Декапирование мессенджерной РНК
Процесс информационной РНК декэпирования состоит из гидролиза структуры 5'-кэпа РНК, обнажая 5'-монофосфат. У эукариот этот 5'-монофосфат является субстратом для 5'- экзонуклеазы Xrn1. [1] и мРНК быстро разрушается. Существует множество ситуаций, которые могут привести к снятию колпачка, некоторые из которых обсуждаются ниже. [2]
У прокариот исходный транскрипт мРНК после бактериальной транскрипции естественным образом содержит 5'-трифосфатную группу ; фермент RppH удаляет молекулу пирофосфата с 5'-конца, превращая 5'-трифосфат в 5'-монофосфат, вызывая деградацию мРНК рибонуклеазами. [3] [4]
Перевод и распад
[ редактировать ]Внутри клеток существует баланс между процессами трансляции и распада мРНК. [2] Сообщения, которые активно транслируются, связываются полисомами и факторами инициации эукариот eIF-4E и eIF-4G (у эукариот). Это блокирует доступ к кэпу фермента декэпирования DCP2 и защищает молекулу мРНК. В условиях нехватки питательных веществ или вирусной инфекции трансляция может быть нарушена и стимулируется декапирование. Этот баланс отражается в размере и количестве цитоплазматических структур, известных как Р-тельца . [5] [6]
Конкретные пути распада
[ редактировать ]Существует ряд конкретных путей распада, которые распознают аберрантные сообщения и способствуют их декапированию. Нонсенс-опосредованный распад распознает преждевременные стоп-кодоны и способствует декэпированию, а также распаду экзосомы . некоторые классы микроРНК Также было показано, что стимулируют декапирование.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Пул, Тони Л.; Стивенс, Одри (июнь 1997 г.). «Структурные модификации РНК влияют на 5'-экзорибонуклеолитический гидролиз с помощью XRN1 и HKE1 Saccharomyces cerevisiae» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 235 (3): 799–805. дои : 10.1006/bbrc.1997.6877 . ПМИД 9207242 .
- ^ Перейти обратно: а б Мейер, Силке; Темме, Клаудия; Вале, Эльмар (январь 2004 г.). «Обмен информационной РНК у эукариот: пути и ферменты». Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 39 (4): 197–216. дои : 10.1080/10409230490513991 . ПМИД 15596551 . S2CID 21227254 .
- ^ Дина, Атилио; Целесник, Елена; Беласко, Джоэл Г. (17 января 2008 г.). «Бактериальный фермент RppH запускает деградацию информационной РНК путем удаления 5'-пирофосфата». Природа . 451 (7176): 355–358. Бибкод : 2008Natur.451..355D . дои : 10.1038/nature06475 . ПМИД 18202662 . S2CID 4321451 .
- ^ Се, Пин-кун; Ричардс, Джейми; Лю, Цюаньшэн; Беласко, Джоэл Г. (22 апреля 2013 г.). «Специфика RppH-зависимой деградации РНК у Bacillus subtilis» . Труды Национальной академии наук . 110 (22): 8864–8869. Бибкод : 2013PNAS..110.8864H . дои : 10.1073/pnas.1222670110 . ПМК 3670361 . ПМИД 23610425 .
- ^ Шет, Уджвал; Паркер, Рой (2 мая 2003 г.). «Декепирование и распад информационной РНК происходят в цитоплазматических процессинговых телах» . Наука . 300 (5620): 805–808. Бибкод : 2003Sci...300..805S . дои : 10.1126/science.1082320 . ПМК 1876714 . ПМИД 12730603 .
- ^ Паркер, Рой; Шет, Уджвал (март 2007 г.). «P-тела и контроль трансляции и деградации мРНК» . Молекулярная клетка . 25 (5): 635–646. doi : 10.1016/j.molcel.2007.02.011 . ПМИД 17349952 .