции FOXA обладают «новаторским» свойством, т.е. могут напрямую связываться с конденсированным хроматином. [5] Эта особенность наблюдалась как in vitro , так и in vivo , где факторы транскрипции FOXA могут связывать связанные с нуклеосомами целевые последовательности ДНК. [10] [11] Новаторское свойство фактора обеспечивается высококонсервативным ДНК-связывающим доменом, который структурно похож на линкерные гистоны H1 и H5. [12] [13] Эта функция позволяет FOXA2 получать доступ к закрытому хроматину и вытеснять линкерные гистоны. Таким образом, FOXA2 способствует локальному открытию хроматина, позволяет рекрутировать альтернативные гистоны и облегчает последующее связывание других факторов транскрипции. [10] [14] [15] Таким образом, FOXA2 играет важную роль в спецификации типа клеток, способствуя доступности хроматина для связывания клоно- или тканеспецифичных факторов. [16] Факторы FOXA также способствуют поддержанию идентичности клеток путем добавления в закладки генов, специфичных для типа клеток, так что эти гены могут быть быстро реактивированы после цитокинеза. [17] Одним из примеров является то, что эктопическая экспрессия FOXA2 вместе с HNF4A приводит к трансдифференцировке фибробластов в гепатоцитоподобные клетки. [18]


В соответствии со своей ролью новаторского транскрипционного фактора FOXA2 экспрессируется на ранних стадиях развития и необходим для развития и гомеостаза различных типов клеток и тканей. У мышей экспрессия Foxa2 возникает в примитивной полоске и узле на эмбриональный день (E) 6,5, а также в мезодерме и дефинитивной энтодерме на E7,5. [19] [20] Его экспрессия впоследствии поддерживается в тканях, происходящих из энтодермы, включая поджелудочную железу, печень, предстательную железу, щитовидную железу и легкие, на протяжении всего развития и в зрелых тканях. [7] Кроме того, Foxa2 экспрессируется в эктодермы . нервных тканях, происходящих из [21] Нокаут Foxa2 является эмбрионально смертельным для мышей, которые умирают между E10 и E11 и обнаруживают дефекты во всех трех зародышевых слоях. [22] [23] Мыши с гетерозиготностью по нокауту Foxa2 жизнеспособны и при старении проявляют фенотип, сходный с болезнью Паркинсона. [24] Исследования с условным нокаутом показывают, что Foxa2 важен для образования островков поджелудочной железы и созревания альфа- и бета-клеток, тем самым он необходим для гомеостаза глюкозы. [25] [26]

Нарушение регуляции транскрипционных факторов FOXA связано с несколькими типами рака человека, включая острый миелолейкоз и рак пищевода, легких, щитовидной железы, поджелудочной железы, молочной железы и простаты. [27] Однонуклеотидные полиморфизмы гена FOXA2 связаны с гепатоцеллюлярной карциномой, особенно у мужчин. Эта ассоциация была воспроизведена на мышах и может зависеть от регуляции, опосредованной андрогенными рецепторами. [28]

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125798 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037025 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Jump up to: а б Голсон М.Л., Кестнер К.Х. (декабрь 2016 г.). «Факторы транскрипции Fox: от развития к болезни» . Разработка . 143 (24): 4558–4570. дои : 10.1242/dev.112672 . ПМК   5201025 . ПМИД   27965437 .
  6. ^ Коста Р.Х., Грейсон Д.Р., Дарнелл Дж.Э. (апрель 1989 г.). «Множественные ядерные факторы, обогащенные гепатоцитами, участвуют в регуляции генов транстиретина и альфа-1-антитрипсина» . Молекулярная и клеточная биология . 9 (4): 1415–25. дои : 10.1128/mcb.9.4.1415 . ПМК   362558 . ПМИД   2786140 .
  7. ^ Jump up to: а б Фридман-младший, Кестнер К.Х. (октябрь 2006 г.). «Семейство транскрипционных факторов Foxa в развитии и метаболизме» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 63 (19–20): 2317–28. дои : 10.1007/s00018-006-6095-6 . ПМЦ   11136376 . ПМИД   16909212 . S2CID   12385486 .
  8. ^ Пани Л., Куиан XB, Клевиденс Д., Коста Р.Х. (февраль 1992 г.). «Ограниченная промоторная активность ядерного фактора 3 бета гепатоцитов фактора транскрипции печени включает клеточно-специфический фактор и положительную аутоактивацию» . Молекулярная и клеточная биология . 12 (2): 552–62. дои : 10.1128/mcb.12.2.552 . ПМЦ   364229 . ПМИД   1732730 .
  9. ^ Цянь X, Коста Р.Х. (апрель 1995 г.). «Анализ доменов бета-белка ядерного фактора-3 гепатоцитов, необходимых для активации транскрипции и ядерного нацеливания» . Исследования нуклеиновых кислот . 23 (7): 1184–91. дои : 10.1093/нар/23.7.1184 . ПМК   306829 . ПМИД   7739897 .
  10. ^ Jump up to: а б Чирилло Л.А., Лин Ф.Р., Куэста И., Фридман Д., Ярник М., Зарет К.С. (февраль 2002 г.). «Открытие компактного хроматина факторами транскрипции раннего развития HNF3 (FoxA) и GATA-4» . Молекулярная клетка . 9 (2): 279–89. дои : 10.1016/s1097-2765(02)00459-8 . ПМИД   11864602 .
  11. ^ Чирилло Л.А., Зарет К.С. (декабрь 1999 г.). «Комплекс факторов транскрипции раннего развития, который более стабилен на частицах ядра нуклеосомы, чем на свободной ДНК» . Молекулярная клетка . 4 (6): 961–9. дои : 10.1016/s1097-2765(00)80225-7 . ПМИД   10635321 .
  12. ^ Кларк К.Л., Халай Э.Д., Лай Э., Берли С.К. (июль 1993 г.). «Сокристаллическая структура мотива распознавания ДНК HNF-3/головки вилки напоминает гистон H5». Природа . 364 (6436): 412–20. Бибкод : 1993Natur.364..412C . дои : 10.1038/364412a0 . ПМИД   8332212 . S2CID   4363526 .
  13. ^ Зарет К.С., Каравака Дж.М., Тулин А., Секия Т. (2010). «Ядерная подвижность и связывание митотических хромосом: сходство между пионерским фактором транскрипции FoxA и линкерным гистоном H1» . Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии . 75 : 219–26. дои : 10.1101/sqb.2010.75.061 . ПМИД   21502411 .
  14. ^ Ли З., Гадуэ П., Чен К., Цзяо Ю., Тутея Г., Шуг Дж. и др. (декабрь 2012 г.). «Foxa2 и H2A.Z опосредуют истощение нуклеосом во время дифференцировки эмбриональных стволовых клеток» . Клетка . 151 (7): 1608–16. дои : 10.1016/j.cell.2012.11.018 . ПМК   3530164 . ПМИД   23260146 .
  15. ^ Апдайк Д.Л., Mango SE (сентябрь 2006 г.). «Временная регуляция развития передней кишки с помощью HTZ-1/H2A.Z и PHA-4/FoxA» . ПЛОС Генетика . 2 (9): е161. дои : 10.1371/journal.pgen.0020161 . ПМЦ   1584275 . ПМИД   17009877 .
  16. ^ Ивафучи-Дой М., Зарет К.С. (июнь 2016 г.). «Контроль судьбы клеток с помощью пионерских факторов транскрипции» . Разработка . 143 (11): 1833–7. дои : 10.1242/dev.133900 . ПМК   6514407 . ПМИД   27246709 .
  17. ^ Каравака Дж. М., Донахью Дж., Беккер Дж. С., Хе Х, Винсон С., Зарет К. С. (февраль 2013 г.). «Закладка путем специфического и неспецифического связывания фактора пионера FoxA1 с митотическими хромосомами» . Гены и развитие . 27 (3): 251–60. дои : 10.1101/gad.206458.112 . ПМЦ   3576511 . ПМИД   23355396 .
  18. ^ Секия С, Сузуки А (июнь 2011 г.). «Прямое преобразование фибробластов мыши в гепатоцитоподобные клетки с помощью определенных факторов». Природа . 475 (7356): 390–3. дои : 10.1038/nature10263 . ПМИД   21716291 . S2CID   205225695 .
  19. ^ Монаган А.П., Кестнер К.Х., Грау Э., Шютц Г. (ноябрь 1993 г.). «Схемы постимплантационной экспрессии указывают на роль мышиных генов вилкоголовки/HNF-3 альфа, бета и гамма в определении дефинитивной эндодермы, хордамезодермы и нейроэктодермы». Разработка . 119 (3): 567–78. дои : 10.1242/dev.119.3.567 . ПМИД   8187630 .
  20. ^ Анг С.Л., Вирда А., Вонг Д., Стивенс К.А., Касио С., Россант Дж., Зарет К.С. (декабрь 1993 г.). «Формирование и поддержание окончательной линии эндодермы у мышей: участие белков HNF3 / forkhead». Разработка . 119 (4): 1301–15. дои : 10.1242/dev.119.4.1301 . ПМИД   8306889 .
  21. ^ Беснард В., Верт С.Е., Халл В.М., Уитсетт Дж.А. (декабрь 2004 г.). «Иммуногистохимическая локализация Foxa1 и Foxa2 в эмбрионах мышей и тканях взрослых». Паттерны экспрессии генов . 5 (2): 193–208. дои : 10.1016/j.modgep.2004.08.006 . ПМИД   15567715 .
  22. ^ Вайнштейн, округ Колумбия, Руис и Альтаба А., Чен В.С., Худлесс П., Презиозо В.Р., Джесселл Т.М., Дарнелл Дж.Э. (август 1994 г.). «Фактор транскрипции крылатой спирали HNF-3 бета необходим для развития хорды у эмбриона мыши». Клетка . 78 (4): 575–88. дои : 10.1016/0092-8674(94)90523-1 . ПМИД   8069910 . S2CID   21650241 .
  23. ^ Анг С.Л., Россант Дж. (август 1994 г.). «Бета HNF-3 необходим для формирования узла и хорды при развитии мышей». Клетка . 78 (4): 561–74. дои : 10.1016/0092-8674(94)90522-3 . ПМИД   8069909 . S2CID   54291913 .
  24. ^ Киттаппа Р., Чанг В.В., Аватрамани Р.Б., Маккей Р.Д. (декабрь 2007 г.). «Ген foxa2 контролирует рождение и спонтанную дегенерацию дофаминовых нейронов в старости» . ПЛОС Биология . 5 (12): е325. doi : 10.1371/journal.pbio.0050325 . ПМК   2121110 . ПМИД   18076286 .
  25. ^ Сунд, Нью-Джерси, Анг С.Л., Сакетт С.Д., Шен В., Дэйгл Н., Магнусон М.А., Кестнер К.Х. (июль 2000 г.). «Ядерный фактор гепатоцитов 3бета (Foxa2) необходим для поддержания дифференцированного состояния взрослого гепатоцита» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (14): 5175–83. дои : 10.1128/mcb.20.14.5175-5183.2000 . ПМК   85966 . ПМИД   10866673 .
  26. ^ Ланц К.А., Ватаманюк М.З., Брестелли Дж.Э., Фридман Дж.Р., Мачинский Ф.М., Кестнер К.Х. (август 2004 г.). «Foxa2 регулирует несколько путей секреции инсулина» . Журнал клинических исследований . 114 (4): 512–20. дои : 10.1172/JCI21149 . ПМК   503770 . ПМИД   15314688 .
  27. ^ Лау Х.Х., Нг Н.Х., Лу Л.С., Джасмен Дж.Б., Тео АК (май 2018 г.). «Молекулярные функции ядерных факторов гепатоцитов - в печени и за ее пределами» . Журнал гепатологии . 68 (5): 1033–1048. дои : 10.1016/j.jhep.2017.11.026 . ПМИД   29175243 .
  28. ^ Ли З., Тутея Г., Шуг Дж., Кестнер К.Х. (январь 2012 г.). «Foxa1 и Foxa2 необходимы для полового диморфизма при раке печени» . Клетка . 148 (1–2): 72–83. дои : 10.1016/j.cell.2011.11.026 . ПМК   3266536 . ПМИД   22265403 .
[ редактировать ]

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: b111c8250a7f8d71f52fad9cb5715585__1717381380
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/b1/85/b111c8250a7f8d71f52fad9cb5715585.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
FOXA2 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)