РНКСЕХ1

РНКСЕХ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2QK9, 2QKB, 2QKK, 3BSU
Идентификаторы
Псевдонимы	РНКСЕХ1 , H1РНК, RNH1, PEOB2, рибонуклеаза H1
Внешние идентификаторы	Опустить : 604123 ; МГИ : 1335073 ; Гомологен : 2202 ; GeneCards : RNASEH1 ; OMA : RNASEH1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	3,558,333 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	28,709,588 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; endothelial cell; ; middle temporal gyrus; ; nipple; ; visceral pleura; ; parietal pleura; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; tibia; ; Brodmann area 23; ; gonad;
	Top expressed in
	Paneth cell; ; primary oocyte; ; saccule; ; otic placode; ; otic vesicle; ; secondary oocyte; ; neural layer of retina; ; primitive streak; ; zygote; ; morula;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	nuclease activity; endonuclease activity; RNA-DNA hybrid ribonuclease activity; ribonuclease activity; hydrolase activity; magnesium ion binding; metal ion binding; RNA binding; nucleic acid binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleus;
Biological process	nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; RNA catabolic process; DNA replication, removal of RNA primer; RNA phosphodiester bond hydrolysis; RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	246243
	19819
	ENSG00000171865
	ENSMUSG00000020630
	О60930
	E9QLN8
showНМ_001286834 ; НМ_001286837 ; НМ_002936 ; НМ_001378271 ; НМ_001378272 ;
	NM_001378273
	НМ_001286865 ; НМ_011275
showНП_001273763 ; НП_001273766 ; НП_002927 ; НП_001365200 ; НП_001365201 ;
	NP_001365202
	НП_001273794 ; НП_035405
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Рибонуклеаза H1, также известная как РНКаза H1, представляет собой фермент , который у человека кодируется RNASEH1 геном . ^[5]^[6]^[7] РНКаза H1 является неспецифической эндонуклеазой и катализирует расщепление РНК по гидролитическому механизму.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171865 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020630 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: рибонуклеаза Н1» .
^ тен Асбрук А.Л., ван Гроениген М., Якобс М.Е., Коевец К., Янссен Б., Баас Ф. (июнь 2002 г.). «Рибонуклеаза H1 картируется на хромосоме 2 и имеет по крайней мере три локуса псевдогена в геноме человека». Геномика . 79 (6): 818–23. дои : 10.1006/geno.2002.6776 . ПМИД 12036296 .
^ Новотны М., Гайдамаков С.А., Гирландо Р., Серрителли С.М., Крауч Р.Дж., Ян В. (октябрь 2007 г.). «Структура человеческой РНКазы H1 в комплексе с гибридом РНК/ДНК: понимание обратной транскрипции ВИЧ» . Мол. Клетка . 28 (2): 264–76. doi : 10.1016/j.molcel.2007.08.015 . ПМИД 17964265 .

Дальнейшее чтение

Новотны М., Серрителли С.М., Гирландо Р. и др. (2008). «Специфическое распознавание гибрида РНК/ДНК и усиление активности РНКазы H1 человека с помощью HBD» . ЭМБО Дж . 27 (7): 1172–81. дои : 10.1038/emboj.2008.44 . ПМЦ 2323259 . ПМИД 18337749 .
Лима В.Ф., Ву Х., Николс Дж.Г. и др. (2003). «Человеческая РНКаза H1 использует один триптофан и два лизина для позиционирования фермента на конце 3'-ДНК/5'-РНК гетеродуплексного субстрата» . Ж. Биол. Хим . 278 (50): 49860–7. дои : 10.1074/jbc.M306543200 . ПМИД 14506260 .
Лима В.Ф., Роуз Дж.Б., Николс Дж.Г. и др. (2007). «Позиционное влияние спиральной геометрии гетеродуплексного субстрата на катализ РНКазой H1 человека». Мол. Фармакол . 71 (1): 73–82. дои : 10.1124/моль.106.025429 . ПМИД 17028157 . S2CID 27765676 .
Лима В.Ф., Николс Дж.Г., Ву Х и др. (2004). «Структурные требования к каталитическому сайту гетеродуплексного субстрата для катализа человеческой РНКазы H1» . Ж. Биол. Хим . 279 (35): 36317–26. дои : 10.1074/jbc.M405035200 . ПМИД 15205459 .
Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2005). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секреторные или мембранные белки из библиотек кДНК с олигокепками» . ДНК Рез . 12 (2): 117–26. дои : 10.1093/dnares/12.2.117 . ПМИД 16303743 .
Ву Х, Лима В.Ф., Крук С.Т. (1999). «Свойства клонированной и экспрессированной человеческой РНКазы H1» . Ж. Биол. Хим . 274 (40): 28270–8. дои : 10.1074/jbc.274.40.28270 . ПМИД 10497183 .
Франк П., Брауншофер-Райтер С., Пёлтль А., Хольцманн К. (1998). «Клонирование, субклеточная локализация и функциональная экспрессия РНКазы человека HII». Биол. Хим . 379 (12): 1407–12. дои : 10.1515/bchm.1998.379.12.1407 . ПМИД 9894807 . S2CID 19692186 .
Ву Х., Лима В.Ф., Чжан Х. и др. (2004). «Определение роли человеческой РНКазы H1 в фармакологии ДНК-подобных антисмысловых препаратов» . Ж. Биол. Хим . 279 (17): 17181–9. дои : 10.1074/jbc.M311683200 . ПМИД 14960586 .
Хиллиер Л.В., Грейвс Т.А., Фултон Р.С. и др. (2005). «Генерация и аннотация последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека» . Природа . 434 (7034): 724–31. Бибкод : 2005Natur.434..724H . дои : 10.1038/nature03466 . ПМИД 15815621 .
Лима В.Ф., Ву Х., Николс Дж.Г. и др. (2003). «Активность человеческой РНКазы H1 регулируется уникальным окислительно-восстановительным переключателем, образующимся между соседними цистеинами» . Ж. Биол. Хим . 278 (17): 14906–12. дои : 10.1074/jbc.M211279200 . ПМИД 12473655 .
тен Асбрук А.Л., ван Гроениген М., Нуой М., Баас Ф. (2002). «Участие человеческих рибонуклеаз H1 и H2 в изменении ответа клеток на антисмысловые фосфоротиоатные олигонуклеотиды» . Евро. Дж. Биохим . 269 (2): 583–92. дои : 10.1046/j.0014-2956.2001.02686.x . ПМИД 11856317 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Серрителли С.М., Крауч Р.Дж. (1998). «Клонирование, экспрессия и картирование рибонуклеаз H человека и мыши, связанных с бактериальной РНКазой HI» . Геномика . 53 (3): 300–7. дои : 10.1006/geno.1998.5497 . ПМИД 9799596 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2002). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Черрителли С.М., Фролова Е.Г., Фэн С. и др. (2003). «Неспособность производить митохондриальную ДНК приводит к эмбриональной смертности у мышей с нулевым Rnaseh1» . Мол. Клетка . 11 (3): 807–15. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00088-1 . ПМИД 12667461 .
Лима В.Ф., Роуз Дж.Б., Николс Дж.Г. и др. (2007). «Человеческая РНКаза H1 различает тонкие изменения в структуре гетеродуплексного субстрата». Мол. Фармакол . 71 (1): 83–91. дои : 10.1124/моль.106.025015 . ПМИД 17028158 . S2CID 24995048 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O60930 (человеческая рибонуклеаза H1 (RNASEH1)) в PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171865 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020630 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: рибонуклеаза Н1» .

[pmid12036296-6] тен Асбрук А.Л., ван Гроениген М., Якобс М.Е., Коевец К., Янссен Б., Баас Ф. (июнь 2002 г.). «Рибонуклеаза H1 картируется на хромосоме 2 и имеет по крайней мере три локуса псевдогена в геноме человека». Геномика . 79 (6): 818–23. дои : 10.1006/geno.2002.6776 . ПМИД 12036296 .

[pmid17964265-7] Новотны М., Гайдамаков С.А., Гирландо Р., Серрителли С.М., Крауч Р.Дж., Ян В. (октябрь 2007 г.). «Структура человеческой РНКазы H1 в комплексе с гибридом РНК/ДНК: понимание обратной транскрипции ВИЧ» . Мол. Клетка . 28 (2): 264–76. doi : 10.1016/j.molcel.2007.08.015 . ПМИД 17964265 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]