Б3ГАТ2

Б3ГАТ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2D0J
Идентификаторы
Псевдонимы	B3GAT2 , GLCATS, бета-1,3-глюкуронилтрансфераза 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 607497 ; МГИ : 2389490 ; Гомологен : 50574 ; Генные карты : B3GAT2 ; ОМА : B3GAT2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	70,957,060 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	23,888,239 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; entorhinal cortex; ; ganglionic eminence; ; buccal mucosa cell; ; pons; ; Brodmann area 46; ; postcentral gyrus; ; hippocampus proper; ; endothelial cell; ; corpus callosum;
	Top expressed in
	proximal tubule; ; right kidney; ; ventricular zone; ; urethra; ; human kidney; ; zygote; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; primary visual cortex; ; superior frontal gyrus; ; neural tube;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; metal ion binding; galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase activity;
Cellular component	integral component of membrane; Golgi apparatus; membrane; Golgi membrane;
Biological process	glycosaminoglycan metabolic process; protein glycosylation; chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process; chondroitin sulfate metabolic process; carbohydrate metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	135152
	280645
	ENSG00000112309
	ENSMUSG00000026156
	Q9NPZ5
	P59270
	НМ_080742
	НМ_172124
	НП_542780
	НП_742122
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Галактозилгалактозилксилозилпротеин 3-бета-глюкуронозилтрансфераза 2 представляет собой фермент , который у человека кодируется B3GAT2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Продукт этого гена представляет собой трансмембранный белок, принадлежащий к семейству глюкуронилтрансфераз, и катализирует перенос бета-1,3-связанной глюкуроновой кислоты на концевую галактозу в различных гликопротеинах или гликолипидах, содержащих Gal-бета-1-4GlcNAc или Gal- остаток бета-1-3GlcNAc. Кодируемый белок участвует в синтезе углеводного эпитопа природного киллера-1 человека (HNK-1), сульфатированного трисахарида, участвующего в клеточной миграции и адгезии в нервной системе. ^{[ 6 ]}

Использование антитела HNK-1 для исследования нервного гребня

Антитела, выработанные против эпитопа HNK-1, сыграли большую роль в исследованиях нервного гребня , особенно у птичьих эмбрионов. ^{[ 7 ]} Первым антителом, выработанным против этого эпитопа, было NC-1. ^{[ 8 ]} что позволило значительно упростить анализ путей миграции нервного гребня. У птиц, и особенно у других позвоночных, результаты окрашивания HNK-1 следует интерпретировать с осторожностью, поскольку эпитоп не уникален для нервного гребня.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000112309 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026156 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Имия К., Ишизаки Т., Сейки Т., Сайто Ф., Инадзава Дж., Ока С., Кавасаки Т. (октябрь 2002 г.). «Клонирование кДНК, геномная структура и хромосомное картирование мышиной глюкуронилтрансферазы-S, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Джин . 296 (1–2): 29–36. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00840-5 . ПМИД 12383500 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: бета-1,3-глюкуронилтрансфераза B3GAT2 (глюкуронозилтрансфераза S)» .
^ Броннер-Фрейзер М. (май 1986 г.). «Анализ ранних стадий миграции туловищного нервного гребня у эмбрионов птиц с использованием моноклональных антител HNK-1». Дев. Биол . 115 (1): 44–55. дои : 10.1016/0012-1606(86)90226-5 . ПМИД 3516760 .
^ Винсент М., Тьери Дж.П. (июнь 1984 г.). «Маркер клеточной поверхности клеток нервного гребня и плакод: дальнейшая эволюция периферической и центральной нервной системы». Дев. Биол . 103 (2): 468–81. дои : 10.1016/0012-1606(84)90334-8 . ПМИД 6202575 .

Внешние ссылки

Местоположение генома человека B3GAT2 и B3GAT2 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для галактозилгалактозилксилозилпротеина 3-бета-глюкуронозилтрансферазы 2 человека (B3GAT2).

Дальнейшее чтение

Нагасе Т., Кикуно Р., Охара О (2002). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XXII. Полные последовательности 50 новых клонов кДНК, кодирующих большие белки» . ДНК Рез . 8 (6): 319–27. дои : 10.1093/dnares/8.6.319 . ПМИД 11853319 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Маркос И., Галан Х.Дж., Боррего С., Антиньоло Г. (2003). «Клонирование, характеристика и картирование хромосом человеческого гена GlcAT-S» . Дж. Хум. Жене . 47 (12): 677–80. дои : 10.1007/s100380200103 . ПМИД 12522689 .
Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека» . Природа . 425 (6960): 805–11. Бибкод : 2003Natur.425..805M . дои : 10.1038/nature02055 . ПМИД 14574404 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Какуда С., Ока С., Кавасаки Т. (2004). «Очистка и характеристика двух рекомбинантных глюкуронилтрансфераз человека, участвующих в биосинтезе углеводов HNK-1 в Escherichia coli». Экспр. белка Пуриф . 35 (1): 111–9. дои : 10.1016/j.pep.2003.12.021 . ПМИД 15039073 .
Какуда С., Сато Ю., Тонояма Ю. и др. (2005). «Различные акцепторные особенности двух глюкуронилтрансфераз, участвующих в биосинтезе углеводов HNK-1» . Гликобиология . 15 (2): 203–10. дои : 10.1093/гликоб/cwi001 . ПМИД 15470230 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация модуляции транскрипции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геном Рез . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .
Шиба Т., Какуда С., Исигуро М. и др. (2006). «Кристаллическая структура GlcAT-S, глюкуронилтрансферазы человека, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Белки . 65 (2): 499–508. дои : 10.1002/прот.21118 . ПМИД 16897771 . S2CID 31290955 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000112309 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026156 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12383500-5] Имия К., Ишизаки Т., Сейки Т., Сайто Ф., Инадзава Дж., Ока С., Кавасаки Т. (октябрь 2002 г.). «Клонирование кДНК, геномная структура и хромосомное картирование мышиной глюкуронилтрансферазы-S, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Джин . 296 (1–2): 29–36. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00840-5 . ПМИД 12383500 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: бета-1,3-глюкуронилтрансфераза B3GAT2 (глюкуронозилтрансфераза S)» .

[7] Броннер-Фрейзер М. (май 1986 г.). «Анализ ранних стадий миграции туловищного нервного гребня у эмбрионов птиц с использованием моноклональных антител HNK-1». Дев. Биол . 115 (1): 44–55. дои : 10.1016/0012-1606(86)90226-5 . ПМИД 3516760 .

[8] Винсент М., Тьери Дж.П. (июнь 1984 г.). «Маркер клеточной поверхности клеток нервного гребня и плакод: дальнейшая эволюция периферической и центральной нервной системы». Дев. Биол . 103 (2): 468–81. дои : 10.1016/0012-1606(84)90334-8 . ПМИД 6202575 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]