Эндонуклеаза UvrABC

Эндонуклеаза UvrABC
Идентификаторы
Псевдонимы	система uvrABCэксцинуклеаза ABC
Внешние идентификаторы	Генные карты : [1] ; ОМА : - ортологи
hideОртологи
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	н ; а
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Эндонуклеаза UvrABC представляет собой мультиферментный комплекс бактерий, участвующий в репарации ДНК путем эксцизионной репарации нуклеотидов , поэтому ее иногда называют эксцинуклеазой . Этот процесс восстановления UvrABC, иногда называемый процессом короткого участка, включает в себя удаление двенадцати нуклеотидов, в которых произошла генетическая мутация, после чего ДНК-полимераза заменяет эти аберрантные нуклеотиды правильными нуклеотидами и завершает восстановление ДНК . Субъединицы этого фермента кодируются генами uvrA , uvrB и uvrC . Этот ферментный комплекс способен восстанавливать различные типы повреждений, включая образование циклобутилдимера . ^[1]

Механизм

Два белка UvrA образуют димер, и оба они обладают АТФазной/ГТФазной активностью.
UvrA Димер связывается с димером UvrB. ^[2] и образует комплекс, способный обнаружить повреждение ДНК . Димер UvrA функционирует как единица, ответственная за обнаружение повреждений ДНК, вероятно, посредством механизма обнаружения искажений двойной спирали ДНК .
При связывании комплекса UvrA ₂ B ₂ с предполагаемым поврежденным участком ДНК обертывается вокруг UvrB. ^[3]
Димер UvrA уходит, и появляется белок UvrC, который связывается с UvrB и, следовательно, образует новый комплекс UvrBC.
UvrC отвечает за расщепление нуклеотидов по обе стороны от повреждения ДНК. ^[4] Он расщепляет фосфодиэфирную связь на четыре нуклеотида ниже места повреждения ДНК, а также расщепляет фосфодиэфирную связь на восемь нуклеотидов выше повреждения ДНК и создает вырезанный сегмент из двенадцати нуклеотидов.
ДНК-хеликаза Затем появляется II (иногда называемая UvrD) и удаляет вырезанный сегмент, удаляя пару оснований. UvrB все еще остается на месте, даже несмотря на то, что UvrC диссоциировал на этой стадии, поскольку UvrB может участвовать в предотвращении повторного отжига вырезанной ДНК.
Входит ДНК-полимераза I и заполняет правильную последовательность нуклеотидов, запуская при этом UvrB, а последняя фосфодиэфирная связь завершается ДНК-лигазой.

См. также

Ссылки

^ Гроссман Л., Юнг А.Т. (1990). «Эндонуклеазная система UvrABC Escherichia coli — взгляд из Балтимора». Мутат. Рез . 236 (2–3): 213–21. дои : 10.1016/0921-8777(90)90006-q . ПМИД 2144612 .
^ Верховен, Эстер Э.А.; Вайман, Клэр; Муленаар, Джери Ф.; Гусен, Нора (1 августа 2002 г.). «Наличие двух субъединиц UvrB в комплексе UvrAB обеспечивает обнаружение повреждений в обеих цепях ДНК» . Журнал ЭМБО . 21 (15): 4196–4205. дои : 10.1093/emboj/cdf396 . ISSN 0261-4189 . ПМК 126143 . ПМИД 12145219 .
^ «uvrB – белок B системы UvrABC – Escherichia coli (штамм K12) – ген и белок uvrB» . www.uniprot.org . Проверено 28 февраля 2016 г. .
^ Верховен, Э.Э.; ван Кестерен, М.; Муленаар, Г.Ф.; Виссе, Р.; Гусен, Н. (18 февраля 2000 г.). «Каталитические сайты для 3'- и 5'-надреза эксцизионной репарации нуклеотидов Escherichia coli расположены в UvrC» . Журнал биологической химии . 275 (7): 5120–5123. дои : 10.1074/jbc.275.7.5120 . hdl : 1887/49954 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 10671556 .

Внешние ссылки

uvrABC + эндонуклеаза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта EC 3.1, ферментам статья, посвященная незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Гроссман Л., Юнг А.Т. (1990). «Эндонуклеазная система UvrABC Escherichia coli — взгляд из Балтимора». Мутат. Рез . 236 (2–3): 213–21. дои : 10.1016/0921-8777(90)90006-q . ПМИД 2144612 .

[2] Верховен, Эстер Э.А.; Вайман, Клэр; Муленаар, Джери Ф.; Гусен, Нора (1 августа 2002 г.). «Наличие двух субъединиц UvrB в комплексе UvrAB обеспечивает обнаружение повреждений в обеих цепях ДНК» . Журнал ЭМБО . 21 (15): 4196–4205. дои : 10.1093/emboj/cdf396 . ISSN 0261-4189 . ПМК 126143 . ПМИД 12145219 .

[3] «uvrB – белок B системы UvrABC – Escherichia coli (штамм K12) – ген и белок uvrB» . www.uniprot.org . Проверено 28 февраля 2016 г. .

[4] Верховен, Э.Э.; ван Кестерен, М.; Муленаар, Г.Ф.; Виссе, Р.; Гусен, Н. (18 февраля 2000 г.). «Каталитические сайты для 3'- и 5'-надреза эксцизионной репарации нуклеотидов Escherichia coli расположены в UvrC» . Журнал биологической химии . 275 (7): 5120–5123. дои : 10.1074/jbc.275.7.5120 . hdl : 1887/49954 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 10671556 .

[1]

[2]

[3]

[4]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )