Репликон (генетика)
Репликон . — это участок генома организма, который независимо реплицируется из одного источника репликации [ нужна ссылка ] . Бактериальная хромосома содержит единственное начало, поэтому вся бактериальная хромосома является репликоном. Хромосомы архей и эукариот могут иметь множественные начала репликации, поэтому их хромосомы могут состоять из нескольких репликонов. [ нужна ссылка ] . Концепция репликона была сформулирована в 1963 году Франсуа Жакобом , Сиднеем Бреннером и Жаком Кюзеном как часть их модели репликона для инициации репликации. Согласно модели репликона, инициированием репликации управляют два компонента: репликатор и инициатор. Репликатор представляет собой всю последовательность ДНК (включая, помимо прочего, точку начала репликации), необходимую для управления инициацией репликации ДНК. Инициатор — это белок, который узнает репликатор и активирует инициацию репликации. [1]
Иногда в бактериологии термин «репликон» используется только для обозначения хромосом, содержащих один источник репликации, и, следовательно, исключает геномы архей и эукариот , которые могут иметь несколько источников репликации. [2]
Прокариоты
[ редактировать ]Для большинства прокариотических хромосом репликоном является вся хромосома. Одним заметным исключением являются археи , где Sulfolobus было показано, что два вида содержат три репликона. Примеры видов бактерий, у которых обнаружено множественные репликоны, включают Rhodobacter sphaeroides (два), Vibrio cholerae , [3] и Burkholderia multivorans (три). Эти «вторичные» (или третичные) хромосомы часто описываются как молекулы, занимающие промежуточное положение между истинной хромосомой и плазмидой , и иногда называются « хромидами ». Различные виды Azospirillum обладают семью репликонами; A. Lipoferum имеет одну бактериальную хромосому, пять хромид и одну плазмиду. Например, [4] Плазмиды и бактериофаги обычно реплицируются в виде одиночных репликонов, но крупные плазмиды грамотрицательных бактерий несут несколько репликонов. было показано, что [5]
Эукариоты
[ редактировать ]В эукариотических хромосомах на хромосому приходится несколько репликонов. Известные примеры имеют размер от 10 до 330 килобаз . Кластер репликонов реплицируется одновременно. Но разные кластеры начинают реплицироваться в разное время во время S-фазы , в зависимости от их местоположения в хромосомах. Обычно кластеры, расположенные ближе к центромере, реплицируются раньше. Анализ тонкой структуры хромосомных источников репликации ограничен одной моделью эукариот, Saccharomyces cerevisiae . Таким образом, не существует общего представления о репликоне как репликаторе и инициаторе у эукариот.
В случае митохондрий определение репликонов несколько запутано, поскольку они используют однонаправленную репликацию с двумя отдельными источниками.
Неклеточные сущности
[ редактировать ]Неклеточные объекты, такие как вирусы , плазмиды , транспозоны , ретротранспозоны , вироиды , вирусоиды и сателлиты РНК, также являются репликонами. Патрик Фортер из Института Пастера ввел термин «сиротский репликон» для обозначения тех, которые не являются вирусами; т.е. у них отсутствует капсид . [6]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Уотсон Джей Ди (2014). Молекулярная биология гена (7-е изд.). Бостон: Лабораторное издательство Колд-Спринг-Харбор. стр. 288–289. ISBN 978-0-321-76243-6 . OCLC 824087979 .
- ^ diCenzo GC, Finan TM (сентябрь 2017 г.). «Разделенный бактериальный геном: структура, функции и эволюция» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 81 (3). дои : 10.1128/MMBR.00019-17 . ПМЦ 5584315 . ПМИД 28794225 .
- ^ Тагомори К., Иида Т., Хонда Т. (август 2002 г.). «Сравнение структур генома вибрионов, бактерий, обладающих двумя хромосомами» . Журнал бактериологии . 184 (16): 4351–4358. дои : 10.1128/JB.184.16.4351-4358.2002 . ПМК 135242 . ПМИД 12142404 .
- ^ Вишневски-Дайе Ф., Борзиак К., Хальса-Мойерс Г., Александр Г., Сухарников Л.О., Вуичет К. и др. (декабрь 2011 г.). Ричардсон П.М. (ред.). «Геномы азоспирилл свидетельствуют о переходе бактерий из водной среды в наземную» . ПЛОС Генетика . 7 (12): е1002430. дои : 10.1371/journal.pgen.1002430 . ПМК 3245306 . ПМИД 22216014 .
- ^ Томас CM (01 мая 2000 г.). Горизонтальный генный пул: бактериальные плазмиды и распространение генов (1-е изд.). ЦРК Пресс. ISBN 9057024624 .
- ^ Рауль Д., Фортер П. (апрель 2008 г.). «Переопределение вирусов: уроки Мимивируса». Обзоры природы. Микробиология . 6 (4): 315–319. дои : 10.1038/nrmicro1858 . ПМИД 18311164 . S2CID 24447407 .