✖


Jump to content

Экзосомный комплекс

Не путать с экзосомой (везикулой) .

«Вид с ленты» экзосомного комплекса человека. PDB 2NN6 См . легенду ниже. Канал, через который проходит РНК при деградации, виден в центре белкового комплекса.

Экзосомальный комплекс (или комплекс PM/Scl , часто называемый просто экзосомой ) представляет собой многобелковый внутриклеточный комплекс , способный расщеплять различные типы молекул РНК (рибонуклеиновой кислоты). Экзосомальные комплексы обнаружены как в эукариотических клетках, так и в археях , тогда как у бактерий более простой комплекс, называемый деградосомой, выполняет аналогичные функции.

Ядро экзосомы содержит шестичленную кольцевую структуру, к которой прикреплены другие белки. В эукариотических клетках экзосомный комплекс присутствует в цитоплазме , ядре и особенно в ядрышке , хотя различные белки взаимодействуют с экзосомным комплексом в этих компартментах, регулируя активность деградации РНК комплекса до субстратов, специфичных для этих клеточных компартментов. Субстраты экзосомы включают информационную РНК , рибосомальную РНК и многие виды малых РНК . Экзосома выполняет экзорибонуклеолитическую функцию, то есть она расщепляет РНК, начиная с одного конца ( в данном случае 3'-конца ), а у эукариот также выполняет эндорибонуклеолитическую функцию, то есть расщепляет РНК в участках внутри молекулы.

Некоторые белки в экзосоме являются мишенью аутоантител у пациентов со специфическими аутоиммунными заболеваниями (особенно синдромом перекрытия PM/Scl ), а некоторые антиметаболические химиотерапевтические препараты при раке действуют путем блокирования активности экзосомы. Кроме того, мутации в компоненте 3 экзосомы вызывают понтоцеребеллярную гипоплазию и заболевание мотонейронов спинного мозга .

Открытие

[ редактировать ]

Экзосома была впервые обнаружена как РНКаза в 1997 году в почкующихся дрожжах Saccharomyces cerevisiae , часто используемом модельном организме . [1] Вскоре после этого, в 1999 году, стало понятно, что экзосома на самом деле представляет собой дрожжевой эквивалент уже описанного комплекса в клетках человека, называемого комплексом PM/Scl был идентифицирован как аутоантиген у пациентов с некоторыми аутоиммунными заболеваниями , который несколько лет назад ( см . ниже ). [2] Очистка этого «комплекса PM/Scl» позволила идентифицировать больше белков экзосом человека и, в конечном итоге, охарактеризовать все компоненты комплекса. [3] [4] В 2001 году растущее количество данных о геноме , которые стали доступны, позволило предсказать белки экзосом у архей, хотя потребовалось еще два года, прежде чем был очищен первый комплекс экзосом из архейного организма. [5] [6]

Структура

[ редактировать ]

Основные белки

[ редактировать ]
Вид сверху и сбоку на кристаллическую структуру экзосомного комплекса человека. Полную легенду смотрите ниже.

Ядро комплекса имеет кольцевую структуру, состоящую из шести белков, принадлежащих к одному классу РНКаз — РНКазным PH- подобным белкам. [7] У архей есть два разных PH-подобных белка (называемых Rrp41 и Rrp42), каждый из которых присутствует три раза в чередующемся порядке. Эукариотические экзосомальные комплексы содержат шесть различных белков, образующих кольцевую структуру. [8] [9] Из этих шести эукариотических белков три напоминают архейный белок Rrp41, а три других белка больше похожи на архейный белок Rrp42. [10]

Субъединицы и организация архейного (слева) и эукариотического (справа) экзосомных комплексов. Различные белки пронумерованы, что показывает, что экзосома архей содержит 4 разных белка, а экзосома эукариот содержит девять разных белков. Полную легенду смотрите ниже.

На вершине этого кольца расположены три белка, которые имеют РНК-связывающий домен S1 (RBD). Два белка дополнительно имеют домен K-гомологии (KH) . [7] У эукариот с кольцом связаны три разных белка «S1», тогда как у архей в состав экзосомы могут входить либо один, либо два разных белка «S1» (хотя к комплексу всегда присоединены три субъединицы S1). [11]

Эта кольцевая структура очень похожа на структуру белков РНКазы PH и PNPase . У бактерий белок РНКаза PH, участвующий в процессинге тРНК , образует гексамерное кольцо, состоящее из шести идентичных белков РНКазы PH. [12] [13] В случае PNPазы, которая представляет собой фосфоролитический белок, расщепляющий РНК, обнаруженный в бактериях , хлоропластах и ​​митохондриях некоторых эукариотических организмов, два домена РНКазы PH, а также РНК-связывающие домены S1 и KH являются частью одного белка, который образует тримерный комплекс, имеющий структуру, почти идентичную структуре экзосомы. [14] Из-за такого высокого сходства как белковых доменов, так и структуры считается, что эти комплексы эволюционно родственны и имеют общего предка . [15] семейству РНКаз РНКазы PH и являются фосфоролитическими экзорибонуклеазами , что означает, что они используют неорганический фосфат для удаления нуклеотидов с 3'-конца молекул РНК Белки экзосомы, подобные РНКазе PH, PNPase и RNase PH принадлежат к . [7]

Связанные белки

[ редактировать ]

Помимо этих девяти основных белков экзосомы, в эукариотических организмах с комплексом часто связаны два других белка. Одним из них является Rrp44 , гидролитическая РНКаза, которая принадлежит к РНКазы R семейству гидролитических экзорибонуклеаз (нуклеаз, которые используют воду для расщепления нуклеотидных связей). Помимо того, что Rrp44 является экзорибонуклеолитическим ферментом, он также обладает эндорибонуклеолитической активностью, которая находится в отдельном домене белка. [16] [17] У дрожжей Rrp44 связан со всеми экзосомными комплексами и играет решающую роль в активности экзосомного комплекса дрожжей. [18] Хотя человеческий гомолог белка существует, в течение длительного времени не было обнаружено доказательств того, что его человеческий гомолог связан с экзосомным комплексом человека. [7] Однако в 2010 году было обнаружено, что у человека есть три гомолога Rrp44, и два из них могут быть связаны с экзосомным комплексом. Эти два белка, скорее всего, разрушают разные субстраты РНК из-за их разной клеточной локализации: один локализован в цитоплазме ( DIS3L1 ), а другой — в ядре ( DIS3 ). [19] [20]

«Вид ленты» частичной структуры субъединицы дрожжевой экзосомы Rrp6, 2hbj с α-спиралями красного цвета и β-листами желтого цвета.

Второй распространенный ассоциированный белок называется Rrp6 (у дрожжей) или PM/Scl-100 (у человека). Как и Rrp44, этот белок представляет собой гидролитическую экзорибонуклеазу, но в данном случае относится к РНКазы D. семейству белков [21] Белок PM/Scl-100 чаще всего является частью экзосомных комплексов в ядре клеток, но также может составлять часть цитоплазматического экзосомного комплекса. [22]

Регуляторные белки

[ редактировать ]

Помимо этих двух прочно связанных белковых субъединиц, многие белки взаимодействуют с экзосомным комплексом как в цитоплазме, так и в ядре клеток. Эти слабо связанные белки могут регулировать активность и специфичность экзосомального комплекса. В цитоплазме экзосома взаимодействует со связывающими белками, богатыми AU-элементами (ARE) (например, KRSP и TTP), которые могут способствовать или предотвращать деградацию мРНК. Ядерная экзосома связана с РНК-связывающими белками (например, MPP6/Mpp6 и C1D/Rrp47 у человека/дрожжей), которые необходимы для обработки определенных субстратов. [7]

Помимо одиночных белков, с экзосомой взаимодействуют и другие белковые комплексы. Одним из них является цитоплазматический комплекс Ski , который включает РНК- геликазу (Ski2) и участвует в деградации мРНК. [23] В ядре процессинг рРНК и мякРНК экзосомой опосредован комплексом TRAMP , который обладает как РНК-хеликазной (Mtr4), так и полиаденилирующей (Trf4) активностью. [24]

Функция

[ редактировать ]

Ферментативная функция

[ редактировать ]
Диаграммы реакций гидролитической (слева) и фосфоролитической (справа) 3'-концевой деградации РНК.

Как указано выше, экзосомальный комплекс содержит множество белков с рибонуклеазными доменами. Точная природа этих рибонуклеазных доменов менялась в ходе эволюции от бактериальных комплексов к архейным и эукариотическим, поскольку различные виды активности приобретались и терялись. Экзосома представляет собой в первую очередь 3'-5' экзорибонуклеазу , что означает, что она расщепляет молекулы РНК с их 3'-конца . Экзорибонуклеазы, содержащиеся в экзосомных комплексах, являются либо фосфоролитическими (РНКазы PH-подобные белки), либо, у эукариот, гидролитическими (белки доменов РНКазы R и РНКазы D). Фосфоролитические ферменты используют неорганический фосфат для расщепления фосфодиэфирных связей , высвобождая нуклеотиддифосфаты . Гидролитические ферменты используют воду для гидролиза этих связей, высвобождая нуклеотидмонофосфаты .

У архей субъединица комплекса Rrp41 представляет собой фосфоролитическую экзорибонуклеазу. В кольце присутствуют три копии этого белка, отвечающие за активность комплекса. [9] У эукариот ни одна из субъединиц РНКазы PH не сохранила эту каталитическую активность, а это означает, что основная кольцевая структура человеческой экзосомы не имеет ферментативно активного белка. [25] Несмотря на эту потерю каталитической активности, структура сердцевинной экзосомы высоко консервативна от архей до человека, что позволяет предположить, что комплекс выполняет жизненно важную клеточную функцию. У эукариот отсутствие фосфоролитической активности компенсируется наличием гидролитических ферментов, ответственных за рибонуклеазную активность экзосомы у таких организмов. [26] [27] [28]

Как указано выше, гидролитические белки Rrp6 и Rrp44 связаны с экзосомой у дрожжей, а у человека, кроме Rrp6, в положении дрожжевого белка Rrp44 могут быть ассоциированы два разных белка, Dis3 и Dis3L1. [19] [20] Хотя первоначально считалось, что белки домена S1 также обладают 3'-5'-гидролитической экзорибонуклеазной активностью, существование этой активности недавно было поставлено под сомнение, и эти белки могли играть лишь роль в связывании субстратов до их деградации комплексом. [26]

Схематическое изображение экзосомных комплексов архей (слева) и эукариот (справа) с наиболее распространенными ассоциированными белками. Цветом и звездочкой отмечены субъединицы каждого комплекса, обладающие каталитической активностью. смотрите ниже . Полную легенду

Субстраты

[ редактировать ]

Экзосома участвует в деградации и процессинге широкого спектра видов РНК. В цитоплазме клеток он участвует в обмене молекул информационной РНК (мРНК). Комплекс может разрушать молекулы мРНК, которые были помечены для деградации, поскольку они содержат ошибки, посредством взаимодействия с белками по бессмысленному или безостановочному распаду . Альтернативно, мРНК деградируют в ходе своего нормального оборота . Несколько белков, которые стабилизируют или дестабилизируют молекулы мРНК посредством связывания с AU-богатыми элементами в 3'-нетранслируемой области мРНК, взаимодействуют с экзосомным комплексом. [29] [30] [31] В ядре экзосома необходима для правильного процессинга нескольких небольших молекул ядерной РНК. [32] Наконец, ядрышко — это отсек, в котором находится большинство экзосомальных комплексов. Там он играет роль в процессинге 5.8S рибосомальной РНК (первая выявленная функция экзосомы) и нескольких малых ядрышковых РНК . [1] [32] [33]

Хотя в большинстве клеток есть и другие ферменты, которые могут расщеплять РНК либо с 3'- , либо с 5'-конца РНК, экзосомный комплекс необходим для выживания клеток. Когда экспрессия белков экзосом искусственно снижается или прекращается, например, с помощью РНК-интерференции , рост прекращается и клетки в конечном итоге погибают. Оба основных белка экзосомального комплекса, а также два основных ассоциированных белка являются незаменимыми белками. [34] Бактерии не имеют экзосомного комплекса; однако аналогичные функции выполняет более простой комплекс, включающий белок ПНПазу , называемый деградосомой . [35]

Две основные субъединицы экзосомы архей (Rrp41 и Rrp42), связанные с небольшой молекулой РНК (красным).

Экзосома является ключевым комплексом в контроле качества клеточной РНК. В отличие от прокариот, эукариоты обладают высокоактивными системами наблюдения за РНК, которые распознают непроцессированные и неправильно процессированные комплексы РНК-белок (такие как рибосомы ) до их выхода из ядра. Предполагается, что эта система предотвращает вмешательство аберрантных комплексов в важные клеточные процессы, такие как синтез белка . [36]

Помимо процессинга, оборота и надзора за РНК, экзосома важна для деградации так называемых загадочных нестабильных транскриптов (CUT), которые производятся из тысяч локусов в геноме дрожжей. [37] [38] Важность этих нестабильных РНК и их деградация до сих пор неясны, но подобные виды РНК также были обнаружены в клетках человека. [39]

Болезнь

[ редактировать ]

Аутоиммунитет

[ редактировать ]

Экзосомальный комплекс является мишенью аутоантител у пациентов с различными аутоиммунными заболеваниями . Эти аутоантитела в основном обнаруживаются у людей с синдромом перекрытия PM/Scl , аутоиммунным заболеванием, при котором у пациентов наблюдаются симптомы как склеродермии , так и полимиозита или дерматомиозита . [40] Аутоантитела можно обнаружить в сыворотке пациентов с помощью различных анализов. В прошлом наиболее часто используемыми методами были двойная иммунодиффузия теленка с использованием экстрактов тимуса , иммунофлуоресценция на клетках HEp-2 или иммунопреципитация из экстрактов клеток человека. В анализах иммунопреципитации с сыворотками из антиэкзосомо-положительных сывороток осаждается особый набор белков. Уже за несколько лет до того, как экзосомный комплекс был идентифицирован, этот паттерн был назван комплексом PM/Scl . [41] Иммунофлуоресценция сыворотки этих пациентов обычно показывает типичное окрашивание ядрышка клеток , что вызвало предположение о том, что антиген, распознаваемый аутоантителами, может играть важную роль в синтезе рибосом . [42] Совсем недавно стали доступны рекомбинантные белки экзосом, и они были использованы для разработки линейных иммуноанализов (LIA) и иммуноферментных анализов (ELISA) для обнаружения этих антител. [7]

При этих заболеваниях антитела в основном направлены против двух белков комплекса, называемых PM/Scl-100 (РНКаза D-подобный белок) и PM/Scl-75 (один из РНКазы PH-подобных белков из кольца), а также антитела. распознающие эти белки обнаруживаются примерно у 30% пациентов с синдромом перекрытия PM/Scl. [43] Хотя эти два белка являются основной мишенью аутоантител, у этих пациентов могут быть нацелены и другие субъединицы экзосом и связанные с ними белки (например, C1D). [44] [45] В настоящее время наиболее чувствительным способом обнаружения этих антител является использование пептида , полученного из белка PM/Scl-100, в качестве антигена в ELISA вместо полноценных белков. С помощью этого метода аутоантитела обнаруживаются до 55% пациентов с синдромом перекрытия PM/Scl, но их также можно обнаружить у пациентов с только склеродермией, полимиозитом или дерматомиозитом. [46]

Поскольку аутотела обнаруживаются преимущественно у пациентов с характеристиками нескольких различных аутоиммунных заболеваний, клинические симптомы этих пациентов могут широко варьировать. Симптомы, которые наблюдаются чаще всего, являются типичными симптомами отдельных аутоиммунных заболеваний и включают феномен Рейно , артрит , миозит и склеродермию . [47] Лечение этих пациентов симптоматическое и аналогично лечению отдельного аутоиммунного заболевания, часто с применением иммунодепрессантов или иммуномодулирующих препаратов. [48]

Лечение рака

[ редактировать ]

что экзосома ингибируется антиметаболитом фторурацилом , препаратом, используемым при химиотерапии рака Было показано , . Это один из наиболее успешных препаратов для лечения солидных опухолей . В дрожжевых клетках, обработанных фторурацилом, были обнаружены дефекты процессинга рибосомальной РНК, идентичные тем, которые наблюдались, когда активность экзосомы блокировалась молекулярно-биологическими стратегиями. Отсутствие правильного процессинга рибосомальной РНК смертельно для клеток, что объясняет антиметаболический эффект препарата. [49]

Неврологические расстройства

[ редактировать ]

Мутации в экзосомном компоненте 3 вызывают инфантильную болезнь спинальных мотонейронов , атрофию мозжечка, прогрессирующую микроцефалию и глубокую глобальную задержку развития, что соответствует понтоцеребеллярной гипоплазии типа 1B ( PCH1B; MIM 614678 ). [50]

Список субъединиц

[ редактировать ]
Легенда Общее имя Домены Человек Дрожжи ( S. cerevisiae ) Архея МВт (кД) Человеческий ген Дрожжевой ген
1 Csl4 С1 РБД hCsl4 Csl4p/Ski4p Csl4 21–32 EXOSC1 YNL232W
2 Ррп4 С1/КХ РБД HRRP4 Ррп4п Ррп4 28–39 EXOSC2 YHR069C
3 40 рупий С1/КХ РБД чРрп40 Цена за 40 пенсов (Ррп4) А 27–32 EXOSC3 YOL142W
4 Ррп41 РНКаза PH HRRP41 Цена 41p/Ski6p Ррп41 С 26–28 EXOSC4 YGR195W
5 Ррп46 РНКаза PH hrrp46 Ррп46п (Ррп41) А, С 25–28 EXOSC5 YGR095C
6 Мтр3 РНКаза PH hMtr3 Мтр3п (Ррп41) А, С 24–37 EXOSC6 YGR158C
7 Ррп42 РНКаза PH HRRP42 Ррп42п Ррп42 29–32 EXOSC7 YDL111C
8 Ррп43 РНКаза PH ОИП2 Ррп43п (Ррп42) А 30–44 EXOSC8 YCR035C
9 Цена за 45 рублей РНКаза PH ПМ/Скл-75 Цена за 45 пенсов (Ррп42) А 34–49 EXOSC9 280 Вт ярдов
10 Ррп6 РНКаза D ПМ/Скл-100 С Ррп6п С н/д 84–100 EXOSC10 YOR001W
11 Ррп44 РНКаза R Дис3 Б, С

Дис3Л1 Б, С

Ррп44п/Dis3p С н/д 105–113 ДИС3

DIS3L1

YOL021C
  • А У архей несколько белков экзосом присутствуют в нескольких копиях, образуя полное ядро ​​экзосомного комплекса.
  • Б У человека в этом положении могут быть связаны два разных белка. В цитоплазме клеток Dis3L1 связан с экзосомой, тогда как в ядре Dis3 может связываться с коровым комплексом.
  • С Способствует рибонуклеолитической активности комплекса.

См. также

[ редактировать ]
  • Протеасома . — основной механизм клеточного расщепления белков
  • Сплайсосома — комплекс, участвующий в сплайсинге РНК , который также содержит кольцевую структуру, связывающую РНК.

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Перейти обратно: а б Митчелл, П; Петфальский, Э; Шевченко А; Манн, М; Толлерви, Д. (1997). «Экзосома: консервативный эукариотический комплекс процессинга РНК, содержащий несколько 3'→5'-экзорибонуклеаз» . Клетка . 91 (4): 457–466. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80432-8 . ПМИД   9390555 . S2CID   16035676 .
  2. ^ Оллманг, К; Петфальский, Э; Подтелейников А; Манн, М; Толлерви, Д; Митчелл, П. (1999). «Экзосома дрожжей и PM-Scl человека представляют собой родственные комплексы 3' → 5' экзонуклеаз» . Гены и развитие . 13 (16): 2148–58. дои : 10.1101/gad.13.16.2148 . ПМК   316947 . ПМИД   10465791 .
  3. ^ Брюэр, Р.; Оллманг, К; Райджмейкерс, Р; Ван Арссен, Ю; Эгбертс, Западная Вирджиния; Петфальский, Э; Ван Венрой, WJ; Толлерви, Д; Пруейн, Дж.Дж. (2001). «Три новых компонента экзосомы человека» . Журнал биологической химии . 276 (9): 6177–84. дои : 10.1074/jbc.M007603200 . hdl : 2066/186951 . ПМИД   11110791 .
  4. ^ Чен, CY; Герци, Р; Онг, ЮВ; Чан, Эл; Райджмейкерс, Р; Пруейн, Г.Дж.; Стеклин, Г; Мороний, К; и др. (2001). «AU-связывающие белки привлекают экзосому для разрушения ARE-содержащих мРНК» . Клетка . 107 (4): 451–64. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00578-5 . ПМИД   11719186 . S2CID   14817671 .
  5. ^ Кунин Е.В. ; Вольф, Ю.И.; Аравинд, Л. (2001). «Прогнозирование экзосомы архей и ее связей с протеасомой, а также механизмами трансляции и транскрипции с помощью сравнительно-геномного подхода» . Геномные исследования . 11 (2): 240–52. дои : 10.1101/гр.162001 . ПМК   311015 . ПМИД   11157787 .
  6. ^ Евгеньева-Хакенберг, Э; Уолтер, П; Хохляйтнер, Э; Лотспайх, Ф; Клюг, Г. (2003). «Экзосомоподобный комплекс у Sulfolobus solfataricus» . Отчеты ЭМБО . 4 (9): 889–93. дои : 10.1038/sj.embor.embor929 . ПМЦ   1326366 . ПМИД   12947419 .
  7. ^ Перейти обратно: а б с д и ж Шильдерс, Г; Ван Дейк, Э; Райджмейкерс, Р; Пруейн, Дж.Дж. (2006). Клеточная и молекулярная биология экзосомы: как создавать или разрушать РНК . Международный обзор цитологии. Том. 251. С. 159–208. дои : 10.1016/S0074-7696(06)51005-8 . ISBN  9780123646552 . ПМИД   16939780 .
  8. ^ Лоренцен, Э; Уолтер, П; Фрибур, С; Евгеньева-Хакенберг, Э; Клюг, Г; Конти, Э (2005). «Ядро экзосомы архей представляет собой гексамерную кольцевую структуру с тремя каталитическими субъединицами». Структурная и молекулярная биология природы . 12 (7): 575–81. дои : 10.1038/nsmb952 . ПМИД   15951817 . S2CID   2003922 .
  9. ^ Перейти обратно: а б Шен, В; Киледжян, М (2006). «Взгляд на убийство: структура экзосомы РНК» . Клетка . 127 (6): 1093–5. дои : 10.1016/j.cell.2006.11.035 . ЧВК   1986773 . ПМИД   17174886 .
  10. ^ Райджмейкерс, Р; Эгбертс, Западная Вирджиния; Ван Венрой, WJ; Пруейн, Дж.Дж. (2002). «Белко-белковые взаимодействия между компонентами экзосом человека поддерживают сборку субъединиц РНКазы PH-типа в шестичленное ПНПазоподобное кольцо». Журнал молекулярной биологии . 323 (4): 653–63. дои : 10.1016/S0022-2836(02)00947-6 . hdl : 2066/186665 . ПМИД   12419256 .
  11. ^ Уолтер, П; Кляйн, Ф; Лоренцен, Э; Ильхманн, А; Клюг, Г; Евгеньева-Хакенберг, Э (2006). «Характеристика нативных и восстановленных экзосомных комплексов гипертермофильной археи Sulfolobus solfataricus». Молекулярная микробиология . 62 (4): 1076–89. дои : 10.1111/j.1365-2958.2006.05393.x . ПМИД   17078816 . S2CID   27114625 .
  12. ^ Исии, Р; Нуреки, О; Ёкояма, С. (2003). «Кристаллическая структура фермента процессинга тРНК РНКазы PH из Aquifex aeolicus» . Журнал биологической химии . 278 (34): 32397–404. дои : 10.1074/jbc.M300639200 . ПМИД   12746447 .
  13. ^ Харлоу, Л.С.; Кадзиола, А; Дженсен, К.Ф.; Ларсен, С. (2004). «Кристаллическая структура фосфоролитической экзорибонуклеазы РНКазы PH из Bacillus subtilis и значение ее четвертичной структуры и связывания тРНК» . Белковая наука . 13 (3): 668–77. дои : 10.1110/ps.03477004 . ПМК   2286726 . ПМИД   14767080 .
  14. ^ Симмонс, МФ; Джонс, GH; Луизи, БФ (2000). «Дублированная складка является структурной основой каталитической активности, процессивности и регуляции полинуклеотидфосфорилазы» . Структура . 8 (11): 1215–26. дои : 10.1016/S0969-2126(00)00521-9 . ПМИД   11080643 .
  15. ^ Линь-Чао, С; Чиу, Северная Каролина; Шустер, Г. (2007). «ПНПаза, экзосома и РНК-хеликазы как строительные компоненты эволюционно-консервативных машин деградации РНК» . Журнал биомедицинской науки . 14 (4): 523–32. дои : 10.1007/s11373-007-9178-y . ПМИД   17514363 .
  16. ^ Лебретон, А; Томецки, Р; Дзембовский, А; Серафин, Б. (2008). «Эндонуклеолитическое расщепление РНК эукариотической экзосомой» (PDF) . Природа . 456 (7224): 993–6. Бибкод : 2008Natur.456..993L . дои : 10.1038/nature07480 . ПМИД   19060886 . S2CID   1808371 .
  17. ^ Шнайдер, К; Люнг, Э; Браун, Дж; Толлерви, Д. (2009). «N-концевой PIN-домен субъединицы экзосомы Rrp44 обладает эндонуклеазной активностью и привязывает Rrp44 к экзосоме ядра дрожжей» . Исследования нуклеиновых кислот . 37 (4): 1127–40. дои : 10.1093/нар/gkn1020 . ПМК   2651783 . ПМИД   19129231 .
  18. ^ Шнайдер, К; Андерсон, Джей Ти; Толлерви, Д. (2007). «Субъединица экзосомы Rrp44 играет непосредственную роль в распознавании субстрата РНК» . Молекулярная клетка . 27 (2): 324–31. doi : 10.1016/j.molcel.2007.06.006 . ПМК   7610968 . ПМИД   17643380 .
  19. ^ Перейти обратно: а б Стаалс, Р.Х.; Бронкхорст, AW; Шильдерс, Г; Сломович, С; Шустер, Г; Черт возьми, Эй Джей; Райджмейкерс, Р; Пруейн, Дж.Дж. (2010). «Dis3-подобный 1: новая экзорибонуклеаза, связанная с экзосомой человека» . Журнал ЭМБО . 29 (14): 2358–67. дои : 10.1038/emboj.2010.122 . ПМК   2910272 . ПМИД   20531389 .
  20. ^ Перейти обратно: а б Томецки, Р; Кристиансен, MS; Люкке-Андерсен, С; Хлебовский, А; Ларсен, К.М.; Щесны, Р.Дж.; Дражковска, К; Пастула, А; и др. (2010). «Коровая экзосома человека взаимодействует с дифференциально локализованными процессивными РНКазами: hDIS3 и hDIS3L» . Журнал ЭМБО . 29 (14): 2342–57. дои : 10.1038/emboj.2010.121 . ПМЦ   2910271 . ПМИД   20531386 .
  21. ^ Миан, И.С. (1997). «Сравнительный анализ последовательностей рибонуклеаз HII, III, II PH и D» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (16): 3187–3195. дои : 10.1093/нар/25.16.3187 . ПМЦ   146874 . ПМИД   9241229 .
  22. ^ Райджмейкерс, Р; Шильдерс, Г; Пруейн, Дж.Дж. (2004). «Экзосома, молекулярная машина для контролируемой деградации РНК как в ядре, так и в цитоплазме». Европейский журнал клеточной биологии . 83 (5): 175–83. дои : 10.1078/0171-9335-00385 . ПМИД   15346807 .
  23. ^ Ван, Л; Льюис, MS; Джонсон, AW (2005). «Доменные взаимодействия внутри комплекса Ski2/3/8 и между комплексом Ski и Ski7p» . РНК . 11 (8): 1291–302. дои : 10.1261/rna.2060405 . ПМК   1370812 . ПМИД   16043509 .
  24. ^ ЛаКава, Дж; Хаусли, Дж; Савану, К; Петфальский, Э; Томпсон, Э; Жакье, А; Толлерви, Д. (2005). «Деградации РНК экзосомой способствует ядерный комплекс полиаденилирования» . Клетка . 121 (5): 713–24. дои : 10.1016/j.cell.2005.04.029 . ПМИД   15935758 . S2CID   14898055 .
  25. ^ Лю, Кью; Грейманн, Дж. К.; Лима, компакт-диск (2007). «Ошибка: восстановление, активность и структура экзосомы эукариотической РНК» . Клетка . 131 (1): 188–189. дои : 10.1016/j.cell.2007.09.019 .
  26. ^ Перейти обратно: а б Дзембовский, А; Лоренцен, Э; Конти, Э; Серафин, Б. (2007). «Одна субъединица, Dis3, по сути, отвечает за основную активность дрожжевой экзосомы». Структурная и молекулярная биология природы . 14 (1): 15–22. дои : 10.1038/nsmb1184 . ПМИД   17173052 . S2CID   24691764 .
  27. ^ Лю, Кью; Грейманн, Дж. К.; Лима, компакт-диск (2006). «Восстановление, активность и структура экзосомы эукариотической РНК» . Клетка . 127 (6): 1223–37. дои : 10.1016/j.cell.2006.10.037 . ПМИД   17174896 . S2CID   62785677 .
  28. ^ Лоренцен, Э; Конти, Э (2005). «Структурные основы распознавания 3'-конца РНК и экзорибонуклеолитического расщепления ядром экзосомы РНКазы PH» . Молекулярная клетка . 20 (3): 473–81. doi : 10.1016/j.molcel.2005.10.020 . ПМИД   16285928 .
  29. ^ ЛеЖен, Ф; Ли, Х; Макват, Л.Е. (2003). «Нонсенс-опосредованный распад мРНК в клетках млекопитающих включает декапирование, деаденилирование и экзонуклеолитическую активность» . Молекулярная клетка . 12 (3): 675–87. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00349-6 . ПМИД   14527413 .
  30. ^ Уилсон, Массачусетс; Мо, С; Ван Хоф, А. (2007). «Геномный скрининг дрожжей раскрывает новые аспекты непрерывного метаболизма мРНК» . Генетика . 177 (2): 773–84. doi : 10.1534/genetics.107.073205 . ПМК   2034642 . ПМИД   17660569 .
  31. ^ Лин, В.Дж.; Даффи, А; Чен, CY (2007). «Локализация мРНК, содержащей элементы, богатые AU, в цитоплазматических гранулах, содержащих субъединицы экзосом» . Журнал биологической химии . 282 (27): 19958–68. дои : 10.1074/jbc.M702281200 . ПМИД   17470429 .
  32. ^ Перейти обратно: а б Оллманг, К; Куфель, Дж; Шанфро, Дж; Митчелл, П; Петфальский, Э; Толлерви, Д. (1999). «Функции экзосомы в синтезе рРНК, мяРНК и мяРНК» . Журнал ЭМБО . 18 (19): 5399–410. дои : 10.1093/emboj/18.19.5399 . ПМЦ   1171609 . ПМИД   10508172 .
  33. ^ Шильдерс, Г; Райджмейкерс, Р; Раатс, Дж. М.; Пруейн, Дж.Дж. (2005). «MPP6 представляет собой ассоциированный с экзосомами РНК-связывающий белок, участвующий в созревании 5,8S рРНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (21): 6795–804. дои : 10.1093/nar/gki982 . ПМЦ   1310903 . ПМИД   16396833 .
  34. ^ ван Дейк, Эль; Шильдерс, Г; Пруейн, Дж.Дж. (2007). «Для роста клеток человека необходима функциональная цитоплазматическая экзосома, которая участвует в различных путях распада мРНК» . РНК . 13 (7): 1027–35. дои : 10.1261/rna.575107 . ЧВК   1894934 . ПМИД   17545563 .
  35. ^ Карпусис А.Дж., Эй.Дж. (2002). «Деградосома РНК Escherichia coli: структура, функции и взаимоотношения в других рибонуклеолитических мультиферментных комплексах». Биохим. Соц. Транс . 30 (2): 150–5. дои : 10.1042/BST0300150 . ПМИД   12035760 .
  36. ^ Хаусли Дж., ЛаКава Дж., Толлерви Д. (июль 2006 г.). «Контроль качества РНК экзосомой». Нат. Преподобный мол. Клеточная Биол . 7 (7): 529–39. дои : 10.1038/nrm1964 . ПМИД   16829983 . S2CID   22499032 .
  37. ^ Уайерс Ф, Ф; Ружмейль, М; Бадис, Г; и др. (июнь 2005 г.). «Загадочные транскрипты pol II разрушаются путем ядерного контроля качества с участием новой поли(А)-полимеразы» . Клетка . 121 (5): 725–37. дои : 10.1016/j.cell.2005.04.030 . ПМИД   15935759 . S2CID   1390706 .
  38. ^ Нил Х., Малабат С., д'Обентон-Карафа Ю., Сюй З., Стейнмец Л.М., Жакье А. (февраль 2009 г.). «Широко распространенные двунаправленные промоторы являются основным источником загадочных транскриптов у дрожжей». Природа . 457 (7232): 1038–42. Бибкод : 2009Natur.457.1038N . дои : 10.1038/nature07747 . ПМИД   19169244 . S2CID   4329373 .
  39. ^ Прекер П, П; Нильсен, Дж; Каммлер, С; и др. (декабрь 2008 г.). «Истощение экзосом РНК обнаруживает транскрипцию выше активных человеческих промоторов» . Наука . 322 (5909): 1851–4. Бибкод : 2008Sci...322.1851P . дои : 10.1126/science.1164096 . ПМИД   19056938 .
  40. ^ Дж. Э. Поуп, Дж. Э. (2002). «Синдромы перекрытия склеродермии». Современное мнение в ревматологии . 14 (6): 704–10. дои : 10.1097/00002281-200211000-00013 . ПМИД   12410095 .
  41. ^ Гелпи, К; Альгеро, А; Анхелес Мартинес, М; Видаль, С; Хуарес, К; Родригес-Санчес, JL (1991). «Идентификация белковых компонентов, реагирующих с аутоантителами против PM/Scl» . Клиническая и экспериментальная иммунология . 81 (1): 59–64. дои : 10.1111/j.1365-2249.1990.tb05291.x . ПМК   1535032 . ПМИД   2199097 .
  42. ^ Таргофф, И.Н.; Райхлин, М. (1985). «Ядрышковая локализация антигена PM-Scl». Артрит и ревматизм . 28 (2): 226–30. дои : 10.1002/арт.1780280221 . ПМИД   3918546 .
  43. ^ Райджмейкерс, Р; Ренц, М; Виманн, К; Эгбертс, Западная Вирджиния; Силиг, HP; Ван Венрой, WJ; Пруейн, Дж.Дж. (2004). «PM-Scl-75 является основным аутоантигеном у пациентов с синдромом перекрытия полимиозита/склеродермии». Артрит и ревматизм . 50 (2): 565–9. дои : 10.1002/арт.20056 . ПМИД   14872500 .
  44. ^ Брауэр, Р; Ври Эгбертс, WT; Хенгстман, Дж.Дж.; Райджмейкерс, Р; Ван Энгелен, БГ; Силиг, HP; Ренц, М; Мирау, Р; и др. (2002). «Аутоантитела, направленные к новым компонентам комплекса PM/Scl, экзосомы человека» . Исследования и терапия артрита . 4 (2): 134–8. дои : 10.1186/ar389 . ПМЦ   83843 . ПМИД   11879549 .
  45. ^ Шильдерс, Г; Эгбертс, Западная Вирджиния; Райджмейкерс, Р; Пруейн, Дж.Дж. (2007). «C1D является основной мишенью аутоантител у пациентов с синдромом перекрытия полимиозита и склеродермии». Артрит и ревматизм . 56 (7): 2449–54. дои : 10.1002/арт.22710 . ПМИД   17599775 .
  46. ^ Малер, М; Райджмейкерс, Р; Дэнрих, К; Блютнер, М; Фрицлер, MJ (2005). «Клиническая оценка аутоантител к новому пептидному антигену PM/Scl» . Исследования и терапия артрита . 7 (3): R704–13. дои : 10.1186/ar1729 . ПМК   1174964 . ПМИД   15899056 .
  47. ^ Малер, М; Райджмейкерс, Р. (2007). «Новые аспекты аутоантител к комплексу PM/Scl: клинические, генетические и диагностические данные». Обзоры аутоиммунитета . 6 (7): 432–7. дои : 10.1016/j.autrev.2007.01.013 . ПМИД   17643929 .
  48. ^ Яблонска, С; Блащик, М (1998). «Склеромиозит: синдром перекрытия склеродермии и полимиозита». Клиническая ревматология . 17 (6): 465–7. дои : 10.1007/BF01451281 . ПМИД   9890673 . S2CID   39237322 .
  49. ^ Лам, ПЯ; Броня, компакт-диск; Степанянц, С.Б.; Кавет, Г; Вольф, МК; Батлер, Дж.С.; Хиншоу, Джей Си; Гарнье, П; и др. (2004). «Обнаружение механизмов действия терапевтических соединений с использованием полногеномного скрининга дрожжевых гетерозигот» . Клетка . 116 (1): 121–37. дои : 10.1016/S0092-8674(03)01035-3 . ПМИД   14718172 . S2CID   11922219 .
  50. ^ Ван, Дж.; Юршоу, М.; Мамса, Х.; Рудник-Шёнеборн, С.; Менезес, член парламента; Хонг, JE; Леонг, Д.В.; Сендерек, Дж.; Салман, MS; Читаят, Д.; Симан, П.; Фон Моерс, А.; Грауль-Нойманн, Л.; Корнберг, AJ; Кастро-Гаго, М.; Собридо, MAJS; Санефудзи, М.; Ши, ПБ; Саламон, Н.; Ким, RC; Винтерс, Х.В.; Чен, З.; Зеррес, К.; Райан, ММ; Нельсон, Сан-Франциско; Джен, Джей Си (2012). «Мутации в гене компонента экзосомы РНК EXOSC3 вызывают понтоцеребеллярную гипоплазию и дегенерацию мотонейронов спинного мозга» . Природная генетика . 44 (6): 704–708. дои : 10.1038/ng.2254 . ПМК   3366034 . ПМИД   22544365 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Exosome_complex&oldid=1232936358"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 3a30bd1c96df906eba8472456834fae5__1720257300
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/3a/e5/3a30bd1c96df906eba8472456834fae5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Exosome complex - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)