Полинуклеотидфосфорилаза
Полинуклеотидфосфорилаза | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Номер ЕС. | 2.7.7.8 | ||
Номер CAS. | 9014-12-4 | ||
Базы данных | |||
ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
КЕГГ | КЕГГ запись | ||
МетаЦик | метаболический путь | ||
ПРЯМОЙ | профиль | ||
PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
|
Полинуклеотидфосфорилаза ( ПНПаза ) представляет собой бифункциональный фермент с фосфоролитической 3'-5' экзорибонуклеазной активностью и 3'-концевой олигонуклеотидной полимеразной активностью. [2] То есть он разрушает цепь РНК, начиная с 3'-конца и продвигаясь к 5'-концу. [1] Он также синтезирует длинные гетерополимерные хвосты in vivo . Он объясняет все наблюдаемое остаточное полиаденилирование у штаммов Escherichia coli, у которых отсутствует нормальный фермент полиаденилирования. [1] Обнаруженная Марианной Грюнберг-Манаго, работавшей в лаборатории Северо Очоа в 1955 году, активность PNPазы в отношении РНК-полимеризации первоначально считалась ответственной за ДНК-зависимый синтез информационной РНК, но к концу 1950-х годов это мнение было опровергнуто. [3] [4]
Он участвует в процессинге и деградации мРНК у бактерий, растений, [5] и животные. [6]
У человека фермент кодируется геном PNPT1 . В активной форме белок образует кольцевую структуру, состоящую из трех молекул ПНПазы. Каждая молекула ПНПазы состоит из двух доменов РНКазы PH , РНК-связывающего домена S1 и домена K-гомологии . Белок присутствует в бактериях и хлоропластах . [2] и митохондрии [7] некоторых эукариотических клеток. У эукариот и архей существует структурно и эволюционно родственный комплекс, называемый экзосомным комплексом . [7]
Та же аббревиатура ( PNPase ) также используется для другого, в остальном не родственного фермента, пуриннуклеозидфосфорилазы .
ПНПаза человека I | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Символ | ПНПАЗА | ||
Альт. символы | ПНПаза, OLD35, old-35 | ||
ген NCBI | 87178 | ||
HGNC | 23166 | ||
МОЙ БОГ | 610316 | ||
ПДБ | 1Е3П | ||
RefSeq | НМ_033109 | ||
ЮниПрот | Q8TCS8 | ||
Другие данные | |||
Номер ЕС | 2.7.7.8 | ||
Локус | Хр. 2 стр15 | ||
|
Ссылки [ править ]
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с Симмонс М.Ф., Джонс Г.Х., Луизи Б.Ф. (ноябрь 2000 г.). «Дублированная складка является структурной основой каталитической активности, процессивности и регуляции полинуклеотидфосфорилазы» . Структура . 8 (11): 1215–26. дои : 10.1016/S0969-2126(00)00521-9 . ПМИД 11080643 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Иегудай-Решефф С., Хирш М., Шустер Г. (август 2001 г.). «Полинуклеотидфосфорилаза действует как экзонуклеаза и поли(А)-полимераза в хлоропластах шпината» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (16): 5408–16. дои : 10.1128/MCB.21.16.5408-5416.2001 . ПМК 87263 . ПМИД 11463823 .
- ^ Грюнберг-Манаго М., Ортис П.Дж., Очоа С. (апрель 1956 г.). «Ферментативный синтез полинуклеотидов. I. Полинуклеотидфосфорилаза azotobacter vinelandii». Биохимика и биофизика Acta . 20 (1): 269–85. дои : 10.1016/0006-3002(56)90286-4 . ПМИД 13315374 .
- ^ Фурт Дж., Гурвиц Дж., Андерс М. (август 1962 г.). «Роль дезоксирибонуклеиновой кислоты в синтезе рибонуклеиновой кислоты. I. Очистка и свойства полимеразы рибонуклеиновой кислоты» (PDF) . Журнал биологической химии . 237 (8): 2611–9. дои : 10.1016/S0021-9258(19)73796-X . ПМИД 13895983 .
- ^ Иегудай-Решефф С., Циммер С.Л., Комине Ю., Стерн Д.Б. (март 2007 г.). «Интеграция метаболизма нуклеиновых кислот хлоропластов в реакцию дефицита фосфатов у Chlamydomonas Reinhardtii» . Растительная клетка . 19 (3): 1023–38. дои : 10.1105/tpc.106.045427 . ПМЦ 1867357 . ПМИД 17351118 .
- ^ Саркар Д., Фишер П.Б. (май 2006 г.). «Полинуклеотидфосфорилаза человека (hPNPase old-35): фермент деградации РНК с плейотрофными биологическими эффектами» (PDF) . Клеточный цикл . 5 (10): 1080–4. дои : 10.4161/cc.5.10.2741 . ПМИД 16687933 . S2CID 42371805 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Шильдерс Г., ван Дейк Э., Раймейкерс Р., Пруейн Г.Дж. (2006). Клеточная и молекулярная биология экзосомы: как создавать или разрушать РНК . Международный обзор цитологии. Том. 251. С. 159–208. дои : 10.1016/S0074-7696(06)51005-8 . ISBN 9780123646552 . ПМИД 16939780 .
Внешние ссылки [ править ]
- Полинуклеотид + фосфорилаза Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)