Пуриннуклеозидфосфорилаза
![]() | Эта статья включает список общих ссылок , но в ней отсутствуют достаточные соответствующие встроенные цитаты . ( сентябрь 2017 г. ) |
пурин-нуклеозидфосфорилаза | |||
---|---|---|---|
![]() | |||
Идентификаторы | |||
Номер ЕС. | 2.4.2.1 | ||
Номер CAS. | 9030-21-1 | ||
Базы данных | |||
ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
КЕГГ | КЕГГ запись | ||
МетаЦик | метаболический путь | ||
ПРЯМОЙ | профиль | ||
PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
|
Пуриннуклеозидфосфорилаза | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | Пурин_фосфорилаза IPR011268 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Генные карты : [1] ; ОМА : - ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Пуриннуклеозидфосфорилаза , PNP , PNPаза или инозинфосфорилаза ( EC 2.4.2.1 ) представляет собой фермент , который у человека кодируется NP геном . [2] Он катализирует химическую реакцию
- пуриновый нуклеозид + фосфат пурин + альфа-D-рибозо-1-фосфат
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются пуриновый нуклеозид и фосфат , тогда как его продуктами являются пурин и альфа-D-рибозо-1-фосфат .
Номенклатура
[ редактировать ]Этот фермент принадлежит к семейству гликозилтрансфераз , а именно пентозилтрансфераз. Систематическое название этого класса ферментов — пуриннуклеозид:фосфатрибозилтрансфераза .
Другие широко используемые имена включают:
- инозинфосфорилаза
- ПНПаза
- ПАНПИ
- ЩЕНОК
- инозин-гуанозинфосфорилаза
- нуклеотид-фосфатаза
- пуриндезоксинуклеозидфосфорилаза
- пуриндезоксирибонуклеозидфосфорилаза
- пуриннуклеозидфосфорилаза
- пуринрибонуклеозидфосфорилы
Этот фермент участвует в трех метаболических путях : метаболизме пуринов , метаболизме пиримидинов и метаболизме никотината и никотинамида .
Функция
[ редактировать ]Пуриннуклеозидфосфорилаза — фермент, участвующий в обмене пуринов . PNP метаболизирует инозин в гипоксантин , а гуанозин в гуанин , в каждом случае создавая рибозофосфат . Примечание: аденозин сначала метаболизируется до инозина с помощью фермента аденозиндезаминазы. [3]

Нуклеозидфосфорилаза — это фермент, который расщепляет нуклеозид путем фосфорилирования рибозы с образованием азотистого основания и рибозо-1-фосфата. Это один из ферментов пути спасения нуклеотидов . Эти пути позволяют клетке вырабатывать нуклеотид-монофосфаты, когда de novo путь синтеза прерван или отсутствует (как в случае с мозгом). Часто путь de novo прерывается в результате применения химиотерапевтических препаратов, таких как метотрексат или аминоптерин .
Все ферменты пути спасения требуют высокоэнергетического донора фосфата, такого как АТФ или PRPP .
- Тимидин может фосфорилироваться тимидинкиназой (ТК).
- Уридин может фосфорилироваться уридинкиназой (Великобритания).
- Цитидин может фосфорилироваться цитидинкиназой (ЦК).
- Дезоксицитидин может фосфорилироваться дезоксицитидинкиназой (DCK).
Аденозин использует фермент аденозинкиназу , которая является очень важным ферментом в клетке. Предпринимаются попытки разработать ингибитор этого фермента для использования в химиотерапии рака .
Регуляция ферментов
[ редактировать ]Этот белок может использовать морфеиновую модель аллостерической регуляции . [4]
Клиническое значение
[ редактировать ]ПНПаза вместе с аденозиндезаминазой (АДА) играет ключевую роль в катаболизме пуринов, называемом путем спасения. Мутации в ADA приводят к накоплению (d)АТФ, который ингибирует рибонуклеотидредуктазу , что приводит к дефициту (d)CTP и (d)TTP, что, в свою очередь, вызывает апоптоз в Т-лимфоцитах и B-лимфоцитах, что приводит к к тяжелому комбинированному иммунодефициту (ТКИД). [ нужна ссылка ]
Пациенты с дефицитом PNP будут иметь проблему иммунодефицита. Он влияет только на Т-клетки; Дефицит не влияет на B-клетки.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кандури Ф, дос Сантос ДМ, Сильва Р.Г., Мендес М.А., Бассо Л.А., Пальма М.С., де Азеведо В.Ф., Сантос Д.С. (январь 2004 г.). «Структуры пуриннуклеозидфосфорилазы человека в комплексе с инозином и ddI». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 313 (4): 907–14. дои : 10.1016/j.bbrc.2003.11.179 . ПМИД 14706628 .
- ^ «Ген Энтрез: нуклеозидфосфорилаза NP» .
- ^ Обзор биохимии Kaplan USMLE
- ^ Селвуд Т., Яффе Е.К. (март 2012 г.). «Динамическая диссоциация гомоолигомеров и контроль функции белка» . Архив биохимии и биофизики . 519 (2): 131–43. дои : 10.1016/j.abb.2011.11.020 . ПМЦ 3298769 . ПМИД 22182754 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Маркерт М.Л. (1991). «Дефицит пуриннуклеозидфосфорилазы». Обзоры иммунодефицита . 3 (1): 45–81. ПМИД 1931007 .
- Боргерс М., Верхаген Х., Де Брабандер М., Де Кри Дж., Де Кок В., Тоне Ф., Геуэнс Г. (ноябрь 1978 г.). «Пуриннуклеозидфосфорилаза при хроническом лимфоцитарном лейкозе (ХЛЛ)» . Кровь . 52 (5): 886–95. дои : 10.1182/blood.V52.5.886.886 . ПМИД 100152 .
- Ост М.Р., Эндрюс Л.Г., Барретт М.Дж., Норби-Слайкорд С.Дж., Маркерт М.Л. (октябрь 1992 г.). «Молекулярный анализ мутаций у пациента с дефицитом пуриннуклеозидфосфорилазы» . Американский журнал генетики человека . 51 (4): 763–72. ПМЦ 1682776 . ПМИД 1384322 .
- Эндрюс Л.Г., Маркерт М.Л. (апрель 1992 г.). «Пропуск экзонов при процессинге мРНК пуриннуклеозидфосфорилазы, приводящий к тяжелому иммунодефициту» . Журнал биологической химии . 267 (11): 7834–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)42589-6 . ПМИД 1560016 .
- Джонсон Дж. Дж., Уильямс С.Р., МакИвор Р.С. (сентябрь 1991 г.). «Последовательность и функциональная характеристика промотора пуриннуклеозидфосфорилазы человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 19 (18): 5015–20. дои : 10.1093/нар/19.18.5015 . ПМК 328804 . ПМИД 1923769 .
- Илик С.Э., Рул С.А., Картер Д.С., Гринхау Т.Дж., Бабу Ю.С., Кук В.Дж., Хабаш Дж., Хелливелл Дж.Р. , Стоклер Дж.Д., Паркс Р.Э. (январь 1990 г.). «Трехмерная структура пуриннуклеозидфосфорилазы эритроцитов человека при разрешении 3,2 А». Журнал биологической химии . 265 (3): 1812–20. дои : 10.2210/pdb2pnp/pdb . ПМИД 2104852 .
- Уильямс С.Р., Гекелер В., МакИвор Р.С., Мартин Д.В. (февраль 1987 г.). «Дефицит пуриннуклеозидфосфорилазы человека, вызванный заменой одного основания» . Журнал биологической химии . 262 (5): 2332–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)61658-8 . ПМИД 3029074 .
- Уильямс С.Р., Годдард Дж.М., Мартин Д.В. (июль 1984 г.). «Последовательность кДНК пуриннуклеозидфосфорилазы человека и характеристика геномного клона» . Исследования нуклеиновых кислот . 12 (14): 5779–87. дои : 10.1093/нар/12.14.5779 . ПМК 320030 . ПМИД 6087295 .
- Паннике У., Тухшмид П., Фридрих В., Бартрам Ч.Р., Шварц К. (декабрь 1996 г.). «Две новые миссенс-мутации и мутации сдвига рамки считывания в экзонах 5 и 6 гена пуриновой нуклеозидфосфорилазы (PNP) у пациента с тяжелым комбинированным иммунодефицитом (SCID)». Генетика человека . 98 (6): 706–9. дои : 10.1007/s004390050290 . ПМИД 8931706 . S2CID 5657916 .
- Маркерт М.Л., Финкель Б.Д., Маклафлин Т.М., Уотсон Т.Дж., Коллард Х.Р., МакМахон С.П., Эндрюс Л.Г., Барретт М.Дж., Уорд Ф.Е. (1997). «Мутации при дефиците пуриннуклеозидфосфорилазы» . Человеческая мутация . 9 (2): 118–21. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(1997)9:2<118::AID-HUMU3>3.0.CO;2-5 . ПМИД 9067751 . S2CID 46243170 .
- Эрион МД, Такабаяши К., Смит Х.Б., Кесси Дж., Вагнер С., Хёнгер С., Шамс С.Л., Илик С.Э. (сентябрь 1997 г.). «Пуриннуклеозидфосфорилаза. 1. Структурно-функциональные исследования». Биохимия . 36 (39): 11725–34. дои : 10.1021/bi961969w . ПМИД 9305962 .
- Эрион, доктор медицинских наук, Стоклер Дж.Д., Гуида В.К., Уолтер Р.Л., Илик С.Е. (сентябрь 1997 г.). «Пуриннуклеозидфосфорилаза. 2. Каталитический механизм». Биохимия . 36 (39): 11735–48. дои : 10.1021/bi961970v . ПМИД 9305963 .
- Стоклер Дж.Д., Пуаро А.Ф., Смит Р.М., Паркс Р.Э., Илик С.Е., Такабаяши К., Эрион, доктор медицинских наук (сентябрь 1997 г.). «Пуриннуклеозидфосфорилаза. 3. Изменение специфичности пуриновых оснований путем сайт-направленного мутагенеза». Биохимия . 36 (39): 11749–56. дои : 10.1021/bi961971n . ПМИД 9305964 .
- Сасаки Ю, Исеки М, Ямагути С, Куросава Ю, Ямамото Т, Мориваки Ю, Кенри Т, Сасаки Т, Ямасита Р (июль 1998 г.). «Прямое доказательство аутосомно-рецессивного наследования кодона терминации Arg24 в гене пуриновой нуклеозидфосфорилазы в семье с тяжелым комбинированным иммунодефицитом». Генетика человека . 103 (1): 81–5. дои : 10.1007/s004390050787 . ПМИД 9737781 . S2CID 8373698 .
- Шеппард Т.Л., Ордуханян П., Джойс Г.Ф. (июль 2000 г.). «ДНК-фермент с N-гликозилазной активностью» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (14): 7802–7. Бибкод : 2000PNAS...97.7802S . дои : 10.1073/pnas.97.14.7802 . ПМК 16625 . ПМИД 10884411 .
- Далал И., Грюнебаум Э., Коэн А., Ройфман С.М. (июнь 2001 г.). «Две новые мутации у пациента с дефицитом пуриновой нуклеозидфосфорилазы (PNP)». Клиническая генетика . 59 (6): 430–7. дои : 10.1034/j.1399-0004.2001.590608.x . ПМИД 11453975 . S2CID 24624559 .
- Ивингс Л., Пеннингтон С.Р., Дженкинс Р., Вайс Дж.Л., Бургойн Р.Д. (май 2002 г.). «Идентификация Ca2+-зависимых партнеров по связыванию нейронального белка-сенсора кальция нейрокальцина дельта: взаимодействие с актином, клатрином и тубулином» . Биохимический журнал . 363 (Часть 3): 599–608. дои : 10.1042/0264-6021:3630599 . ПМЦ 1222513 . ПМИД 11964161 .
- Фалькенберг М. , Гаспари М., Рантанен А., Трифунович А., Ларссон Н.Г., Густафссон К.М. (июль 2002 г.). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». Природная генетика . 31 (3): 289–94. дои : 10.1038/ng909 . ПМИД 12068295 . S2CID 11164308 .
- Стойчев Г., Кирдашук Б., Шугар Д. (август 2002 г.). «Ксантозин и ксантин. Субстратные свойства пуриннуклеозидфосфорилаз и их значение для других ферментных систем» . Европейский журнал биохимии . 269 (16): 4048–57. дои : 10.1046/j.1432-1033.2002.03097.x . ПМИД 12180982 .
- Агарвал Р.П., Паркс Р.Э. (1969). «Пуриннуклеозидфосфорилаза из эритроцитов человека. IV Кристаллизация и некоторые свойства» . Ж. Биол. Хим . 244 (4): 644–7. дои : 10.1016/S0021-9258(18)94403-0 . ПМИД 5768862 .
- Бойер П.Д., Ларди Х. и Мирбак К. (ред.), Ферменты, 2-е изд., том. 5, Academic Press, Нью-Йорк, 1961, с. 237-255.
- ХЕППЕЛ ЛА, ХИЛМО Р.Дж. (1952). «[Фосфоролиз и гидролиз пуриновых рибозидов ферментами дрожжей.]» . Ж. Биол. Хим . 198 (2): 683–94. дои : 10.1016/S0021-9258(18)55525-3 . ПМИД 12999785 .
- Калькар Х.М. (1947). «Ферментативный синтез пуриновых рибозидов» . Ж. Биол. Хим . 167 (2): 477–486. дои : 10.1016/S0021-9258(17)31000-1 . ПМИД 20285042 .
- Сондерс П.П., Уилсон Б.А., Сондерс Г.Ф. (1969). «Очистка и сравнительные свойства пиримидиннуклеозидфосфорилазы из Bacillus stearothermophilus» . Ж. Биол. Хим . 244 (13): 3691–7. дои : 10.1016/S0021-9258(18)83424-X . ПМИД 4978445 .
- Цубои К.К., Хадсон П.Б. (1957). «Ферменты эритроцитов человека. I. Пуриннуклеозидфосфорилаза; методика выделения» . Ж. Биол. Хим . 224 (2): 879–887. дои : 10.1016/S0021-9258(18)64980-4 . ПМИД 13405917 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Человеческий PNP в Корнельском университете
- PNP E. Coli в Корнельском университете
- Пурин-нуклеозид + фосфорилаза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)