ПРПФ19

ПРПФ19
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4LG8
Идентификаторы
Псевдонимы	PRPF19 , NMP200, PRP19, PSO4, SNEV, UBOX4, hPSO4, фактор процессинга пре-мРНК 19
Внешние идентификаторы	Опустить : 608330 ; МГИ : 106247 ; Гомологен : 6421 ; Генные карты : PRPF19 ; ОМА : PRPF19 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	60,906,585 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	10,886,923 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pons; ; right frontal lobe; ; Brodmann area 9; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; prefrontal cortex; ; cerebellar hemisphere; ; right hemisphere of cerebellum; ; anterior pituitary; ; islet of Langerhans;
	Top expressed in
	aortic valve; ; primitive streak; ; motor neuron; ; ascending aorta; ; fossa; ; right ventricle; ; epiblast; ; Paneth cell; ; facial motor nucleus; ; ankle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	ubiquitin protein ligase activity; ubiquitin-protein transferase activity; ubiquitin-ubiquitin ligase activity; protein binding; identical protein binding; transferase activity;
Cellular component	site of double-strand break; nuclear speck; catalytic step 2 spliceosome; membrane; lipid droplet; spindle; Prp19 complex; DNA replication factor A complex; spliceosomal complex; cytoskeleton; nucleus; cytoplasm; nucleoplasm; U2-type catalytic step 1 spliceosome; U2-type catalytic step 2 spliceosome;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; spliceosomal tri-snRNP complex assembly; lipid biosynthetic process; negative regulation of neuron differentiation; positive regulation of astrocyte differentiation; positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; protein K63-linked ubiquitination; mRNA processing; protein polyubiquitination; inner cell mass cell proliferation; cellular response to DNA damage stimulus; spliceosomal complex assembly; protein ubiquitination; proteasomal protein catabolic process; transcription-coupled nucleotide-excision repair; double-strand break repair via nonhomologous end joining; DNA repair; RNA splicing; generation of catalytic spliceosome for first transesterification step; positive regulation of neuron differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	27339
	28000
	ENSG00000110107
	ENSMUSG00000024735
	Q9UMS4
	Q99KP6
	НМ_014502
	НМ_001253843 ; НМ_001253844 ; НМ_134129
	НП_055317
	НП_001240772 ; НП_001240773 ; НП_598890
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор процессинга пре-мРНК 19 представляет собой белок , который у человека кодируется PRPF19 геном . ^[5]^[6]

У S. cerevisiae Pso4 выполняет плейотропные функции в рекомбинации ДНК и в подверженной ошибкам репарации негомологичного соединения концов ДНК. [предоставлено OMIM] ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что PRPF19 взаимодействует с CDC5L . ^[7]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000110107 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000024735 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Махаджан К.Н., Митчелл Б.С. (сентябрь 2003 г.). «Роль человеческого Pso4 в репарации ДНК млекопитающих и ассоциации с терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазой» . Proc Natl Acad Sci США . 100 (19): 10746–51. Бибкод : 2003PNAS..10010746M . дои : 10.1073/pnas.1631060100 . ЧВК 196874 . ПМИД 12960389 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: гомолог фактора процессинга пре-мРНК PRPF19 PRP19/PSO4 19 (S. cerevisiae)» .
^ Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . ЭМБО Дж . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ISSN 0261-4189 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

Дальнейшее чтение

Гернер С., Хольцманн К., Мейснер М. и др. (1999). «Повторная сборка белков и шаперонов во фракциях белков ядерного матрикса человека». Дж. Селл. Биохим . 74 (2): 145–51. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19990801)74:2<145::AID-JCB1>3.0.CO;2-# . ПМИД 10404385 . S2CID 196598497 .
Готцманн Дж., Гернер С., Мейснер М. и др. (2000). «hNMP 200: новый человеческий белок ядерного матрикса, сочетающий структурные и регуляторные функции». Эксп. Сотовый Res . 261 (1): 166–79. дои : 10.1006/excr.2000.5025 . ПМИД 11082287 .
Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Шерл А., Куте И., Деон С. и др. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека» . Мол. Биол. Клетка . 13 (11): 4100–9. doi : 10.1091/mbc.E02-05-0271 . ПМЦ 133617 . ПМИД 12429849 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Макарова О.В., Макаров Е.М., Урлауб Х. и др. (2004). «Подмножество белков 35S U5 человека, включая Prp19, функционирует до каталитического этапа 1 сплайсинга» . ЭМБО Дж . 23 (12): 2381–91. дои : 10.1038/sj.emboj.7600241 . ПМК 423283 . ПМИД 15175653 .
Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Курс. Биол . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 . S2CID 2371325 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Лёшер М., Форчеггер К., Риттер Г. и др. (2005). «Взаимодействие лигазы U-box E3 SNEV с PSMB4, субъединицей бета7 20 S протеасомы» . Биохим. Дж . 388 (Часть 2): 593–603. дои : 10.1042/BJ20041517 . ПМЦ 1138967 . ПМИД 15660529 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Чжан Н., Каур Р., Лу X и др. (2006). «Комплекс сплайсинга и репарации ДНК мРНК Pso4 взаимодействует с WRN для обработки межцепочечных поперечных связей ДНК» . Ж. Биол. Хим . 280 (49): 40559–67. дои : 10.1074/jbc.M508453200 . ПМИД 16223718 .
Гриллари Дж., Аджух П., Стадлер Г. и др. (2005). «SNEV — это эволюционно консервативный фактор сплайсинга, олигомеризация которого необходима для сборки сплайсосом» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (21): 6868–83. дои : 10.1093/nar/gki986 . ПМК 1310963 . ПМИД 16332694 .
Фоглауэр Р., Чанг М.В., Дампьер Б. и др. (2006). «Сверхэкспрессия SNEV продлевает продолжительность жизни эндотелиальных клеток человека». Эксп. Сотовый Res . 312 (6): 746–59. doi : 10.1016/j.yexcr.2005.11.025 . PMID 16388800 .
Лу Х, Легерски Р.Дж. (2007). «Ядерный комплекс Prp19/Pso4 подвергается убиквитилированию и структурным изменениям в ответ на повреждение ДНК» . Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 354 (4): 968–74. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.01.097 . ПМК 1810354 . ПМИД 17276391 .
Форчеггер К., Вагнер Б., Фоглауэр Р. и др. (2007). «Ранняя эмбриональная смертность мышей, лишенных необходимого белка SNEV» . Мол. Клетка. Биол . 27 (8): 3123–30. дои : 10.1128/MCB.01188-06 . ЧВК 1899945 . ПМИД 17283042 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000110107 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000024735 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12960389-5] Махаджан К.Н., Митчелл Б.С. (сентябрь 2003 г.). «Роль человеческого Pso4 в репарации ДНК млекопитающих и ассоциации с терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазой» . Proc Natl Acad Sci США . 100 (19): 10746–51. Бибкод : 2003PNAS..10010746M . дои : 10.1073/pnas.1631060100 . ЧВК 196874 . ПМИД 12960389 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: гомолог фактора процессинга пре-мРНК PRPF19 PRP19/PSO4 19 (S. cerevisiae)» .

[pmid11101529-7] Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . ЭМБО Дж . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ISSN 0261-4189 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]