ПРПФ40А

ПРПФ40А
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1UZC, 1YWI, 1YWJ, 1ZR7, 2CQN, 2DYF, 2KZG, 2L5F, 2L9V, 2LKS
Идентификаторы
Псевдонимы	PRPF40A , FBP-11, FBP11, FLAF1, FNBP3, HIP-10, HIP10, HYPA, NY-REN-6, Prp40, гомолог A фактора процессинга пре-мРНК 40
Внешние идентификаторы	Опустить : 612941 ; МГИ : 1860512 ; Гомологен : 6377 ; Генные карты : PRPF40A ; ОМА : PRPF40A – ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 2 (human) Band 2q23.3 Start 152,651,593 bp End 152,718,012 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2|2 C1.1 Start 53,134,704 bp End 53,191,284 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in secondary oocyte caput epididymis corpus epididymis tail of epididymis Achilles tendon epithelium of nasopharynx trabecular bone mucosa of paranasal sinus oral cavity visceral pleura Top expressed in tail of embryo genital tubercle spermatid spermatocyte ventricular zone Rostral migratory stream zygote abdominal wall embryo epiblast More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function proline-rich region binding protein binding RNA binding Cellular component nuclear matrix U1 snRNP U2-type prespliceosome membrane nucleus nucleoplasm cytosol nuclear speck Biological process cell division cell cycle mRNA processing regulation of cytokinesis cell migration cytoskeleton organization RNA splicing regulation of cell shape mRNA splicing, via spliceosome mRNA cis splicing, via spliceosome Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 55660 56194 Вместе ENSG00000196504 ENSMUSG00000061136 ЮниПрот О75400 Q9R1C7 RefSeq (мРНК) showНМ_017892 НМ_001354432 НМ_001354431 НМ_001365596 НМ_001365597 NM_001365598 NM_001365599 NM_001365600 NM_001365601 NM_001365602 NM_001365603 NM_001365604 NM_001365605 NM_001395472 NM_001395473 NM_001395475 NM_001395476 NM_001395477 NM_001395478 NM_001395479 NM_001395480 NM_001395481 NM_001395482 NM_001395483 NM_001395488 НМ_018785 RefSeq (белок) showНП_060362 НП_001341361 НП_001341360 НП_001352525 НП_001352526 NP_001352527 NP_001352528 NP_001352529 NP_001352530 NP_001352531 NP_001352532 NP_001352533 NP_001352534 showНП_061255 НП_001357944 НП_001357945 НП_001357946 НП_001357947 NP_001357948 NP_001357949 Местоположение (UCSC) Chr 2: 152,65 – 152,72 Мб Чр 2: 53,13 – 53,19 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Гомолог А фактора процессинга пре-мРНК 40 представляет собой белок , который у человека кодируется PRPF40A геном .

Взаимодействия

Было показано, что PRPF40A взаимодействует с Хантингтином .

Дальнейшее чтение

• Чан, округ Колумбия, Бедфорд М.Т., Ледер П. (1996). «Формин-связывающие белки несут домены WWP/WW, которые связывают богатые пролином пептиды и функционально напоминают домены SH3» . ЭМБО Дж . 15 (5): 1045–54. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00442.x . ПМК   450002 . ПМИД   8605874 .
• Бедфорд М.Т., Чан, округ Колумбия, Ледер П. (1997). «Домены FBP WW и домен Abl SH3 связываются с определенным классом лигандов, богатых пролином» . ЭМБО Дж . 16 (9): 2376–83. дои : 10.1093/emboj/16.9.2376 . ПМК   1169838 . ПМИД   9171351 .
• Фабер П.В., Барнс Г.Т., Шриниди Дж. и др. (1998). «Хантингтин взаимодействует с семейством белков домена WW» . Хм. Мол. Жене . 7 (9): 1463–74. дои : 10.1093/hmg/7.9.1463 . ПМИД   9700202 .
• Сканлан М.Дж., Гордан Дж.Д., Уильямсон Б. и др. (1999). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточным раком». Межд. Дж. Рак . 83 (4): 456–64. doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5 . ПМИД   10508479 . S2CID   21839750 .
• Бедфорд М.Т., Сарбасова Д., Сюй Дж. и др. (2000). «Новый мотив в поддержку Арг, признанный доменами WW» . Ж. Биол. Хим . 275 (14): 10359–69. дои : 10.1074/jbc.275.14.10359 . ПМИД   10744724 .
• Чжан QH, Е М, Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геном Рез . 10 (10): 1546–60. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК   310934 . ПМИД   11042152 .
• Венцель Дж., Санценбахер Р., Гадими М. и др. (2002). «Множественные взаимодействия цитозольной полипролиновой области лиганда CD95: намеки на способность обратной передачи сигнала фактора смерти». ФЭБС Летт . 509 (2): 255–62. дои : 10.1016/S0014-5793(01)03174-X . ПМИД   11741599 . S2CID   33084576 .
• Аллен М., Фридлер А., Шон О., Байкрофт М. (2002). «Структура домена FF человека HYPA/FBP11». Дж. Мол. Биол . 323 (3): 411–6. дои : 10.1016/S0022-2836(02)00968-3 . ПМИД   12381297 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Като М, Като М (2004). «Идентификация и характеристика гена FNBP3 человека in silico». Межд. Дж. Мол. Мед . 12 (4): 651–6. дои : 10.3892/ijmm.12.4.651 . ПМИД   12964049 .
• Бусино Л., Донзелли М., Кьеза М. и др. (2003). «Деградация Cdc25A бета-TrCP во время S-фазы и в ответ на повреждение ДНК». Природа . 426 (6962): 87–91. Бибкод : 2003Natur.426...87B . дои : 10.1038/nature02082 . ПМИД   14603323 . S2CID   768783 .
• Мизутани К., Суэцугу С., Такенава Т. (2004). «FBP11 регулирует ядерную локализацию N-WASP и ингибирует N-WASP-зависимое образование микрошипов». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 313 (3): 468–74. дои : 10.1016/j.bbrc.2003.11.139 . ПМИД   14697212 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК   514446 . ПМИД   15302935 .
• Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Курс. Биол . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД   15324660 . S2CID   2371325 .
• Гёлер Х., Лаловски М., Стельцль У. и др. (2004). «Сеть взаимодействия белков связывает GIT1, усилитель агрегации хантингтина, с болезнью Хантингтона» . Мол. Клетка . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . ПМИД   15383276 .
• Лин КТ, Лу РМ, Тарн, Вайоминг (2004). «Белки, содержащие домен WW, взаимодействуют с ранней сплайсосомой и участвуют в сплайсинге пре-мРНК in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 24 (20): 9176–85. дои : 10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004 . ПМК   517884 . ПМИД   15456888 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .