XRN1 (ген)

XRN1
Идентификаторы
Псевдонимы	XRN1 , SEP1, 5'-3' экзорибонуклеаза 1, Xrn1
Внешние идентификаторы	Опустить : 607994 ; МГИ : 891964 ; Гомологен : 5894 ; Генные карты : XRN1 ; ОМА : XRN1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	142,448,062 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	95,939,856 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pancreatic epithelial cell; ; Achilles tendon; ; germinal epithelium; ; visceral pleura; ; parietal pleura; ; tibia; ; bone marrow cells; ; gingival epithelium; ; endothelial cell; ; palpebral conjunctiva;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; cumulus cell; ; Rostral migratory stream; ; thymus; ; genital tubercle; ; zygote; ; pineal gland; ; secondary oocyte; ; vas deferens; ; granulocyte;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein binding; nucleic acid binding; nuclease activity; exonuclease activity; hydrolase activity; RNA binding; G-quadruplex RNA binding; G-quadruplex DNA binding; 5'-3' exoribonuclease activity; telomerase RNA binding; 5'-3' exonuclease activity;
Cellular component	membrane; plasma membrane; nucleus; cytoplasm; cytosol; dendrite; neuronal cell body; synapse; P-body;
Biological process	regulation of mRNA stability; rRNA catabolic process; nuclear mRNA surveillance; histone mRNA catabolic process; negative regulation of translation; response to testosterone; cellular response to cycloheximide; RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic; cellular response to puromycin; negative regulation of telomere maintenance via telomerase; nuclear-transcribed mRNA catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	54464
	24127
	ENSG00000114127
	ENSMUSG00000032410
	Q8ИЖ2
	P97789
	НМ_001042604 ; НМ_001282857 ; НМ_001282859 ; НМ_019001
	НМ_011916 ; НМ_001311130
	НП_001269786 ; НП_001269788 ; НП_061874
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

5'-3' экзорибонуклеаза 1 ( Xrn1 ) представляет собой белок , который у человека кодируется геном XRN1 . Xrn1 гидролизует РНК от 5’ к 3’ в направлении . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена семейства 5'-3' экзонуклеаз . Кодируемый белок может участвовать в репликационно-зависимой гистонов деградации мРНК и напрямую взаимодействует с энхансером белка 4 , декапирующего мРНК . Помимо метаболизма мРНК, аналогичный белок у дрожжей участвует в различных ядерных и цитоплазматических функциях. включая транскрипцию , трансляцию , гомологичную рекомбинацию , мейоз , поддержание теломер и сборку микротрубочек . Мутации в этом гене связаны с остеосаркомой , что позволяет предположить, что кодируемый белок может также играть роль в формировании костей . Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскрипта.

См. также

Xrn2

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000114127 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032410 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Маллен Т.Э., Марзлафф В.Ф. (январь 2008 г.). «Деградация мРНК гистонов требует олигоуридилирования с последующим декэпированием и одновременной деградацией мРНК как с 5’ на 3’, так и с 3’ на 5’ » . Гены и развитие . 22 (1): 50–65. дои : 10.1101/gad.1622708 . ПМК 2151014 . ПМИД 18172165 .
^ «Ген Энтреза: 5'-3' экзорибонуклеаза 1» .

Дальнейшее чтение

Башкиров В.И., Шертан Х., Золингер Дж.А., Бюрстедде Дж.М., Хейер В.Д. (февраль 1997 г.). «Цитоплазматическая экзорибонуклеаза мыши (mXRN1p) с предпочтением субстратов тетраплекса G4» . Журнал клеточной биологии . 136 (4): 761–73. дои : 10.1083/jcb.136.4.761 . ПМК 2132493 . ПМИД 9049243 .
Ингельфингер Д., Арндт-Йовин DJ, Люрманн Р., Аксель Т. (декабрь 2002 г.). «Белки LSm1-7 человека колокализуются с ферментами, разрушающими мРНК Dcp1/2 и Xrnl, в отдельных цитоплазматических фокусах» . РНК . 8 (12): 1489–501. дои : 10.1017/S1355838202021726 . HDL : 11858/00-001M-0000-0012-F270-9 . ПМК 1370355 . ПМИД 12515382 .
Браун Дж. Э., Трюффо В., Боланд А., Ханцингер Э., Чанг К. Т., Хаас Г., Вайхенридер О., Коулз М., Изаурральде Е. (декабрь 2012 г.). «Прямое взаимодействие между DCP1 и XRN1 связывает декапирование мРНК с 5'-экзонуклеолитической деградацией». Структурная и молекулярная биология природы . 19 (12): 1324–31. дои : 10.1038/nsmb.2413 . ПМИД 23142987 . S2CID 1134057 .
Ли Ю, Масаки Т., Ямане Д., Макгиверн Д.Р., Лемон С.М. (январь 2013 г.). «Конкурирующая и неконкурентная активность миР-122 и 5'-экзонуклеазы Xrn1 в регуляции репликации вируса гепатита С» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (5): 1881–6. дои : 10.1073/pnas.1213515110 . ПМЦ 3562843 . ПМИД 23248316 .
Ли Ю, Ямане Д., Лемон С.М. (май 2015 г.). «Анализ роли 5'-экзорибонуклеаз Xrn1 и Xrn2 в ограничении репликации вируса гепатита С» . Журнал вирусологии . 89 (9): 4857–65. дои : 10.1128/JVI.03692-14 . ПМЦ 4403451 . ПМИД 25673723 .
Берджесс HM, Мор I (март 2015 г.). «Клеточная 5'-3'-экзонуклеаза мРНК Xrn1 контролирует накопление двухцепочечной РНК и противовирусные реакции» . Клетка-хозяин и микроб . 17 (3): 332–44. дои : 10.1016/j.chom.2015.02.003 . ПМЦ 4826345 . ПМИД 25766294 .
Дин М, Линь Б, Ли Т, Лю Й, Ли Й, Чжоу Х, Мяо М, Гу Дж, Пан Х, Ян Ф, Ли Т, Лю XY, Ли Р (апрель 2015 г.). «Двойная, но противоположная функция регулирования роста миР-204 и ее мишени XRN1 в клетках аденокарциномы простаты и нейроэндокринноподобных клетках рака простаты» . Онкотаргет . 6 (10): 7686–700. дои : 10.18632/oncotarget.3480 . ПМЦ 4480709 . ПМИД 25797256 .
Бласко-Морено Б, де Кампос-Мата Л, Бетчер Р, Гарсиа-Мартинес Х, Юнгфляйш Дж, Недиалкова Д.Д., Чаттопадхьяй С, Гас М.Э., Олива Б, Перес-Ортин Х.Е., Лейдель С.А., Чодер М., Диес Дж. (март 2019 г.) ). «Экзонуклеаза Xrn1 активирует транскрипцию и трансляцию мРНК, кодирующих мембранные белки» . Природные коммуникации . 21 (10): 1298. Бибкод : 2019NatCo..10.1298B . дои : 10.1038/s41467-019-09199-6 . ПМЦ 6428865 . ПМИД 30899024 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000114127 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032410 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Маллен Т.Э., Марзлафф В.Ф. (январь 2008 г.). «Деградация мРНК гистонов требует олигоуридилирования с последующим декэпированием и одновременной деградацией мРНК как с 5’ на 3’, так и с 3’ на 5’ » . Гены и развитие . 22 (1): 50–65. дои : 10.1101/gad.1622708 . ПМК 2151014 . ПМИД 18172165 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: 5'-3' экзорибонуклеаза 1» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]