Рибонуклеаза Z

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

ТРНАза Z
ТРНАза Z
Идентификаторы
Номер ЕС.	3.1.26.11
Номер CAS.	98148-84-6
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
Экспаси	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

ТРНАза Z ( EC 3.1.26.11 , 3 тРНКаза , эндонуклеаза тРНК 3 , РНКаза Z , 3' тРНКаза ) представляет собой фермент ^[1]^[2]^[3]^[4]^[5]^[6]^[7] который, среди прочего, катализирует реакции, участвующие в созревании тРНК . Здесь он эндонуклеолитически расщепляет РНК и удаляет дополнительные 3'- нуклеотиды из предшественника тРНК, образуя 3'-концы тРНК . 3’- гидроксигруппа На конце тРНК остается 5’- фосфорильная , а на концевой молекуле – группа. Аналогичным образом он обрабатывает тРНК-подобные молекулы, такие как mascRNA . ^[8]

Ссылки

^ Шиффер С., Рёш С., Марчфельдер А. (июнь 2002 г.). «Присвоение функции консервативной группе белков: ферментам, обрабатывающим 3'-тРНК» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2769–77. дои : 10.1093/emboj/21.11.2769 . ПМК 126033 . ПМИД 12032089 .
^ Майер М., Шиффер С., Марчфельдер А. (февраль 2000 г.). «Обработка тРНК 3' в растениях: ядерная и митохондриальная активности различаются». Биохимия . 39 (8): 2096–105. дои : 10.1021/bi992253e . ПМИД 10684660 .
^ Шиффер С., Хелм М., Теобальд-Дитрих А., Жье Р., Марчфельдер А. (июль 2001 г.). «Фермент, обрабатывающий растительную тРНК 3', имеет широкий спектр субстратов». Биохимия . 40 (28): 8264–72. дои : 10.1021/bi0101953 . ПМИД 11444972 .
^ Кунцманн А., Бреннике А., Марчфельдер А. (январь 1998 г.). «Созревание 5'-конца и редактирование РНК должны предшествовать процессингу 3'-тРНК в митохондриях растений» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (1): 108–13. дои : 10.1073/pnas.95.1.108 . ЧВК 18142 . ПМИД 9419337 .
^ Мёрл М., Марчфельдер А. (январь 2001 г.). «Окончательный вариант. Важность 3'-процессинга тРНК» . Отчеты ЭМБО . 2 (1): 17–20. doi : 10.1093/embo-reports/kve006 . ПМЦ 1083803 . ПМИД 11252717 .
^ Минагава А., Такаку Х., Такаги М., Нашимото М. (апрель 2004 г.). «Новый эндонуклеолитический механизм генерации 3'-концев CCA молекул тРНК у Thermotoga maritima» . Журнал биологической химии . 279 (15): 15688–97. дои : 10.1074/jbc.M313951200 . ПМИД 14749326 .
^ Такаку Х., Минагава А., Такаги М., Нашимото М. (май 2003 г.). «Ген-кандидат предрасположенности к раку простаты кодирует 3'-тРНК, процессирующую эндорибонуклеазу» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (9): 2272–8. дои : 10.1093/нар/gkg337 . ПМК 154223 . ПМИД 12711671 .
^ Вилуш Дж. Э., Фрейер С. М., Спектор Д. Л. (ноябрь 2008 г.). «Процессинг 3'-конца длинной некодирующей РНК, удерживаемой в ядре, дает тРНК-подобную цитоплазматическую РНК» . Клетка . 135 (5): 919–32. дои : 10.1016/j.cell.2008.10.012 . ПМЦ 2722846 . ПМИД 19041754 .

Внешние ссылки

TRNase + Z в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[1] Шиффер С., Рёш С., Марчфельдер А. (июнь 2002 г.). «Присвоение функции консервативной группе белков: ферментам, обрабатывающим 3'-тРНК» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2769–77. дои : 10.1093/emboj/21.11.2769 . ПМК 126033 . ПМИД 12032089 .

[2] Майер М., Шиффер С., Марчфельдер А. (февраль 2000 г.). «Обработка тРНК 3' в растениях: ядерная и митохондриальная активности различаются». Биохимия . 39 (8): 2096–105. дои : 10.1021/bi992253e . ПМИД 10684660 .

[3] Шиффер С., Хелм М., Теобальд-Дитрих А., Жье Р., Марчфельдер А. (июль 2001 г.). «Фермент, обрабатывающий растительную тРНК 3', имеет широкий спектр субстратов». Биохимия . 40 (28): 8264–72. дои : 10.1021/bi0101953 . ПМИД 11444972 .

[4] Кунцманн А., Бреннике А., Марчфельдер А. (январь 1998 г.). «Созревание 5'-конца и редактирование РНК должны предшествовать процессингу 3'-тРНК в митохондриях растений» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (1): 108–13. дои : 10.1073/pnas.95.1.108 . ЧВК 18142 . ПМИД 9419337 .

[5] Мёрл М., Марчфельдер А. (январь 2001 г.). «Окончательный вариант. Важность 3'-процессинга тРНК» . Отчеты ЭМБО . 2 (1): 17–20. doi : 10.1093/embo-reports/kve006 . ПМЦ 1083803 . ПМИД 11252717 .

[6] Минагава А., Такаку Х., Такаги М., Нашимото М. (апрель 2004 г.). «Новый эндонуклеолитический механизм генерации 3'-концев CCA молекул тРНК у Thermotoga maritima» . Журнал биологической химии . 279 (15): 15688–97. дои : 10.1074/jbc.M313951200 . ПМИД 14749326 .

[7] Такаку Х., Минагава А., Такаги М., Нашимото М. (май 2003 г.). «Ген-кандидат предрасположенности к раку простаты кодирует 3'-тРНК, процессирующую эндорибонуклеазу» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (9): 2272–8. дои : 10.1093/нар/gkg337 . ПМК 154223 . ПМИД 12711671 .

[8] Вилуш Дж. Э., Фрейер С. М., Спектор Д. Л. (ноябрь 2008 г.). «Процессинг 3'-конца длинной некодирующей РНК, удерживаемой в ядре, дает тРНК-подобную цитоплазматическую РНК» . Клетка . 135 (5): 919–32. дои : 10.1016/j.cell.2008.10.012 . ПМЦ 2722846 . ПМИД 19041754 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )