ДКП1А

ДКП1А
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2WX3, 4B6H
Идентификаторы
Псевдонимы	DCP1A , HSA275986, Nbla00360, SMAD4IP1, SMIF, декапирующая мРНК 1А
Внешние идентификаторы	Опустить : 607010 ; МГИ : 1923151 ; Гомологен : 10178 ; Генные карты : DCP1A ; ОМА : DCP1A – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	53,347,586 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	30,249,020 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	oocyte; ; secondary oocyte; ; cartilage tissue; ; testicle; ; Achilles tendon; ; gonad; ; sural nerve; ; tibialis anterior muscle; ; buccal mucosa cell; ; islet of Langerhans;
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; zygote; ; primary oocyte; ; medullary collecting duct; ; tail of embryo; ; saccule; ; otic vesicle; ; genital tubercle; ; otic placode; ; cumulus cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	enzyme regulator activity; enzyme activator activity; protein binding; mRNA binding; hydrolase activity; identical protein binding; kinesin binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; membrane; nucleus; P-body; cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Biological process	positive regulation of catalytic activity; deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA; protein localization to cytoplasmic stress granule; regulation of mRNA stability; deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA; exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	55802
	75901
	ENSG00000272886
	ENSMUSG00000021962
	Q9NPI6
	Q91YD3
	НМ_018403 ; НМ_001290204 ; НМ_001290205 ; НМ_001290206 ; НМ_001290207
	НМ_133761
	НП_001277133 ; НП_001277134 ; НП_001277135 ; НП_001277136 ; НП_060873
	НП_598522
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фермент 1А, декепирующий мРНК, представляет собой белок , который у человека кодируется DCP1A геном . ^[5]

Декапирование является ключевым этапом общего и регулируемого распада мРНК. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой декапирующий фермент. Этот белок и другой декапирующий фермент образуют декапирующий комплекс, который взаимодействует с нонсенс-опосредованным фактором распада hUpf1 и может рекрутироваться в мРНК, содержащие кодоны преждевременного терминирования. Этот белок также участвует в сигнальном пути TGF-бета. ^[5]

Взаимодействия

Было показано, что DCP1A взаимодействует с DCP2. ^[6] и УПФ1 . ^[6] Также было показано, что он колокализуется с GW182 и другими маркерами P-тела . ^[7] Человеческий DCP1A является гетеротримерным, ^[8] и устанавливает контакт с каркасом EDC3/4. ^[9] Гомолог Arabidopsis thaliana взаимодействует с растительным специфичным моторным белком миозина типа XI . ^[10]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000272886 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021962 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: гомолог А фермента, декапирующего DCP1 DCP1 (S. cerevisiae)» .
^ Jump up to: ^а ^б Люкке-Андерсен Дж (декабрь 2002 г.). «Идентификация человеческого декапирующего комплекса, связанного с белками hUpf при нонсенс-опосредованном распаде» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (23): 8114–8121. дои : 10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002 . ПМК 134073 . ПМИД 12417715 .
^ Эйстатиой Т., Якимив А., Чан Е.К., Серафин Б., Куго Н., Фрицлер М.Дж. (октябрь 2003 г.). «Белок GW182 колокализуется с белками, связанными с деградацией мРНК hDcp1 и hLSm4, в цитоплазматических тельцах GW» . РНК . 9 (10): 1171–1173. дои : 10.1261/rna.5810203 . ПМК 1370480 . ПМИД 13130130 .
^ Тритшлер Ф., Браун Дж.Э., Моц С., Играя С., Хаас Г., Трюффо В. и др. (декабрь 2009 г.). «DCP1 образует асимметричные тримеры для сборки в активные комплексы, декапирующие мРНК у многоклеточных животных» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (51): 21591–21596. Бибкод : 2009PNAS..10621591T . дои : 10.1073/pnas.0909871106 . ПМЦ 2789166 . ПМИД 19966221 .
^ Тритшлер Ф., Эулалио А., Трюффо В., Хартманн, доктор медицинских наук, Хелмс С., Шмидт С. и др. (декабрь 2007 г.). «Дивергентная складка Sm в белках EDC3 опосредует связывание DCP1 и нацеливание на P-тельца» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (24): 8600–8611. дои : 10.1128/MCB.01506-07 . ПМК 2169425 . ПМИД 17923697 .
^ Стеффенс А., Ягле Б., Треш А., Хюльскамп М., Якоби М. (апрель 2014 г.). «Движение процессингового тела у Arabidopsis зависит от взаимодействия между миозинами и ДЕКАППИРУЮЩИМ БЕЛКОМ 1» . Физиология растений . 164 (4): 1879–1892. дои : 10.1104/стр.113.233031 . ПМЦ 3982750 . ПМИД 24525673 .

Дальнейшее чтение

Бай Р.Ю., Кестер С., Оуян Т., Хан С.А., Хаммершмидт М., Пешель С., Дайстер Дж. (март 2002 г.). «SMIF, белок, взаимодействующий с Smad4, который действует как коактиватор передачи сигналов TGFbeta». Природная клеточная биология . 4 (3): 181–190. дои : 10.1038/ncb753 . ПМИД 11836524 . S2CID 19938060 .
Каллебо I (май 2002 г.). «Домен EVH1/WH1 как ключевой участник передачи сигналов TGFbeta» . Письма ФЭБС . 519 (1–3): 178–180. дои : 10.1016/S0014-5793(02)02751-5 . ПМИД 12023040 . S2CID 84499961 .
Люкке-Андерсен Дж (декабрь 2002 г.). «Идентификация человеческого декапирующего комплекса, связанного с белками hUpf при нонсенс-опосредованном распаде» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (23): 8114–8121. дои : 10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002 . ПМК 134073 . ПМИД 12417715 .
Ингельфингер Д., Арндт-Йовин DJ, Люрманн Р., Аксель Т. (декабрь 2002 г.). «Белки LSm1-7 человека колокализуются с ферментами, разрушающими мРНК Dcp1/2 и Xrnl, в отдельных цитоплазматических фокусах» . РНК . 8 (12): 1489–1501. дои : 10.1017/S1355838202021726 . ПМК 1370355 . ПМИД 12515382 .
Леонард Д., Аджу П., Ламонд А.И., Легерски Р.Дж. (сентябрь 2003 г.). «hLodestar/HuF2 взаимодействует с CDC5L и участвует в сплайсинге пре-мРНК». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359 . дои : 10.1016/S0006-291X(03)01486-4 . ПМИД 12927788 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (июль 2004 г.). «Схема взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1315–1323. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж. и др. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–12135. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Лю Дж., Валенсия-Санчес М.А., Хэннон Г.Дж., Паркер Р. (июль 2005 г.). «МикроРНК-зависимая локализация целевых мРНК в P-тельцах млекопитающих» . Природная клеточная биология . 7 (7): 719–723. дои : 10.1038/ncb1274 . ПМК 1855297 . ПМИД 15937477 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–1178. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Фенгер-Грён М., Филлман С., Норрильд Б., Люкке-Андерсен Дж. (декабрь 2005 г.). «Множественные факторы обработки тела и ARE-связывающий белок TTP активируют декапирование мРНК» . Молекулярная клетка . 20 (6): 905–915. doi : 10.1016/j.molcel.2005.10.031 . ПМИД 16364915 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–648. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000272886 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021962 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: гомолог А фермента, декапирующего DCP1 DCP1 (S. cerevisiae)» .

[pmid12417715-6] Jump up to: ^а ^б Люкке-Андерсен Дж (декабрь 2002 г.). «Идентификация человеческого декапирующего комплекса, связанного с белками hUpf при нонсенс-опосредованном распаде» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (23): 8114–8121. дои : 10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002 . ПМК 134073 . ПМИД 12417715 .

[7] Эйстатиой Т., Якимив А., Чан Е.К., Серафин Б., Куго Н., Фрицлер М.Дж. (октябрь 2003 г.). «Белок GW182 колокализуется с белками, связанными с деградацией мРНК hDcp1 и hLSm4, в цитоплазматических тельцах GW» . РНК . 9 (10): 1171–1173. дои : 10.1261/rna.5810203 . ПМК 1370480 . ПМИД 13130130 .

[8] Тритшлер Ф., Браун Дж.Э., Моц С., Играя С., Хаас Г., Трюффо В. и др. (декабрь 2009 г.). «DCP1 образует асимметричные тримеры для сборки в активные комплексы, декапирующие мРНК у многоклеточных животных» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (51): 21591–21596. Бибкод : 2009PNAS..10621591T . дои : 10.1073/pnas.0909871106 . ПМЦ 2789166 . ПМИД 19966221 .

[9] Тритшлер Ф., Эулалио А., Трюффо В., Хартманн, доктор медицинских наук, Хелмс С., Шмидт С. и др. (декабрь 2007 г.). «Дивергентная складка Sm в белках EDC3 опосредует связывание DCP1 и нацеливание на P-тельца» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (24): 8600–8611. дои : 10.1128/MCB.01506-07 . ПМК 2169425 . ПМИД 17923697 .

[10] Стеффенс А., Ягле Б., Треш А., Хюльскамп М., Якоби М. (апрель 2014 г.). «Движение процессингового тела у Arabidopsis зависит от взаимодействия между миозинами и ДЕКАППИРУЮЩИМ БЕЛКОМ 1» . Физиология растений . 164 (4): 1879–1892. дои : 10.1104/стр.113.233031 . ПМЦ 3982750 . ПМИД 24525673 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]