Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза

ДНТТ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2COE
Идентификаторы
Псевдонимы	DNTT , TDT, ДНК-нуклеотидиллексотрансфераза, терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза
Внешние идентификаторы	Опустить : 187410 ; МГИ : 98659 ; Гомологен : 3014 ; GeneCards : DNTT ; ОМА : ДНТТ - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	96,338,564 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	41,047,964 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	thymus; ; bone marrow; ; trabecular bone; ; bone marrow cells; ; testicle; ; human penis; ; synovial joint; ; amniotic fluid; ; pharynx; ; cecum;
	Top expressed in
	thymus; ; ankle joint; ; granulocyte; ; tibiofemoral joint; ; bone marrow; ; embryo; ; sternocleidomastoid muscle; ; trachea; ; femur; ; body of femur;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; DNA binding; DNA-directed DNA polymerase activity; nucleotidyltransferase activity; protein binding; metal ion binding; DNA nucleotidylexotransferase activity; DNA polymerase; DNA polymerase activity;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm; euchromatin; nuclear matrix; cytoplasm; cytosol;
Biological process	DNA metabolic process; DNA biosynthetic process; DNA modification; response to ATP; double-strand break repair via nonhomologous end joining;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1791
	21673
	ENSG00000107447
	ENSMUSG00000025014
	P04053
	P09838
	НМ_001017520 ; НМ_004088
	НМ_001043228 ; НМ_009345
	НП_001017520 ; НП_004079
	НП_001036693 ; НП_033371
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза ( TdT ), также известная как ДНК-нуклеотидилексотрансфераза ( DNTT ) или терминальная трансфераза , представляет собой специализированную ДНК-полимеразу, экспрессируемую в незрелых, пре-B, пре-Т -лимфоидных клетках и клетках острого лимфобластного лейкоза /лимфомы. TdT добавляет N-нуклеотиды к V, D и J экзонам генов TCR и BCR во время рекомбинации генов антител , обеспечивая феномен многообразия соединений . У человека терминальная трансфераза кодируется DNTT геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Являясь членом семейства X ферментов ДНК-полимеразы , он работает совместно с полимеразой λ и полимеразой μ, которые принадлежат к одному и тому же семейству ферментов-полимераз X. Разнообразие, внесенное TdT, сыграло важную роль в эволюции иммунной системы позвоночных, значительно увеличив разнообразие антигенных рецепторов, которыми клетка оснащена для борьбы с патогенами. Исследования с использованием мышей, нокаутных по TdT, обнаружили резкое сокращение (в 10 раз) разнообразия Т-клеточных рецепторов (TCR) по сравнению с таковым в нормальных системах или системах дикого типа. Большее разнообразие TCR, которым оснащен организм, приводит к большей устойчивости к инфекции. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Хотя TdT была одной из первых ДНК-полимераз, идентифицированных у млекопитающих в 1960 году, ^{[ 9 ]} она остается одной из наименее изученных из всех ДНК-полимераз. ^{[ 7 ]} В 2016–2018 годах было обнаружено, что TdT демонстрирует поведение, зависящее от транс- шаблона, в дополнение к более широко известному поведению, независимому от шаблона. ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

TdT отсутствует в ЗКП печени плода , что значительно ухудшает разнообразие соединений в В-клетках в течение эмбрионального периода. ^{[ 12 ]}

Функция и регулирование

Обычно TdT катализирует добавление нуклеотидов к 3'-концу молекулы ДНК . В отличие от большинства ДНК-полимераз, она не требует матрицы. Предпочтительным субстратом этого фермента является 3'-конец , но он также может добавлять нуклеотиды к тупым или утопленным 3'-концам. Кроме того, TdT является единственной полимеразой, которая, как известно, катализирует синтез полимеров ДНК длиной 2–15 нуклеотидов из свободных нуклеотидов в растворе in vivo . ^{[ 13 ]} In vitro такое поведение катализирует общее образование полимеров ДНК без определенной длины. ^{[ 14 ]} Предполагается, что фрагменты ДНК длиной 2–15 нуклеотидов, полученные in vivo, действуют в сигнальных путях, связанных с механизмом репарации и/или рекомбинации ДНК. ^{[ 13 ]} двухвалентного катиона Как и многим полимеразам, TdT требует кофактора . ^{[ 15 ]} однако TdT уникален своей способностью использовать более широкий спектр катионов, таких как мг ²⁺, Мин. ²⁺, Зн ²⁺ и Ко ²⁺. ^{[ 15 ]} Скорость ферментативной активности зависит от доступных двухвалентных катионов и добавляемого нуклеотида. ^{[ 16 ]}

TdT экспрессируется главным образом в первичных лимфоидных органах, таких как тимус и костный мозг. Регуляция его экспрессии происходит несколькими путями. К ним относятся белок-белковые взаимодействия, подобные взаимодействиям с TdIF1. TdIF1 — еще один белок, который взаимодействует с TdT, ингибируя его функцию, маскируя область связывания ДНК полимеразы TdT. Регуляция экспрессии TdT также существует на уровне транскрипции, при этом на регуляцию влияют факторы, специфичные для стадии, и происходит ограничительным образом. ^{[ 7 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} Хотя экспрессия обычно происходит в первичных лимфоидных органах, недавние работы показали, что стимуляция антигеном может привести к вторичной экспрессии TdT наряду с другими ферментами, необходимыми для перестройки генов за пределами тимуса для Т-клеток. ^{[ 19 ]} Пациенты с острым лимфобластным лейкозом значительно перепроизводят TdT. ^{[ 16 ]} Клеточные линии, полученные от этих пациентов, послужили одним из первых источников чистого ТдТ и привели к открытию различий в активности между человеческими и бычьими изоформами. ^{[ 16 ]}

Механизм

Подобно многим полимеразам , каталитический сайт TdT имеет два двухвалентных катиона в своем пальмовом домене, которые способствуют связыванию нуклеотидов, помогают снизить pK _a 3'-OH-группы и, в конечном итоге, облегчают выход образующегося побочного продукта пирофосфата. ^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}

Изоформная вариация

Несколько изоформ TdT наблюдались у мышей, крупного рогатого скота и человека. На сегодняшний день два варианта идентифицированы у мышей, а три — у людей. ^{[ 22 ]}

Два варианта сплайсинга, идентифицированные у мышей, названы в соответствии с их длиной: TdTS состоит из 509 аминокислот, а TdTL, более длинный вариант, состоит из 529 аминокислот. Различия между TdTS и TdTL возникают за пределами областей, связывающих ДНК и нуклеотиды. То, что разница в 20 аминокислот влияет на ферментативную активность, является спорным: некоторые утверждают, что модификации TdTL придают экзонуклеазную активность, в то время как другие утверждают, что TdTL и TdTS имеют почти идентичную in vitro активность . Кроме того, сообщается, что TdTL может модулировать каталитическую активность TdTS in vivo посредством неизвестного механизма. Предполагается, что это помогает регулировать роль TdT в рекомбинации V(D)J. ^{[ 23 ]}

Изоформы TdT человека имеют три варианта TdTL1, TdTL2 и TdTS. TdTL1 широко экспрессируется в линиях лимфоидных клеток, тогда как TdTL2 преимущественно экспрессируется в нормальных малых лимфоцитах. Оба локализуются в ядре при экспрессии ^{[ 24 ]} и оба обладают 3'->5' экзонуклеазной активностью. ^{[ 25 ]} Напротив, изоформы TdTS не обладают экзонуклеазной активностью и осуществляют необходимую элонгацию во время рекомбинации V(D)J. ^{[ 25 ]} Поскольку аналогичная экзонуклеазная активность, предполагаемая в мышином TdTL, обнаружена в TdTL человека и быка, некоторые постулируют, что изоформы TdTL быка и человека регулируют изоформы TdTS таким же образом, как это было предложено у мышей. ^{[ 23 ]} Кроме того, некоторые предполагают, что TdTL1 может участвовать в регуляции активности TdTL2 и/или TdTS.

Роль в рекомбинации V(D)J

Под действием ферментов RAG 1/2 в расщепленной двухцепочечной ДНК остаются шпильковые структуры на конце каждого сегмента ДНК, созданного в результате расщепления. Обе шпильки открываются комплексом Артемиды , который при фосфорилировании обладает эндонуклеазной активностью, обеспечивая свободные 3'-ОН-концы для действия TdT. Как только комплекс Артемиды выполнит свою работу и добавит палиндромные нуклеотиды (P-нуклеотиды) к вновь открытым шпилькам ДНК, все готово для того, чтобы TdT выполнил свою работу. TdT теперь может прийти и добавить N-нуклеотиды к существующим P-нуклеотидам в направлении от 5' к 3', в котором, как известно, функционируют полимеразы. В среднем к каждому 3'-концу, образующемуся в результате действия комплекса Артемиды, добавляются 2-5 случайных пар оснований. Количество добавленных оснований достаточно для того, чтобы два вновь синтезированных сегмента оцДНК подверглись микрогомологическому выравниванию во время негомологичного соединения концов в соответствии с обычными паттернами спаривания оснований Уотсона-Крика (AT, CG). Отсюда неспаренные нуклеотиды вырезаются экзонуклеазой, такой как комплекс Артемида (который обладает экзонуклеазной активностью в дополнение к эндонуклеазной активности), а затем зависимые от матрицы полимеразы могут заполнить пробелы, наконец, создавая новый кодирующий сустав под действием лигазы для объединения сегменты. Хотя TdT не различает четыре пары оснований при добавлении их к N-нуклеотидным сегментам, он продемонстрировал смещение в пользу гуанина и цитозина . пары оснований ^{[ 7 ]}

Зависимая от шаблона активность

TDT связан с тремя нитями ДНК, демонстрируя активную конфигурацию его матрично-зависимого катализа.

В зависимости от матрицы TdT может включать нуклеотиды через разрывы цепей в двухцепочечной ДНК способом, называемым транс, в отличие от механизма in cis , обнаруженного в большинстве полимераз. Оптимально это происходит при разрыве одной пары оснований между нитями и в меньшей степени при увеличении разрыва. Этому способствует участок TdT, называемый Loop1, который выборочно исследует короткие разрывы в двухцепочечной ДНК. Кроме того, открытие этой шаблонно-зависимой активности привело к более убедительным механистическим гипотезам относительно того, как распределение длин добавлений N-областей возникает при рекомбинации V(D)J. ^{[ 26 ]}

Графическая диаграмма, показывающая *зависимую от транс-* матрицы активность терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы. Loop1 выделен красным.

Полимераза μ и полимераза λ проявляют аналогичную синтетическую активность, зависимую от транс -матрицы, что и TdT, но без аналогичной зависимости от нижестоящей двухцепочечной ДНК. ^{[ 27 ]} Кроме того, было обнаружено, что полимераза λ проявляет аналогичную синтетическую активность, независимую от матрицы. Известно, что наряду с активностью терминальной трансферазы он также работает более общим образом, зависящим от шаблона. ^{[ 28 ]} Сходство между TdT и полимеразой μ позволяет предположить, что они тесно связаны эволюционно. ^{[ 26 ]}

Использование

Терминальная трансфераза находит применение в молекулярной биологии . Его можно использовать в RACE для добавления нуклеотидов, которые затем можно использовать в качестве матрицы для праймера в последующей ПЦР . Его также можно использовать для добавления нуклеотидов, меченных изотопами , например, в анализе TUNEL ( терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза d U TP Nick End . радиоактивными L abeling) для демонстрации апоптоза (который частично маркируется фрагментированной ДНК) ). Он также используется в иммунофлуоресцентном анализе для диагностики острого лимфобластного лейкоза . ^{[ 29 ]}

В иммуногистохимии и проточной цитометрии антитела к TdT можно использовать для демонстрации присутствия незрелых Т- и В-клеток и плюрипотентных гемопоэтических стволовых клеток, содержащих антиген, тогда как зрелые лимфоидные клетки всегда TdT-отрицательны. Хотя TdT-положительные клетки обнаруживаются в небольших количествах в здоровых лимфатических узлах и миндалинах, злокачественные клетки острого лимфобластного лейкоза также являются TdT-положительными, и поэтому антитела можно использовать как часть панели для диагностики этого заболевания и диагностики. отличить ее, например, от мелкоклеточных опухолей детского возраста. ^{[ 30 ]}

TdT также недавно нашел применение в синтезе олигонуклеотидов De Novo с привязанными аналогами TdT-dNTP, способными удлинять праймер на 1 нт за раз. ^{[ 31 ]} Другими словами, фермент TdT продемонстрировал способность создавать синтетическую ДНК, добавляя по одной букве к последовательности праймера.

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000107447 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025014 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Изобе М., Хюбнер К., Эриксон Дж., Петерсон Р.К., Боллум Ф.Дж., Чанг Л.М. и др. (сентябрь 1985 г.). «Хромосомная локализация гена терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы человека в области 10q23-q25» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (17): 5836–40. Бибкод : 1985PNAS...82.5836I . дои : 10.1073/pnas.82.17.5836 . ПМК 390648 . ПМИД 3862101 .
^ Ян-Фенг Т.Л., Ландау Н.Р., Балтимор Д., Франк У (1986). «Ген терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы расположен на хромосоме 10 человека (10q23----q24) и на хромосоме 19 мыши». Цитогенетика и клеточная генетика . 43 (3–4): 121–6. дои : 10.1159/000132309 . ПМИД 3467897 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Мотеа Э.А., Бердис А.Дж. (май 2010 г.). «Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза: история ошибочной ДНК-полимеразы» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1804 (5): 1151–66. дои : 10.1016/j.bbapap.2009.06.030 . ПМК 2846215 . ПМИД 19596089 .
^ Хайфар С.М., Хикман Х.Д., Ирвин К.Р., Чарке Д.С., Беннинк Дж.Р., Юделл Дж.В. (июль 2008 г.). «Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза устанавливает и расширяет иерархию иммунодоминирования противовирусных CD8+ Т-клеток» . Журнал иммунологии . 181 (1): 649–59. дои : 10.4049/jimmunol.181.1.649 . ПМЦ 2587314 . ПМИД 18566432 .
^ Боллум Ф.Дж. (август 1960 г.). «Полимераза тимуса теленка» . Журнал биологической химии . 235 (8): 2399–403. дои : 10.1016/S0021-9258(18)64634-4 . ПМИД 13802334 .
^ Гуж Дж., Розарио С., Ромен Ф., Пуатвен Ф., Беген П., Деларю М. (апрель 2015 г.). «Структурная основа нового механизма соединения и выравнивания ДНК при репарации ДНК эукариот DSB» . Журнал ЭМБО . 34 (8): 1126–42. дои : 10.15252/embj.201489643 . ПМК 4406656 . ПМИД 25762590 .
^ Лок Дж., Деларю М. (декабрь 2018 г.). «Концевая дезоксинуклеотидилтрансфераза: история нешаблонной ДНК-полимеразы, способной образовывать мостики ДНК и матричный синтез между цепями» (PDF) . Современное мнение в области структурной биологии . 53 : 22–31. дои : 10.1016/j.sbi.2018.03.019 . ПМИД 29656238 . S2CID 4882661 .
^ Харди Р. (2008). «Глава 7: Развитие и биология B-лимфоцитов». В Поле В. (ред.). Фундаментальная иммунология (книга) (6-е изд.). Филадельфия: Липпинкотт Уильямс и Уилкинс. стр. 237–269. ISBN 978-0-7817-6519-0 .
^ Jump up to: ^а ^б Рамадан К., Шевелев И.В., Мага Г., Хюбшер У (май 2004 г.). «Синтез ДНК de novo с помощью ДНК-полимеразы человека лямбда, ДНК-полимеразы мю и терминальной дезоксирибонуклеотидилтрансферазы». Журнал молекулярной биологии . 339 (2): 395–404. дои : 10.1016/j.jmb.2004.03.056 . ПМИД 15136041 .
^ Боллум Ф.Дж., Чанг Л.М., Циапалис С.М., Дорсон Дж.В. (1974). «[8] Ферменты, полимеризующие нуклеотиды, из вилочковой железы теленка». Ферменты, полимеризующие нуклеотиды из вилочковой железы теленка . Методы энзимологии. Том. 29. С. 70–81. дои : 10.1016/0076-6879(74)29010-4 . ISBN 9780121818920 . ПМИД 4853390 .
^ Jump up to: ^а ^б Чанг Л.М., Боллум Ф.Дж. (апрель 1970 г.). «Доксинуклеотид-полимеризующие ферменты вилочковой железы теленка. IV. Ингибирование терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы металлическими лигандами» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 65 (4): 1041–8. Бибкод : 1970PNAS...65.1041C . дои : 10.1073/pnas.65.4.1041 . ПМК 283020 . ПМИД 4985880 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Дейбель М.Р., Коулман М.С. (май 1980 г.). «Биохимические свойства очищенной терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы человека» . Журнал биологической химии . 255 (9): 4206–12. дои : 10.1016/S0021-9258(19)85653-3 . ПМИД 7372675 .
^ Черрье М., Д'Андон М.Ф., Ружон Ф., Дуайен Н. (февраль 2008 г.). «Идентификация нового цис-регуляторного элемента терминального гена дезоксинуклеотидилтрансферазы в 5'-области мышиного локуса». Молекулярная иммунология . 45 (4): 1009–17. дои : 10.1016/j.molimm.2007.07.027 . ПМИД 17854898 .
^ Кубота Т., Маэдзава С., Койвай К., Хаяно Т., Койвай О. (август 2007 г.). «Идентификация функциональных доменов в TdIF1 и его механизм ингибирования активности TdT» . Гены в клетки . 12 (8): 941–59. дои : 10.1111/j.1365-2443.2007.01105.x . ПМИД 17663723 . S2CID 25530793 .
^ Чжан Ю, Ши М, Вэнь Ц, Луо В, Ян Цз, Чжоу М и др. (01.01.2012). «Антигенная стимуляция индуцирует рекомбинационную активацию гена 1 и экспрессию терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы в мышиной Т-клеточной гибридоме». Клеточная иммунология . 274 (1–2): 19–25. дои : 10.1016/j.cellimm.2012.02.008 . ПМИД 22464913 .
^ Вашиштха А.К., Ван Дж., Кенигсберг WH (сентябрь 2016 г.). «Различные двухвалентные катионы изменяют кинетику и точность ДНК-полимераз» . Журнал биологической химии . 291 (40): 20869–20875. дои : 10.1074/jbc.R116.742494 . ПМК 5076500 . ПМИД 27462081 .
^ Деларю М., Буле Ж.Б., Лескар Дж., Эксперт-Безансон Н., Журдан Н., Сукумар Н. и др. (февраль 2002 г.). «Кристаллические структуры независимой от матрицы ДНК-полимеразы: мышиная концевая дезоксинуклеотидилтрансфераза» . Журнал ЭМБО . 21 (3): 427–39. дои : 10.1093/emboj/21.3.427 . ПМЦ 125842 . ПМИД 11823435 . {{cite journal}}: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )
^ Стинберг М.Л., Локхандвала М.Ф., Джандхьяла Б.С. (1988). «Нарушения транспорта натрия как причинный фактор усиленного перелива норадреналина у крыс со спонтанной гипертензией». Клиническая и экспериментальная гипертония, Часть А. 10 (5): 833–41. дои : 10.1080/07300077.1988.11878788 . ПМИД 2846215 .
^ Jump up to: ^а ^б Шмольдт А., Бенте Х.Ф., Хаберланд Г. (сентябрь 1975 г.). «Метаболизм дигитоксина микросомами печени крысы» . Биохимическая фармакология . 24 (17): 1639–41. дои : 10.1016/0006-2952(75)90094-5 . hdl : 10033/333424 . ПМИД 10 .
^ Тайский TH, Кирни Дж. Ф. (сентябрь 2004 г.). «Различные и противоположные активности сплайсинговых вариантов терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы человека» . Журнал иммунологии . 173 (6): 4009–19. doi : 10.4049/jimmunol.173.6.4009 . ПМИД 15356150 . S2CID 40193319 .
^ Jump up to: ^а ^б Тайский TH, Кирни Дж. Ф. (2005). Изоформы терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы: аспекты развития и функции . Достижения иммунологии. Том. 86. стр. 113–36. дои : 10.1016/S0065-2776(04)86003-6 . ISBN 9780120044863 . ПМИД 15705420 .
^ Jump up to: ^а ^б Бланд Р.Д., Кларк Т.Л., Харден Л.Б. (февраль 1976 г.). «Быстрая инфузия бикарбоната натрия и альбумина недоношенным детям из группы высокого риска вскоре после рождения: контролируемое проспективное исследование». Американский журнал акушерства и гинекологии . 124 (3): 263–7. дои : 10.1016/0002-9378(76)90154-x . ПМИД 2013 .
^ Мартин М.Дж., Бланко Л. (июль 2014 г.). «Принятие решений во время NHEJ: сеть взаимодействий в Polμ человека, вовлеченная в распознавание субстрата и соединение концов» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (12): 7923–34. дои : 10.1093/nar/gku475 . ПМК 4081086 . ПМИД 24878922 .
^ Мага Г., Рамадан К., Локателли Г.А., Шевелев И., Спадари С., Хюбшер У. (январь 2005 г.). «Удлинение ДНК под действием лямбда-полимеразы ДНК человека и активность терминальной трансферазы по-разному координируются пролиферирующим клеточным ядерным антигеном и репликационным белком А» . Журнал биологической химии . 280 (3): 1971–81. дои : 10.1074/jbc.M411650200 . ПМИД 15537631 . S2CID 43322190 .
^ Фабер Дж., Кантарджян Х., Робертс М.В., Китинг М., Фрейрих Э., Альбитар М. (январь 2000 г.). «Терминальный дезоксинуклеотидилтрансферазно-отрицательный острый лимфобластный лейкоз». Архивы патологии и лабораторной медицины . 124 (1): 92–7. дои : 10.5858/2000-124-0092-TDTNAL . ПМИД 10629138 .
^ Леонг А.С., Купер К., Леонг Ф.Дж. (2003). Руководство по диагностической цитологии (2-е изд.). Greenwich Medical Media, Ltd., стр. 413–414. ISBN 1-84110-100-1 .
^ Паллюк С., Арлоу Д.Х., де Ронд Т., Бартел С., Канг Дж.С., Бектор Р. и др. (август 2018 г.). «Синтез ДНК de novo с использованием полимеразно-нуклеотидных конъюгатов» . Природная биотехнология . 36 (7): 645–650. дои : 10.1038/nbt.4173 . ОСТИ 1461176 . ПМИД 29912208 . S2CID 49271982 .

Дальнейшее чтение

О'Мэлли Д.П., Орази А. (август 2006 г.). «Терминальные дезоксинуклеотидилтрансферазо-положительные клетки в селезенке, аппендиксе и кистах жаберной щели у педиатрических пациентов». Гематологическая . 91 (8): 1139–40. ПМИД 16885057 .
Ямасита Н., Симадзаки Н., Ибе С., Канеко Р., Танабэ А., Тойомото Т. и др. (июль 2001 г.). «Концевая дезоксинуклеотидилтрансфераза напрямую взаимодействует с новым ядерным белком, гомологичным p65». Гены в клетки . 6 (7): 641–52. дои : 10.1046/j.1365-2443.2001.00449.x . ПМИД 11473582 . S2CID 19573920 . {{cite journal}}: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )
Чанг Л.М., Боллум Ф.Дж. (1986). «Молекулярная биология терминальной трансферазы». Критические обзоры CRC по биохимии . 21 (1): 27–52. дои : 10.3109/10409238609113608 . ПМИД 3524991 .
Маэзава С., Хаяно Т., Койвай К., Фукусима Р., Куда К., Кубота Т. и др. (май 2008 г.). «Bood POZ, содержащий ген типа 2, является человеческим аналогом дрожжевого Btb3p и способствует деградации терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы» . Гены в клетки . 13 (5): 439–57. дои : 10.1111/j.1365-2443.2008.01179.x . ПМИД 18429817 . S2CID 9698107 .
Таплин М.Е., Франц М.Е., Каннинг С., Ритц Дж., Блумберг Р.С., Балк С.П. (март 1996 г.). «Доказательства против развития Т-клеток в слизистой оболочке кишечника взрослого человека, основанные на отсутствии экспрессии терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы» . Иммунология . 87 (3): 402–7. дои : 10.1046/j.1365-2567.1996.496571.x . ПМК 1384108 . ПМИД 8778025 .
Группа А, Ли Ю, Роуленд С, Новотны П., Хинрикс А.Л., Смемо С. и др. (январь 2006 г.). «Сканирование хромосомы 10 идентифицирует новый локус, показывающий сильную связь с болезнью Альцгеймера с поздним началом» . Американский журнал генетики человека . 78 (1): 78–88. дои : 10.1086/498851 . ПМК 1380225 . ПМИД 16385451 . {{cite journal}}: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )
Дворжак М.Н., Фрич Г., Фрёшль Г., Принц Д., Гаднер Х. (ноябрь 1998 г.). «Четырехцветное проточно-цитометрическое исследование терминальных дезоксинуклеотидилтрансфераз-положительных лимфоидных предшественников в детском костном мозге: экспрессия CD79a предшествует CD19 в раннем онтогенезе B-клеток». Кровь . 92 (9): 3203–9. дои : 10.1182/blood.V92.9.3203 . ПМИД 9787156 .
Фудзита К., Симадзаки Н., Охта Й., Кубота Т., Ибе С., Тодзи С. и др. (июнь 2003 г.). «Концевая дезоксинуклеотидилтрансфераза образует тройной комплекс с новым белком ремоделирования хроматина массой 82 кДа и коровым гистоном» . Гены в клетки . 8 (6): 559–71. дои : 10.1046/j.1365-2443.2003.00656.x . ПМИД 12786946 . S2CID 25223336 . {{cite journal}}: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )
Кубота Т., Маэдзава С., Койвай К., Хаяно Т., Койвай О. (август 2007 г.). «Идентификация функциональных доменов в TdIF1 и его механизм ингибирования активности TdT» . Гены в клетки . 12 (8): 941–59. дои : 10.1111/j.1365-2443.2007.01105.x . ПМИД 17663723 . S2CID 25530793 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Бриджес С.Л. (август 1998 г.). «Частое добавление N и клональное родство среди легких цепей лямбда иммуноглобулина, экспрессируемых в синовиальных оболочках и PBL при ревматоидном артрите, а также влияние использования сегмента гена V лямбда на длину CDR3» . Молекулярная медицина . 4 (8): 525–53. дои : 10.1007/BF03401757 . ПМК 2230400 . ПМИД 9742508 .
Лю Л., МакГавран Л., Ловелл М.А., Вэй Кью, Джеймисон Б.А., Уильямс С.А. и др. (июнь 2004 г.). «Неположительная терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза при педиатрическом предшественнике B-лимфобластного лейкоза» . Американский журнал клинической патологии . 121 (6): 810–5. doi : 10.1309/QD18-PPV1-NH3T-EUTF . ПМИД 15198352 . {{cite journal}}: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )
Ян Б., Гэти К.Н., Коулман М.С. (апрель 1994 г.). «Мутационный анализ остатков в нуклеотидсвязывающем домене терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы человека» . Журнал биологической химии . 269 (16): 11859–68. дои : 10.1016/S0021-9258(17)32652-2 . ПМИД 8163485 .
Тайский TH, Кирни Дж. Ф. (сентябрь 2004 г.). «Различные и противоположные активности сплайсинговых вариантов терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы человека» . Журнал иммунологии . 173 (6): 4009–19. doi : 10.4049/jimmunol.173.6.4009 . ПМИД 15356150 . S2CID 40193319 .
Симадзаки Н., Фудзита К., Койвай О. (март 2002 г.). «[Экспрессия и функция терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы и открытие новой ДНК-полимеразы мю]». Сэйкагаку. Журнал Японского биохимического общества . 74 (3): 227–32. ПМИД 11974916 .
Махаджан К.Н., Митчелл Б.С. (сентябрь 2003 г.). «Роль человеческого Pso4 в репарации ДНК млекопитающих и ассоциации с терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазой» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (19): 10746–51. Бибкод : 2003PNAS..10010746M . дои : 10.1073/pnas.1631060100 . ЧВК 196874 . ПМИД 12960389 .
Махаджан К.Н., Ганги-Петерсон Л., Соршер Д.Х., Ван Дж., Гати К.Н., Махаджан Н.П. и др. (ноябрь 1999 г.). «Ассоциация терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы с Ku» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (24): 13926–31. Бибкод : 1999PNAS...9613926M . дои : 10.1073/pnas.96.24.13926 . ПМК 24167 . ПМИД 10570175 . {{cite journal}}: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )
Ибе С., Фудзита К., Тойомото Т., Симадзаки Н., Канеко Р., Танабэ А. и др. (сентябрь 2001 г.). «Концевая дезоксинуклеотидилтрансфераза отрицательно регулируется путем прямого взаимодействия с ядерным антигеном пролиферирующей клетки» . Гены в клетки . 6 (9): 815–24. дои : 10.1046/j.1365-2443.2001.00460.x . ПМИД 11554927 . S2CID 19287230 . {{cite journal}}: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )

Внешние ссылки

Терминальная + дезоксирибонуклеотидилтрансфераза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000107447 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025014 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid3862101-5] Изобе М., Хюбнер К., Эриксон Дж., Петерсон Р.К., Боллум Ф.Дж., Чанг Л.М. и др. (сентябрь 1985 г.). «Хромосомная локализация гена терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы человека в области 10q23-q25» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (17): 5836–40. Бибкод : 1985PNAS...82.5836I . дои : 10.1073/pnas.82.17.5836 . ПМК 390648 . ПМИД 3862101 .

[pmid3467897-6] Ян-Фенг Т.Л., Ландау Н.Р., Балтимор Д., Франк У (1986). «Ген терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы расположен на хромосоме 10 человека (10q23----q24) и на хромосоме 19 мыши». Цитогенетика и клеточная генетика . 43 (3–4): 121–6. дои : 10.1159/000132309 . ПМИД 3467897 .

[pmid19596089-7] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Мотеа Э.А., Бердис А.Дж. (май 2010 г.). «Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза: история ошибочной ДНК-полимеразы» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1804 (5): 1151–66. дои : 10.1016/j.bbapap.2009.06.030 . ПМК 2846215 . ПМИД 19596089 .

[8] Хайфар С.М., Хикман Х.Д., Ирвин К.Р., Чарке Д.С., Беннинк Дж.Р., Юделл Дж.В. (июль 2008 г.). «Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза устанавливает и расширяет иерархию иммунодоминирования противовирусных CD8+ Т-клеток» . Журнал иммунологии . 181 (1): 649–59. дои : 10.4049/jimmunol.181.1.649 . ПМЦ 2587314 . ПМИД 18566432 .

[pmid13802334-9] Боллум Ф.Дж. (август 1960 г.). «Полимераза тимуса теленка» . Журнал биологической химии . 235 (8): 2399–403. дои : 10.1016/S0021-9258(18)64634-4 . ПМИД 13802334 .

[pmid25762590-10] Гуж Дж., Розарио С., Ромен Ф., Пуатвен Ф., Беген П., Деларю М. (апрель 2015 г.). «Структурная основа нового механизма соединения и выравнивания ДНК при репарации ДНК эукариот DSB» . Журнал ЭМБО . 34 (8): 1126–42. дои : 10.15252/embj.201489643 . ПМК 4406656 . ПМИД 25762590 .

[pmid29656238-11] Лок Дж., Деларю М. (декабрь 2018 г.). «Концевая дезоксинуклеотидилтрансфераза: история нешаблонной ДНК-полимеразы, способной образовывать мостики ДНК и матричный синтез между цепями» (PDF) . Современное мнение в области структурной биологии . 53 : 22–31. дои : 10.1016/j.sbi.2018.03.019 . ПМИД 29656238 . S2CID 4882661 .

[Paul0807-12] Харди Р. (2008). «Глава 7: Развитие и биология B-лимфоцитов». В Поле В. (ред.). Фундаментальная иммунология (книга) (6-е изд.). Филадельфия: Липпинкотт Уильямс и Уилкинс. стр. 237–269. ISBN 978-0-7817-6519-0 .

[pmid15136041-13] Jump up to: ^а ^б Рамадан К., Шевелев И.В., Мага Г., Хюбшер У (май 2004 г.). «Синтез ДНК de novo с помощью ДНК-полимеразы человека лямбда, ДНК-полимеразы мю и терминальной дезоксирибонуклеотидилтрансферазы». Журнал молекулярной биологии . 339 (2): 395–404. дои : 10.1016/j.jmb.2004.03.056 . ПМИД 15136041 .

[pmid4853390-14] Боллум Ф.Дж., Чанг Л.М., Циапалис С.М., Дорсон Дж.В. (1974). «[8] Ферменты, полимеризующие нуклеотиды, из вилочковой железы теленка». Ферменты, полимеризующие нуклеотиды из вилочковой железы теленка . Методы энзимологии. Том. 29. С. 70–81. дои : 10.1016/0076-6879(74)29010-4 . ISBN 9780121818920 . ПМИД 4853390 .

[pmid4985880-15] Jump up to: ^а ^б Чанг Л.М., Боллум Ф.Дж. (апрель 1970 г.). «Доксинуклеотид-полимеризующие ферменты вилочковой железы теленка. IV. Ингибирование терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы металлическими лигандами» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 65 (4): 1041–8. Бибкод : 1970PNAS...65.1041C . дои : 10.1073/pnas.65.4.1041 . ПМК 283020 . ПМИД 4985880 .

[pmid7372675-16] Jump up to: ^а ^б ^с Дейбель М.Р., Коулман М.С. (май 1980 г.). «Биохимические свойства очищенной терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы человека» . Журнал биологической химии . 255 (9): 4206–12. дои : 10.1016/S0021-9258(19)85653-3 . ПМИД 7372675 .

[17] Черрье М., Д'Андон М.Ф., Ружон Ф., Дуайен Н. (февраль 2008 г.). «Идентификация нового цис-регуляторного элемента терминального гена дезоксинуклеотидилтрансферазы в 5'-области мышиного локуса». Молекулярная иммунология . 45 (4): 1009–17. дои : 10.1016/j.molimm.2007.07.027 . ПМИД 17854898 .

[18] Кубота Т., Маэдзава С., Койвай К., Хаяно Т., Койвай О. (август 2007 г.). «Идентификация функциональных доменов в TdIF1 и его механизм ингибирования активности TdT» . Гены в клетки . 12 (8): 941–59. дои : 10.1111/j.1365-2443.2007.01105.x . ПМИД 17663723 . S2CID 25530793 .

[19] Чжан Ю, Ши М, Вэнь Ц, Луо В, Ян Цз, Чжоу М и др. (01.01.2012). «Антигенная стимуляция индуцирует рекомбинационную активацию гена 1 и экспрессию терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы в мышиной Т-клеточной гибридоме». Клеточная иммунология . 274 (1–2): 19–25. дои : 10.1016/j.cellimm.2012.02.008 . ПМИД 22464913 .

[pmid27462081-20] Вашиштха А.К., Ван Дж., Кенигсберг WH (сентябрь 2016 г.). «Различные двухвалентные катионы изменяют кинетику и точность ДНК-полимераз» . Журнал биологической химии . 291 (40): 20869–20875. дои : 10.1074/jbc.R116.742494 . ПМК 5076500 . ПМИД 27462081 .

[pmid11823435-21] Деларю М., Буле Ж.Б., Лескар Дж., Эксперт-Безансон Н., Журдан Н., Сукумар Н. и др. (февраль 2002 г.). «Кристаллические структуры независимой от матрицы ДНК-полимеразы: мышиная концевая дезоксинуклеотидилтрансфераза» . Журнал ЭМБО . 21 (3): 427–39. дои : 10.1093/emboj/21.3.427 . ПМЦ 125842 . ПМИД 11823435 . {{cite journal}}: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )

[pmid2846215-22] Стинберг М.Л., Локхандвала М.Ф., Джандхьяла Б.С. (1988). «Нарушения транспорта натрия как причинный фактор усиленного перелива норадреналина у крыс со спонтанной гипертензией». Клиническая и экспериментальная гипертония, Часть А. 10 (5): 833–41. дои : 10.1080/07300077.1988.11878788 . ПМИД 2846215 .

[Schmoldt_1975-23] Jump up to: ^а ^б Шмольдт А., Бенте Х.Ф., Хаберланд Г. (сентябрь 1975 г.). «Метаболизм дигитоксина микросомами печени крысы» . Биохимическая фармакология . 24 (17): 1639–41. дои : 10.1016/0006-2952(75)90094-5 . hdl : 10033/333424 . ПМИД 10 .

[pmid15356150-24] Тайский TH, Кирни Дж. Ф. (сентябрь 2004 г.). «Различные и противоположные активности сплайсинговых вариантов терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы человека» . Журнал иммунологии . 173 (6): 4009–19. doi : 10.4049/jimmunol.173.6.4009 . ПМИД 15356150 . S2CID 40193319 .

[pmid15705420-25] Jump up to: ^а ^б Тайский TH, Кирни Дж. Ф. (2005). Изоформы терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы: аспекты развития и функции . Достижения иммунологии. Том. 86. стр. 113–36. дои : 10.1016/S0065-2776(04)86003-6 . ISBN 9780120044863 . ПМИД 15705420 .

[Bland_1976-26] Jump up to: ^а ^б Бланд Р.Д., Кларк Т.Л., Харден Л.Б. (февраль 1976 г.). «Быстрая инфузия бикарбоната натрия и альбумина недоношенным детям из группы высокого риска вскоре после рождения: контролируемое проспективное исследование». Американский журнал акушерства и гинекологии . 124 (3): 263–7. дои : 10.1016/0002-9378(76)90154-x . ПМИД 2013 .

[pmid24878922-27] Мартин М.Дж., Бланко Л. (июль 2014 г.). «Принятие решений во время NHEJ: сеть взаимодействий в Polμ человека, вовлеченная в распознавание субстрата и соединение концов» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (12): 7923–34. дои : 10.1093/nar/gku475 . ПМК 4081086 . ПМИД 24878922 .

[28] Мага Г., Рамадан К., Локателли Г.А., Шевелев И., Спадари С., Хюбшер У. (январь 2005 г.). «Удлинение ДНК под действием лямбда-полимеразы ДНК человека и активность терминальной трансферазы по-разному координируются пролиферирующим клеточным ядерным антигеном и репликационным белком А» . Журнал биологической химии . 280 (3): 1971–81. дои : 10.1074/jbc.M411650200 . ПМИД 15537631 . S2CID 43322190 .

[pmid10629138-29] Фабер Дж., Кантарджян Х., Робертс М.В., Китинг М., Фрейрих Э., Альбитар М. (январь 2000 г.). «Терминальный дезоксинуклеотидилтрансферазно-отрицательный острый лимфобластный лейкоз». Архивы патологии и лабораторной медицины . 124 (1): 92–7. дои : 10.5858/2000-124-0092-TDTNAL . ПМИД 10629138 .

[Leong-30] Леонг А.С., Купер К., Леонг Ф.Дж. (2003). Руководство по диагностической цитологии (2-е изд.). Greenwich Medical Media, Ltd., стр. 413–414. ISBN 1-84110-100-1 .

[pmid29912208-31] Паллюк С., Арлоу Д.Х., де Ронд Т., Бартел С., Канг Дж.С., Бектор Р. и др. (август 2018 г.). «Синтез ДНК de novo с использованием полимеразно-нуклеотидных конъюгатов» . Природная биотехнология . 36 (7): 645–650. дои : 10.1038/nbt.4173 . ОСТИ 1461176 . ПМИД 29912208 . S2CID 49271982 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)