✖


Jump to content

ДНК-полимераза лямбда

ГОЛОСОВАНИЕ
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы POLL , БЕТАН, ПОЛКАППА, полимераза (ДНК) лямбда, ДНК-полимераза лямбда
Внешние идентификаторы Опустить : 606343 ; МГИ : 1889000 ; Гомологен : 40863 ; GeneCards : ОПРОС ; ОМА : ОПРОС - ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить

27343

56626

Вместе

ENSG00000166169

ENSMUSG00000025218

ЮниПрот

Q9UGP5

Q9QUG2
Q9QXE2

RefSeq (мРНК)

НМ_001174084
НМ_001174085
НМ_001308382
НМ_013274

НМ_020032
НМ_001330506
НМ_001330507

RefSeq (белок)

НП_001167555
НП_001167556
НП_001295311
НП_037406

Местоположение (UCSC) Чр 10: 101,58 – 101,59 Мб Чр 19: 45,54 – 45,55 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

ДНК-полимераза лямбда , также известная как Pol λ , представляет собой фермент, обнаруженный у всех эукариот . У человека он кодируется POLL геном . [ 5 ] [ 6 ]

Функция

[ редактировать ]

Pol λ является членом X-семейства ДНК -полимераз . Считается, что он повторно синтезирует недостающие нуклеотиды во время негомологичного соединения концов (NHEJ), пути восстановления двухцепочечного разрыва ДНК (DSB) . [ 7 ] [ 8 ] NHEJ является основным путем репарации DSB ДНК у высших эукариот. Хромосомные DSB являются наиболее тяжелым типом повреждения ДНК . Во время NHEJ дуплексы, образующиеся в результате выравнивания разорванных концов ДНК, обычно содержат небольшие пробелы, которые необходимо заполнить ДНК-полимеразой . Эту функцию может выполнять ДНК-полимераза лямбда. [ 9 ]

Кристаллическая структура pol λ показывает, что, в отличие от ДНК-полимераз, катализирующих репликацию ДНК , pol λ осуществляет обширные контакты с 5'-фосфатом нижестоящей цепи ДНК. Это позволяет полимеразе стабилизировать два конца двухцепочечного разрыва и объясняет, почему pol λ уникально подходит для участия в негомологическом соединении концов. [ 10 ]

В дополнение к NHEJ, pol λ может также участвовать в базовой эксцизионной репарации (BER), где он обеспечивает резервную активность в отсутствие Pol β . [ 11 ] [ 12 ] BER является основным путем восстановления небольших повреждений оснований, возникающих в результате алкилирования , окисления, депуринации/депиримидинирования и дезаминирования ДНК.

Помимо каталитического полимеразного домена, pol λ имеет домен массой 8 кДа и домен BRCT . Домен 8 кДа обладает лиазной активностью, которая может удалять 5'-дезоксирибозофосфатную группу с конца разрыва цепи. [ 13 ] Домен BRCT представляет собой фосфопептидсвязывающий домен, который распространен среди белков репарации ДНК и, вероятно, участвует в координации белок-белковых взаимодействий. [ 14 ] Pol λ структурно и функционально связан с pol μ , другим членом семейства X, который также участвует в негомологическом соединении концов . [ 15 ] Как и pol μ, pol λ участвует в рекомбинации V(D)J, процессе, посредством которого рецепторов B- и T-клеток генерируется разнообразие позвоночных в иммунной системе . В то время как pol μ важен для перегруппировок тяжелых цепей, pol λ, по-видимому, более важен для перегруппировок легких цепей. [ 16 ] [ 17 ] Дрожжи Saccharomyces cerevisiae имеют единственный гомолог как pol λ, так и pol μ, называемый Pol4. [ 18 ]

Синтез транслезий представляет собой механизм толерантности к повреждениям, при котором специализированные ДНК-полимеразы заменяют репликативные полимеразы при копировании повреждений ДНК во время репликации. ДНК-полимераза лямбда, по-видимому, участвует в синтезе транслейкозных сайтов и повреждениях 8-oxodG . [ 9 ] [ 19 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что Pol λ взаимодействует с PCNA . [ 20 ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000166169 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025218 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Энтрез: полимераза POLL (ДНК-направленная), лямбда» .
  6. ^ Ауфуши С., Флаттер Е., Дахан А., Файли А., Берточчи Б., Сторк С., Дельбос Ф., Кочеа Л., Гупта Н., Вейл Дж.К., Рейно К.А. (сентябрь 2000 г.). «Две новые ДНК-полимеразы человека и мыши семейства polX» . Нуклеиновые кислоты Рез . 28 (18): 3684–93. дои : 10.1093/нар/28.18.3684 . ПМК   110747 . ПМИД   10982892 .
  7. ^ Дейли Дж.М., Лаан Р.Л., Суреш А., Уилсон Т.Е. (август 2005 г.). «Совместная зависимость ДНК от действия полимеразы семейства pol X при негомологичном соединении концов» . Ж. Биол. Хим . 280 (32): 29030–7. дои : 10.1074/jbc.M505277200 . ПМИД   15964833 .
  8. ^ Ли Дж.В., Бланко Л., Чжоу Т., Гарсиа-Диас М., Бебенек К., Кункель Т.А., Ван З., Повирк Л.Ф. (январь 2004 г.). «Роль лямбда-полимеразы ДНК в заполнении пробелов на основе выравнивания для соединения концов негомологичного ДНК в ядерных экстрактах человека» . Ж. Биол. Хим . 279 (1): 805–11. дои : 10.1074/jbc.M307913200 . hdl : 10261/338875 . ПМИД   14561766 .
  9. ^ Jump up to: а б Бебенек К., Педерсен Л.К., Кункель Т.А. (2014). «Структурно-функциональные исследования ДНК-полимеразы λ» . Биохимия . 53 (17): 2781–92. дои : 10.1021/bi4017236 . ПМК   4018081 . ПМИД   24716527 .
  10. ^ Гарсиа-Диас М., Бебенек К., Кран Дж.М., Бланко Л., Кункель Т.А., Педерсен Л.С. (февраль 2004 г.). «Структурное решение для лямбда-зависимой репарации ДНК-полимеразой разрывов ДНК с минимальной гомологией» . Мол. Клетка . 13 (4): 561–72. дои : 10.1016/S1097-2765(04)00061-9 . ПМИД   14992725 .
  11. ^ Тано К., Накамура Дж., Асагоши К., Аракава Х., Сонода Э., Брейтуэйт Э.К., Прасад Р., Буерстедде Дж.М., Такеда С., Ватанабэ М., Уилсон С.Х. (июнь 2007 г.). «Взаимодействие между ДНК-полимеразами бета и лямбда в восстановлении окислительных повреждений ДНК в клетках DT40 курицы» . Восстановление ДНК (Амст.) . 6 (6): 869–75. дои : 10.1016/j.dnarep.2007.01.011 . ПМК   2080795 . ПМИД   17363341 .
  12. ^ Брейтуэйт Э.К., Прасад Р., Шок Д.Д., Хоу Э.В., Бирд В.А., Уилсон С.Х. (май 2005 г.). «ДНК-полимераза лямбда опосредует активность эксцизионной репарации резервного основания в экстрактах эмбриональных фибробластов мыши» . Ж. Биол. Хим . 280 (18): 18469–75. дои : 10.1074/jbc.M411864200 . ПМИД   15749700 .
  13. ^ Гарсиа-Диас М., Бебенек К., Кункель Т.А., Бланко Л. (сентябрь 2001 г.). «Идентификация внутренней активности 5'-дезоксирибозо-5-фосфат-лиазы в лямбда-полимеразе ДНК человека: возможная роль в репарации вырезаемых оснований» . Ж. Биол. Хим . 276 (37): 34659–63. дои : 10.1074/jbc.M106336200 . hdl : 10261/338865 . ПМИД   11457865 .
  14. ^ Ю Х, Чини CC, Хэ М, Мер Г, Чен Дж (октябрь 2003 г.). «Домен BRCT представляет собой домен, связывающий фосфобелок». Наука . 302 (5645): 639–42. Бибкод : 2003Sci...302..639Y . дои : 10.1126/science.1088753 . ПМИД   14576433 . S2CID   29407635 .
  15. ^ Ник МакЭлхинни С.А., Рамсден Д.А. (август 2004 г.). «Соперничество между братьями и сестрами: конкуренция между членами семьи Pol X в рекомбинации V (D) J и общем восстановлении двухцепочечных разрывов». Иммунол. Преподобный . 200 : 156–64. дои : 10.1111/j.0105-2896.2004.00160.x . ПМИД   15242403 . S2CID   36516952 .
  16. ^ Берточчи Б., Де Смет А., Берек С., Вейл Дж. К., Рейно К. А. (август 2003 г.). «Перестройка гена легкой цепи каппа иммуноглобулина нарушается у мышей с дефицитом ДНК-полимеразы мю» . Иммунитет . 19 (2): 203–11. дои : 10.1016/S1074-7613(03)00203-6 . ПМИД   12932354 .
  17. ^ Берточчи Б., Де Смет А., Вейл Дж. К., Рейно Калифорния (июль 2006 г.). «Неперекрывающиеся функции ДНК-полимераз мю, лямбда и терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы во время рекомбинации иммуноглобулина V (D) J in vivo» . Иммунитет . 25 (1): 31–41. doi : 10.1016/j.immuni.2006.04.013 . ПМИД   16860755 .
  18. ^ Либер М.Р. (июль 2006 г.). «Полимеразы для рекомбинации V(D)J» . Иммунитет . 25 (1): 7–9. doi : 10.1016/j.immuni.2006.07.007 . ПМИД   16860749 .
  19. ^ Бурак М.Дж., Гуджа К.Э., Хамбарджиева Э., Деркунт Б., Гарсия-Диас М. (2016). «Механизм точности ДНК-полимеразы лямбда способствует безошибочному обходу 8-оксо-dG» . ЭМБО Дж. 35 (18): 2045–59. дои : 10.15252/embj.201694332 . ПМЦ   5282837 . ПМИД   27481934 .
  20. ^ Мага Г, Виллани Г, Рамадан К, Шевелев И, Танги Ле Гак Н, Бланко Л, Бланка Г, Спадари С, Хюбшер У (декабрь 2002 г.). «ДНК-полимераза лямбда человека функционально и физически взаимодействует с ядерным антигеном пролиферирующей клетки при синтезе ДНК в норме и при транспорозе» . Ж. Биол. Хим . 277 (50): 48434–40. дои : 10.1074/jbc.M206889200 . ПМИД   12368291 .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=DNA_polymerase_lambda&oldid=1193578447"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 5c51307c5c99c1ffc9fb91db59b514ea__1704369000
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/5c/ea/5c51307c5c99c1ffc9fb91db59b514ea.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
DNA polymerase lambda - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)