ПРПФ31

ПРПФ31
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2OZB, 3SIU, 3SIV, 3JCR,%%s3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	PRPF31 , фактор процессинга пре-мРНК 31, NY-BR-99, PRP31, RP11, SNRNP61
Внешние идентификаторы	Опустить : 606419 ; МГИ : 1916238 ; Гомологен : 5980 ; Генные карты : PRPF31 ; OMA : PRPF31 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	54,131,719 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	3,645,485 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; granulocyte; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; muscle layer of sigmoid colon; ; placenta; ; body of uterus; ; apex of heart; ; right ovary; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	primitive streak; ; yolk sac; ; ventricular zone; ; neural layer of retina; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; epiblast; ; hair follicle; ; embryo; ; embryo;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	snRNP binding; U4 snRNA binding; U4atac snRNA binding; protein binding; ribonucleoprotein complex binding; RNA binding;
Cellular component	Cajal body; nuclear speck; U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; U4atac snRNP; nucleoplasm; MLL1 complex; U2-type spliceosomal complex; precatalytic spliceosome; spliceosomal complex; U4 snRNP; nucleus; U2-type precatalytic spliceosome;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; spliceosomal tri-snRNP complex assembly; mRNA processing; snoRNA localization; ribonucleoprotein complex localization; RNA splicing;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	26121
	68988
	ENSG00000275885 ; ENSG00000105618
	ENSMUSG00000008373
	Q8WWY3
	Q8CCF0
	НМ_015629
	НМ_001159714 ; НМ_027328
	НП_056444 ; НП_056444.3
	НП_001153186 ; НП_081604
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомолог фактора процессинга 31 пре-мРНК PRP31 (S. cerevisiae) , также известный как PRPF31 , представляет собой белок , который у человека кодируется PRPF31 геном . ^[5]

Функция

PRPF31 — это ген, кодирующий фактор сплайсинга hPRP31. Это важно для образования сплайсосомы. hPRP31 связан с ди-мяРНП U4 / U6 и взаимодействует с другим фактором сплайсинга, h PRP6 , с образованием три-мяРНП U4/U6- U5 . Было показано, что при нокдауне hPRP31 РНКи ди-мяРНП U4/U6 накапливаются в тельцах Кахаля и три-мяРНП U4/U6-U5 не могут образоваться. ^[6]

PRPF31 рекрутируется в интроны после присоединения РНК U4 и U6 и белка NHP2L1 15,5К . Добавление PRPF31 имеет решающее значение для перехода сплайсосомного комплекса в активированное состояние. ^[7]

Клиническое значение

Мутация PRPF31 является одной из 4 известных мутаций факторов сплайсинга, которые, как известно, вызывают пигментный ретинит . Первая мутация PRPF31 была обнаружена Vithana et al. в 2001 году. ^[5] Пигментный ретинит (РП) — клинически и генетически гетерогенная группа дистрофий сетчатки, характеризующаяся прогрессирующей дегенерацией фоторецепторов , приводящая в конечном итоге к тяжелым нарушениям зрения. ^[8]

Наследование

Мутации PRPF31 наследуются по аутосомно-доминантному типу, что составляет 2,5% случаев аутосомно-доминантного пигментного ретинита (adRP) в смешанной популяции Великобритании. ^[9] Однако характер наследования мутаций PRPF31 нетипичен для доминантного наследования и демонстрирует феномен частичной пенетрантности , при котором доминантные мутации, по-видимому, «пропускают» поколения. Считается, что это связано с наличием двух аллелей дикого типа с высокой экспрессивностью : аллеля и аллеля с низкой экспрессивностью. Если у пациента есть мутантный аллель и аллель с высокой экспрессией, у них не проявляется фенотип заболевания. Если у пациента есть мутантный аллель и аллель с низкой экспрессией, остаточный уровень белка падает ниже порога нормальной функции, и поэтому у него действительно проявляется фенотип заболевания. Таким образом, тип наследования PRPF31 можно рассматривать как разновидность гаплонедостаточности . Этот вариант гаплонедостаточности наблюдается только при двух других заболеваниях человека: эритропоэтической протопорфирии , вызванной мутациями в гене FECH ; и наследственный эллиптоцитоз , вызванный мутациями в гене спектрина . ^[10]^[11]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000105618 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000275885, ENSG00000105618 — Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000008373 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б Витана Э.Н., Абу-Сафие Л., Аллен М.Дж., Кэри А., Папайоанну М., Чакарова С., Аль-Магтех М., Эбенезер Н.Д., Уиллис С., Мур А.Т., Берд А.С., Хант Д.М., Бхаттачарья С.С. (август 2001 г.). «Человеческий гомолог гена сплайсинга пре-мРНК дрожжей, PRP31, лежит в основе аутосомно-доминантного пигментного ретинита на хромосоме 19q13.4 (RP11)» . Мол. Клетка . 8 (2): 375–81. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00305-7 . ПМИД 11545739 .
^ Шафферт Н., Хоссбах М., Хайнцманн Р., Аксель Т., Люрманн Р. (август 2004 г.). «Нокдаун РНКи hPrp31 приводит к накоплению ди-мяРНП U4/U6 в тельцах Кахаля» . ЭМБО Дж . 23 (15): 3000–9. дои : 10.1038/sj.emboj.7600296 . ПМК 514917 . ПМИД 15257298 .
^ Лю С., Ли П., Дыбков О., Ноттротт С., Хартмут К., Люрманн Р., Карломаньо Т., Валь MC (апрель 2007 г.). «Связывание человеческого домена Nop Prp31 с составной РНК-белковой платформой в мяРНП U4». Наука . 316 (5821): 115–20. Бибкод : 2007Sci...316..115L . дои : 10.1126/science.1137924 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-E16C-F . ПМИД 17412961 . S2CID 22091845 .
^ «Ген Entrez: PRPF31 гомолог фактора процессинга пре-мРНК PRP31 31 (S. cerevisiae)» .
^ Васим Н.Х., Вацлавик В., Вебстер А., Дженкинс С.А., Бёрд А.С., Бхаттачарья СС (март 2007 г.). «Мутации в гене, кодирующем фактор сплайсинга пре-мРНК, PRPF31, у пациентов с аутосомно-доминантным пигментным ретинитом». Исследовательская офтальмология и визуальные науки . 48 (3): 1330–4. дои : 10.1167/iovs.06-0963 . ПМИД 17325180 .
^ Рэндон Дж., Буланже Л., Марешаль Дж., Гарбарз М., Валье А., Рибейро Л., Таманьини Дж., Дерми Д., Делоне Дж. (ноябрь 1994 г.). «Вариант аллели альфа LELY с низкой экспрессией спектрина, несущий наследственную мутацию эллиптоцитоза в кодоне 28». Br J Гематол . 88 (3): 534–40. дои : 10.1111/j.1365-2141.1994.tb05070.x . ПМИД 7819065 . S2CID 39527747 .
^ Гуя Л., Пюи Х., Ламорил Дж., Да Силва В., Граншан Б., Нордманн Ю., Дейбах Дж. К. (июнь 1998 г.). «Наследование при эритропоэтической протопорфирии: распространенный аллельный вариант феррохелатазы дикого типа с низкой экспрессией объясняет клинические проявления». Ам Джей Хум Жене . 93 (6): 2150–10. ПМИД 10068685 .

Дальнейшее чтение

Тариццо МЛ (1975). «Всемирная организация здравоохранения и профилактика слепоты». Транзакции. Раздел по офтальмологии. Американская академия офтальмологии и отоларингологии . 79 (3 ч. 2): OP453–6. ПМИД 1154573 .
аль-Магте М., Инглхерн К.Ф., Кин Т.Дж. и др. (1994). «Идентификация шестого локуса аутосомно-доминантного пигментного ретинита на хромосоме 19». Хм. Мол. Жене . 3 (2): 351–4. дои : 10.1093/hmg/3.2.351 . ПМИД 8004108 .
Аль-Магте М., Витана Э., Тарттелин Э. и др. (1996). «Доказательства наличия основного локуса пигментного ретинита на 19q13.4 (RP11) и ассоциации с уникальным фенотипом бимодальной экспрессивности» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 59 (4): 864–71. ЧВК 1914817 . ПМИД 8808602 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Витана Э.Н., Абу-Сафие Л., Аллен М.Дж. и др. (2001). «Человеческий гомолог гена сплайсинга пре-мРНК дрожжей, PRP31, лежит в основе аутосомно-доминантного пигментного ретинита на хромосоме 19q13.4 (RP11)» . Мол. Клетка . 8 (2): 375–81. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00305-7 . ПМИД 11545739 .
Макарова О.В., Макаров Е.М., Лю С. и др. (2002). «Белок 61K, кодируемый геном (PRPF31), связанным с аутосомно-доминантным пигментным ретинитом, необходим для образования три-мяРНП U4/U6·U5 и сплайсинга пре-мРНК» . ЭМБО Дж . 21 (5): 1148–57. дои : 10.1093/emboj/21.5.1148 . ПМК 125353 . ПМИД 11867543 .
Дири Э.К., Витана Э.Н., Ньюболд Р.Дж. и др. (2003). «Механизм заболевания пигментным ретинитом (RP11), вызванным мутациями в гене фактора сплайсинга PRPF31» . Хм. Мол. Жене . 11 (25): 3209–19. дои : 10.1093/hmg/11.25.3209 . ПМИД 12444105 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Мартинес-Химено М., Гамунди М.Дж., Эрнан И. и др. (2003). «Мутации в генах фактора сплайсинга пре-мРНК PRPF3, PRPF8 и PRPF31 в испанских семьях с аутосомно-доминантным пигментным ретинитом». Инвестируйте. Офтальмол. Вис. Наука . 44 (5): 2171–7. дои : 10.1167/iovs.02-0871 . ПМИД 12714658 .
Сканлан М.Дж., Подагра I, Гордон CM и др. (2003). «Гуморальный иммунитет к раку молочной железы человека: определение антигена и количественный анализ экспрессии мРНК». Рак Иммунитет . 1 :4. ПМИД 12747765 .
Ван Л., Рибаудо М., Чжао К. и др. (2003). «Новая делеция в гене сплайсинга пре-мРНК PRPF31 вызывает аутосомно-доминантный пигментный ретинит в большой китайской семье» . Являюсь. Дж. Мед. Жене. А. 121 (3): 235–9. дои : 10.1002/ajmg.a.20224 . ПМЦ 1579744 . ПМИД 12923864 .
Рейтер Т.Я., Медхерст А.Л., Вайсфис К. и др. (2003). «Двугибридные дрожжевые скрининги подразумевают участие белков анемии Фанкони в регуляции транскрипции, передаче сигналов в клетках, окислительном метаболизме и клеточном транспорте». Эксп. Сотовый Res . 289 (2): 211–21. дои : 10.1016/S0014-4827(03)00261-1 . ПМИД 14499622 .
Витана Э.Н., Абу-Сафие Л., Пелосини Л. и др. (2003). «Экспрессия мРНК PRPF31 у пациентов с аутосомно-доминантным пигментным ретинитом: молекулярный ключ к неполной пенетрантности?». Инвестируйте. Офтальмол. Вис. Наука . 44 (10): 4204–9. дои : 10.1167/iovs.03-0253 . ПМИД 14507862 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология 19-й хромосомы человека» . Природа . 428 (6982): 529–35. Бибкод : 2004Natur.428..529G . дои : 10.1038/nature02399 . ПМИД 15057824 .
Ся К., Чжэн Д., Пань К. и др. (2004). «Новая мутация сайта сплайсинга PRPF31 в китайской семье с аутосомно-доминантным пигментным ретинитом». Мол. Вис . 10 : 361–5. ПМИД 15162096 .
Шафферт Н., Хоссбах М., Хайнцманн Р. и др. (2005). «Нокдаун РНКи hPrp31 приводит к накоплению ди-мяРНП U4/U6 в тельцах Кахаля» . ЭМБО Дж . 23 (15): 3000–9. дои : 10.1038/sj.emboj.7600296 . ПМК 514917 . ПМИД 15257298 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW об обзоре пигментного ретинита

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000105618 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000275885, ENSG00000105618 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000008373 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11545739-5] Перейти обратно: ^а ^б Витана Э.Н., Абу-Сафие Л., Аллен М.Дж., Кэри А., Папайоанну М., Чакарова С., Аль-Магтех М., Эбенезер Н.Д., Уиллис С., Мур А.Т., Берд А.С., Хант Д.М., Бхаттачарья С.С. (август 2001 г.). «Человеческий гомолог гена сплайсинга пре-мРНК дрожжей, PRP31, лежит в основе аутосомно-доминантного пигментного ретинита на хромосоме 19q13.4 (RP11)» . Мол. Клетка . 8 (2): 375–81. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00305-7 . ПМИД 11545739 .

[pmid15257298-6] Шафферт Н., Хоссбах М., Хайнцманн Р., Аксель Т., Люрманн Р. (август 2004 г.). «Нокдаун РНКи hPrp31 приводит к накоплению ди-мяРНП U4/U6 в тельцах Кахаля» . ЭМБО Дж . 23 (15): 3000–9. дои : 10.1038/sj.emboj.7600296 . ПМК 514917 . ПМИД 15257298 .

[pmid17412961-7] Лю С., Ли П., Дыбков О., Ноттротт С., Хартмут К., Люрманн Р., Карломаньо Т., Валь MC (апрель 2007 г.). «Связывание человеческого домена Nop Prp31 с составной РНК-белковой платформой в мяРНП U4». Наука . 316 (5821): 115–20. Бибкод : 2007Sci...316..115L . дои : 10.1126/science.1137924 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-E16C-F . ПМИД 17412961 . S2CID 22091845 .

[entrez-8] «Ген Entrez: PRPF31 гомолог фактора процессинга пре-мРНК PRP31 31 (S. cerevisiae)» .

[pmid17325180-9] Васим Н.Х., Вацлавик В., Вебстер А., Дженкинс С.А., Бёрд А.С., Бхаттачарья СС (март 2007 г.). «Мутации в гене, кодирующем фактор сплайсинга пре-мРНК, PRPF31, у пациентов с аутосомно-доминантным пигментным ретинитом». Исследовательская офтальмология и визуальные науки . 48 (3): 1330–4. дои : 10.1167/iovs.06-0963 . ПМИД 17325180 .

[pmid7819065-10] Рэндон Дж., Буланже Л., Марешаль Дж., Гарбарз М., Валье А., Рибейро Л., Таманьини Дж., Дерми Д., Делоне Дж. (ноябрь 1994 г.). «Вариант аллели альфа LELY с низкой экспрессией спектрина, несущий наследственную мутацию эллиптоцитоза в кодоне 28». Br J Гематол . 88 (3): 534–40. дои : 10.1111/j.1365-2141.1994.tb05070.x . ПМИД 7819065 . S2CID 39527747 .

[pmid10068685-11] Гуя Л., Пюи Х., Ламорил Дж., Да Силва В., Граншан Б., Нордманн Ю., Дейбах Дж. К. (июнь 1998 г.). «Наследование при эритропоэтической протопорфирии: распространенный аллельный вариант феррохелатазы дикого типа с низкой экспрессией объясняет клинические проявления». Ам Джей Хум Жене . 93 (6): 2150–10. ПМИД 10068685 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]