Экзорибонуклеаза
Экзорибонуклеаза экзонуклеаза — это - рибонуклеаза , представляющая собой ферменты, которые расщепляют РНК путем удаления концевых нуклеотидов либо с 5'-конца , либо с 3'-конца молекулы РНК. Ферменты, удаляющие нуклеотиды с 5'-конца, называются 5'-3'-экзорибонуклеазами , а ферменты, удаляющие нуклеотиды с 3'-конца, называются 3'-5'-экзорибонуклеазами .
Экзорибонуклеазы могут использовать либо воду для расщепления нуклеотид-нуклеотидной связи (что называется гидролитической активностью), либо неорганический фосфат (что называется фосфоролитической активностью). Гидролитические экзорибонуклеазы классифицируются под номером EC 3.1, а фосфоролитические экзорибонуклеазы — под номером EC 2.7.7. Поскольку фосфоролитические ферменты используют неорганический фосфат для расщепления связей, они выделяют нуклеотиддифосфаты , тогда как гидролитические ферменты (которые используют воду) выделяют нуклеотидмонофосфаты .
Экзорибонуклеазы существуют во всех царствах жизни: у бактерий , архей и эукариот . Экзорибонуклеазы участвуют в деградации многих различных видов РНК, включая информационную РНК , транспортную РНК , рибосомальную РНК и микроРНК . Экзорибонуклеазы могут представлять собой отдельные белки (такие как РНКаза D или РНКаза PH ), но также могут представлять собой комплексы из нескольких белков, такие как комплекс экзосом (в котором представлены четыре основных семейства экзорибонуклеаз).
Основные семьи
[ редактировать ]| Семья | Примеры участников | Распределение | Каталитическая активность |
|---|---|---|---|
| РНР | РНКаза R | Большинство бактерий, все эукариоты | 3'-5' гидролитический |
| РНКаза II | |||
| Ррп44 | |||
| ЗАКОН | РНКаза D | Некоторые бактерии, все эукариоты | 3'-5' гидролитический |
| РНКаза Т | |||
| ПМ/Скл-100 | |||
| Олигорибонуклеаза | |||
| РБН | РНКаза БН | Определенные бактерии | 3'-5' гидролитический |
| ПДКС | ПНПаза | Все королевства | 3'-5' фосфоролитический |
| ПМ/Скл-75 | |||
| РНКаза PH | |||
| Рекомендуемая розничная цена 4 | Ррп4 | Все эукариоты, большинство архей | 3'-5' гидролитический |
| 5ПХ | Экзорибонуклеаза I | Все эукариоты | 5'-3' гидролитический |
| Экзорибонуклеаза II |
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- Цзо Ю; Депутат Дойчера. (2001). «Суперсемейства экзорибонуклеаз: структурный анализ и филогенетическое распределение» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (5): 1017–26. дои : 10.1093/нар/29.5.1017 . ПМК 56904 . ПМИД 11222749 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Экзорибонуклеазы Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)