ПРПФ3

ПРПФ3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1X4Q, 3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	PRPF3 , фактор процессинга пре-мРНК 3, HPRP3, HPRP3P, PRP3, Prp3p, RP18, SNRNP90
Внешние идентификаторы	Опустить : 607301 ; МГИ : 1918017 ; Гомологен : 3447 ; Генные карты : PRPF3 ; ОМА : PRPF3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	150,353,233 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	95,763,197 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; right uterine tube; ; left ovary; ; right ovary; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; anterior pituitary; ; cerebellar hemisphere; ; right hemisphere of cerebellum; ; body of uterus;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; primitive streak; ; ventricular zone; ; epiblast; ; neural layer of retina; ; otic vesicle; ; yolk sac; ; otic placode; ; primary oocyte;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; identical protein binding; RNA binding;
Cellular component	Cajal body; U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; spliceosomal complex; nucleus; nucleoplasm; cytosol; nuclear speck; protein-containing complex; U2-type precatalytic spliceosome;
Biological process	RNA splicing, via transesterification reactions; mRNA splicing, via spliceosome; mRNA processing; spliceosomal tri-snRNP complex assembly; RNA splicing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9129
	70767
	ENSG00000117360
	ENSMUSG00000015748
	О43395
	Q922U1
	НМ_004698 ; НМ_001350529
	НМ_027541 ; НМ_001316751
	НП_004689 ; НП_001337458
	НП_001303680 ; НП_081817
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Малый ядерный рибонуклеопротеин U4/U6 Prp3 представляет собой белок , который у человека кодируется PRPF3 геном . ^[5]

Функция

Удаление интронов из ядерных пре-мРНК происходит в комплексах, называемых сплайсосомами , которые состоят из 4 небольших частиц ядерного рибонуклеопротеина (мяРНП) и неопределенного числа временно связанных факторов сплайсинга . PRPF3 — один из нескольких белков, которые связываются с мяРНП U4 и U6. [поставлено OMIM] ^[5]

Взаимодействия

Было показано, что PRPF3 взаимодействует с DVL3 . ^[6]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000117360 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015748 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Entrez: гомолог фактора 3 процессинга пре-мРНК PRPF3 PRP3 (S. cerevisiae)» .
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сюй С.Ю., Шварц М., Розенберг Т., Гал А. (август 1996 г.). «Девятый локус (RP18) аутосомно-доминантного пигментного ретинита картируется в прицентромерной области хромосомы 1» . Молекулярная генетика человека . 5 (8): 1193–7. дои : 10.1093/hmg/5.8.1193 . ПМИД 8842740 .
Ван А., Форман-Кей Дж., Луо Й., Луо М., Чоу Й.Х., Пламб Дж., Фризен Дж.Д., Цуй Л.К., Хенг Х.Х., Вулфорд Дж.Л., Ху Дж. (ноябрь 1997 г.). «Идентификация и характеристика генов человека, кодирующих Hprp3p и Hprp4p, взаимодействующие компоненты сплайсосомы» . Молекулярная генетика человека . 6 (12): 2117–26. дои : 10.1093/hmg/6.12.2117 . ПМИД 9328476 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (декабрь 1997 г.). «Новый циклофилин и человеческие гомологи дрожжей Prp3 и Prp4 образуют комплекс, связанный с мяРНП U4/U6» . РНК . 3 (12): 1374–87. ПМЦ 1369579 . ПМИД 9404889 .
Хэн Х.Х., Ван А., Ху Дж. (март 1998 г.). «Картирование человеческих генов HPRP3 и HPRP4, кодирующих U4/U6-ассоциированные факторы сплайсинга, с хромосомами 1q21.1 и 9q31-q33». Геномика . 48 (2): 273–5. дои : 10.1006/geno.1997.5181 . ПМИД 9521884 .
Сюй С.Ю., Розенберг Т., Гал А. (апрель 1998 г.). «Уточненное генетическое картирование аутосомно-доминантного локуса пигментного ретинита RP18 уменьшает критическую область до 2 см между D1S442 и D1S2858 на хромосоме 1q». Генетика человека . 102 (4): 493–4. дои : 10.1007/s004390050728 . ПМИД 9600251 . S2CID 39815355 .
Рейдт Ю, Рейтер К, Аксель Т, Ингельфингер Д, Люрманн Р, Фикнер Р (март 2000 г.). «Кристаллическая структура малого ядерного рибонуклеопротеина человека U4/U6, специфичного для частиц SnuCyp-20, ядерного циклофилина» (PDF) . Журнал биологической химии . 275 (11): 7439–42. дои : 10.1074/jbc.275.11.7439 . ПМИД 10713041 . S2CID 20261807 .
Чакарова К.Ф., Химс М.М., Больц Х., Абу-Сафие Л., Патель Р.Дж., Папайоанну М.Г., Инглхерн К.Ф., Кин Т.Дж., Уиллис С., Мур А.Т., Розенберг Т., Вебстер А.Р., Берд А.К., Гал А., Хант Д., Витана Э.Н., Бхаттачарья СС (январь 2002 г.). «Мутации в HPRP3, третьем члене генов фактора сплайсинга пре-мРНК, участвующие в аутосомно-доминантном пигментном ретините» . Молекулярная генетика человека . 11 (1): 87–92. дои : 10.1093/hmg/11.1.87 . ПМИД 11773002 .
Горовиц Д.С., Ли Э.Дж., Мабон С.А., Мистели Т. (февраль 2002 г.). «Циклофилин участвует в сплайсинге пре-мРНК» . Журнал ЭМБО . 21 (3): 470–80. дои : 10.1093/emboj/21.3.470 . ПМЦ 125845 . ПМИД 11823439 .
Гонсалес-Сантос Дж. М., Ван А., Джонс Дж., Ушида С., Лю Дж., Ху Дж. (июнь 2002 г.). «Центральная область человеческого фактора сплайсинга Hprp3p взаимодействует с Hprp4p» . Журнал биологической химии . 277 (26): 23764–72. дои : 10.1074/jbc.M111461200 . ПМИД 11971898 .
Ноттротт С., Урлауб Х., Люрманн Р. (октябрь 2002 г.). «Иерархические кластерные белковые взаимодействия с мяРНК U4/U6: биохимическая роль белков U4/U6» . Журнал ЭМБО . 21 (20): 5527–38. дои : 10.1093/emboj/cdf544 . ПМК 129076 . ПМИД 12374753 .
Аджух П., Чусейнов Дж., Райдер У., Ламонд А.И. (декабрь 2002 г.). «Новая функция человеческого фактора C1 (HCF-1), белка-хозяина, необходимого для заражения вирусом простого герпеса, в сплайсинге пре-мРНК» . Журнал ЭМБО . 21 (23): 6590–602. дои : 10.1093/emboj/cdf652 . ПМК 136956 . ПМИД 12456665 .
Мартинес-Химено М., Гамунди М.Дж., Эрнан И., Масерас М., Милла Э., Аюсо С., Гарсиа-Сандовал Б., Бенейто М., Вилела С., Байгет М., Антиньоло Г., Карбальо М. (май 2003 г.). «Мутации в генах фактора сплайсинга пре-мРНК PRPF3, PRPF8 и PRPF31 в испанских семьях с аутосомно-доминантным пигментным ретинитом» . Исследовательская офтальмология и визуальные науки . 44 (5): 2171–7. дои : 10.1167/iovs.02-0871 . ПМИД 12714658 .
Рейдт Ю, Валь М.С., Фассауэр Д., Горовиц Д.С., Люрманн Р., Фикнер Р. (август 2003 г.). «Кристаллическая структура комплекса человеческого сплайсосомного циклофилина H и пептида U4/U6 snRNP-60K». Журнал молекулярной биологии . 331 (1): 45–56. дои : 10.1016/S0022-2836(03)00684-3 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F238-B . ПМИД 12875835 .
Вада Ю., Итабаши Т., Сато Х., Тамай М. (ноябрь 2004 г.). «Клинические особенности японской семьи с аутосомно-доминантным пигментным ретинитом, связанным с мутацией Thr494Met в гене HPRP3». Архив клинической и экспериментальной офтальмологии Грефе = Архив клинической и экспериментальной офтальмологии Альбрехта фон Грефе . 242 (11): 956–61. дои : 10.1007/s00417-004-0923-x . ПМИД 15085354 . S2CID 22773384 .
Станек Д., Нойгебауэр К.М. (сентябрь 2004 г.). «Обнаружение промежуточных продуктов сборки мяРНП в тельцах Кахаля методом резонансного переноса энергии флуоресценции» . Журнал клеточной биологии . 166 (7): 1015–25. дои : 10.1083/jcb.200405160 . ПМК 2172029 . ПМИД 15452143 .
Майта Х, Китаура Х, Арига Х, Игучи-Арига С.М. (январь 2005 г.). «Ассоциация PAP-1 и Prp3p, продуктов генов, вызывающих доминантный пигментный ретинит, в комплексе три-мяРНП». Экспериментальные исследования клеток . 302 (1): 61–8. дои : 10.1016/j.yexcr.2004.08.022 . ПМИД 15541726 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NIH/NCBI/UW об обзоре пигментного ретинита

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000117360 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015748 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Entrez: гомолог фактора 3 процессинга пре-мРНК PRPF3 PRP3 (S. cerevisiae)» .

[pmid16189514-6] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]