EXT2 (ген)
EXT2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | EXT2 , SOTV, SSMS, экзостозингликозилтрансфераза 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 608210 ; МГИ : 108050 ; Гомологен : 345 ; Генные карты : EXT2 ; OMA : EXT2 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Экзостозингликозилтрансфераза-2 — белок , который у человека кодируется EXT2 геном . [5] [6] [7]
Этот ген кодирует одну из двух гликозилтрансфераз, участвующих в стадии удлинения цепи биосинтеза гепарансульфата . Мутации в этом гене вызывают форму наследственного множественного экзостоза II типа (HME) . [7]
Расположение гена
[ редактировать ]Ген EXT2 расположен на 11-й хромосоме генома человека, его расположение — на p-плече этой хромосомы. [8] P-плечо хромосомы — это более короткое плечо хромосомы. [9]
Взаимодействия
[ редактировать ]В семейство EXT входят EXT2, EXT1 , EXTL1 , EXTL2 и EXTL3 . Белки, образованные этими генами, работают вместе, образуя и удлиняя цепи гепарансульфата. Цепи гепарансульфата представляют собой протеогликаны, присутствующие во внеклеточном матриксе большинства типов тканей. В их функциях многое еще не совсем понятно, однако известно, что они играют важную роль в формировании костей и хрящей . [10] Хрящ расположен в пластинках роста длинных костей и располагается по определенному образцу, прежде чем он позже окостенеет в кость, когда он отрастет дальше от пластинки роста. Новый хрящ в растущей кости размещается посредством сигнальных белков, которые связываются с цепями гепарансульфата. [11] Также было показано, что EXT2 (белок) взаимодействует с TRAP1 , белком теплового шока. [12] Белки теплового шока связываются со специфическими белками, помогая им сохранять свою форму, когда клетка подвергается стрессу. [13] Было обнаружено, что TRAP1 связывается с участком (на С-конце) белков EXT1 и EXT2, помогая ему сохранять желаемую форму и функцию. [14]
Распространение видов
[ редактировать ]Было обнаружено, что этот ген присутствует у многих видов, помимо человека, таких как мыши, куры, собаки, коровы и многие другие. и другие ортологи Были обнаружены , в том числе Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans . [15]
Мутации
[ редактировать ]Мутации, изменяющие аминокислотную последовательность белка экзостозингликозилтрансферазы-2, могут привести к его нефункциональности. Когда этот белок нефункционален, цепи гепарансульфата становятся короче. Цепи по-прежнему формируются и удлиняются другими белками, кодируемыми генами семейства EXT, хотя и не в такой степени. Это увеличивает вероятность того, что хрящевая клетка будет размещена неправильно, поскольку гепарансульфат является супрессором опухолей костей и хрящей. Поскольку кость имеет очень специфическую структуру, неправильная установка хрящевой клетки на ранних стадиях роста сравнима с неправильным размещением кирпича на ранних этапах строительства стены. Смещение хряща приведет к образованию опухоли хряща или опухолей в пластинках роста длинных костей. Это состояние известно как наследственные множественные экзостозы (HME) или наследственные множественные остеохондромы (HMO). [16] HME также может быть результатом мутации гена EXT1 или других генов семейства EXT. [17] Мутации EXT1 имеют тенденцию быть более тяжелыми с большим количеством экзостозов и являются причиной 56-78% случаев HME у людей, за исключением Китая, где мутации гена EXT2 более распространены. HME поражает 1 из 50 000 человек и чаще встречается у мужчин в соотношении 1,5:1. [18]
Наследственность гена EXT2
[ редактировать ]Мутации гена EXT2 являются доминантными аутосомными (не сцепленными с полом) и летальны в гомозиготной форме. Это означает, что если мутантный ген унаследован от обоих родителей, дающих потомству две копии мутантного гена (гомозиготная форма мутантного гена), это приведет к ранней эмбриональной гибели на гаструлы стадии развития . Причина, по которой это происходит, заключается в том, что гепарансульфат играет не только роль в формировании костей, но и в эмбриональном развитии. Гепарансульфат может связывать сигнальные молекулы, используемые в разработке, такие как трансформирующий фактор роста β , белки Fgf и белки Wnt . Единственные люди с этой мутацией существуют в гетерозиготной форме, это означает, что у них есть один нормальный ген EXT2 и один мутировавший. При наследовании этой генной мутации для мутировавшего родителя и немутировавшего родителя существует 50% вероятность того, что потомство также будет иметь мутацию EXT2. У двух родителей с мутацией EXT2 из их живых потомков двое из трех будут иметь эту мутацию. [19]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000151348 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027198 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Wu YQ, Heutink P, de Vries BB, Sandkuijl LA, van den Ouweland AM, Niermeijer MF и др. (январь 1994 г.). «Отнесение второго локуса для множественных экзостозов к прицентромерной области хромосомы 11». Молекулярная генетика человека . 3 (1): 167–71. дои : 10.1093/hmg/3.1.167 . ПМИД 8162019 .
- ^ Бридж Дж.А., Нельсон М., Орндал С., Бхатия П., Нефф Дж.Р. (май 1998 г.). «Клональные кариотипические аномалии наследственных множественных экзостозов хромосомных локусов 8q24.1 (EXT1) и 11p11-12 (EXT2) у пациентов со спорадическими и наследственными остеохондромами» . Рак . 82 (9): 1657–63. doi : 10.1002/(SICI)1097-0142(19980501)82:9<1657::AID-CNCR10>3.0.CO;2-3 . ПМИД 9576285 . S2CID 20882831 .
- ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: экзостозы EXT2 (множественные) 2» .
- ^ «Экзостозингликозилтрансфераза 2 EXT2 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . НКБИ . Проверено 14 ноября 2019 г.
- ^ «Как генетики указывают местоположение гена?» . Домашний справочник по генетике . Медицинская библиотека НИЗ США . Проверено 14 ноября 2019 г.
- ^ Буссе М., Фета А., Престо Дж., Вилен М., Грёнинг М., Челлен Л., Куше-Гульберг М. (ноябрь 2007 г.). «Вклад EXT1, EXT2 и EXTL3 в удлинение цепи гепарансульфата» . Журнал биологической химии . 282 (45): 32802–10. дои : 10.1074/jbc.M703560200 . ПМИД 17761672 .
- ^ Хюгель Дж., Сгарилья Ф., Эномото-Ивамото М., Кояма Э., Дорманс Дж. П., Пасифичи М. (сентябрь 2013 г.). «Гепарансульфат в развитии, росте и патологии скелета: случай наследственных множественных экзостозов» . Динамика развития . 242 (9): 1021–32. дои : 10.1002/dvdy.24010 . ПМК 4007065 . ПМИД 23821404 .
- ^ Симмонс А.Д., Муси М.М., Лопес К.С., Хван Л.И., Ян Ю.П., Ловетт М. (ноябрь 1999 г.). «Прямое взаимодействие между белками EXT и гликозилтрансферазами нарушено при наследственных множественных экзостозах» . Молекулярная генетика человека . 8 (12): 2155–64. дои : 10.1093/hmg/8.12.2155 . ПМИД 10545594 .
- ^ Бактисаран, Раман; Тангирала, Рамакришна; Рао, Ч. Мохан (1 апреля 2015 г.). «Маленькие белки теплового шока: роль в клеточных функциях и патологии» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1854 (4): 291–319. дои : 10.1016/j.bbapap.2014.12.019 . ISSN 1570-9639 . ПМИД 25556000 .
- ^ Симмонс, Эндрю Д.; Мюзи, Морис М.; Лопес, Карла С.; Хван, Ларн-Юань; Ян, Я-Пин; Ловетт, Майкл (1 ноября 1999 г.). «Прямое взаимодействие между белками EXT и гликозилтрансферазами является дефектным при наследственных множественных экзостозах» . Молекулярная генетика человека . 8 (12): 2155–2164. дои : 10.1093/hmg/8.12.2155 . ISSN 0964-6906 . ПМИД 10545594 .
- ^ «Ортологи EXT2» . НКБИ . Проверено 15 ноября 2019 г. .
- ^ Буссе М., Фета А., Престо Дж., Вилен М., Грёнинг М., Челлен Л., Куше-Гульберг М. (ноябрь 2007 г.). «Вклад EXT1, EXT2 и EXTL3 в удлинение цепи гепарансульфата» . Журнал биологической химии . 282 (45): 32802–10. дои : 10.1074/jbc.M703560200 . ПМИД 17761672 .
- ^ «Остеохондрома: рак костей: опухоли костей» . www.tumorsurgery.org . (3) Хирург саркомы и онколог-ортопед . Проверено 15 ноября 2019 г. .
- ^ Чен XJ, Чжан Х, Тан ЗП, Ху В, Ян ЮФ (ноябрь 2016 г.). «Новая мутация EXT2 выявлена в большой семье с множественными остеохондромами» . Отчеты о молекулярной медицине . 14 (5): 4687–4691. дои : 10.3892/ммр.2016.5814 . ПМК 5102042 . ПМИД 27748933 .
- ^ Стикенс Д., Зак Б.М., Ружье Н., Эско Дж.Д., Верб З. (ноябрь 2005 г.). «У мышей с дефицитом Ext2 отсутствует гепарансульфат, и у них развиваются экзостозы» . Разработка . 132 (22): 5055–68. дои : 10.1242/dev.02088 . ПМЦ 2767329 . ПМИД 16236767 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Вуйтс В., Ван Хул В. (2000). «Молекулярная основа множественных экзостозов: мутации в генах EXT1 и EXT2». Человеческая мутация . 15 (3): 220–7. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(200003)15:3<220::AID-HUMU2>3.0.CO;2-K . ПМИД 10679937 . S2CID 45999816 .
- Вуйтс В., Рамлахан С., Ван Хул В., Хехт Дж.Т., ван ден Оувеланд А.М., Раскинд В.Х. и др. (август 1995 г.). «Уточнение локуса множественных экзостозов (EXT2) до интервала 3 см на хромосоме 11» . Американский журнал генетики человека . 57 (2): 382–7. ПМК 1801560 . ПМИД 7668264 .
- Стикенс Д., Клайнс Г., Берби Д., Рамос П., Томас С., Хог Д. и др. (сентябрь 1996 г.). «Ген множественных экзостозов EXT2 определяет семейство предполагаемых генов-супрессоров опухолей». Природная генетика . 14 (1): 25–32. дои : 10.1038/ng0996-25 . ПМИД 8782816 . S2CID 27148572 .
- Вуйтс В., Ван Хул В., Ваутерс Дж., Немцова М., Рейньерс Э., Ван Хул Е.В. и др. (октябрь 1996 г.). «Позиционное клонирование гена, участвующего в наследственных множественных экзостозах» . Молекулярная генетика человека . 5 (10): 1547–57. дои : 10.1093/hmg/5.10.1547 . ПМИД 8894688 .
- Клайнс Г.А., Эшли Дж.А., Шах С., Ловетт М. (апрель 1997 г.). «Структура гена множественных экзостозов 2 человека и характеристика гомологов у мышей и Caenorhabditis elegans» . Геномные исследования . 7 (4): 359–67. дои : 10.1101/гр.7.4.359 . ПМК 139145 . ПМИД 9110175 .
- Филипп С., Портер Д.Э., Эмертон М.Э., Уэллс Д.Е., Симпсон А.Х., Monaco AP (сентябрь 1997 г.). «Мутационный скрининг генов EXT1 и EXT2 у пациентов с наследственными множественными экзостозами» . Американский журнал генетики человека . 61 (3): 520–8. дои : 10.1086/515505 . ПМК 1715939 . ПМИД 9326317 .
- Вуйтс В., Ван Халл В., Де Булль К., Хендрикс Дж., Баккер Э., Ванхонакер Ф. и др. (февраль 1998 г.). «Мутации в генах EXT1 и EXT2 при наследственных множественных экзостозах» . Американский журнал генетики человека . 62 (2): 346–54. дои : 10.1086/301726 . ПМЦ 1376901 . ПМИД 9463333 .
- Маккормик С., Ледюк И., Мартиндейл Д., Мэттисон К., Эсфорд Л.Е., Дайер А.П., Туфаро Ф. (июнь 1998 г.). «Предполагаемый супрессор опухоли EXT1 изменяет экспрессию гепарансульфата на клеточной поверхности». Природная генетика . 19 (2): 158–61. дои : 10.1038/514 . ПМИД 9620772 . S2CID 25832441 .
- Линд Т., Туфаро Ф., Маккормик С., Линдал У., Лидхолт К. (октябрь 1998 г.). «Предполагаемые опухолевые супрессоры EXT1 и EXT2 представляют собой гликозилтрансферазы, необходимые для биосинтеза гепарансульфата» . Журнал биологической химии . 273 (41): 26265–8. дои : 10.1074/jbc.273.41.26265 . ПМИД 9756849 .
- Пак К.Дж., Шин К.Х., Ку Дж.Л., Чо Т.Дж., Ли Ш., Чой И.Х. и др. (1999). «Зародышевые мутации в генах EXT1 и EXT2 у корейских пациентов с наследственными множественными экзостозами» . Журнал генетики человека . 44 (4): 230–4. дои : 10.1007/s100380050149 . ПМИД 10429361 .
- Сюй Л., Ся Дж., Цзян Х., Чжоу Дж., Ли Х., Ван Д. и др. (1999). «Мутационный анализ наследственных множественных экзостозов у китайцев». Генетика человека . 105 (1–2): 45–50. дои : 10.1007/s004390051062 . ПМИД 10480354 .
- Симмонс А.Д., Муси М.М., Лопес К.С., Хван Л.И., Ян Ю.П., Ловетт М. (ноябрь 1999 г.). «Прямое взаимодействие между белками EXT и гликозилтрансферазами нарушено при наследственных множественных экзостозах» . Молекулярная генетика человека . 8 (12): 2155–64. дои : 10.1093/hmg/8.12.2155 . ПМИД 10545594 .
- Маккормик С., Дункан Дж., Гутсос К.Т., Туфаро Ф. (январь 2000 г.). «Предполагаемые опухолевые супрессоры EXT1 и EXT2 образуют стабильный комплекс, который накапливается в аппарате Гольджи и катализирует синтез гепарансульфата» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (2): 668–73. Бибкод : 2000PNAS...97..668M . дои : 10.1073/pnas.97.2.668 . ПМК 15388 . ПМИД 10639137 .
- Кобаяши С., Моримото К., Симидзу Т., Такахаши М., Куросава Х., Ширасава Т. (февраль 2000 г.). «Ассоциация EXT1 и EXT2, наследственных генных продуктов множественных экзостозов, в аппарате Гольджи». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 268 (3): 860–7. дои : 10.1006/bbrc.2000.2219 . ПМИД 10679296 .
- Ши Ю.Р., Ву JY, Цай Ф.Дж., Ли CC, Цай CH (апрель 2000 г.). «Мутация R223P в гене EXT2 вызывает наследственные множественные экзостозы». Человеческая мутация . 15 (4): 390–1. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(200004)15:4<390::AID-HUMU35>3.0.CO;2-E . ПМИД 10738008 . S2CID 83566600 .
- Стикенс Д., Браун Д., Эванс Г.А. (июль 2000 г.). «Гены EXT по-разному экспрессируются в костях и хрящах во время эмбриогенеза мыши» . Динамика развития . 218 (3): 452–64. doi : 10.1002/1097-0177(200007)218:3<452::AID-DVDY1000>3.0.CO;2-P . ПМИД 10878610 . S2CID 25986105 .
- Бернард М.А., Холл CE, Хог Д.А., Коул В.Г., Скотт А., Снаггс М.Б. и др. (февраль 2001 г.). «Снижение уровней предполагаемых белков-супрессоров опухоли EXT1 и EXT2 в экзостозных хондроцитах». Подвижность клеток и цитоскелет . 48 (2): 149–62. doi : 10.1002/1097-0169(200102)48:2<149::AID-CM1005>3.0.CO;2-3 . ПМИД 11169766 .