ПРПФ4Б

ПРПФ4Б
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	4IAN, 4IFC, 4IIR, 4IJP
Идентификаторы
Псевдонимы	PRPF4B , PR4H, PRP4, PRP4H, PRP4K, dJ1013A10.1, фактор процессинга пре-мРНК 4B
Внешние идентификаторы	Опустить : 602338 ; МГИ : 109584 ; Гомологен : 134085 ; Генные карты : PRPF4B ; OMA : PRPF4B — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	4,064,983 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	34,906,064 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	endothelial cell; ; Epithelium of choroid plexus; ; mucosa of paranasal sinus; ; Achilles tendon; ; epithelium of nasopharynx; ; ventricular zone; ; left ovary; ; body of uterus; ; right ovary; ; right uterine tube;
	Top expressed in
	fossa; ; condyle; ; genital tubercle; ; Paneth cell; ; tail of embryo; ; lobe of cerebellum; ; cerebellar vermis; ; substantia nigra; ; otic placode; ; saccule;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	kinase activity; transferase activity; protein kinase activity; protein serine/threonine kinase activity; nucleotide binding; protein binding; ATP binding; cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; RNA binding;
Cellular component	catalytic step 2 spliceosome; spliceosomal complex; nucleus; chromosome; nuclear speck;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; protein phosphorylation; mRNA processing; RNA splicing; phosphorylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	8899
	19134
	ENSG00000112739
	ENSMUSG00000021413
	Q13523
	Q61136
	НМ_003913 ; НМ_176800
	НМ_013830
	НП_003904
	НП_038858
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомолог серин/треонин-протеинкиназы PRP4 представляет собой фермент , который у человека кодируется PRPF4B геном . ^[5]^[6]^[7]

Сплайсинг пре-мРНК происходит в два последовательных этапа переэтерификации, и считается, что белок, кодируемый этим геном, участвует в сплайсинге пре-мРНК и в передаче сигнала. Этот белок принадлежит к семейству киназ, которое включает богатые серином/аргинином протеинспецифические киназы и циклинзависимые киназы (CDK). Этот белок рассматривается как CDK-подобная киназа (Clk) с гомологией митоген-активируемых протеинкиназ (MAPK). ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что PRPF4B взаимодействует с Пинином . ^[8]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000112739 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021413 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (август 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . ДНК Рез . 5 (1): 31–9. дои : 10.1093/dnares/5.1.31 . ПМИД 9628581 .
^ Кодзима Т., Зама Т., Вада К., Оноги Х., Хагивара М. (август 2001 г.). «Клонирование человеческого PRP4 обнаруживает взаимодействие с Clk1» . J Биол Хим . 276 (34): 32247–56. дои : 10.1074/jbc.M103790200 . ПМИД 11418604 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: PRPF4B Гомолог B фактора процессинга пре-мРНК PRP4 4 (дрожжи)» .
^ Деллер, Грэм; Макаров Евгений М; Каугер Джефф Дж.М.; Лонгман Даса; Сазерленд Хайди Дж.Э.; Люрман Рейнхард; Торчиа Джозеф; Бикмор Венди А. (июль 2002 г.). «Киназа PRP4 млекопитающих совместно очищает и взаимодействует с компонентами как мяРНП U5, так и комплексов деацетилазы N-CoR» . Мол. Клетка. Биол . 22 (14). США: 5141–56. дои : 10.1128/MCB.22.14.5141-5156.2002 . hdl : 11858/00-001M-0000-0029-BC76-A . ISSN 0270-7306 . ПМК 139773 . ПМИД 12077342 .

Дальнейшее чтение

Шульц С.Дж., Нигг Э.А. (1994). «Идентификация 21 новой протеинкиназы человека, включая 3 членов семейства, родственного регулятору клеточного цикла nimA Aspergillus nidulans». Рост клеток отличается . 4 (10): 821–30. ПМИД 8274451 .
Гросс Т., Лютцельбергер М., Вейгманн Х. и др. (1997). «Функциональный анализ протеинкиназы Prp4 делящихся дрожжей, участвующей в сплайсинге пре-мРНК и выделении предполагаемого гомолога млекопитающих» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (5): 1028–35. дои : 10.1093/нар/25.5.1028 . ПМК 146536 . ПМИД 9102632 .
Хуан Ю, Дэн Т, Уинстон Б.В. (2000). «Характеристика активации киназы hPRP4: потенциальная роль в передаче сигналов». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 271 (2): 456–63. дои : 10.1006/bbrc.2000.2651 . ПМИД 10799319 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Деллер Г., Макаров Е.М., Каугер Дж.Дж. и др. (2002). «Киназа PRP4 млекопитающих совместно очищает и взаимодействует с компонентами как мяРНП U5, так и комплексов деацетилазы N-CoR» . Мол. Клетка. Биол . 22 (14): 5141–56. дои : 10.1128/MCB.22.14.5141-5156.2002 . ПМК 139773 . ПМИД 12077342 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Нат. Биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Беннетт Э.М., Левер А.М., Аллен Дж.Ф. (2004). «Gag вируса иммунодефицита человека типа 2 специфически взаимодействует с PRP4, серин-треониновой киназой, и ингибирует фосфорилирование фактора сплайсинга SF2» . Дж. Вирол . 78 (20): 11303–12. doi : 10.1128/JVI.78.20.11303-11312.2004 . ПМК 521795 . ПМИД 15452250 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Чжан Ю., Вольф-Ядлин А., Росс П.Л. и др. (2005). «Масс-спектрометрия с временным разрешением участков фосфорилирования тирозина в сигнальной сети рецептора эпидермального фактора роста выявляет динамические модули» . Мол. Клетка. Протеомика . 4 (9): 1240–50. дои : 10.1074/mcp.M500089-MCP200 . ПМИД 15951569 .
Стельзл Ю., Ворм Ю., Лаловски М. и др. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .
Ноусиайнен М., Силье Х.Х., Зауэр Г. и др. (2006). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (14): 5391–6. Бибкод : 2006PNAS..103.5391N . дои : 10.1073/pnas.0507066103 . ПМЦ 1459365 . ПМИД 16565220 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Нат. Биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
Хуанг Б., Ан Ю.Т., Макферсон Л. и др. (2007). «Взаимодействие PRP4 с Круппелеподобным фактором 13 регулирует транскрипцию CCL5» . Дж. Иммунол . 178 (11): 7081–7. doi : 10.4049/jimmunol.178.11.7081 . ПМЦ 2674583 . ПМИД 17513757 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000112739 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021413 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9628581-5] Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (август 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . ДНК Рез . 5 (1): 31–9. дои : 10.1093/dnares/5.1.31 . ПМИД 9628581 .

[pmid11418604-6] Кодзима Т., Зама Т., Вада К., Оноги Х., Хагивара М. (август 2001 г.). «Клонирование человеческого PRP4 обнаруживает взаимодействие с Clk1» . J Биол Хим . 276 (34): 32247–56. дои : 10.1074/jbc.M103790200 . ПМИД 11418604 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: PRPF4B Гомолог B фактора процессинга пре-мРНК PRP4 4 (дрожжи)» .

[pmid12077342-8] Деллер, Грэм; Макаров Евгений М; Каугер Джефф Дж.М.; Лонгман Даса; Сазерленд Хайди Дж.Э.; Люрман Рейнхард; Торчиа Джозеф; Бикмор Венди А. (июль 2002 г.). «Киназа PRP4 млекопитающих совместно очищает и взаимодействует с компонентами как мяРНП U5, так и комплексов деацетилазы N-CoR» . Мол. Клетка. Биол . 22 (14). США: 5141–56. дои : 10.1128/MCB.22.14.5141-5156.2002 . hdl : 11858/00-001M-0000-0029-BC76-A . ISSN 0270-7306 . ПМК 139773 . ПМИД 12077342 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]