Щелочная фосфатаза плацентарного типа

АЛПП
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1EW2, 1ZEB, 1ZED, 1ZEF, 2GLQ, 3MK0, 3MK1, 3MK2
Идентификаторы
Псевдонимы	ALPP , ALP, PALP, PLAP, PLAP-1, щелочная фосфатаза, плацентарная, ALPI, IAP
Внешние идентификаторы	Опустить : 171800 ; МГИ : 1924018 ; Гомологен : 122414 ; GeneCards : ALPP ; ОМА : АЛПП – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	232,382,889 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	87,029,328 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	placenta; ; testicle; ; right uterine tube; ; upper lobe of left lung; ; right lung; ; lower lobe of lung; ; canal of the cervix; ; ectocervix; ; left ovary; ; muscle tissue;
	Top expressed in
	duodenum; ; epithelium of small intestine; ; jejunum; ; ileum; ; migratory enteric neural crest cell; ; sexually immature organism; ; stomach; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; large intestine; ; colon;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	alkaline phosphatase activity; phosphatase activity; zinc ion binding; protein binding; hydrolase activity; catalytic activity; magnesium ion binding; metal ion binding;
Cellular component	integral component of membrane; anchored component of membrane; cell surface; membrane; plasma membrane;
Biological process	metabolism; dephosphorylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	250
	76768
	ENSG00000163283
	ENSMUSG00000079440
	P05187
	F8VPQ6
	НМ_001632
	НМ_001081082
	НП_001623
	НП_001074551
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Щелочная фосфатаза плацентарного типа, также известная как плацентарная щелочная фосфатаза ( PLAP ), представляет собой аллостерический фермент , который у человека кодируется ALPP геном . ^[5]^[6]^[7]

Ген

Существует по крайней мере четыре различных, но родственных щелочных фосфатазы: кишечная ( ALPI ), плацентарная (этот фермент), плацентарноподобная ( ALPPL2 ) и печень/кости/почки ( ALPL ) (тканенеспецифическая). Первые три расположены вместе на хромосоме 2, тогда как тканенеспецифическая форма расположена на хромосоме 1. Кодирующая последовательность этой формы щелочной фосфатазы уникальна тем, что 3'-нетранслируемая область содержит несколько копий повтора семейства Alu. Кроме того, этот ген полиморфен, и хорошо охарактеризованы три общих аллеля (тип 1, тип 2 и тип 3) для этой формы щелочной фосфатазы. ^[7]

Функция

Щелочная фосфатаза плацентарного типа представляет собой мембраносвязанный гликозилированный димерный фермент, также называемый термостабильной формой, который экспрессируется преимущественно в плаценте, хотя он тесно связан с кишечной формой фермента, а также с плацентарной формой. -подобная форма. ^[7]

Клиническое значение

PLAP является опухолевым маркером, особенно при семиноме. ^[8]^[9]^[10] и рак яичников (например, дисгерминома ). ^[11] PLAP надежен только у некурящих, поскольку курение мешает измерению PLAP. ^[12] поскольку концентрация PLAP в сыворотке крови у курильщиков увеличивается до 10 раз, и поэтому ее измерение в этой группе не имеет большого значения. ^[13]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163283 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079440 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кам В., Клаузер Э., Ким Ю.С., Кан Ю.В., Раттер У.Дж. (февраль 1986 г.). «Клонирование, секвенирование и хромосомная локализация кДНК плацентарной щелочной фосфатазы человека» . Proc Natl Acad Sci США . 82 (24): 8715–9. дои : 10.1073/pnas.82.24.8715 . ПМК 391507 . ПМИД 3001717 .
^ Хентхорн П.С., Нолл Б.Дж., Радуча М., Ротблюм К.Н., Слотер С., Вайс М., Лафферти М.А., Фишер Т., Харрис Х. (сентябрь 1986 г.). «Продукты двух общих аллелей в локусе плацентарной щелочной фосфатазы человека различаются семью аминокислотами» . Proc Natl Acad Sci США . 83 (15): 5597–601. Бибкод : 1986PNAS...83.5597H . дои : 10.1073/pnas.83.15.5597 . ПМЦ 386335 . ПМИД 3461452 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: щелочная фосфатаза ALPP, плацентарная (изозим Регана)» .
^ «Европейская группа по опухолевым маркерам. Европейская экспертная группа по опухолевым маркерам. Герминогенный рак» . Архивировано из оригинала 26 апреля 2012 г.
^ В. Альбрехт; и др. (2004). «Маркеры опухолей яичек: краеугольные камни в лечении злокачественных герминогенных опухолей» (PDF) . Джей Лаб Мед . 28 (2): 109–115. дои : 10.1515/labmed.2004.018 . S2CID 53781946 . Архивировано из оригинала (PDF) 24 января 2011 г.
^ Осетр С (август 2002 г.). «Практические рекомендации по использованию онкомаркеров в клинике» . Клин. Хим . 48 (8): 1151–9. дои : 10.1093/клинчем/48.8.1151 . ПМИД 12142367 .
^ Фишман WH (декабрь 1987 г.). «Клиническое и биологическое значение изоферментного опухолевого маркера - PLAP». Клин. Биохим . 20 (6): 387–92. дои : 10.1016/0009-9120(87)90003-8 . ПМИД 3325192 .
^ Шмолл Х.Дж., Сушон Р., Креге С. и др. (сентябрь 2004 г.). «Европейский консенсус по диагностике и лечению рака зародышевых клеток: отчет Европейской консенсусной группы по раку зародышевых клеток (EGCCCG)». Анналы онкологии . 15 (9): 1377–99. дои : 10.1093/annonc/mdh301 . ПМИД 15319245 .
^ «Опухолевые маркеры при раке яичка» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 12 ноября 2010 г.

Дальнейшее чтение

Най К.Е., Райли Г.А., Пинчинг ЭйДжей (1992). «Дефект, наблюдаемый в пути гидролиза фосфатидилинозитола в ВИЧ-инфицированных лимфоцитах и лимфобластоидных клетках, обусловлен ингибированием инозитол-1,4,5-трисфосфат-1,3,4,5-тетракисфосфат-5-фосфомоноэстеразы» . Клин. Эксп. Иммунол . 89 (1): 89–93. дои : 10.1111/j.1365-2249.1992.tb06883.x . ПМК 1554388 . ПМИД 1321014 .
Лоу М.Э. (1992). «Сайт-специфические мутации на СООН-конце плацентарной щелочной фосфатазы: изменение одной аминокислоты превращает белок, закрепленный на фосфатидилинозитолгликанах, в секретируемый белок» . Дж. Клеточная Биол . 116 (3): 799–807. дои : 10.1083/jcb.116.3.799 . ПМК 2289307 . ПМИД 1730777 .
Миканович Р., Гербер Л.Д., Бергер Дж., Кодукула К., Уденфренд С. (1990). «Селективность сайта расщепления/присоединения мембранных белков, заякоренных на фосфатидилинозитол-гликанах, определяемая сайт-специфическим мутагенезом на Asp-484 плацентарной щелочной фосфатазы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (1): 157–61. Бибкод : 1990ПНАС...87..157М . дои : 10.1073/pnas.87.1.157 . ПМЦ 53219 . ПМИД 2153284 .
Мартин Д., Сперр Н.К., Троусдейл Дж. (1988). «ПДРФ гена плацентарной щелочной фосфатазы человека (PLAP)» . Нуклеиновые кислоты Рез . 15 (21): 9104. doi : 10.1093/nar/15.21.9104 . ПМК 306450 . ПМИД 2891112 .
Нолл Б.Дж., Ротблюм К.Н., Лонгли М. (1988). «Нуклеотидная последовательность гена плацентарной щелочной фосфатазы человека. Эволюция 5'-фланкирующей области путем делеции / замены» . Ж. Биол. Хим . 263 (24): 12020–7. дои : 10.1016/S0021-9258(18)37887-6 . ПМИД 3042787 .
Миканович Р., Бэйли К.А., Бринк Л., Гербер Л., Пан Ю.К., Халмс Дж.Д., Уденфренд С. (1988). «Аспарагиновая кислота-484 зарождающейся плацентарной щелочной фосфатазы конденсируется с фосфатидилинозитолгликаном, становясь карбоксильным концом зрелого фермента» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 85 (5): 1398–402. Бибкод : 1988PNAS...85.1398M . дои : 10.1073/pnas.85.5.1398 . ПМК 279778 . ПМИД 3422741 .
Нолл Б.Дж., Ротблюм К.Н., Лонгли М. (1988). «Два события дупликации генов в эволюции термостабильных щелочных фосфатаз человека». Джин . 60 (2–3): 267–76. дои : 10.1016/0378-1119(87)90235-6 . ПМИД 3443302 .
Овитт CE, Штраус А.В., Альперс Д.Х., Чоу Ю.И., Бойме I (1986). «Экспрессия мРНК плацентарной щелочной фосфатазы разного размера в клетках плаценты и хориокарциномы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 83 (11): 3781–5. Бибкод : 1986PNAS...83.3781O . дои : 10.1073/pnas.83.11.3781 . ПМК 323607 . ПМИД 3459156 .
Миллан Х.Л. (1986). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности щелочной фосфатазы плаценты человека» . Ж. Биол. Хим . 261 (7): 3112–5. дои : 10.1016/S0021-9258(17)35755-1 . ПМИД 3512548 .
Эзра Э., Блахер Р., Уденфренд С. (1984). «Очистка и частичное секвенирование плацентарной щелочной фосфатазы человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 116 (3): 1076–83. дои : 10.1016/S0006-291X(83)80252-6 . ПМИД 6651840 .
Ле Дю М.Х., Стигбранд Т., Тауссиг М.Дж., Менез А., Стура Э.А. (2001). «Кристаллическая структура щелочной фосфатазы из плаценты человека при разрешении 1,8 А. Влияние на специфичность субстрата» . Ж. Биол. Хим . 276 (12): 9158–65. дои : 10.1074/jbc.M009250200 . ПМИД 11124260 .
Спервей Т.Д., Дэлли Дж.А., Хай С., Буллейд, Нью-Джерси (2001). «Ранние события присоединения гликозилфосфатидилинозитола. Белки-субстраты связываются с субъединицей трансамидазы gpi8p» . Ж. Биол. Хим . 276 (19): 15975–82. дои : 10.1074/jbc.M010128200 . ПМИД 11278620 .
Рамп А, Каспер Г, Хейс С, Вен Г, Старке Х, Лиер Т, Леманн Р, Лагеманн Д, Розенталь А (2001). «Сложное расположение генов в области 220 т.п.н. дважды дуплицированной ДНК на 2q37.1 человека». Геномика . 73 (1): 50–5. дои : 10.1006/geno.2000.6504 . ПМИД 11352565 .
Веннберг С., Козленков А., Ди Мауро С., Фреландер Н., Бекман Л., Хойлаертс М.Ф., Миллан Дж.Л. (2002). «Структура, типирование геномной ДНК и кинетическая характеристика аллозима D плацентарной щелочной фосфатазы (PLAP/ALPP)». Хм. Мутат . 19 (3): 258–67. дои : 10.1002/humu.10052 . ПМИД 11857742 . S2CID 44666573 .
Козленков А, Манес Т, Хойлаертс М.Ф., Миллан Дж.Л. (2002). «Назначение функций консервативным остаткам щелочных фосфатаз млекопитающих» . Ж. Биол. Хим . 277 (25): 22992–9. дои : 10.1074/jbc.M202298200 . ПМИД 11937510 .
Тан Дж, Ли В (2002). «[Методологическое исследование по определению активности гликозилфосфатидилинозитол-специфической фосфолипазы D в сыворотке крови]». Хунань И Кэ да Сюэ Сюэ Бао . 24 (2): 119–22. ПМИД 11938765 .
Лехто М.Т., Шаром Ф.Дж. (2002). «Близость белковой части белка, закрепленного GPI, к поверхности мембраны: исследование FRET». Биохимия . 41 (26): 8368–76. дои : 10.1021/bi012038+ . ПМИД 12081485 .
Ле Дю М.Х., Миллан Дж.Л. (2003). «Структурные доказательства функционального расхождения щелочных фосфатаз человека» . Ж. Биол. Хим . 277 (51): 49808–14. дои : 10.1074/jbc.M207394200 . ПМИД 12372831 .
Ллинас П., Стура Э.А., Менез А., Кисс З., Стигбранд Т., Миллан Х.Л., Ле Дю М.Х. (июль 2005 г.). «Структурные исследования плацентарной щелочной фосфатазы человека в комплексе с функциональными лигандами». Дж. Мол. Биол . 350 (3): 441–51. дои : 10.1016/j.jmb.2005.04.068 . ПМИД 15946677 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163283 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079440 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid3001717-5] Кам В., Клаузер Э., Ким Ю.С., Кан Ю.В., Раттер У.Дж. (февраль 1986 г.). «Клонирование, секвенирование и хромосомная локализация кДНК плацентарной щелочной фосфатазы человека» . Proc Natl Acad Sci США . 82 (24): 8715–9. дои : 10.1073/pnas.82.24.8715 . ПМК 391507 . ПМИД 3001717 .

[pmid3461452-6] Хентхорн П.С., Нолл Б.Дж., Радуча М., Ротблюм К.Н., Слотер С., Вайс М., Лафферти М.А., Фишер Т., Харрис Х. (сентябрь 1986 г.). «Продукты двух общих аллелей в локусе плацентарной щелочной фосфатазы человека различаются семью аминокислотами» . Proc Natl Acad Sci США . 83 (15): 5597–601. Бибкод : 1986PNAS...83.5597H . дои : 10.1073/pnas.83.15.5597 . ПМЦ 386335 . ПМИД 3461452 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: щелочная фосфатаза ALPP, плацентарная (изозим Регана)» .

[egtm_tumour_markers_in_germ_cell_cancer-8] «Европейская группа по опухолевым маркерам. Европейская экспертная группа по опухолевым маркерам. Герминогенный рак» . Архивировано из оригинала 26 апреля 2012 г.

[egtm_Albrecht-9] В. Альбрехт; и др. (2004). «Маркеры опухолей яичек: краеугольные камни в лечении злокачественных герминогенных опухолей» (PDF) . Джей Лаб Мед . 28 (2): 109–115. дои : 10.1515/labmed.2004.018 . S2CID 53781946 . Архивировано из оригинала (PDF) 24 января 2011 г.

[Practice_Guidelines_for_Tumor_Marker_Use_in_the_Clinic-10] Осетр С (август 2002 г.). «Практические рекомендации по использованию онкомаркеров в клинике» . Клин. Хим . 48 (8): 1151–9. дои : 10.1093/клинчем/48.8.1151 . ПМИД 12142367 .

[pmid3325192-11] Фишман WH (декабрь 1987 г.). «Клиническое и биологическое значение изоферментного опухолевого маркера - PLAP». Клин. Биохим . 20 (6): 387–92. дои : 10.1016/0009-9120(87)90003-8 . ПМИД 3325192 .

[pmid15319245-12] Шмолл Х.Дж., Сушон Р., Креге С. и др. (сентябрь 2004 г.). «Европейский консенсус по диагностике и лечению рака зародышевых клеток: отчет Европейской консенсусной группы по раку зародышевых клеток (EGCCCG)». Анналы онкологии . 15 (9): 1377–99. дои : 10.1093/annonc/mdh301 . ПМИД 15319245 .

[Tumor_Markers_in_Testicular_Cancers-13] «Опухолевые маркеры при раке яичка» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 12 ноября 2010 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]