ПОЛК

ПОЛК
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4X0P, 4X0Q, 5AGA, 5A9J, 5A9F
Идентификаторы
Псевдонимы	POLQ , POLH, PRO0327, полимераза (ДНК) тета, ДНК-полимераза тета, ДНК-полимераза θ
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604419 ; МГИ : 2155399 ; Гомологен : 32727 ; GeneCards : POLQ ; OMA : POLQ — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	121,545,988 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	36,915,779 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; testicle; ; ventricular zone; ; bone marrow; ; ganglionic eminence; ; bone marrow cells; ; trabecular bone; ; stromal cell of endometrium; ; mucosa of transverse colon; ; gingival epithelium;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; morula; ; spermatocyte; ; ventricular zone; ; yolk sac; ; embryo; ; zygote; ; blastocyst; ; secondary oocyte;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; DNA binding; nucleotidyltransferase activity; single-stranded DNA helicase activity; 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity; chromatin binding; damaged DNA binding; protein binding; nucleic acid binding; DNA-directed DNA polymerase activity; ATP binding; 5'-3' exonuclease activity; identical protein binding;
Cellular component	nucleoplasm; chromosome; nucleus; cytoplasm;
Biological process	somatic hypermutation of immunoglobulin genes; negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination; double-strand break repair via alternative nonhomologous end joining; cellular response to DNA damage stimulus; DNA replication; double-strand break repair via homologous recombination; protein homooligomerization; DNA repair; base-excision repair; DNA biosynthetic process; double-strand break repair; DNA-dependent DNA replication; nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10721
	77782
	ENSG00000051341
	ENSMUSG00000034206
	О75417
	Q8CGS6
	НМ_199420 ; НМ_006596
	НМ_001159369 ; НМ_029977
	НП_955452
	НП_001152841 ; НП_084253
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

ДНК-полимераза тета — это фермент , который у человека кодируется POLQ геном . ^[5]^[6] Эта полимераза играет ключевую роль в одном из трех основных путей восстановления двухцепочечных разрывов: тета-опосредованном соединении концов (TMEJ). ^[7]^[8]^[9]^[10] Большинство двухцепочечных разрывов восстанавливаются путем негомологичного соединения концов (NHEJ) или репарации, направленной на гомологию (HDR). Однако в некоторых случаях NHEJ и HR недостаточны, и TMEJ является единственным решением, позволяющим исправить ситуацию. ^[11] TMEJ часто называют альтернативным NHEJ, но он отличается тем, что ему не нужен гетеродимер Ku , и он может действовать только на резецированные концы ДНК. ^[12] После отжига коротких (т.е. нескольких нуклеотидов) участков на выступах ДНК ДНК-полимераза тета катализирует зависимый от матрицы синтез ДНК через разорванные концы, стабилизируя парную структуру. ^[13]^[14]

Мутационная подпись тета-полимеразы

TMEJ по своей сути является мутагенным , поскольку тета-полимераза использует гомологичные нуклеотиды с обоих концов разрыва для инициации репарации, что приводит к потере одного набора этих нуклеотидов в последовательности ДНК. Таким образом, TMEJ представляет собой форму соединения концов, опосредованного микрогомологией (MMEJ). Более того, если концы разрывов не стабилизированы должным образом, они могут отсоединиться после полимеризации. шаблонная вставка . Когда эти полимеризованные концы снова отжигаются, между делеционными соединениями возникает ^[15]

Обратная транскрипция РНК

Polθ способствует восстановлению ДНК с помощью матрицы РНК . Ранее долгое время считалось, что ДНК-полимеразы способны только транскрибировать ДНК в ДНК или РНК и не способны записывать РНК сегменты в ДНК . ^[16]^[17]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000051341 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034206 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Шариф Ф.С., Войта П.Дж., Ропп П.А., Коупленд У.К. (июль 1999 г.). «Клонирование и хромосомное картирование тета-полимеразы ДНК человека (POLQ), восьмой ДНК-полимеразы человека». Геномика . 59 (1): 90–6. дои : 10.1006/geno.1999.5843 . ПМИД 10395804 .
^ «Ген Энтрез: полимераза POLQ (ДНК-направленная), тета» .
^ Чан Ш., Ю А.М., Маквей М. (июль 2010 г.). «Двойная роль тета-ДНК-полимеразы в альтернативном соединении концов двухцепочечных разрывов у дрозофилы» . ПЛОС Генетика . 6 (7): е1001005. дои : 10.1371/journal.pgen.1001005 . ПМЦ 2895639 . ПМИД 20617203 .
^ Ю А.М., Маквей М. (сентябрь 2010 г.). «Зависимое от синтеза соединение концов, опосредованное микрогомологией, объясняет несколько типов ремонтных соединений» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (17): 5706–17. дои : 10.1093/nar/gkq379 . ПМЦ 2943611 . ПМИД 20460465 .
^ Кул В., ван Шендел Р., Карамбелас А.Е., ван Хетерен Дж.Т., Окихара К.Л., Тейстерман М. (05 февраля 2014 г.). «Тета-зависимый путь восстановления полимеразы подавляет обширную геномную нестабильность в эндогенных участках ДНК G4» . Природные коммуникации . 5 (1): 3216. Бибкод : 2014NatCo...5.3216K . дои : 10.1038/ncomms4216 . ПМИД 24496117 .
^ Реринк С.Ф., ван Шендель Р., Тейстерман М. (июнь 2014 г.). «Тета-опосредованное полимеразой соединение концов связанных с репликацией разрывов ДНК у C. elegans» . Геномные исследования . 24 (6): 954–62. дои : 10.1101/гр.170431.113 . ПМК 4032859 . ПМИД 24614976 .
^ Шиммель Дж., ван Шендель Р., ден Даннен Дж. Т., Тийстерман М. (сентябрь 2019 г.). «Шаблонные вставки: дымящийся пистолет для тета-опосредованного полимеразным соединением концов». Тенденции в генетике . 35 (9): 632–644. дои : 10.1016/j.tig.2019.06.001 . ПМИД 31296341 . S2CID 195892718 .
^ Юсефзаде М.Дж., Вятт Д.В., Таката К., Му Ю., Хенсли С.С., Томида Дж. и др. (октябрь 2014 г.). «Механизм подавления хромосомной нестабильности ДНК-полимеразой POLQ» . ПЛОС Генетика . 10 (10): e1004654. дои : 10.1371/journal.pgen.1004654 . ПМЦ 4183433 . ПМИД 25275444 .
^ Матеос-Гомес П.А., Гонг Ф., Наир Н., Миллер К.М., Лаззерини-Денчи Э., Сфейр А. (февраль 2015 г.). «Полимераза θ млекопитающих способствует альтернативному NHEJ и подавляет рекомбинацию» . Природа . 518 (7538): 254–7. Бибкод : 2015Natur.518..254M . дои : 10.1038/nature14157 . ПМЦ 4718306 . ПМИД 25642960 .
^ Чекальди Р., Лю Дж.К., Амунугама Р., Хайду И., Примак Б., Петалкорин М.И. и др. (февраль 2015 г.). «Опухоли с дефицитом гомологичной рекомбинации зависят от восстановления, опосредованного Polθ» . Природа . 518 (7538): 258–62. Бибкод : 2015Natur.518..258C . дои : 10.1038/nature14184 . ПМК 4415602 . ПМИД 25642963 .
^ Шиммель Дж., ван Шендель Р., ден Даннен Дж. Т., Тийстерман М. (сентябрь 2019 г.). «Шаблонные вставки: дымящийся пистолет для тета-опосредованного полимеразным соединением концов». Тенденции в генетике . 35 (9): 632–644. дои : 10.1016/j.tig.2019.06.001 . ПМИД 31296341 . S2CID 195892718 .
^ «Новое открытие показывает, что клетки человека могут записывать последовательности РНК в ДНК» . физ.орг . Проверено 10 июля 2021 г.
^ Чандрамули Г., Чжао Дж., Макдевитт С., Русанов Т., Хоанг Т., Борисонник Н. и др. (июнь 2021 г.). «Polθ обратно транскрибирует РНК и способствует репарации ДНК с помощью матрицы РНК» . Достижения науки . 7 (24): eabf1 Бибкод : 2021SciA....7.1771C . дои : 10.1126/sciadv.abf1771 . ПМЦ 8195485 . ПМИД 34117057 .

Дальнейшее чтение

Хогг М., Зауэр-Эрикссон А.Е., Йоханссон Э. (март 2012 г.). «Беспорядочный синтез ДНК с помощью ДНК-полимеразы θ человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (6): 2611–22. дои : 10.1093/nar/gkr1102 . ПМК 3315306 . ПМИД 22135286 .
Робертсон Н.Г., Хетарпал У., Гутьеррес-Эспелета Г.А., Бибер Ф.Р., Мортон CC (сентябрь 1994 г.). «Выделение новых и известных генов из библиотеки кДНК улитки плода человека с использованием субтрактивной гибридизации и дифференциального скрининга». Геномика . 23 (1): 42–50. дои : 10.1006/geno.1994.1457 . ПМИД 7829101 .
Мага Г, Шевелев И, Рамадан К, Спадари С, Хюбшер У (май 2002 г.). «ДНК-полимераза тета, очищенная из клеток человека, представляет собой высокоточный фермент». Журнал молекулярной биологии . 319 (2): 359–69. дои : 10.1016/S0022-2836(02)00325-X . ПМИД 12051913 .
Секи М., Марини Ф., Вуд Р.Д. (ноябрь 2003 г.). «POLQ (Pol theta), ДНК-полимераза и ДНК-зависимая АТФаза в клетках человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (21): 6117–26. дои : 10.1093/нар/gkg814 . ПМК 275456 . ПМИД 14576298 .
Кавамура К., Бахар Р., Сеймия М., Чиё М., Вада А., Окада С. и др. (март 2004 г.). «ДНК-полимераза тета преимущественно экспрессируется в лимфоидных тканях и активируется при раке человека». Международный журнал рака . 109 (1): 9–16. дои : 10.1002/ijc.11666 . ПМИД 14735462 . S2CID 19912440 .
Сузуки Ю., Ямашита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж. и др. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши обнаруживает гомологичную блочную структуру в областях промотора» . Геномные исследования . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604 . ПМК 515316 . ПМИД 15342556 .
Секи М., Масутани С., Ян Л.В., Шуфферт А., Иваи С., Бахар И., Вуд Р.Д. (ноябрь 2004 г.). «Высокоэффективный обход повреждений ДНК ДНК-полимеразой Q человека» . Журнал ЭМБО . 23 (22): 4484–94. дои : 10.1038/sj.emboj.7600424 . ПМК 526458 . ПМИД 15496986 .
Чиапперино Д., Кай М., Сайер Дж.М., Яги Х., Крот Х., Масутани С. и др. (декабрь 2005 г.). «Склонный к ошибкам синтез транслейкоза с помощью ДНК-полимеразы человека эта на ДНК-содержащих дезоксиаденозиновых аддуктах 7,8-дигидрокси-9,10-эпокси-7,8,9,10-тетрагидробензо[а]пирена» . Журнал биологической химии . 280 (48): 39684–92. дои : 10.1074/jbc.M508008200 . PMID 16188888 .
Зан Х., Шима Н., Сюй З., Аль-Кахтани А., Эвинджер Ии А.Дж., Чжун Ю. и др. (ноябрь 2005 г.). «Транслейная ДНК-полимераза тета играет доминирующую роль в соматической гипермутации гена иммуноглобулина» . Журнал ЭМБО . 24 (21): 3757–69. дои : 10.1038/sj.emboj.7600833 . ПМЦ 1276717 . ПМИД 16222339 .
Круэ-Хеннекварт С., Койн С., Глинн М.Т., Окли Г.Г., Карти член парламента (апрель 2006 г.). «УФ-индуцированное фосфорилирование RPA увеличивается в отсутствие ДНК-полимеразы эта и требует ДНК-ПК». Восстановление ДНК . 5 (4): 491–504. дои : 10.1016/j.dnarep.2006.01.008 . ПМИД 16520097 .
Чен Ю.В., Кливер Дж.Э., Ханаока Ф., Чанг К.Ф., Чжоу К.М. (апрель 2006 г.). «Новая роль ДНК-полимеразы эта в модуляции клеточной чувствительности к химиотерапевтическим агентам» . Молекулярные исследования рака . 4 (4): 257–65. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-05-0118 . ПМИД 16603639 .
Юаса М.С., Масутани С., Хирано А., Кон М.А., Ямаидзуми М., Накатани Ю., Ханаока Ф. (июль 2006 г.). «Эта-комплекс ДНК-полимеразы человека, содержащий Rad18, Rad6 и Rev1; протеомный анализ и нацеливание комплекса на связанную с хроматином фракцию клеток, подвергающихся остановке репликационной вилки». Гены в клетки . 11 (7): 731–44. дои : 10.1111/j.1365-2443.2006.00974.x . ПМИД 16824193 . S2CID 32695133 .
Чой Дж.И., Стовер Дж.С., Энджел К.С., Чоудхури Дж., Риццо С.Дж., Гюнгерих Ф.П. (сентябрь 2006 г.). «Биохимические основы генотоксичности пищевых мутагенов гетероциклических ариламинов: ДНК-полимераза человека эта избирательно производит делецию двух оснований при копировании N2-гуанилового аддукта 2-амино-3-метилимидазо[4,5-f]хинолина, но не аддукта C8. на площадке НаРИ G3» . Журнал биологической химии . 281 (35): 25297–306. дои : 10.1074/jbc.M605699200 . ПМИД 16835218 .
Кино К., Ито Н., Сугасава К., Сугияма Х., Ханаока Ф. (2007). «Синтез транслейкоза с помощью ДНК-полимеразы человека эта через окислительные продукты гуанина» . Серия симпозиумов по нуклеиновым кислотам . 48 (48): 171–2. дои : 10.1093/насс/48.1.171 . ПМИД 17150533 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000051341 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034206 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10395804-5] Шариф Ф.С., Войта П.Дж., Ропп П.А., Коупленд У.К. (июль 1999 г.). «Клонирование и хромосомное картирование тета-полимеразы ДНК человека (POLQ), восьмой ДНК-полимеразы человека». Геномика . 59 (1): 90–6. дои : 10.1006/geno.1999.5843 . ПМИД 10395804 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: полимераза POLQ (ДНК-направленная), тета» .

[7] Чан Ш., Ю А.М., Маквей М. (июль 2010 г.). «Двойная роль тета-ДНК-полимеразы в альтернативном соединении концов двухцепочечных разрывов у дрозофилы» . ПЛОС Генетика . 6 (7): е1001005. дои : 10.1371/journal.pgen.1001005 . ПМЦ 2895639 . ПМИД 20617203 .

[8] Ю А.М., Маквей М. (сентябрь 2010 г.). «Зависимое от синтеза соединение концов, опосредованное микрогомологией, объясняет несколько типов ремонтных соединений» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (17): 5706–17. дои : 10.1093/nar/gkq379 . ПМЦ 2943611 . ПМИД 20460465 .

[9] Кул В., ван Шендел Р., Карамбелас А.Е., ван Хетерен Дж.Т., Окихара К.Л., Тейстерман М. (05 февраля 2014 г.). «Тета-зависимый путь восстановления полимеразы подавляет обширную геномную нестабильность в эндогенных участках ДНК G4» . Природные коммуникации . 5 (1): 3216. Бибкод : 2014NatCo...5.3216K . дои : 10.1038/ncomms4216 . ПМИД 24496117 .

[10] Реринк С.Ф., ван Шендель Р., Тейстерман М. (июнь 2014 г.). «Тета-опосредованное полимеразой соединение концов связанных с репликацией разрывов ДНК у C. elegans» . Геномные исследования . 24 (6): 954–62. дои : 10.1101/гр.170431.113 . ПМК 4032859 . ПМИД 24614976 .

[11] Шиммель Дж., ван Шендель Р., ден Даннен Дж. Т., Тийстерман М. (сентябрь 2019 г.). «Шаблонные вставки: дымящийся пистолет для тета-опосредованного полимеразным соединением концов». Тенденции в генетике . 35 (9): 632–644. дои : 10.1016/j.tig.2019.06.001 . ПМИД 31296341 . S2CID 195892718 .

[pmid25275444-12] Юсефзаде М.Дж., Вятт Д.В., Таката К., Му Ю., Хенсли С.С., Томида Дж. и др. (октябрь 2014 г.). «Механизм подавления хромосомной нестабильности ДНК-полимеразой POLQ» . ПЛОС Генетика . 10 (10): e1004654. дои : 10.1371/journal.pgen.1004654 . ПМЦ 4183433 . ПМИД 25275444 .

[pmid25642960-13] Матеос-Гомес П.А., Гонг Ф., Наир Н., Миллер К.М., Лаззерини-Денчи Э., Сфейр А. (февраль 2015 г.). «Полимераза θ млекопитающих способствует альтернативному NHEJ и подавляет рекомбинацию» . Природа . 518 (7538): 254–7. Бибкод : 2015Natur.518..254M . дои : 10.1038/nature14157 . ПМЦ 4718306 . ПМИД 25642960 .

[pmid25642963-14] Чекальди Р., Лю Дж.К., Амунугама Р., Хайду И., Примак Б., Петалкорин М.И. и др. (февраль 2015 г.). «Опухоли с дефицитом гомологичной рекомбинации зависят от восстановления, опосредованного Polθ» . Природа . 518 (7538): 258–62. Бибкод : 2015Natur.518..258C . дои : 10.1038/nature14184 . ПМК 4415602 . ПМИД 25642963 .

[15] Шиммель Дж., ван Шендель Р., ден Даннен Дж. Т., Тийстерман М. (сентябрь 2019 г.). «Шаблонные вставки: дымящийся пистолет для тета-опосредованного полимеразным соединением концов». Тенденции в генетике . 35 (9): 632–644. дои : 10.1016/j.tig.2019.06.001 . ПМИД 31296341 . S2CID 195892718 .

[16] «Новое открытие показывает, что клетки человека могут записывать последовательности РНК в ДНК» . физ.орг . Проверено 10 июля 2021 г.

[10.1126/sciadv.abf1771-17] Чандрамули Г., Чжао Дж., Макдевитт С., Русанов Т., Хоанг Т., Борисонник Н. и др. (июнь 2021 г.). «Polθ обратно транскрибирует РНК и способствует репарации ДНК с помощью матрицы РНК» . Достижения науки . 7 (24): eabf1 Бибкод : 2021SciA....7.1771C . дои : 10.1126/sciadv.abf1771 . ПМЦ 8195485 . ПМИД 34117057 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]